Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 191,310 (bp)   Positions: 424
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
F344/Stm (2019) 
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
Srpk2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
T
G
C
T
-
A
T
C
T
T
C
A
G
G
G
G
A
G
G
-
A
-
T
C
A
C
T
A
5
C
G
C
C
C
G
C
G
G
G
A
C
A
G
-
C
C
G
A
G
2
C
T
G
-
G
C
T
T
G
C
T
T
A
T
A
-
11
C
T
G
A
T
C
2
T
A
C
G
T
2
A
A
-
T
T
-
T
4
-
T
10
3
G
A
C
-
G
G
T
T
T
T
C
A
C
T
T
C
G
A
-
T
A
A
A
T
C
C
T
G
C
G
-
C
A
A
A
C
C
A
G
G
A
G
A
C
G
A
C
C
3
-
G
C
A
C
C
A
-
A
T
3
A
C
T
A
A
-
G
T
T
A
-
-
-
T
C
G
A
T
C
T
T
A
C
C
T
-
C
G
C
C
G
A
A
T
A
A
C
A
G
T
A
C
G
2
A
T
C
-
C
G
C
C
9
T
C
T
G
T
12
C
C
C
A
C
C
-
G
C
T
A
A
A
G
-
A
-
C
A
T
C
G
A
G
-
A
C
T
C
A
A
C
A
-
T
G
2
T
T
G
3
G
T
G
T
4
T
C
T
T
G
A
G
T
2
T
A
-
C
T
T
G
G
T
T
G
-
A
A
T
T
G
-
A
A
A
T
-
G
T
A
A
T
A
G
A
A
T
-
A
C
4
2
G
A
-
-
-
C
C
A
A
-
-
T
T
T
A
8
G
C
19
19
38
C
T
2
A
6
G
T
20
A
G
-
T
T
A
T
T
T
T
T
T
C
C
G
2
T
C
T
G
G
C
C
T
T
A
T
G
G
T
T
A
T
G
C
-
C
G
A
T
T
C
A
T
T
C
G
A
G
C
G
A
G
G
T
C
A
A
6
-
T
A
-
G
C
C
C
-
T
T
A
G
G
-
T
G
G
G
-
A
G
G
T
G
C
T
G
G
A
C
  11,464,809
  11,464,986
  11,465,003
  11,465,336
  11,465,416
  11,465,451
  11,465,769
  11,465,816
  11,465,926
  11,466,036
  11,466,069
  11,466,157
  11,466,322
  11,466,361
  11,466,363
  11,466,365
  11,466,367
  11,466,550
  11,468,152
  11,468,279
  11,468,543
  11,468,582
  11,468,860
  11,469,156
  11,469,292
  11,469,353
  11,469,634
  11,469,814
  11,469,948
  11,470,412
  11,470,417
  11,471,279
  11,471,605
  11,471,701
  11,472,008
  11,472,553
  11,472,768
  11,473,510
  11,473,796
  11,473,939
  11,474,103
  11,474,529
  11,475,454
  11,475,641
  11,475,786
  11,476,391
  11,476,966
  11,477,419
  11,477,564
  11,478,194
  11,478,215
  11,478,337
  11,478,404
  11,478,526
  11,478,551
  11,478,637
  11,478,662
  11,478,866
  11,479,686
  11,479,688
  11,479,845
  11,481,005
  11,481,078
  11,481,687
  11,482,083
  11,482,824
  11,482,872
  11,483,065
  11,483,100
  11,483,279
  11,483,514
  11,483,553
  11,483,643
  11,483,645
  11,484,088
  11,484,236
  11,484,481
  11,484,491
  11,484,619
  11,484,712
  11,485,000
  11,485,191
  11,485,388
  11,485,398
  11,485,595
  11,485,750
  11,486,071
  11,486,683
  11,487,580
  11,487,743
  11,487,839
  11,488,063
  11,488,086
  11,488,091
  11,488,179
  11,488,480
  11,488,977
  11,489,894
  11,490,278
  11,490,349
  11,490,448
  11,490,482
  11,490,620
  11,490,879
  11,491,103
  11,491,169
