Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 203,652 (bp)   Positions: 698
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
Syndig1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120101729
LOC120101729
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
G
G
C
T
C
A
T
T
A
A
A
A
C
G
C
C
G
A
A
A
C
C
T
G
T
-
T
A
A
A
5
G
G
A
T
G
A
T
C
A
C
T
C
C
C
A
T
C
C
C
G
3
G
G
C
T
A
2
G
C
A
T
C
T
G
A
T
A
C
T
T
C
A
T
T
C
T
A
T
A
-
4
T
A
T
A
T
C
T
G
G
T
G
T
A
T
G
A
T
3
A
T
T
T
G
-
T
G
G
C
G
-
G
T
A
C
G
C
T
T
C
A
A
T
T
C
C
-
-
T
A
C
T
G
T
T
A
G
G
C
G
A
A
G
C
A
C
T
T
A
T
T
T
-
T
G
9
A
A
A
T
G
G
G
G
T
T
-
-
T
C
A
A
G
A
C
A
T
T
A
A
A
T
C
C
A
G
C
A
T
T
T
C
A
T
A
T
G
A
A
-
C
A
-
C
T
C
G
T
T
T
C
-
G
T
G
G
C
A
A
A
2
C
C
C
G
3
T
T
T
G
2
A
C
-
-
A
T
-
A
T
4
A
G
3
G
C
G
G
C
-
-
-
G
T
G
G
A
A
A
24
-
G
G
C
3
T
A
C
G
T
A
G
T
T
G
C
G
G
G
A
A
G
G
A
C
T
C
G
A
A
C
C
T
T
C
T
G
G
T
C
A
C
T
-
C
A
-
A
G
A
A
A
T
G
G
C
T
G
C
A
G
G
C
T
C
G
C
A
G
G
G
A
T
T
C
C
C
A
C
G
G
A
8
G
A
T
G
C
C
C
T
A
C
A
T
2
C
G
G
T
A
C
T
G
C
T
T
G
G
C
G
T
G
C
A
-
C
T
G
T
G
G
T
A
C
C
A
A
2
-
A
-
G
C
C
A
T
C
16
A
C
A
A
A
A
A
A
T
A
A
A
C
G
A
C
T
T
T
C
G
T
-
T
A
G
A
A
C
A
A
G
G
A
-
A
A
T
G
G
C
A
A
A
T
T
C
A
G
5
C
G
A
G
T
G
A
A
G
A
T
G
A
C
C
C
G
C
A
T
G
G
G
C
G
T
T
T
C
T
G
T
T
G
C
C
T
T
C
C
G
G
C
C
2
A
G
T
T
T
A
T
T
C
T
C
G
G
111
G
G
G
T
G
G
G
A
G
C
C
T
C
T
G
A
2
30
T
G
A
G
G
G
G
G
C
C
T
C
G
T
C
C
C
G
A
T
G
T
-
G
T
A
T
T
T
C
A
T
C
C
G
T
G
C
A
A
4
T
C
C
-
11
T
A
-
G
A
A
C
C
C
A
G
T
T
A
T
A
-
T
A
T
A
T
C
A
T
T
G
T
T
G
C
A
T
C
T
G
T
A
C
C
A
C
G
T
A
G
C
A
6
A
-
C
C
T
A
A
C
T
-
T
G
T
-
G
T
G
G
T
T
T
A
G
T
G
T
G
C
A
T
G
G
G
A
T
C
C
A
-
T
C
A
9
G
C
G
A
C
-
C
T
A
T
C
A
G
A
T
-
C
T
A
A
-
C
T
C
7
-
T
C
A
T
G
  138,031,016
  138,031,645
  138,032,044
  138,032,434
  138,032,485
  138,032,514
  138,032,581
  138,033,013
  138,033,502
  138,033,668
  138,033,947
  138,034,062
  138,034,119
  138,034,378
  138,034,629
  138,036,146
  138,036,149
  138,036,252
  138,036,258
  138,036,713
  138,037,223
  138,037,419
  138,038,245
  138,038,325
  138,038,347
  138,038,493
  138,038,586
  138,038,599
  138,038,858
  138,038,872
  138,038,964
  138,039,065
  138,039,262
  138,039,279
  138,039,297
  138,039,387
  138,039,454
  138,039,634
  138,039,644
  138,039,779
  138,039,820
  138,039,976
  138,040,448
  138,040,464
  138,040,733
  138,040,874
  138,041,161
  138,041,443
  138,041,627
  138,041,672
  138,041,752
  138,041,879
  138,042,087
  138,042,201
  138,042,215
  138,042,319
  138,042,389
  138,042,464
  138,042,483
  138,042,572
  138,042,577
  138,042,710
  138,042,758
  138,042,965
  138,043,074
