Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 265,478 (bp)   Positions: 635
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC100911723
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
Stk39
A
A
C
G
-
C
C
C
C
G
T
-
2
C
C
G
C
A
C
G
T
C
A
4
G
G
T
T
-
C
G
C
T
G
G
G
C
T
C
A
A
C
G
G
C
T
G
T
A
C
G
A
C
T
C
C
-
T
A
A
C
C
T
C
C
C
-
A
C
G
A
A
A
T
A
A
T
A
T
A
A
A
A
A
A
A
A
T
A
A
4
A
-
T
2
A
A
C
-
A
T
-
T
G
G
A
A
A
C
T
-
T
G
G
A
A
A
A
A
A
-
A
A
T
2
G
T
G
A
A
T
G
A
T
T
T
T
T
A
2
A
T
A
C
A
G
A
A
A
T
C
C
C
C
T
C
A
A
G
T
C
G
C
A
T
-
T
T
T
T
C
C
T
G
G
C
-
A
C
G
C
2
G
T
-
A
C
4
G
G
C
C
-
A
C
T
A
T
A
C
C
A
G
A
A
-
G
T
A
C
T
T
G
-
A
G
C
T
T
A
A
T
G
G
G
T
T
T
G
G
G
G
A
C
A
C
C
T
G
G
T
T
T
T
C
G
G
T
G
T
T
G
A
G
T
T
C
C
T
A
C
A
T
A
A
C
G
A
G
C
T
C
T
-
A
T
C
A
T
-
G
G
-
G
A
G
3
9
T
A
C
C
G
G
C
G
C
T
T
T
C
C
A
4
G
-
A
G
A
A
C
G
G
3
T
T
C
C
C
-
T
C
A
A
A
A
C
G
T
C
T
-
C
C
G
T
A
G
C
T
A
-
T
A
2
G
G
C
A
-
G
T
A
A
A
A
A
A
A
G
-
-
G
G
A
C
T
C
A
-
G
G
C
A
A
G
A
G
G
T
-
G
7
A
G
T
T
T
A
A
T
2
C
T
-
C
C
A
A
C
4
G
A
T
A
G
A
G
G
C
G
-
A
A
C
G
G
-
G
T
C
G
A
G
G
G
A
C
A
T
C
G
C
7
-
-
T
G
A
G
G
T
G
G
C
-
A
C
C
T
T
A
T
A
G
G
A
C
G
20
G
C
T
-
14
G
G
A
G
C
T
G
A
T
C
7
G
G
T
C
C
C
C
C
T
G
G
T
G
T
T
G
T
A
G
A
T
T
T
C
C
G
T
A
A
G
A
A
C
C
C
G
A
G
T
A
A
A
C
C
G
T
G
G
A
C
T
C
T
T
T
C
G
G
G
2
A
-
A
2
T
G
2
A
A
A
T
C
A
T
G
A
A
A
A
T
C
2
A
-
T
A
A
A
T
14
A
T
T
C
A
C
T
C
T
C
T
T
T
C
A
C
T
G
T
A
A
-
2
G
C
12
T
-
G
A
A
A
-
A
G
G
C
A
-
A
C
G
-
A
G
C
-
A
A
-
T
C
T
T
A
2
T
G
A
G
2
G
8
5
G
G
C
-
T
  52,914,898
  52,915,121
  52,915,392
  52,916,137
  52,916,359
  52,916,687
  52,916,758
  52,918,038
  52,918,972
  52,919,589
  52,920,023
  52,920,156
  52,920,212
  52,920,424
  52,921,129
  52,921,359
  52,922,718
  52,922,840
  52,923,398
  52,924,718
  52,925,181
  52,925,606
  52,925,675
  52,925,973
  52,926,045
  52,926,627
  52,927,352
  52,928,613
  52,928,617
  52,928,993
  52,929,790
  52,930,230
  52,930,296
  52,930,564
  52,930,720
  52,932,190
  52,932,259
  52,932,885
  52,932,888
  52,932,956
  52,932,992
  52,933,054
  52,933,537
  52,933,628
  52,933,792
  52,933,986
  52,934,109
  52,934,182
  52,934,445
  52,935,073
  52,935,119
  52,935,138
  52,935,274
  52,935,345
  52,936,043
  52,936,628
  52,936,799
  52,936,917
  52,937,096
  52,937,396
  52,937,430
  52,937,488
  52,937,493
  52,937,514
  52,937,556
  52,937,640
  52,937,791
  52,937,885
  52,938,077
  52,938,092
  52,938,287
  52,938,617
  52,939,662
  52,939,728
  52,940,331
  52,940,332
  52,941,512
  52,941,762
  52,942,485
  52,942,573
  52,942,692
  52,942,922
  52,944,049
  52,944,050
  52,944,062
  52,944,257
  52,944,363
  52,944,589
  52,945,421
  52,945,517
  52,945,775
  52,945,846
  52,945,924
  52,946,111
  52,946,178
  52,946,195
  52,946,197
  52,946,231
  52,946,370
