Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly mRatBN7.2

Genes ( + )

Genes ( + )

Genes ( - )

mRatBN7.2

BXH2/CubMcwi (2020)


Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16										Spag16
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
-	A	A	G	G	C	C	C	C	C	C	G	3	G	T	A	G	C	C	C	C	-	T	-	A	C	A	T	-	T	C	T	C	-	-	A	A	A	-	A	-	-	A	-	-	-	-	A	A	-	-	G	C	T	A	-	T	G	-	-	-	-	-	-	C	-	A	-	-	A	A	-	A	-	-	-	-	-	G	C	T	-	-	-	G	-	2	C	-	-	-	A	C	-	A	A	T	T	G	A	-	-	A	-	C	G	A	T	-	T	A	A	-	-	A	G	A	-	A	A	T	A	-	-	A	A	-	T	T	2	A	A	-	A	-	A	A	-	A	G	T	-	-	-	C	A	G	A	-	C	C	G	-	A	A	2	A	-	C	A	-	A	-	G	C	A	A	C	C	T	-	A	G	-	T	C	T	-	A	C	G	-	G	-	-	A	A	T	A	-	T	T	A	A	C	T	-	-	A	T	A	-	A	-	C	-	T	-	A	G	T	T	A	A	A	A	-	A	A	A	A	A	A	G	C	G	G	A	T	T	T	2	A	-	C	T	-	-	2	2	-	A	G	C	A	C	T	T	G	-	-	A	A	-	A	A	-	-	-	T	G	-	-	2	2	C	C	G	A	A	G	A	-	A	-	T	A	2	G	G	-	-	A	-	-	G	-	T	G	A	C	G	T	A	-	G	A	G	-	-	G	G	2	T	A	T	G	-	G	C	T	T	-	G	G	2	T	G	A	-	C	-	G	G	-	-	-	-	-	G	G	A	G	A	A	-	T	C	A	G	-	-	-	-	C	A	A	-	-	A	C	G	G	G	A	G	G	-	-	G	G	A	T	2	-	G	A	A	-	-	-	-	G	G	G	T	-	G	T	G	A	-	T	-	G	G	A	C	G	A	A	-	G	-	-	G	C	-	2	-	-	-	T	T	-	A	2	A	G	C	-	G	-	-	-	-	C	-	T	-	-	G	G	T	T	A	2	G	C	C	C	G	-	G	T	G	A	G	T	C	-	-	A	G	G	G	T	A	-	T	2	G	-	G	G	G	G	2	T	-	-	-	G	G	-	G	-	T	-	-	2	T	A	-	G	T	G	G	A	A	T	-	G	-	-	-	G	-	C	T	-	-	-	G	G	-	-	T	-	G	-	-	A	G	-	T	-	G	-	A	T	2	G	-	A	C	A	G	A	T	G	-	A	A	G	-	T	-	-	-	T	-	A	G	A	G	G	-	A	T	-	T	A	T	T	T	-	-	-	C	G	T	C	-	T	-	-	C	C	-	A	-	-	T	T	-	-	-	G	A	A	C	G	G	A	G	A	G	A	2	A	G	-	A	C	G
71,335,239	71,355,729	71,450,674	71,554,801	71,569,993	71,629,420	71,629,424	71,629,426	71,629,428	71,629,429	71,670,262	71,729,012	71,777,377	71,780,797	71,780,801	71,787,323	71,793,352	71,793,961	71,794,780	71,796,540	71,796,584	71,798,616	71,799,371	71,800,166	71,800,382	71,801,277	71,802,175	71,802,489	71,802,536	71,802,642	71,802,787	71,802,937	71,803,407	71,803,572	71,804,604	71,804,709	71,804,828	71,804,838	71,805,192	71,805,356	71,805,411	71,805,497	71,806,135	71,806,330	71,806,534	71,806,741	71,806,949	71,807,326	71,807,724	71,807,797	71,807,831	71,807,978	71,808,186	71,808,282	71,808,283	71,808,293	71,808,310	71,808,396	71,808,405	71,808,554	71,808,615	71,808,789	71,808,841	71,808,891	71,808,935	71,809,024	71,809,479	71,809,620	71,809,729	71,809,862	71,809,956	71,809,984	71,810,080	71,810,123	71,810,175	71,810,320	71,810,338	71,810,421	71,810,468	71,810,585	71,810,694	71,810,718	71,810,844	71,810,969	71,810,976	71,811,018	71,811,098	71,811,123	71,811,255	71,811,302	71,811,330	71,811,333	71,811,339	71,811,351	71,811,405	71,811,487	71,811,550	71,811,558	71,811,568	71,811,612	71,811,629	71,811,658	71,811,687	71,812,085	71,812,241	71,812,330	71,812,363	71,812,452	71,812,521	71,812,673	71,813,105	71,813,184	71,813,271	71,813,297	71,813,337	71,813,370	71,813,398	71,813,411	71,813,433	71,813,499	71,813,509	71,813,514	71,813,535	71,813,626	71,813,798	71,813,848	71,813,892	71,813,959	71,813,990	71,814,210	71,814,223	71,814,240	71,814,271	71,814,645	71,814,669	71,814,745	71,814,770	71,814,782	71,815,023	71,815,026	71,815,148	71,815,229	71,815,250	71,815,288	71,815,322	71,815,406	