  138,043,413
  138,043,563
  138,043,694
  138,043,839
  138,044,084
  138,044,267
  138,044,520
  138,044,620
  138,044,651
  138,045,110
  138,045,753
  138,046,027
  138,046,053
  138,046,451
  138,046,537
  138,046,547
  138,046,768
  138,047,258
  138,047,395
  138,047,526
  138,047,631
  138,048,172
  138,048,623
  138,048,668
  138,048,774
  138,049,287
  138,049,433
  138,049,554
  138,049,643
  138,049,860
  138,049,936
  138,050,174
  138,050,508
  138,050,513
  138,050,565
  138,050,846
  138,051,043
  138,051,500
  138,051,533
  138,051,861
  138,052,026
  138,052,450
  138,052,503
  138,052,510
  138,052,535
  138,052,773
  138,052,939
  138,053,464
  138,053,504
  138,053,575
  138,053,822
  138,053,836
  138,054,355
  138,054,402
  138,054,496
  138,056,126
  138,056,165
  138,056,470
  138,056,476
  138,057,479
  138,057,509
  138,059,331
  138,060,262
  138,060,710
  138,061,201
  138,061,411
  138,061,521
  138,061,914
  138,062,624
  138,063,041
  138,063,502
  138,064,194
  138,065,055
  138,066,404
  138,069,620
  138,069,891
  138,070,203
  138,070,576
  138,070,867
  138,071,228
  138,071,254
  138,072,545
  138,073,946
  138,074,400
  138,076,774
  138,077,391
  138,077,399
  138,077,415
  138,078,160
  138,078,698
  138,079,329
  138,079,418
  138,081,061
  138,082,939
  138,082,941
  138,082,943
  138,082,945
  138,084,715
  138,085,450
  138,085,872
  138,085,991
  138,086,427
  138,086,589
  138,086,856
  138,087,186
  138,087,188
  138,087,218
  138,087,245
  138,087,286
  138,087,305
  138,088,554
  138,089,516
  138,090,756
  138,090,935
  138,091,791
  138,092,879
  138,093,560
  138,094,028
  138,094,517
  138,094,877
  138,094,918
  138,095,215
  138,095,286
  138,095,495
  138,095,526
  138,095,756
  138,095,806
  138,095,846
  138,096,218
  138,096,229
  138,096,484
  138,096,597
  138,096,837
  138,096,894
  138,098,482
  138,099,428
  138,100,019
  138,100,057
  138,100,060
  138,100,152
  138,100,235
  138,100,325
  138,100,597
  138,100,690
  138,101,243
  138,101,975
  138,102,290
  138,102,646
  138,103,052
  138,103,476
  138,103,671
  138,103,897
  138,103,961
  138,104,041
  138,104,069
  138,104,324
  138,104,963
  138,105,258
  138,106,058
  138,106,092
  138,106,094
  138,106,096
  138,106,881
  138,107,045
  138,107,143
  138,107,164
  138,108,072
  138,108,288
  138,108,658
  138,109,121
  138,109,328
  138,109,399
  138,109,434
  138,109,589
  138,111,458
  138,111,511
  138,111,971
  138,112,430
  138,113,337
  138,113,356
  138,113,367
  138,113,370
  138,113,376
  138,114,649