  52,946,482
  52,946,491
  52,946,827
  52,946,872
  52,946,912
  52,946,934
  52,947,228
  52,947,449
  52,947,543
  52,947,607
  52,947,610
  52,948,128
  52,948,462
  52,948,567
  52,948,570
  52,948,573
  52,948,657
  52,948,660
  52,948,663
  52,948,666
  52,948,669
  52,949,057
  52,949,063
  52,949,081
  52,949,530
  52,951,287
  52,951,522
  52,952,960
  52,953,110
  52,953,464
  52,953,939
  52,954,047
  52,954,309
  52,954,384
  52,954,468
  52,954,663
  52,955,496
  52,955,770
  52,955,771
  52,957,407
  52,957,430
  52,958,051
  52,958,540
  52,958,791
  52,958,798
  52,958,919
  52,959,728
  52,960,784
  52,960,951
  52,961,374
  52,962,088
  52,962,792
  52,962,806
  52,962,808
  52,963,101
  52,963,680
  52,963,888
  52,963,925
  52,964,623
  52,964,875
  52,965,251
  52,966,461
  52,966,735
  52,967,462
  52,967,515
  52,967,534
  52,967,895
  52,969,610
  52,969,614
  52,969,618
  52,970,875
  52,972,659
  52,973,819
  52,974,314
  52,975,453
  52,975,826
  52,976,494
  52,976,589
  52,977,336
  52,977,380
  52,977,623
  52,977,765
  52,978,181
  52,978,736
  52,979,188
  52,979,949
  52,980,088
  52,980,198
  52,981,796
  52,984,633
  52,984,793
  52,984,882
  52,986,015
  52,986,289
  52,986,669
  52,986,718
  52,986,721
  52,988,157
  52,988,643
  52,989,649
  52,990,505
  52,990,788
  52,991,800
  52,992,233
  52,992,283
  52,993,572
  52,994,000
  52,994,954
  52,995,178
  52,995,182
  52,995,219
  52,995,567
  52,995,636
  52,997,182
  52,997,390
  52,998,004
  52,998,211
  52,999,099
  52,999,524
  53,000,090
  53,000,801
  53,000,826
  53,001,373
  53,001,530
  53,001,581
  53,002,127
  53,002,504
  53,002,515
  53,002,546
  53,002,784
  53,003,363
  53,003,480
  53,003,562
  53,004,001
  53,004,101
  53,004,103
  53,005,168
  53,005,523
  53,006,907
  53,007,192
  53,007,217
  53,007,282
  53,007,339
  53,008,023
  53,008,371
  53,008,424
  53,008,604
  53,008,819
  53,009,895
  53,009,942
  53,010,264
  53,010,385
  53,010,518
  53,011,002
  53,011,314
  53,011,530
  53,011,943
  53,011,994
  53,012,085
  53,012,409
  53,012,639
  53,012,702
  53,012,815
  53,012,974
  53,013,078
  53,013,254
  53,013,255
  53,013,312
  53,013,921
  53,014,083
  53,014,122
  53,014,513
  53,015,332
  53,016,010
  53,017,259
  53,017,645
  53,017,731
  53,018,372
  53,019,424
  53,019,630
  53,019,681
  53,020,013
  53,020,155
  53,020,486
  53,021,731
  53,022,734
  53,022,814
  53,023,169
  53,023,234
  53,024,125
  53,024,755
  53,026,272
  53,026,448
  53,026,627
  53,026,713
  53,026,795
  53,027,315
  53,028,173
  53,028,768
  53,029,166
  53,029,635
  53,029,706
  53,030,443
  53,030,491
  53,032,389
  53,033,317
  53,034,647
  53,035,777
  53,037,526
  53,038,539
  53,039,030
  53,039,231
  53,040,198