71,815,441	71,815,586	71,815,686	71,815,731	71,815,854	71,815,897	71,815,971	71,815,979	71,815,981	71,815,987	71,816,005	71,816,043	71,816,053	71,816,065	71,816,068	71,816,106	71,816,188	71,816,214	71,816,262	71,816,263	71,816,283	71,816,285	71,816,323	71,816,328	71,816,333	71,816,364	71,816,372	71,816,394	71,816,470	71,816,488	71,816,519	71,816,568	71,816,669	71,816,744	71,816,864	71,816,914	71,817,059	71,817,087	71,817,193	71,822,594	71,822,966	71,822,978	71,823,034	71,823,037	71,823,077	71,823,095	71,823,178	71,823,234	71,823,246	71,823,305	71,823,311	71,823,376	71,823,384	71,823,452	71,823,493	71,823,504	71,823,517	71,823,535	71,823,558	71,823,560	71,823,566	71,823,598	71,823,602	71,823,615	71,823,617	71,823,647	71,823,649	71,823,659	71,823,664	71,823,667	71,823,682	71,823,698	71,823,715	71,823,738	71,823,750	71,823,755	71,823,761	71,823,762	71,823,782	71,823,793	71,823,819	71,823,834	71,823,849	71,823,851	71,823,868	71,823,897	71,823,901	71,823,904	71,823,912	71,823,920	71,823,926	71,823,941	71,823,959	71,823,985	71,824,015	71,824,021	71,824,034	71,824,057	71,824,168	71,824,203	71,824,205	71,824,219	71,824,250	71,824,268	71,824,285	71,824,302	71,824,369	71,824,379	71,824,442	71,824,456	71,824,467	71,825,061	71,825,106	71,825,108	71,825,117	71,825,248	71,825,285	71,825,354	71,825,428	71,825,581	71,825,612	71,825,624	71,825,635	71,825,656	71,825,782	71,825,783	71,825,792	71,825,898	71,825,922	71,825,944	71,825,980	71,825,989	71,825,995	71,826,010	71,826,024	71,826,027	71,826,065	71,826,091	71,826,173	71,826,225	71,826,234	71,826,248	71,826,255	71,826,303	71,826,327	71,826,340	71,826,377	71,826,437	71,826,449	71,826,473	71,826,496	71,826,516	71,826,533	71,826,556	71,826,576	71,826,592	71,826,625	71,826,688	71,826,691	71,826,727	71,826,728	71,826,746	71,826,759	71,826,763	71,826,765	71,826,785	71,826,794	71,826,826	71,826,851	71,826,898	71,826,902	71,826,994	71,826,995	71,827,057	71,827,143	71,827,177	71,827,183	71,827,187	71,827,208	71,827,362	71,827,422	71,827,428	71,827,514	71,827,551	71,827,599	71,827,634	71,827,667	71,827,739	71,827,764	71,827,780	71,827,828	71,827,866	71,827,895	71,827,919	71,827,979	71,828,016	71,828,160	71,828,225	71,828,320	71,828,345	71,828,497	71,828,507	71,828,578	71,828,630	71,828,714	71,828,718	71,828,733	71,828,780	71,828,784	71,828,787	71,828,873	71,828,894	71,828,900	71,828,919	71,828,933	71,828,979	71,828,991	71,829,016	71,829,026	71,829,035	71,829,077	71,829,107	71,829,156	71,829,164	71,829,191	71,829,239	71,829,289	71,829,298	71,829,357	71,829,390	71,829,407	71,829,521	71,829,533	71,829,570	71,829,571	71,829,593	71,829,609	71,829,692	71,829,697	71,829,710	71,829,722	71,829,763	71,829,840	71,829,866	71,829,881	71,829,921	71,829,942	71,829,948	71,829,955	71,829,978	71,830,024	71,830,053	71,830,074	71,830,079	71,830,080	71,830,086	71,830,093	71,830,098	71,830,162	71,830,172	71,830,223	71,830,233	71,830,237	71,830,245	71,830,253	71,830,260	71,830,327	71,830,338	71,830,345	71,830,425	71,830,429	71,830,461	71,830,501	71,830,519	71,830,529	71,830,583	