  11,491,232
  11,491,370
  11,491,411
  11,491,447
  11,491,577
  11,491,821
  11,492,335
  11,492,539
  11,494,266
  11,494,285
  11,494,302
  11,494,631
  11,494,769
  11,494,770
  11,494,825
  11,495,331
  11,495,469
  11,495,587
  11,496,058
  11,496,449
  11,496,737
  11,497,321
  11,497,763
  11,497,912
  11,498,295
  11,498,525
  11,498,696
  11,498,914
  11,499,034
  11,499,527
  11,499,531
  11,499,688
  11,499,754
  11,500,229
  11,500,364
  11,500,386
  11,500,477
  11,500,558
  11,500,574
  11,500,655
  11,500,810
  11,500,900
  11,501,006
  11,501,018
  11,501,030
  11,501,320
  11,501,394
  11,501,464
  11,502,032
  11,502,173
  11,502,992
  11,503,039
  11,503,225
  11,503,544
  11,503,998
  11,504,179
  11,504,218
  11,504,248
  11,504,272
  11,504,529
  11,504,748
  11,505,238
  11,505,407
  11,505,547
  11,505,820
  11,506,008
  11,506,217
  11,506,220
  11,506,501
  11,506,899
  11,506,963
  11,507,389
  11,508,005
  11,508,424
  11,508,625
  11,509,878
  11,509,891
  11,509,894
  11,510,029
  11,510,074
  11,510,075
  11,511,153
  11,511,160
  11,511,228
  11,511,504
  11,511,847
  11,512,035
  11,512,265
  11,512,350
  11,512,498
  11,513,232
  11,513,461
  11,513,485
  11,514,026
  11,515,373
  11,515,667
  11,515,799
  11,517,429
  11,517,803
  11,518,179
  11,519,030
  11,519,858
  11,523,607
  11,523,834
  11,524,310
  11,524,876
  11,526,492
  11,526,718
  11,526,961
  11,527,052
  11,527,640
  11,527,723
  11,527,867
  11,527,896
  11,527,899
  11,529,608
  11,529,927
  11,530,097
  11,530,388
  11,530,813
  11,532,326
  11,532,597
  11,533,379
  11,534,181
  11,534,398
  11,535,223
  11,535,744
  11,536,960
  11,537,294
  11,537,386
  11,537,419
  11,537,425
  11,538,544
  11,538,962
  11,539,130
  11,541,741
  11,543,894
  11,544,215
  11,544,345
  11,544,912
  11,545,063
  11,545,980
  11,546,509
  11,546,979
  11,547,031
  11,547,381
  11,547,725
  11,548,781
  11,548,806
  11,552,780
  11,552,813
  11,553,227
  11,553,277
  11,553,435
  11,553,554
  11,554,706
  11,555,460
  11,557,629
  11,558,151
  11,558,197
  11,558,516
  11,558,906
  11,561,287
  11,562,883
  11,563,280
  11,564,988
  11,564,990
  11,565,543
  11,565,579
  11,565,930
  11,566,422
  11,566,445
  11,566,481
  11,566,585
  11,566,626
  11,566,632
  11,566,655
  11,566,755
  11,566,777
  11,567,253
  11,568,196
  11,569,516
  11,569,840
  11,569,867
  11,571,394
  11,571,771
  11,571,910
  11,572,097
  11,573,267
  11,573,645
  11,574,001
  11,574,094