  53,040,417
  53,040,838
  53,041,389
  53,041,625
  53,041,712
  53,043,065
  53,043,482
  53,043,883
  53,043,949
  53,044,256
  53,044,312
  53,045,354
  53,045,578
  53,045,857
  53,046,126
  53,047,616
  53,048,031
  53,048,842
  53,049,592
  53,049,769
  53,050,679
  53,052,347
  53,052,466
  53,052,532
  53,052,729
  53,052,790
  53,052,794
  53,052,798
  53,057,558
  53,057,619
  53,057,638
  53,057,647
  53,057,673
  53,057,674
  53,057,900
  53,057,905
  53,057,991
  53,058,180
  53,058,189
  53,058,329
  53,059,179
  53,059,181
  53,059,183
  53,059,185
  53,059,187
  53,059,189
  53,059,191
  53,059,727
  53,059,853
  53,059,925
  53,060,090
  53,060,093
  53,060,576
  53,065,202
  53,065,772
  53,066,854
  53,066,890
  53,067,679
  53,067,966
  53,068,014
  53,068,982
  53,069,492
  53,069,712
  53,069,830
  53,070,134
  53,070,364
  53,070,465
  53,070,747
  53,070,859
  53,071,237
  53,071,922
  53,072,121
  53,073,477
  53,073,754
  53,073,782
  53,073,829
  53,073,837
  53,073,921
  53,074,008
  53,074,180
  53,074,230
  53,074,458
  53,074,589
  53,074,755
  53,075,018
  53,075,178
  53,075,467
  53,075,782
  53,076,126
  53,076,129
  53,076,253
  53,076,365
  53,076,379
  53,076,719
  53,077,050
  53,077,196
  53,077,395
  53,079,166
  53,079,290
  53,079,486
  53,080,215
  53,080,883
  53,080,919
  53,081,707
  53,082,592
  53,082,817
  53,083,185
  53,083,719
  53,084,165
  53,084,747
  53,084,750
  53,085,103
  53,085,407
  53,085,451
  53,085,905
  53,085,987
  53,086,058
  53,086,545
  53,088,578
  53,088,655
  53,088,664
  53,089,131
  53,089,146
  53,089,165
  53,089,292
  53,089,402
  53,090,620
  53,090,682
  53,091,397
  53,091,559
  53,092,190
  53,092,483
  53,093,489
  53,094,072
  53,094,440
  53,094,760
  53,094,762
  53,095,007
  53,095,494
  53,097,417
  53,099,868
  53,100,538
  53,100,803
  53,100,826
  53,101,543
  53,101,565
  53,101,996
  53,102,879
  53,102,911
  53,103,125
  53,103,402
  53,104,200
  53,114,497
  53,114,510
  53,117,902
  53,119,510
  53,122,106
  53,123,207
  53,123,326
  53,123,768
  53,123,776
  53,123,982
  53,124,489
  53,124,767
  53,124,789
  53,127,057
  53,128,395
  53,128,826
  53,128,832
  53,128,838
  53,128,904
  53,129,504
  53,129,827
  53,129,858
  53,130,278
  53,130,916
  53,131,216
  53,131,643
  53,131,917
  53,132,306
  53,132,774
  53,133,087
  53,134,697
  53,135,563
  53,135,879
  53,136,330
  53,136,650
  53,137,263
  53,137,589
  53,138,594
  53,138,806
  53,138,962
  53,140,623
  53,141,110
  53,141,221
  53,141,350
  53,141,548
  53,141,714
  53,143,060
  53,143,276
  53,145,042
  53,145,203
  53,145,428
  53,146,003
  53,146,655
  53,146,879
  53,147,188
  53,147,407
  53,147,930
  53,148,027
  53,148,482
  53,149,590
  53,149,682
  53,150,545