  138,115,612
  138,115,646
  138,116,808
  138,117,028
  138,117,032
  138,117,034
  138,117,728
  138,118,048
  138,118,152
  138,119,734
  138,119,752
  138,120,219
  138,120,357
  138,120,423
  138,120,605
  138,120,696
  138,121,129
  138,121,329
  138,121,368
  138,121,452
  138,121,551
  138,123,552
  138,123,770
  138,123,937
  138,123,969
  138,124,122
  138,124,124
  138,124,127
  138,124,323
  138,125,176
  138,126,054
  138,126,915
  138,127,044
  138,127,064
  138,127,674
  138,127,688
  138,127,950
  138,128,060
  138,128,106
  138,128,336
  138,128,384
  138,128,988
  138,129,034
  138,129,266
  138,129,383
  138,129,749
  138,130,039
  138,130,119
  138,130,220
  138,130,221
  138,130,292
  138,130,628
  138,130,630
  138,131,231
  138,131,959
  138,131,970
  138,132,003
  138,132,012
  138,132,325
  138,132,384
  138,132,429
  138,132,575
  138,132,624
  138,132,680
  138,132,793
  138,132,905
  138,133,046
  138,133,093
  138,133,129
  138,133,141
  138,133,157
  138,133,190
  138,133,254
  138,133,314
  138,133,324
  138,133,587
  138,133,588
  138,133,677
  138,133,683
  138,133,737
  138,133,872
  138,133,886
  138,133,899
  138,134,085
  138,134,118
  138,134,467
  138,134,503
  138,134,504
  138,134,544
  138,134,609
  138,134,614
  138,134,677
  138,134,725
  138,134,774
  138,134,925
  138,134,965
  138,134,988
  138,135,775
  138,136,153
  138,136,522
  138,136,677
  138,136,839
  138,136,840
  138,136,916
  138,137,147
  138,137,432
  138,137,815
  138,137,830
  138,137,835
  138,137,945
  138,138,049
  138,138,080
  138,138,181
  138,138,187
  138,138,277
  138,138,577
  138,138,578
  138,138,629
  138,138,680
  138,138,682
  138,138,762
  138,138,879
  138,138,940
  138,139,046
  138,140,018
  138,140,046
  138,140,216
  138,140,254
  138,140,852
  138,140,921
  138,141,054
  138,141,704
  138,141,706
  138,141,828
  138,142,276
  138,142,280
  138,142,636
  138,143,148
  138,143,755
  138,143,871
  138,144,268
  138,144,524
  138,144,556
  138,144,756
  138,144,758
  138,144,760
  138,144,831
  138,144,941
  138,144,952
  138,145,294
  138,145,528
  138,145,644
  138,145,646
  138,146,025
  138,146,067
  138,146,200
  138,146,828
  138,146,830
  138,146,832
  138,146,834
  138,146,836
  138,147,043
  138,147,685
  138,147,798
  138,147,888
  138,148,279
  138,148,576
  138,148,674
  138,149,030
  138,149,174
  138,149,267
  138,149,312
  138,149,313
  138,149,352
  138,149,440
  138,150,192
  138,150,519
  138,151,190
  138,151,498
  138,151,761
  138,151,794
  138,151,845
  138,151,934
  138,152,103
