Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 168,890 (bp)   Positions: 371
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF2B/Stm (2019) 
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
Tacr1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
C
C
A
G
-
-
A
T
A
C
C
T
G
A
T
C
A
T
A
G
A
-
C
C
C
G
C
A
G
A
C
G
T
G
-
C
T
G
C
T
G
10
-
-
2
-
-
A
G
T
T
G
T
A
T
A
C
G
G
G
C
A
G
-
T
T
G
G
G
-
T
G
G
G
G
G
G
G
-
T
T
G
A
G
T
A
G
A
C
109
A
G
A
-
G
C
-
T
A
A
A
A
A
A
A
A
C
G
G
-
C
G
C
C
T
C
C
-
A
T
G
G
A
T
68
C
T
G
G
T
A
A
A
C
2
T
A
A
G
T
A
C
C
G
G
G
C
A
C
C
T
G
G
G
T
A
A
A
G
G
G
C
-
T
-
-
A
A
T
G
C
-
A
C
-
T
2
C
A
-
C
-
C
C
C
-
G
T
A
G
G
-
T
G
C
A
G
C
G
-
C
C
G
T
A
G
G
T
-
-
T
G
C
T
G
A
-
G
T
G
C
G
C
-
C
T
-
G
T
A
A
G
A
T
C
A
T
G
G
T
G
G
G
G
8
A
-
A
A
C
A
A
A
C
A
T
G
C
T
T
G
T
C
C
C
A
-
T
G
T
G
T
C
G
G
G
T
G
C
C
G
G
C
G
4
C
T
C
A
A
G
C
-
G
12
C
C
G
A
C
-
G
T
A
A
C
A
A
C
T
G
2
-
-
-
A
18
13
A
G
-
C
T
C
A
A
A
T
C
G
G
T
T
T
C
G
-
G
A
A
A
T
C
G
G
T
-
T
C
G
A
T
G
C
A
C
C
A
2
2
8
T
T
T
T
T
T
T
A
  114,920,882
  114,920,989
  114,921,639
  114,921,895
  114,922,045
  114,922,936
  114,923,011
  114,923,029
  114,923,099
  114,923,212
  114,923,336
  114,923,341
  114,923,355
  114,923,431
  114,923,563
  114,923,794
  114,923,822
  114,924,028
  114,924,089
  114,924,094
  114,924,196
  114,924,201
  114,924,204
  114,924,416
  114,924,655
  114,924,664
  114,924,792
  114,925,434
  114,925,805
  114,925,855
  114,925,860
  114,927,775
  114,928,630
  114,928,747
  114,929,892
  114,930,562
  114,931,451
  114,931,720
  114,934,520
  114,939,897
  114,939,934
  114,940,049
  114,940,632
  114,941,413
  114,941,474
  114,941,475
  114,941,478
  114,941,502
  114,941,617
  114,942,100
  114,942,342
  114,942,633
  114,942,641
  114,943,360
  114,943,648
  114,944,262
  114,944,607
  114,944,914
  114,945,396
  114,945,418
  114,945,484
  114,945,853
  114,946,217
  114,946,383
  114,946,746
  114,946,935
  114,947,002
  114,947,004
  114,947,870
  114,947,930
  114,948,122
  114,948,333
  114,949,067
  114,949,230
  114,949,232
  114,949,234
  114,949,236
  114,949,238
  114,949,284
  114,949,370
  114,949,583
  114,949,584
  114,949,995
  114,950,505
  114,950,957
  114,951,138
  114,951,640
  114,951,647
  114,951,840
  114,951,942
  114,952,340
  114,952,393
  114,952,934
  114,953,143
  114,953,600
  114,953,814
  114,953,816
  114,954,133
  114,954,173
  114,954,277
  114,954,302
  114,954,422
  114,954,627
  114,955,474
  114,955,540
  114,955,690
  114,955,818
  114,956,048
  114,956,118
  114,956,288
  114,956,289
  114,957,569
  114,958,815
  114,959,251
  114,959,263
  114,960,020
  114,960,053
  114,960,517
  114,960,518
  114,960,814
  114,960,822
  114,960,935
  114,961,370
  114,961,740
  114,962,448
  114,962,680
  114,962,728
  114,962,732
  114,963,013
  114,963,351
  114,966,154
  114,966,306
  114,966,307
  114,967,000
  114,968,474
  114,970,195
  114,970,290
  114,971,886
  114,973,925
  114,973,996
  114,974,241
  114,974,569
  114,975,065
  114,975,396
  114,977,211
  114,977,225
  114,977,227
  114,977,232
  114,978,073
  114,978,190
  114,978,310
  114,979,888
  114,980,186
  114,980,911
  114,981,282
  114,981,939
  114,982,043
  114,982,400
  114,983,471
  114,984,057
  114,984,316
  114,984,657
  114,984,678
  114,985,393
  114,985,472
  114,985,592
  114,985,746
  114,985,748
  114,985,787
  114,985,806
  114,985,880
  114,985,886
  114,986,502
  114,986,622
  114,986,631
  114,986,672
  114,986,697
  114,986,702