  11,574,301
  11,574,594
  11,576,769
  11,576,809
  11,577,104
  11,577,720
  11,577,732
  11,578,339
  11,578,761
  11,578,842
  11,578,844
  11,578,845
  11,579,335
  11,579,657
  11,579,791
  11,580,087
  11,580,291
  11,580,292
  11,580,420
  11,580,931
  11,581,756
  11,581,887
  11,583,311
  11,583,319
  11,583,461
  11,583,509
  11,583,599
  11,583,676
  11,585,081
  11,585,603
  11,587,731
  11,588,168
  11,588,528
  11,589,181
  11,590,195
  11,590,216
  11,590,771
  11,591,549
  11,591,880
  11,591,987
  11,592,361
  11,595,201
  11,595,254
  11,595,317
  11,596,150
  11,596,566
  11,596,728
  11,596,834
  11,597,526
  11,598,210
  11,598,610
  11,601,586
  11,601,935
  11,602,478
  11,602,918
  11,602,940
  11,603,729
  11,603,891
  11,604,220
  11,604,356
  11,604,380
  11,604,774
  11,604,832
  11,604,986
  11,605,319
  11,605,910
  11,607,809
  11,607,942
  11,609,902
  11,609,924
  11,611,324
  11,611,704
  11,613,732
  11,614,376
  11,614,949
  11,617,236
  11,617,305
  11,617,856
  11,619,347
  11,619,669
  11,619,898
  11,620,031
  11,620,158
  11,620,830
  11,621,013
  11,621,525
  11,621,529
  11,621,545
  11,621,924
  11,622,309
  11,623,126
  11,623,513
  11,624,568
  11,627,267
  11,627,590
  11,627,924
  11,629,062
  11,629,644
  11,630,081
  11,635,540
  11,636,845
  11,637,153
  11,638,152
  11,639,377
  11,639,405
  11,639,450
  11,640,148
  11,644,755
  11,645,302
  11,646,319
  11,646,603
  11,647,114
  11,648,202
  11,649,456
  11,649,568
  11,649,746
  11,650,196
  11,650,384
  11,650,510
  11,650,592
  11,650,598
  11,650,754
  11,653,567
  11,653,601
  11,653,719
  11,655,132
T
G
-
A
-
2
T
G
T
A
C
T
-
T
T
T
T
G
A
A
4
T
4
C
A
G
A
A
G
-
A
A
T
T
T
A
T
T
C
A
-
T
G
C
2
-
T
A
-
A
-
T
C
A
43
A
T
G
G
A
T
C
C
G
C
G
3
-
T
G
A
G
-
G
-
C
C
A
A
C
-
C
G
A
A
G
3
A
-
2
C
-
-
A
-
T
4
T
A
C
G
-
C
T
G
A
C
G
T
A
G
7
C
G
G
G
C
A
G
G
A
T
A
2
T
G
G
C
T
T
G
A
T
G
A
G
T
A
G
T
T
-
3
A
G
T
T
T
-
5
G
C
-
G
T
C
G
G
66
A
G
C
G
T
2
4
A
T
C
G
-
A
A
A
T
T
T
C
G
G
A
T
-
-
G
G
C
G
G
T
G
A
C
T
T
T
2/-
C
C
T
T
T
T
T
-
-
C
T
C
A
C
-
A
A
T
C
T
T
2
T
T
C
G
T
G
A
3
G
T
T
G
C
T
C
-
C
5
G
T
C
T
G
G
T
G
T
C
A
-
C
C
A
-
A
C
A
C
-
C
T
C
T/C
A
C
C
C
-
-
T
T
A
-
A
A
A
C
C
A
G
T
C
C
C
A
T
C
G
G
C
2
A
C
G
T
C
G
C
G
C
A
2
G
T
-
-
C
G
G
3
3
T
-
G
T
T
2
C
C
C
G
-
T
T
-
-
-
T
C
-
T
-
A
C
-
G
A
T
C
C
G
C
C
C
C
A
C
T
T
C
-
C
-
C
A
A
T
T
A
C
C
G
A
A
C
-
C
C
A
A
T
T
T
G
C
G
A
G
C
C
T
A
G
A
T
A
-
-
A
C
T
G
G
-
T
G
G
G
A
A
T
T
T
C
G
G
A
T
C
C
A
A
T
32
G
A
A
C
T
G
A
T
A
C
T