  138,152,174
  138,152,386
  138,152,612
  138,152,628
  138,152,691
  138,152,811
  138,153,409
  138,153,612
  138,153,619
  138,154,351
  138,154,764
  138,155,316
  138,155,676
  138,155,793
  138,155,864
  138,156,094
  138,156,214
  138,156,436
  138,156,508
  138,156,557
  138,156,711
  138,156,996
  138,156,997
  138,157,157
  138,157,201
  138,157,354
  138,157,557
  138,157,776
  138,157,948
  138,158,188
  138,158,191
  138,158,204
  138,158,250
  138,158,385
  138,158,709
  138,159,080
  138,159,138
  138,159,294
  138,159,331
  138,159,425
  138,159,481
  138,159,562
  138,159,566
  138,159,935
  138,161,294
  138,162,521
  138,162,571
  138,162,660
  138,163,347
  138,163,600
  138,163,757
  138,164,125
  138,164,202
  138,164,348
  138,164,459
  138,164,475
  138,164,861
  138,165,290
  138,166,193
  138,166,576
  138,167,755
  138,168,676
  138,169,005
  138,170,551
  138,170,759
  138,170,987
  138,171,290
  138,171,358
  138,171,449
  138,171,984
  138,172,356
  138,172,942
  138,173,005
  138,173,406
  138,175,092
  138,179,059
  138,179,384
  138,180,016
  138,180,277
  138,180,736
  138,180,890
  138,181,060
  138,181,973
  138,182,077
  138,183,630
  138,183,940
  138,185,991
  138,188,009
  138,189,175
  138,189,716
  138,190,164
  138,190,637
  138,190,888
  138,191,481
  138,191,483
  138,191,692
  138,191,721
  138,191,865
  138,191,872
  138,191,876
  138,191,880
  138,191,884
  138,191,937
  138,192,122
  138,192,489
  138,192,517
  138,192,970
  138,193,044
  138,193,274
  138,193,495
  138,193,645
  138,194,029
  138,194,382
  138,194,657
  138,195,068
  138,195,212
  138,195,419
  138,195,505
  138,195,702
  138,195,735
  138,195,806
  138,195,847
  138,196,181
  138,196,309
  138,196,331
  138,196,646
  138,197,805
  138,197,924
  138,198,003
  138,198,299
  138,198,854
  138,199,241
  138,199,750
  138,202,193
  138,203,753
  138,204,804
  138,205,523
  138,205,645
  138,205,898
  138,205,906
  138,205,927
  138,205,990
  138,207,285
  138,207,321
  138,208,182
  138,208,324
  138,208,562
  138,208,645
  138,208,773
  138,208,775
  138,208,777
  138,209,001
  138,209,074
  138,209,709
  138,210,449
  138,210,497
  138,210,870
  138,211,184
  138,211,446
  138,211,597
  138,212,520
  138,212,778
  138,212,983
  138,213,017
  138,213,178
  138,213,274
  138,213,710
  138,213,806
  138,213,832
  138,213,849
  138,213,866
  138,213,892
  138,214,167
  138,214,190
  138,214,302
  138,214,366
  138,214,368
  138,214,378
  138,214,395
  138,214,483
  138,214,539
  138,214,616
  138,214,690
  138,214,700
