Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 284,993 (bp)   Positions: 566
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LH/MavRrrcAek (2020) 
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
Tbc1d22a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
A
A
T
T
A
8
T
G
G
A
C
A
A
C
C
C
8
4
A
T
G
T
T
A
T
C
T
-
A
T
T
G
T
T
C
C
C
G
T
C
T
C
-
A
C
T
G
A
C
T
G
G
T
T
G
T
C
T
T
A
A
A
G
8
9
-
A
G
A
T
T
A
32
T
T
T
T
T
T
T
T
G
G
A
C
T
G
T
C
2
G
5
A
C
T
T
C
G
A
G
C
T
A
T
T
T
C
G
C
C
C
C
T
T
T
C
48
A
T
27
T
G
G
T
C
A
C
A
A
A
48
C
G
T
G
G
A
T
T
T
T
G
A
G
T
G
A
T
A
T
T
C
A
T
-
T
C
A
A
C
G
A
T
T
G
G
A
G
T
T
-
T
A
-
G
G
C
T
T
T
T
C
A
C
A
T
T
C
G
G
A
T
G
A
C
-
C
C
C
C
T
C
A
6
C
C
C
T
T
G
A
G
G
C
-
G
C
G
C
T
C
A
-
T
T
T
-
A
T
C
T
C
T
T
7
T
T
C
T
G
A
T
A
T
C
A
A
T
C
A
A
C
C
G
G
A
G
A
G
A
T
A
A
G
G
A
A
A
T
A
-
G
G
17
G
C
2
A
T
C
A
G
T
T
G
G
G
G
T
T
A
T
A
T
G
4
A
C
C
G
A
C
T
T
C
C
C
G
C
T
C
T
A
A
T
T
G
C
A
G
T
C
A
G
C
C
C
T
C
C
T
A
A
T
G
T
-
G
C
C
T
C
G
T
G
C
-
2
G
T
A
G
G
C
C
C
G
C
G
C
C
A
A
T
11
G
C
G
C
T
A
C
C
T
C
A
G
T
T
T
G
C
G
C
-
T
A
T
A
3
36
G
T
A
C
T
C
C
T
G
C
C
T
A
A
A
A
C
G
G
G
8
C
T
G
T
C
T
2
G
G
C
T
A
C
C
T
T
T
T
A
-
C
T
2
A
T
A
T
G
C
-
A
A
T
G
G
C
C
A
-
24
-
A
C
A
2
-
G
C
C
T
A
T
G
T
A
T
T
C
A
T
T
3
A
G
G
T
C
A
C
G
G
C
C
T
14
C
G
A
G
T
C
T
4
C
A
C
T
A
T
A
T
A
G
T
T
C
T
G
T
T
A
C
A
A
T
G
G
T
T
G
G
G
T
C
3
A
G
T
-
A
A
A
G
C
T
C
C
C
A
C
G
C
A
T
G
G
T
T
G
A
A
T
G
A
C
T
A
T
A
T
C
G
G
  117,292,608
  117,293,293
  117,293,364
  117,293,510
  117,293,849
  117,294,378
  117,294,437
  117,294,444
  117,294,804
  117,294,859
  117,294,876
  117,294,907
  117,294,912
  117,295,198
  117,295,459
  117,295,878
  117,296,282
  117,296,487
  117,296,749
  117,297,489
  117,299,101
  117,299,887
  117,300,125
  117,300,936
  117,303,046
  117,303,057
  117,305,531
  117,306,698
  117,307,229
  117,307,741
  117,309,103
  117,309,124
  117,309,222
  117,312,158
  117,313,357
  117,313,430
  117,314,402
  117,318,968
  117,319,151
  117,322,950
  117,323,312
  117,324,042
  117,324,552
  117,327,104
  117,327,671
  117,329,295
  117,329,414
  117,330,194
  117,330,824
  117,336,315
  117,336,827
  117,336,967
  117,337,275
  117,337,379
  117,338,579
  117,339,205
  117,339,531
  117,339,948
  117,341,153
  117,341,505
  117,341,610
  117,342,171
  117,342,505
  117,342,779
  117,342,813
  117,344,166
  117,344,178
  117,344,689
  117,344,876
  117,345,514
  117,345,855
  117,346,434
  117,346,491
  117,346,731
  117,346,732
  117,346,734
  117,346,736
  117,346,738
  117,346,764
  117,346,766
  117,346,768
  117,347,125
  117,347,145
  117,347,599
  117,348,068
  117,348,709
  117,349,165
