Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 175,188 (bp)   Positions: 438
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
Sptbn1
G
G
-
T
A
C
-
T
T
G
C
A
C
C
C
C
C
-
G
-
T
T
A
-
T
-
A
A
A
G
T
G
G
-
C
A
-
T
A
T
-
-
A
G
C
T
-
-
A
-
C
G
C
-
-
-
G
C
-
-
T
-
-
2
G
G
A
C
C
A
-
G
G
A
C
A
19
T
C
C
-
C
C
G
-
T
-
C
T
C
T
C
C
T
G
A
4
C
-
G
T
T
C
G
4
2
A
A
T
T
T
G
G
G
T
C
A
G
A
G
G
5
T
G
G
A
C
T
G
T
A
A
T
G
T
G
T
T
T
A
A
-
C
T
A
G
T
C
16
G
G
G
T
T
G
T
C
T
G
C
C
C
T
C
C
C
A
C
C
A
T
A
G
-
8
T
T
C
A
A
A
C
C
T
A
8
A
C
C
C
A
A
T
-
C
G
-
T
C
5
A
-
-
T
G
-
T
T
C
T
C
C
G
G
-
-
A
-
G
C
A
G
G
T
C
-
-
C
C
C
T
G
A
T
C
G
A
A
C
A
T
G
T
C
T
A
T
T
A
-
T
A
T
-
C
C
G
A
A
A
A
3
-
T
4
-
G
C
A
G
C
T
G
C
A
G
C
T
A
C
A
A
C
A
G
G
C
A
A
C
-
-
-
9
-
C
C
A
A
10
6
A
G
C
C
C
A
C
C
T
T
A
2
A
A
A
G
C
A
C
G
T
C
A
A
G
T
G
C
G
-
T
C
C
-
G
G
C
A
G
4
C
G
C
C
T
A
-
A
109
C
T
C
T
C
-
A
C
G
T
T
T
C
C
3
C
-
A
10
5
C
T
T
A
A
4
G
-
G
-
T
-
G
A
C
-
T
5
T
C
A
-
T
G
G
C
T
C
C
C
C
C
A
-
C
C
C
C
T
T
C
C
A
C
A
T
C
A
G
T
T
A
T
-
-
-
T
-
C
T
T
T
T
G
A
10
A
A
  103,842,135
  103,842,391
  103,844,230
  103,844,367
  103,845,804
  103,845,904
  103,848,475
  103,850,136
  103,850,309
  103,850,345
  103,850,480
  103,851,803
  103,853,629
  103,856,475
  103,858,996
  103,860,248
  103,861,115
  103,863,026
  103,864,500
  103,865,114
  103,867,203
  103,869,632
  103,870,562
  103,871,869
  103,873,654
  103,874,007
  103,875,011
  103,875,147
  103,875,403
  103,875,423
  103,875,628
  103,876,010
  103,876,614
  103,876,644
  103,876,810
  103,877,068
  103,877,975
  103,878,184
  103,879,076
  103,879,144
  103,879,200
  103,879,233
  103,879,966
  103,880,603
  103,880,875
  103,882,616
  103,883,360
  103,883,403
  103,883,885
  103,884,202
  103,884,206
  103,884,425
  103,884,745
  103,885,048
  103,885,443
  103,885,647
  103,886,461
  103,886,605
  103,886,628
  103,891,302
  103,894,958
  103,896,248
  103,896,398
  103,897,913
  103,898,630
  103,899,116
  103,901,143
  103,901,647
  103,901,934
  103,903,125
  103,904,146
  103,904,161
  103,904,165
  103,906,736
  103,907,534
  103,908,182
  103,912,016
  103,912,050
  103,912,491
  103,914,955
  103,915,438
  103,915,671
  103,916,303
  103,917,460
  103,917,480
  103,917,483
  103,917,485
  103,917,487
  103,919,066
  103,919,427
  103,920,194
  103,920,345
  103,920,350
  103,924,072
  103,924,983
  103,928,185
  103,928,434
  103,928,439
  103,928,441
  103,930,349
  103,933,366
  103,933,644
  103,933,860
  103,934,028
  103,934,240
  103,934,911
  103,935,407
  103,936,056
  103,937,499
  103,939,691
  103,939,979
  103,940,103
  103,940,555
  103,941,805
  103,941,922
  103,941,933
  103,941,937
  103,942,389
