Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 168,165 (bp)   Positions: 219
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
HXB2/IpcvMcwi (2019) 
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
Syn2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Timp4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
T
C
C
T
T
T
A
C
-
G
C
-
A
G
-
-
C
A
G
T
A
A
T
4
T
-
8
G
G
-
-
-
2
T
G
-
T
G
A
C
T
3
A
A
-
A
T
G
29
T
G
G
T
2
A
T
A
A
A
G
-
C
32
G
-
C
G
-
A
C
A
-
A
T
A
100
C
T
C
T
G
G
-
G
C
-
G
T
G
G
A
-
A
G
G
A
A
C
T
C
A
3
-
3
T
C
T
T
C
C
A
T
T
T
C
-
-
T
T
T
A
A
A
C
G
G
T
C
T
T
A
T
A
A
-
A
G
C
C
A
2
A
C
C
-
A
C
C
A
T
6
A
A
T
T
A
T
A
G
G
T
A
A
C
G
C
A
T
C
A
C
G
42
T
C
C
G
T
T
G
C
A
C
G
T
C
T
T
G
C
G
C
A
G
G
G
T
C
C
T
G
A
C
A
G
G
G
A
G
A
A
T
C
-
A
T
  148,178,976
  148,181,969
  148,183,568
  148,183,577
  148,184,128
  148,186,117
  148,186,330
  148,187,565
  148,187,572
  148,188,184
  148,188,575
  148,188,903
  148,188,992
  148,189,756
  148,189,772
  148,189,775
  148,190,124
  148,190,273
  148,190,288
  148,190,480
  148,190,674
  148,190,746
  148,191,670
  148,191,690
  148,191,876
  148,192,128
  148,192,765
  148,193,885
  148,194,222
  148,194,262
  148,194,915
  148,195,530
  148,195,585
  148,195,586
  148,195,944
  148,195,974
  148,195,982
  148,196,188
  148,196,320
  148,196,393
  148,197,174
  148,197,573
  148,197,739
  148,198,261
  148,198,819
  148,198,822
  148,201,741
  148,203,856
  148,205,137
  148,208,230
  148,208,309
  148,212,418
  148,214,072
  148,214,368
  148,214,958
  148,214,984
  148,215,046
  148,215,641
  148,216,675
  148,216,946
  148,217,602
  148,218,364
  148,219,152
  148,221,246
  148,222,084
  148,222,184
  148,223,096
  148,224,933
  148,225,025
  148,225,554
  148,225,603
  148,226,065
  148,227,421
  148,227,765
  148,227,773
  148,228,191
  148,228,813
  148,229,060
  148,230,009
  148,232,132
  148,232,541
  148,233,571
  148,234,314
  148,234,384
  148,234,486
  148,234,644
  148,234,669
  148,234,728
  148,236,928
  148,237,067
  148,238,916
  148,240,015
  148,240,612
  148,243,181
  148,243,233
  148,245,793
  148,247,090
  148,247,100
  148,247,110
  148,249,718
  148,251,111
  148,252,243
  148,254,528
  148,254,668
  148,255,460
  148,258,162
  148,259,577
  148,266,619
  148,267,421
  148,267,710
  148,268,507
  148,270,914
  148,271,456
  148,273,305
  148,274,300
  148,274,301
  148,274,302
  148,275,743
  148,277,456
  148,277,483
  148,278,811
  148,278,926
  148,279,045
  148,280,078
  148,280,092
  148,280,292
  148,280,711
  148,280,824
  148,283,253
  148,283,686
  148,283,938
  148,283,959
  148,283,961
  148,286,277
  148,286,550
  148,287,535
  148,289,883
  148,290,105
  148,290,113
  148,290,474
  148,290,475
  148,290,494
  148,290,507
  148,291,522
  148,293,068
  148,294,240
  148,294,292
  148,295,187
  148,295,391
  148,296,151
  148,298,646
  148,298,702
  148,298,897
  148,298,904
  148,298,930
  148,298,980
  148,298,995
  148,298,999
  148,299,008
  148,299,071
  148,299,278
  148,299,299
  148,299,896
  148,300,275
  148,300,372
  148,300,381
  148,301,932
  148,302,620
  148,302,644
  148,302,939
  148,303,481
  148,304,423
  148,306,136
  148,306,725
  148,306,761
  148,307,293
  148,307,357
  148,308,690
  148,310,786
  148,310,839
  148,311,330
  148,312,528
  148,313,639
  148,314,004
  148,314,067
  148,316,239
  148,316,552
  148,316,787
  148,317,663
  148,318,783
  148,322,710
  148,322,983
  148,324,135
  148,324,606
  148,325,202
  148,326,154
  148,326,367
  148,326,769
  148,326,878
  148,328,369
  148,328,693
  148,328,933
  148,328,944
  148,329,033
  148,329,326
  148,332,893
  148,334,566
  148,334,862
  148,334,875
  148,335,359
  148,337,245
  148,337,691
  148,337,936
  148,338,934
  148,340,635
  148,344,377
  148,344,768
  148,344,910
  148,346,567
G/-
C
A
C
A
G
C
T/-
C
G
T
A
T
T
G
G
C
-/16
-/2
T
T
A
C
G
G
C
-
-
5
-
A
A
G
G
T
-
G
A
44
C
C
C
T
C
-
G
G
A
G
C
A
-
G
A
A
A
2/-
C
A
G
G
G
A
A
A
-
A
T
A
A
2
G
T
G
A
G
G
G
-
T
C
T
C
T
C
C
A
T
A
T
C
T
A
G
A
-/C
-/A
A
G
G
T
C
A
G
-
10
-
G
T
C
A
T
T
T
G/-
G/-
G
A
4
-/8
A
-
C
C
G
G
T
A
A
C
-/G
T/A
A
-
C
C
T
G
C
A
T
T
T
-
T
T
T
8
G
T
G
C
A
-
C
G
C
C
G
C
G
-
C
C
G
G
T
A
T
G
C
T
G
T
A
-
-
T
T
A
A
A
A
T
G
G
A
C
T
G
C
T
T
A
T
G
T
A
A
C
T
T
C
A
C
A/-
G
A
A
A
G
A
G
G
C
T
10
G
C