  117,349,381
  117,349,897
  117,350,237
  117,350,482
  117,350,484
  117,350,486
  117,350,540
  117,350,549
  117,350,941
  117,351,110
  117,351,118
  117,351,194
  117,351,271
  117,351,281
  117,351,394
  117,352,372
  117,352,434
  117,352,681
  117,353,460
  117,353,636
  117,353,848
  117,354,595
  117,355,112
  117,356,614
  117,356,984
  117,357,562
  117,358,262
  117,359,696
  117,360,027
  117,360,505
  117,361,012
  117,361,350
  117,361,786
  117,361,789
  117,361,791
  117,362,612
  117,362,645
  117,365,251
  117,366,532
  117,367,009
  117,367,800
  117,368,328
  117,368,348
  117,368,753
  117,372,329
  117,373,001
  117,373,111
  117,373,112
  117,373,151
  117,373,432
  117,374,126
  117,374,827
  117,374,995
  117,375,155
  117,377,312
  117,377,690
  117,377,868
  117,378,300
  117,378,935
  117,379,787
  117,380,169
  117,381,053
  117,381,800
  117,381,852
  117,381,908
  117,383,614
  117,383,689
  117,383,915
  117,384,957
  117,385,116
  117,385,168
  117,386,268
  117,386,790
  117,387,022
  117,387,297
  117,387,351
  117,387,636
  117,388,023
  117,388,172
  117,388,212
  117,388,266
  117,388,678
  117,388,834
  117,388,886
  117,389,240
  117,389,456
  117,389,602
  117,389,769
  117,389,839
  117,390,455
  117,390,473
  117,390,588
  117,391,644
  117,391,648
  117,391,694
  117,391,696
  117,392,210
  117,392,994
  117,395,300
  117,397,024
  117,397,048
  117,397,183
  117,397,282
  117,397,330
  117,397,635
  117,398,416
  117,398,471
  117,400,247
  117,400,630
  117,401,295
  117,403,610
  117,404,380
  117,405,264
  117,405,888
  117,407,134
  117,407,644
  117,407,879
  117,407,882
  117,408,858
  117,409,505
  117,410,245
  117,411,581
  117,412,468
  117,412,585
  117,412,605
  117,412,692
  117,412,717
  117,412,784
  117,412,995
  117,413,039
  117,413,053
  117,414,374
  117,416,545
  117,417,017
  117,417,096
  117,417,142
  117,417,321
  117,417,536
  117,418,431
  117,419,656
  117,420,253
  117,420,294
  117,420,691
  117,421,019
  117,421,146
  117,421,992
  117,422,134
  117,422,580
  117,422,601
  117,422,664
  117,422,704
  117,423,752
  117,423,864
  117,424,478
  117,427,239
  117,427,484
  117,427,691
  117,428,432
  117,429,102
  117,429,395
  117,429,479
  117,429,615
  117,429,963
  117,430,010
  117,430,145
  117,430,259
  117,430,814
  117,430,995
  117,431,277
  117,431,304
  117,431,573
  117,431,584
  117,431,624
  117,431,722
  117,431,754
  117,431,851
  117,432,093
  117,432,224
  117,432,259
  117,432,411
  117,433,253
  117,433,378
  117,433,403
  117,433,800
  117,434,099
  117,434,454
  117,434,662
  117,434,794