  103,942,554
  103,942,556
  103,942,559
  103,942,561
  103,942,569
  103,942,788
  103,942,830
  103,942,910
  103,943,019
  103,943,244
  103,943,267
  103,943,440
  103,943,499
  103,943,842
  103,944,309
  103,944,325
  103,944,528
  103,944,546
  103,944,892
  103,945,216
  103,945,247
  103,945,393
  103,945,680
  103,945,834
  103,945,960
  103,946,810
  103,947,052
  103,947,282
  103,947,825
  103,948,331
  103,948,468
  103,948,494
  103,948,680
  103,949,391
  103,949,442
  103,949,684
  103,950,561
  103,951,056
  103,951,774
  103,954,121
  103,955,799
  103,956,305
  103,957,713
  103,957,718
  103,957,815
  103,957,836
  103,957,839
  103,957,842
  103,957,892
  103,957,904
  103,958,048
  103,958,263
  103,958,624
  103,959,409
  103,959,572
  103,959,904
  103,960,038
  103,961,250
  103,961,282
  103,961,425
  103,961,802
  103,963,187
  103,963,208
  103,964,041
  103,965,528
  103,966,031
  103,968,476
  103,969,234
  103,971,298
  103,973,036
  103,973,037
  103,973,042
  103,973,050
  103,973,090
  103,973,111
  103,973,126
  103,973,136
  103,973,150
  103,973,160
  103,973,275
  103,973,943
  103,974,217
  103,976,181
  103,976,646
  103,976,714
  103,977,158
  103,978,816
  103,979,076
  103,979,407
  103,979,482
  103,980,326
  103,980,434
  103,980,477
  103,980,483
  103,980,485
  103,980,932
  103,981,023
  103,981,025
  103,981,090
  103,981,155
  103,981,320
  103,981,359
  103,981,513
  103,981,573
  103,981,694
  103,981,723
  103,981,812
  103,981,991
  103,982,126
  103,982,185
  103,982,200
  103,982,283
  103,982,619
  103,982,653
  103,982,832
  103,982,952
  103,983,071
  103,983,122
  103,983,137
  103,983,153
  103,983,204
  103,983,226
  103,983,368
  103,983,485
  103,983,567
  103,983,617
  103,983,620
  103,983,676
  103,983,684
  103,983,741
  103,983,764
  103,983,889
  103,983,977
  103,983,999
  103,984,160
  103,984,225
  103,984,329
  103,984,458
  103,984,510
  103,984,523
  103,984,762
  103,984,790
  103,984,800
  103,984,853
  103,984,858
  103,984,861
  103,984,865
  103,984,896
  103,984,990
  103,984,993
  103,985,019
  103,985,036
  103,985,042
  103,985,095
  103,985,119
  103,985,121
  103,985,239
  103,985,303
  103,985,386
  103,985,559
  103,985,589
  103,985,598
  103,985,632
  103,985,656
  103,985,696
  103,985,779
  103,986,021
  103,986,028
  103,986,057
  103,986,087
  103,986,160
  103,986,179
  103,986,202
  103,986,213
  103,986,214
  103,986,236
  103,986,249
  103,986,324
  103,986,328
  103,986,329
  103,986,368
  103,986,383
  103,986,431
  103,986,446
  103,986,497
  103,986,503
  103,986,528
  103,986,535
  103,986,609
  103,986,628
  103,986,722
  103,986,730