  53,150,898
  53,150,994
  53,151,663
  53,153,004
  53,153,501
  53,153,682
  53,153,892
  53,154,667
  53,154,834
  53,155,026
  53,155,030
  53,155,037
  53,155,045
  53,155,378
  53,155,577
  53,155,584
  53,155,597
  53,156,042
  53,156,204
  53,156,664
  53,156,832
  53,156,958
  53,157,036
  53,157,094
  53,157,098
  53,157,691
  53,157,713
  53,157,847
  53,157,881
  53,158,018
  53,158,047
  53,158,352
  53,158,353
  53,158,356
  53,158,875
  53,158,905
  53,159,006
  53,159,105
  53,159,145
  53,159,622
  53,160,174
  53,160,373
  53,160,488
  53,160,751
  53,160,864
  53,160,925
  53,160,997
  53,161,009
  53,161,166
  53,161,766
  53,161,978
  53,162,105
  53,162,393
  53,162,649
  53,162,894
  53,163,114
  53,163,218
  53,163,285
  53,163,341
  53,163,702
  53,163,706
  53,165,030
  53,165,096
  53,165,199
  53,165,965
  53,166,856
  53,166,867
  53,167,280
  53,167,761
  53,167,867
  53,168,720
  53,168,806
  53,169,118
  53,169,158
  53,169,161
  53,169,384
  53,169,728
  53,169,729
  53,169,757
  53,169,866
  53,169,885
  53,169,964
  53,169,970
  53,170,319
  53,171,234
  53,171,746
  53,171,951
  53,172,369
  53,173,029
  53,173,221
  53,173,611
  53,173,870
  53,174,089
  53,174,303
  53,174,348
  53,174,418
  53,174,534
  53,174,718
  53,175,361
  53,175,483
  53,175,544
  53,175,650
  53,175,714
  53,175,923
  53,176,411
  53,176,713
  53,178,027
  53,178,089
  53,179,037
T
G
T
A
3
T
T
G
A
A
C
2
-
T
T
A
T
G
A
A
G
T
G
-
T
A
C
A
7
T
C
A
C
A
A/-
A
T
C
T
G
G
A
A
A
T
C
A
C
G
T
T
G
T
C
T
T
5
G
T
C/-
-/T
T
C
C/T
T
T
3
G
T
A
G
-
C
G
G
G
C
T
C
-
G
G
-
T
-
G
T
G
C
T
-
G
21
C
-
G
A/G
G
4
G
C
11
C
T
C
G
G
G
G
C
2
C
-/A
A/-
G/-
-/G
G/-
-/G
-/G
-/G
C
C
G
C
-
A
G
T
G
G
C
A
G
C
C
C
A
C
G
-
G
A
T
T
G
A
G
G
G
C
G
T
T
T
C
T
G
G
A
G
T
A
T
G
C
3
G
G
G
T/A
T
T
A
T
A
A
G
G
T
C
T
-
A
C
A
G
T
-
A
A
T
T
G
G
?
A
G
C
G
A
T
G
A
G
-
A
A
C
G
T
G
G
T
6
G
-
-
C
C
G
G
A/-
A
A
A
C
C
C
A
A
A
A
G
G
C
T
A
C
A
A
C
C
C
C
G
A
A
-
A
C
C
A
G
A
C
C
A
G
C
-
T
-
C
C
G
A
A
T
A
A
A
G
C
2
C
G
A
C
C
2
A
A
2
A
G
A
-
-
C
C
T
T
A
A
T
A
T
C
C
C
G
T
G
-
A
A
T
-/A
G
G
T
T
-/A
-
C
C
T
T
T
G
-/G
A
G
G
G
T
T
C
C
A
C
3
G
T
T
C
G
T
T
C
G
A
G
T
-
-/A
C
T
C
2
A
C
T/-
T/-
T/-
-/T
-/T
A/T
T
C
A
6
C
C
G
T
C
A
G
C
A
A
T
G
G
C
-/T
T
T
C
9
A
-
-
A
-
C
C
G
C
C
-
A
A
4
T
T
G
T
T
-
-/A
G
C
G
C
G
A
A
A
A
G
G
T
G
T
A
C
A
G
G
A
C
A
C
A
A/-
A
C
A
G
A
G
-
G
A
C
A
G
A
A
C
T
A
T
A
G
-/G
-/G
C
C
-
C
G
A
C
G
G
A
-
A/-
G
A
8
-
-/A
A
C
A
T
G
A
G
C
T
-
A
T
G/A
G/-
-/G
G
G
-
C
-
-
A
A
C
C
A
A
G
C
G
C
C
C
G
A
T
C
C
G
A
G
G
T
T
G
A
G
A
C
G
C
G
A
T
A
G
A
C
G
T
G
A
-
C
-
T
A
A
A
-
C
3
C
-
C
A
-
T
T
T
G
T
G
C
T
G
G
C
G
G
T
-
G/-
3
A
G
G
C
-
14/-
G
-
A
-
G
T
A
G
C
T
C
-
G
T
G
T
-
A
C
G
-
22
-
A
G
-
A/-
T
A
G
G
T
G
G
T
A
A
G
11
G
T
A
2
G
A
T
2
G
G
5
A
T
G
G
T
-
-
A
G
A
-
A
-
-
C
A
T
G
C