  117,434,810
  117,435,857
  117,436,056
  117,436,774
  117,436,940
  117,437,473
  117,438,908
  117,438,999
  117,439,512
  117,439,548
  117,439,940
  117,440,630
  117,441,125
  117,441,610
  117,442,822
  117,444,587
  117,444,603
  117,445,184
  117,445,263
  117,445,265
  117,446,042
  117,446,049
  117,446,895
  117,447,783
  117,447,916
  117,448,038
  117,448,048
  117,448,134
  117,448,263
  117,449,938
  117,451,670
  117,452,370
  117,452,371
  117,453,758
  117,453,816
  117,455,113
  117,456,024
  117,456,037
  117,456,129
  117,459,773
  117,460,401
  117,461,851
  117,462,337
  117,462,381
  117,462,429
  117,462,449
  117,462,776
  117,463,743
  117,463,897
  117,463,900
  117,464,539
  117,466,734
  117,467,902
  117,468,619
  117,468,950
  117,469,919
  117,471,231
  117,471,836
  117,471,894
  117,472,038
  117,472,540
  117,472,933
  117,474,179
  117,475,679
  117,481,701
  117,483,161
  117,483,461
  117,484,650
  117,485,506
  117,485,699
  117,486,951
  117,487,389
  117,487,392
  117,487,637
  117,487,962
  117,488,294
  117,489,162
  117,489,167
  117,489,453
  117,489,509
  117,490,264
  117,490,516
  117,490,643
  117,490,939
  117,491,016
  117,491,081
  117,491,348
  117,492,247
  117,492,789
  117,493,184
  117,493,305
  117,495,090
  117,495,091
  117,495,675
  117,496,200
  117,496,474
  117,497,005
  117,497,210
  117,497,320
  117,497,718
  117,498,012
  117,498,216
  117,498,293
  117,498,744
  117,499,071
  117,499,258
  117,499,604
  117,499,944
  117,500,428
  117,500,738
  117,500,868
  117,501,050
  117,501,139
  117,501,444
  117,502,010
  117,502,267
  117,502,535
  117,502,541
  117,502,586
  117,502,589
  117,502,811
  117,502,847
  117,502,930
  117,503,101
  117,503,396
  117,503,397
  117,503,891
  117,503,903
  117,504,035
  117,505,839
  117,506,144
  117,506,730
  117,506,788
  117,507,137
  117,507,140
  117,507,148
  117,507,246
  117,507,504
  117,510,299
  117,511,309
  117,511,500
  117,511,501
  117,511,542
  117,511,876
  117,512,089
  117,512,090
  117,512,094
  117,512,589
  117,512,728
  117,512,733
  117,512,991
  117,513,354
  117,513,514
  117,515,001
  117,515,013
  117,515,840
  117,517,108
  117,519,006
  117,520,254
  117,521,101
  117,521,527
  117,522,000
  117,522,334
  117,522,695
  117,525,320
  117,526,892
  117,527,947
  117,529,371
  117,529,541
  117,529,722
  117,529,762
  117,530,566
  117,531,093
  117,531,381
  117,531,552
  117,532,108
  117,532,193
  117,532,210
  117,532,402
  117,532,420
  117,533,699
  117,533,955
  117,534,183
  117,534,259
  117,534,396
  117,534,514
  117,534,522
  117,534,527