71,830,619	71,830,697	71,830,722	71,830,766	71,830,797	71,830,798	71,830,805	71,830,820	71,830,861	71,830,880	71,830,913	71,830,938	71,831,510	71,831,521	71,831,587	71,831,594	71,831,616	71,831,636	71,831,663	71,831,702	71,831,776	71,831,778	71,831,784	71,831,809	71,831,876	71,831,932	71,831,971	71,832,030	71,832,085	71,832,137	71,832,202	71,832,237	71,832,279	71,832,285	71,832,306	71,832,340	71,832,391	71,832,403	71,832,427	71,832,451	71,832,551	71,832,633	71,832,638	71,832,642	71,832,654	71,832,669	71,832,679	71,832,728	71,832,745	71,832,769	71,832,772	71,832,783	71,832,831	71,832,859	71,832,866	71,832,923	71,832,952	71,833,004	71,833,020	71,833,057	71,833,059	71,833,073	71,833,075	71,833,083	71,833,130	71,833,141	71,833,173	71,833,174	71,833,183	71,833,204	71,833,206	71,833,285	71,833,325	71,833,331	71,833,432	71,833,448	71,833,504	71,833,568	71,833,684	71,833,687	71,833,715	71,833,757	71,833,772	71,833,792	71,833,831	71,833,836	71,833,858	71,833,864	71,833,867	71,833,875	71,834,078	71,834,135	71,834,139	71,834,147	71,834,175	71,834,206	71,834,237	71,834,247	71,834,271	71,834,284	71,834,327	71,834,340	71,834,390	71,834,402	71,834,531	71,834,688	71,834,770	71,834,787	71,834,800	71,834,938	71,835,055	71,835,091	71,835,132	71,835,182	71,835,192	71,835,220	71,835,299	71,835,421	71,835,472	71,835,572	71,835,573	71,835,588	71,835,635	71,835,667	71,835,773	71,835,895	71,835,949	71,836,026	71,836,342	71,836,662	71,836,703	71,836,778	71,836,955	71,837,012	71,837,169	71,837,452	71,837,807	71,837,960	71,838,466	71,838,840	71,839,083	71,839,398	71,839,679	71,839,906	71,840,076	71,840,435	71,840,719	71,840,747	71,845,906	71,858,512	71,920,341	71,920,343	71,920,344	71,920,345	71,920,346	71,920,347	71,920,348	71,925,370	71,946,572	71,960,850	72,038,942	72,042,290	72,042,297	72,213,868
A	-	-/G	-/T	A/-	-/T	T/-	T/-	-/T	T/-	A/-	G/C	3/-	G/A	T/C	-	-	-	-	T	T/-	G	-	A	-	C/T	-	-	G	A	-	-	-	T	T	-	T	C	A	-	T	A	-	C	A	C	A	-	T	T	C	-	-	A	T	T	-	-	C	A	C	A	T	A	-	A	T	T	A	-	-	G	T	T	T	G	C	A	-	A	-	T	T	T	T	T	-	-/T	A	C	T	T	-	T	-	-	-	-	A	-	A	A	-	C	-	-	-	-	T	C	T	T	T	T	T	-	T	C	T	T	G	T	A	T	T	T	T	-	-	-	-	T	T	-	A	-	-	T	G	A	A	T	A	T	-	-	-	-	A	-	-	-	G	-	T	-	C	G	A	G	T	-	C	-	G	C	T	A	-	-	G	T	-	T	A	-	-	A	-	A	-	G	-	A	A	-	T	-	-	C	-	-	-	T	A	-	T	T	T	A	T	C	T	A	A	T	-	A	T	-	A	-	-	-	T	T	T	T	-	T	-	T	-	T	-	-	-	T	-	A	-	-	T	A	-	-	T	T/T	-	-	T	T	-	-	T	T	-	-	-	T	C	-	-	C	-	T	A	G	A	A	-	T	T	-	-	-	A	-	-	T	T	T	A	-	T	A	-	-	-	-	A	A	T	T	A	-	G	-	-	C	-	-	-	-	A	-	-	-	G	T	-	-	-	A	T	A	T	T	-	A	-	A	A	-	T	-	A	A	T	C	-	G	-	-	A	T	G	C	C	-	-	-	T	-	-	A	-	-	-	T	A	T	A	G	G	-	-	A	T	T	-	-	-	T	-	-	T	G	T	-	T	-	-	-	T	-	-	C	G	T	A	A	-	T	-	A	T	-	C	A	G	G	-	T	T	-	-	-	T	-	-	G	-	T	G	-	-	T	-	T	2	G	-	G	A	-	-	T	-	-	A	T	A	G	A	A	-	C	C/-	A	C	T	-	-	-	-	-	T/-	-	-	-	T	C	-	A	T	C	-	-	-	2	A	-	T	-	-	-	-	T	G	-	T	T	-	-	-	-	-	A	T	C	A	-	T	2	-	T	C	G	G	-	G	-	T	T	-	-	-	-	-	A	G	-	G	G	G	-	T	T	A	G	T	A	-	-	G	T	-	T	-	G	T	-	T	A	G	A	-	T	T	A/G	-	-	G	T	A	T	-	-	A	-	G	-	-	A	A	-	T	A	A	-	G	-	T	-	T	-	T	-	-	T	A	T	-	G/-	-	T	G	T	-	-	-	-	C	-	C	G	-	-	G	-	G	G	-	-	C	G	T	-	-	-	-/G	C/-	C/-	-/T	C/-	T/-	C/-	T/-	2/-	-	A/-	2	G/-	T/-	G/C