  138,214,717
  138,214,751
  138,214,847
  138,214,851
  138,214,866
  138,214,886
  138,214,891
  138,214,899
  138,214,977
  138,215,072
  138,215,210
  138,215,382
  138,215,408
  138,215,612
  138,215,838
  138,215,912
  138,215,946
  138,216,049
  138,216,125
  138,216,163
  138,216,241
  138,216,320
  138,216,365
  138,216,366
  138,216,376
  138,216,389
  138,216,393
  138,216,536
  138,216,546
  138,216,552
  138,216,570
  138,216,597
  138,216,601
  138,216,604
  138,216,631
  138,216,638
  138,216,727
  138,216,728
  138,216,787
  138,216,796
  138,216,801
  138,216,870
  138,216,871
  138,216,875
  138,216,924
  138,217,136
  138,217,320
  138,217,473
  138,219,588
  138,220,351
  138,220,359
  138,220,688
  138,221,369
  138,221,554
  138,221,680
  138,221,742
  138,222,416
  138,224,233
  138,224,234
  138,224,862
  138,225,374
  138,225,675
  138,225,677
  138,225,730
  138,225,947
  138,226,113
  138,227,144
  138,228,254
  138,228,255
  138,228,347
  138,228,505
  138,230,087
  138,230,214
  138,230,889
  138,231,028
  138,231,061
  138,232,135
  138,232,804
  138,233,412
  138,233,493
  138,233,641
T
C
C
T
T
C
A
G
C
A
G
C
T
G
T
A
G
T
A
G
G
C
T
T
C
A
C
C
C
G
G
T
-
A
A
G
-
A
G
C
T
G
T
C
A
T
A
G
C
G
T
A
A
-
A
A
G
G
C
-
T
A
G
C
T
C
A
-
G
G
A
C
C
A
G
C
C
T
C
G
-
G
10
-
C
G
C
G
C
T
A
T
A
C
A
C
G
A/-
A/-
G
C
-
G
C
C
C
A
-/2
T/G
T
A
T
A
5
T
G
G
T
A
T
G
A
T
G
G
G
C
T
T
4
2
C
T
T
A
C
C
-
G
C
A
T
-
T
T
A
A
G
G
C
C
T
C
-
C
G
C
T
-
-/C
-/C
-/C
C
A
A
-
A
C
A
3
G
C
T
G
C
T
G
T
G
C
G
G
G
C/5
A
T
T
G
A
T
G
C
G
G
T
T
G
T
C
T
T
G
17
A
T
2
-
G
T
A
G
C
C
A/-
2
A
C
A
A
A
T
C
G
-
T/-
-/T
-/T
A
-
-
G
C
C
-
G
A
A
A
G
C
A
T
-
-
G
-
-
A
A
-/A
A
T
15
3
9
T
C
A
T
G
?
G
-
A
A
C
T
-
C
G
T
A
C
C
T
C
A
C
T
A
A
A
T
G
C
A
G
T
C
T
-
G
G
A
G
A
C
A
G
A
T
G
T
C
T
G
A
A
-
A
G
A
G
T
G
G
A
A
G
C
A
T
G
A/-
A
T
C
G
A
G
G
C
A
A
G
G
C
T
T
T
G
T
C
A
G
-
T
C
A
C
T
T
T
C
T
T
T
G
-
T
A
A
A
T
G
A
A
T
G
-
A
A
T
A
A
A
G
-
4
T
G
A
C
A
A
G
T
T
T
C
G
-
2
C
2
T
T
T
G
C
-
-
G
G
C
G/-
G
G
G
G
C
G
-
G
G
A
G
T
C
C
C
T
A
C
A
C
T
T
G
C
T
G
G
A
A
T
2
G
G
C
T
A
T
T
G
C
C
C
T
G
A
-
T
A
G
A
C
A
T
G
A
T
C
A
G
G
T
T
A
A
-
A
T/-
A
A
T
A
G
C
G
A
G
A
C
C
A
T
T
C
A
T
T
A
A
T
T
-
C
A
C
-
-
C
A
C
T
C
T
A
A
-
A
A
A
C
A
A
A
G
T
T
G
C/-
G
C
A
G
-
-
C/-
-/C
C/-
C/-
C/-
-/T
T
A
T
A
C
A
-
C
T
A
T
C
-
C
A
G
8
-
C
G
C
C
C
T
G
C
A
T
A
C
T
T
G
G
-
C
G
G
4
-
C
G
T
T
G
G/-
G
G
C/G
G
T
G
A
G
G
G
A
C
-
A
G
A
A
G
G
A
A
C
C
C
T
G
-
A
C
A
A
C
T
T
G
T
T
C
C
T
T
-
-
G
T
T
T
G
C
G
T
C
4
C
A
C
A
A
C
A
A
A
G
-
G
A
C
A
A
A
T
T
C
A
C
T
G
A
T
T
-
6
C
T
-
-
A/-
G
A
T/-
T
T
T
A
T
C
G
G
A
G
-
T
G
C
T
C
T
T
C
T
-
C
C
T
G
A
A