  117,534,666
  117,534,842
  117,535,044
  117,535,154
  117,535,270
  117,535,471
  117,535,515
  117,535,617
  117,535,629
  117,536,180
  117,536,233
  117,536,372
  117,536,658
  117,536,780
  117,536,933
  117,537,025
  117,537,145
  117,537,430
  117,537,481
  117,537,580
  117,537,588
  117,537,618
  117,537,729
  117,537,793
  117,538,024
  117,538,187
  117,538,514
  117,538,578
  117,539,179
  117,539,261
  117,539,331
  117,539,355
  117,539,398
  117,540,137
  117,540,383
  117,540,551
  117,541,234
  117,541,294
  117,541,543
  117,541,770
  117,541,963
  117,541,987
  117,542,045
  117,542,052
  117,542,178
  117,542,199
  117,542,209
  117,542,263
  117,542,280
  117,542,562
  117,542,601
  117,542,611
  117,542,614
  117,542,954
  117,543,046
  117,543,110
  117,543,121
  117,543,318
  117,543,627
  117,544,188
  117,544,424
  117,544,910
  117,545,045
  117,545,531
  117,545,608
  117,546,507
  117,548,673
  117,548,774
  117,550,048
  117,550,657
  117,552,167
  117,553,205
  117,554,146
  117,554,589
  117,555,115
  117,555,853
  117,556,693
  117,558,076
  117,559,599
  117,562,447
  117,562,893
  117,563,231
  117,565,206
  117,566,028
  117,566,264
  117,569,228
  117,569,546
  117,569,972
  117,570,575
  117,572,057
  117,573,235
  117,573,521
  117,573,595
  117,573,884
  117,574,719
  117,574,780
  117,574,928
  117,574,929
  117,574,970
  117,575,074
  117,575,098
  117,575,112
  117,575,655
T
G
G
C
G
T
-
-/A
A
T
G
T
C
G
A
T
T
-
-
G
C
A
C
C
C
C
-
C
3
-
-
-
-/T
C
C
G
T
G
T
C
T
-
G
2
G
A
G
A
G
T
C
A
A
G
C
A
C
T
A
C
C
G
G
C
-
-
3
G
T
C
C
C
G
-
-/C
-/C
C/-
C/-
C/-
C
C
C
A
A
G
T
C
T
C
T
-
T
-
G
T
A
C
T
T
G
T
A
C
G
C
A
C
T
A
T
T
T
T
C
A
C
T
-
G
-
-
C/-
A
C
G
T
G
-
G
G
G
-
T
A
C
A
C
G
C
C
C
C
C
G
A
C
T
G
A
T
G
C
T
T
C
C
C
A
G
G
T
A
G
C
C
A
A
T
T
G
-
G
C
G
2
A
A
T
G
C
C
C
G
G
G
T
G
C
T
A
C
G
C
A
G/-
A
T
T
T
T
T
C
A
G
-
T
T
A
C
C
T
G
A
A
T
C
C
-
A
T
A
T
C
96
C
C
C
8
T
C
T
C
T
A
C
-
C
C
-
C
A
G
C
G
C
A
T
C
C
A
C
G
A
T
A
A
G
A
G
A
G
C
G
G
T
-
G
G
C
C
-
2
A
A
17/-
-/T
T
-
G
C
T
T
C
G
C
A
A
T
A
C
C
G
G
G
C
G/A
-
T
T
A
A
G
T
C
C
T
A
G
A
T
-/A
T
C
G
G
C
C
A
A
G
A
G
T
A/C
C/13
T
T
A
C
T
A
C
T
T
C
A
C
A
A
T
G
C
T
A
C
A
G
4
-
A
C
G
A
T
T
T
A
A
T
A
T
G
G
T
G
11/-
A
T
A
T
C
G
T
T
C
T
G
A
C
G
A
C
T
A
G
8
C
-
A
T
-
-
-/C
-/C
-/G
-
C
T
T
C
A
-
T
C
G
G
T
G
G
A
A
A
-
T
C
A
C
T
A
2/-
A/-
A
G
C
C
G
A
C
C
C
G
G
A
T/-
C
-
G
C
G
C
A
T
A
G
G
C
A
A
T
T
C
T
-
3
G
A
T
-
A
T/-
G
T
C
G
A
A
C
G
C
A
G
G
C
G/C
-
G
A
A
G
T
G
T
C
A
T
T
C
-
G
A
G
T
C
T
C
-
T
G
T
C
G
G
T
C
G
A
C
-
A
C
-
C
C
G
T
C
G
C
A
A
C
C
A
A
A
C
T
-
T
A
C
2
G
G
G
T
T
C
T
T
T
G
A
A
T
G
C
A
A
C
-
A
G
G
C
A
G
T
C
T
A
C
C
T
A/T
A