  103,986,746
  103,987,144
  103,987,199
  103,987,326
  103,987,364
  103,987,419
  103,987,529
  103,988,154
  103,988,213
  103,988,261
  103,988,288
  103,988,515
  103,988,530
  103,988,534
  103,988,606
  103,988,645
  103,988,776
  103,988,970
  103,989,100
  103,989,259
  103,989,346
  103,989,501
  103,989,613
  103,989,638
  103,989,667
  103,989,683
  103,989,701
  103,989,731
  103,989,756
  103,989,777
  103,989,996
  103,990,955
  103,991,118
  103,991,886
  103,991,933
  103,991,950
  103,992,349
  103,993,019
  103,993,460
  103,994,250
  103,994,542
  103,996,965
  103,997,253
  103,997,707
  103,998,741
  103,999,019
  103,999,027
  103,999,989
  104,000,034
  104,000,066
  104,000,209
  104,000,489
  104,000,813
  104,000,879
  104,000,881
  104,000,894
  104,000,928
  104,000,931
  104,001,058
  104,001,143
  104,001,490
  104,001,608
  104,001,632
  104,001,634
  104,001,636
  104,001,709
  104,001,727
  104,002,046
  104,002,581
  104,003,181
  104,003,605
  104,003,665
  104,004,028
  104,004,154
  104,004,262
  104,004,583
  104,004,650
  104,005,145
  104,005,524
  104,005,951
  104,007,600
  104,007,674
  104,008,264
  104,008,265
  104,008,356
  104,009,853
  104,010,048
  104,010,271
  104,010,273
  104,010,275
  104,010,277
  104,010,279
  104,011,102
  104,011,424
  104,011,428
  104,011,433
  104,012,011
  104,012,553
  104,012,557
  104,012,764
  104,013,020
  104,013,341
  104,013,469
  104,013,474
  104,013,480
  104,013,484
  104,013,608
  104,013,652
  104,013,678
  104,013,780
  104,013,802
  104,013,879
  104,014,008
  104,014,189
  104,014,215
  104,014,310
  104,014,314
  104,014,324
  104,014,493
  104,014,615
  104,014,635
  104,014,687
  104,014,798
  104,014,934
  104,015,071
  104,015,320
  104,015,331
  104,015,807
A
A
C
C
G
T
8
-
C
A
T
G
T
-
A
T
G
2
A
T
C
A
G
T
C
T
G
G
G
A
C
A
-
C
-
-
3
A
T
-
G
C
G
A
T
C
G
T
G
A
A
A
T
A
A
C
A
T
A
10
-
C
A
-
-
A
G
T
T
G
G
-
A
G
A
G
-
-
-
-
G
T
T
-
10
-
4
T
-
-
G
-
T
C
A
C
-
A
G
A
C
C
T
A
-
-
G
G
C
C
C
A
A
A
C
G
G
A
-
C
-
-
C
A
C
G
T
A
-
C
G
G
C
A
C
A
-
C
C
G
G
2
G
C
G
C
C
T
-
A
T
T
C
C
A
C
T
C
C
T
T
T
C
-
G
T
C
T
G
G
A
G
A
A
-
-
C
T
G
C
G
A
T
C
G
-
G
T
G
A
G
G
A
18
T
A
G
C
A
-
G
T
T
C
A
4
-
A
T
A
A
T
A
A
4
2
G
2
A
A
G
A
A
C
T
C
10
T
T
G
C
A
G
C
T
C
C
G
T
G
C
C
G
A
C
G
C
G
C
3
C
C
G
A
G
A
A
G
G
G
C
-
4
C
-
T
A
G
G
C
T
C
A
T
C
A
T
C
G
T
G
G
-
G
A
A
T
G
G
T
A
A
12
-
7
T
T
G
G
-
-
G
A
T
T
T
G
T
G
C
C
G
-
G
G
C
A
T
G
T
A
C
G
T
C
A
C
A
A
A
10
C
A
T
4
A
A
A
-
A
-
T
A
T
T
C
G
T
C
-
T
-
-
C
T
C
C
A
T
A
C
C
T
T
-
A
2
-
-
-
-
G
G
G
G
-
A
4
A
4
A
G
A
G
T
G
C
-
A
T
C
T
C
A
A
T
-
A
A
A
A
A
G
-/C
A
A
T
A
C
G
A
T
C
A
G
G
G
C
T
C
G
T
G
2
4
7
G
9
T
C
C
C
C
A
G
-
G
G