  114,986,704
  114,986,728
  114,986,732
  114,986,753
  114,986,778
  114,986,870
  114,986,940
  114,987,004
  114,987,200
  114,987,309
  114,987,382
  114,987,455
  114,987,501
  114,987,570
  114,987,630
  114,987,661
  114,987,673
  114,987,810
  114,987,837
  114,988,239
  114,988,366
  114,988,556
  114,988,757
  114,989,009
  114,989,446
  114,989,688
  114,989,728
  114,989,763
  114,989,806
  114,989,835
  114,989,907
  114,990,752
  114,990,836
  114,990,839
  114,991,264
  114,991,291
  114,991,555
  114,992,091
  114,992,111
  114,992,547
  114,994,038
  114,994,503
  114,995,385
  114,995,421
  114,995,557
  114,996,604
  114,996,625
  114,996,802
  114,997,009
  114,997,297
  114,997,347
  114,997,465
  114,997,618
  114,997,642
  114,997,650
  114,997,964
  114,998,688
  114,999,941
  115,000,025
  115,001,037
  115,006,063
  115,006,536
  115,007,341
  115,009,088
  115,010,265
  115,010,907
  115,011,195
  115,013,241
  115,014,744
  115,017,301
  115,023,153
  115,025,686
  115,025,688
  115,025,928
  115,026,943
  115,026,945
  115,026,947
  115,029,729
  115,030,913
  115,031,302
  115,034,133
  115,035,496
  115,035,523
  115,036,631
  115,036,643
  115,036,728
  115,037,478
  115,038,657
  115,038,915
  115,038,985
  115,039,025
  115,039,477
  115,039,543
  115,039,759
  115,039,867
  115,039,873
  115,039,890
  115,039,891
  115,040,778
  115,041,023
  115,041,024
  115,041,175
  115,041,448
  115,041,815
  115,042,480
  115,042,693
  115,043,036
  115,043,057
  115,044,979
  115,047,101
  115,047,257
  115,047,609
  115,048,132
  115,049,498
  115,049,888
  115,050,310
  115,050,343
  115,050,596
  115,050,598
  115,050,607
  115,050,617
  115,050,620
  115,050,716
  115,051,061
  115,051,329
  115,051,760
  115,052,070
  115,052,439
  115,053,222
  115,053,932
  115,053,939
  115,054,257
  115,054,295
  115,055,175
  115,055,459
  115,056,458
  115,056,916
  115,056,940
  115,056,942
  115,057,395
  115,058,114
  115,058,956
  115,058,979
  115,059,363
  115,059,412
  115,061,145
  115,061,515
  115,063,183
  115,063,263
  115,064,035
  115,064,537
  115,065,400
  115,065,491
  115,065,499
  115,066,151
  115,066,154
  115,066,206
  115,068,294
  115,068,760
  115,070,339
  115,070,353
  115,073,669
  115,074,644
  115,075,518
  115,076,166
  115,077,580
  115,079,649
  115,079,788
  115,080,524
  115,080,526
  115,080,566
  115,080,652
  115,080,982
  115,081,571
  115,081,932
  115,082,199
  115,082,732
  115,082,741
  115,082,843
  115,083,279
  115,085,251
  115,085,743
  115,088,914
  115,088,920
  115,088,926
  115,088,975
  115,088,977
  115,088,979
  115,088,981
  115,088,983
  115,089,334
  115,089,487
  115,089,729
G
T
T
G
G
A
3
T
C
A
G
A
T
C
C
G
C
G
G
C
T
A
G
C
T
T/-
T
A
T
G
C
G
T
T
C
T
C
-
C
A
T
-
T
-
A
A
-
2
58
-
A
G
G
A
G
G
C
G
T
T
A
-
T
G
A
G
G
A
A
A
A
3
C
-/A
-/A
-/A
-/A
A/-
A
A
7
A
G
A
G
C
C
C
C
G
T
-
G
A
G
G
A
T
2
C
G
G
G
G
-
C
T
G
T
A
A
T
G
A
A
T
C
A
T
A
T
C
A
A
A/C
T/C
-
-/T
C
A
A
G
G
T
C
T
-
-
G
G
A
C
G
T
T
C
A
A
T
G
T
T
C
A
T/-
A
A
G
G
G
T
A
A
T
4
C
-/2
-/2
T
-
C
A
T
4
C
T
C
-
-
T
C
6
T
2
G
T
A
3
A
C
G
A
A
T
A
C
T
G
A
A
A
A
T
T
A
C
T
A
A
C
G
C
C
A
T
C
A
-
2
A
C
T
T
A
A
6
-
G
C
A
C
G
C
A
G
C
T
G
C
C
A
G
A
A
A
A
-
-
G
G/-
G/-
A
-/C
-/T
-/T
T
G
G
A
A
C
C
A
G
T
T
T
-
4
C
C
T/A
G/A
T/C
C/T
A
A
G/C
T/C
A
G
T
A
A
T
A
-
T
C
G
G
G
A
T
C
T
-
T/-
-/T
A/-
G
T
A
A
G
C
C
T
G
-
T
C
A
-
2
6
-/4
G
-
-
G
C
3
T
C
T
G
G
G
C
T
A
?
C
-/C
A
T
A
2
A
G
G
G
A
A
A
A
G
T
C
T
T
-
C
A
T
G
T
T
G
-
-
-
A
A
A
A
A
C
C
G