Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 339,598 (bp)   Positions: 739
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
Slit2
A
T
G
A
G
T
G
A
C
G
G
T
A
G
A
G
C
C
-
G
T
A
G
107
G
C
-
G
A
C
G
-
C
C
G
T
A
A
T
A
A
G
C
T
T
T
C
A
C
G
C
C
T
C
A
T
T
T
T
C
G
T
C
A
T
T
T
G
A
C
C
G
T
A
G
T
C
T
-
A
T
C
G
A
A
-
A
T
-
G
C
5
C
T
C
G
T
C
T
T
T
C
G
A
T
T
T
T
T
C
G
G
A
C
A
G
A
T
G
G
T
G
A
C
C
A
T
T
3
G
A
C
T
C
C
A
C
G
A
T
C
T
T
G
T
G
T
T
C
A
G
G
T
T
T
-
C
A
A
A
A
A
A
A
A
A
T
T
T
C
C
C
-
A
G
A
C
A
T
T
A
G
T
G
A
C
G
C
T
C
T
G
C
C
A
-
G
2
T
T
T
C
G
A
C
G
T
G
T
C
G
C
C
A
T
T
A
G
G
G
T
C
C
C
-
G
T
A
10
G
T
C
A
A
A
C
A
A
G
A
C
C
T
T
A
A
-
G
T
T
3
T
T
C
C
T
G
T
T
A
-
-
C
A
A
C
115
A
C
T
G
T
T
G
T
A
A
G
C
T
G
A
T
A
A
T
G
-
T
T
A
-
A
C
A
2
-
G
A
T
G
A
A
A
T
10
T
T
C
-
C
A
2
G
C
2
-
G
T
G
A
-
G
T
2
G
T
T
4
3
4
C
T
T
T
-
A
T
T
T
C
T
2
2
G
T
T
T
T
T
T
A
A
T
T
G
C
A
G
A
G
C
C
-
T
G
T
A
13
A
A
A
T
T
T
A
C
-
A
A
C
T
G
A
C
G
G
-
G
-
G
G
A
G
G
G
C
C
A
T
A
A
C
T
T
T
A
G
T
A
C
-
T
T
A
G
A
A
-
C
A
C
T
G
G
G
T
A
T
A
G
G
A
T
T
C
G
C
C
T
T
G
C
C
C
C
G
A
A
T
G
A
A
A
A
G
G
3
C
C
C
T
-
G
A
C
T
C
A
T
T
T
C
T
G
G
G
T
C
A
T
G
T
C
A
C
A
A
11
G
G
G
A
A
G
A
T
A
G
A
-
G
T
A
G
G
A
A
G
T
2
C
2
-
C
C
A
68
G
T
-
A
C
C
A
A
T
2
G
A
T
A
A
G
G
G
A
G
A
G
T
T
T
T
C
T
G
A
C
T
T
C
C
A
-
G
T
A
T
T
C
C
T
A
C
C
C
A
A
A
C
G
G
A
T
A
G
G
C
A
G
T
C
A
C
G
-
A
C
A
A
-
A
A
T
T
G
T
C
A
T
G
T
T
T
G
A
G
T
C
-
A
A
G
T
T
-
C
2
T
4
G
A
C
A
G
T
T
A
A
A
A
A
G
G
G
T
A
A
A
-
T
-
T
C
6
C
C
C
A
T
G
G
A
T
A
T
C
T
-
G
A
T
G
T
G
T
T
C
A
A
A
2
G
-
T
T
A
A
G
C
2
C
A
A
A
A
G
C
A
-
A
G
C
T
A
A
A
T
T
A
G
T
C
A
-
A
A
G
T
-
A
G
G
A
T
C
T
G
T
A
T
G
A
T
-
T
T
G
T
C
C
G
T
A
C
C
G
G
  62,616,524
  62,616,526
  62,617,210
  62,617,832
  62,619,567
  62,620,333
  62,620,334
  62,621,118
  62,621,182
  62,621,630
  62,621,882
  62,622,771
  62,622,788
  62,623,573
  62,623,728
  62,624,311
  62,625,010
  62,625,219
  62,625,517
  62,626,364
  62,627,006
  62,627,500
  62,627,523
  62,627,580
  62,628,325
  62,628,685
  62,628,868
  62,629,375
  62,629,532
  62,629,569
  62,630,143
  62,630,486
  62,630,694
  62,630,700
  62,630,759
  62,630,822
  62,630,901
  62,630,988
  62,631,020
  62,631,059
  62,631,294
  62,631,450
  62,631,492
  62,631,507
  62,631,563
  62,631,771
  62,632,221
  62,632,222
  62,632,466
  62,632,934
  62,633,600
  62,633,672
  62,633,757
  62,633,981
  62,634,578
  62,634,861
  62,634,887
  62,634,938
  62,635,016
  62,635,720
  62,635,936
  62,636,078
  62,636,211
  62,636,533
  62,636,534
  62,636,845
  62,636,855
  62,636,856
  62,637,300
  62,637,909
  62,638,087
  62,638,321
  62,638,437
  62,638,495
  62,638,542
  62,638,715
  62,638,895
  62,639,348
  62,639,965
  62,640,197
  62,640,321
  62,640,906
  62,641,721
  62,641,781
  62,642,129
  62,642,159
  62,642,184
  62,642,472
  62,642,535
  62,642,976
  62,643,160
  62,648,195
  62,650,093
  62,650,273
  62,650,274
  62,650,306
  62,651,123
  62,652,334
  62,652,400
  62,653,217
  62,653,324
  62,653,673
  62,654,853
  62,655,174
  62,655,219
  62,655,221
  62,655,223
  62,655,225
  62,655,227
  62,655,243
  62,656,428
  62,656,452
  62,657,036
  62,657,541
  62,657,589
  62,658,145
  62,658,508
  62,659,637
  62,660,287
  62,660,714
  62,660,742
  62,661,914
  62,662,690
  62,663,675
  62,664,455
  62,664,701
  62,665,148
  62,665,780
  62,666,036
  62,666,063
  62,666,632
  62,667,380
  62,667,383
  62,668,281
  62,668,353
  62,668,356
  62,668,448
  62,668,572
  62,668,735
  62,668,865
  62,669,149
  62,669,231
  62,669,232
  62,669,333
  62,669,396
  62,669,493
  62,669,914
  62,670,219
  62,670,250
  62,670,409
  62,670,488
  62,670,504
  62,670,594
  62,670,601
  62,670,622
  62,670,764
  62,671,222
  62,671,254
  62,671,256
  62,671,258
  62,671,260
  62,671,262
  62,671,264
  62,671,266
  62,671,268
  62,671,270
  62,671,614
  62,671,719
  62,671,831
  62,671,838
  62,671,960
  62,671,987
  62,672,092
  62,672,267
  62,672,761
  62,673,358
  62,673,369
  62,673,523
  62,673,698
  62,673,728
  62,673,868
  62,674,500
  62,674,545
  62,674,655
  62,674,762
  62,675,417
  62,675,521
  62,675,522
  62,675,768
  62,675,780
  62,675,914
  62,675,923
  62,675,945
  62,675,947
  62,676,110
  62,676,303
  62,676,313
  62,676,334
  62,676,348
  62,676,354
  62,676,360
  62,676,372
  62,676,677
  62,676,690
  62,676,809
  62,676,944
  62,677,154
  62,677,181
  62,677,199
  62,677,258
  62,677,261
  62,677,387
  62,677,548
  62,677,591
  62,677,822
  62,677,864
  62,677,933
  62,678,029
  62,678,103
  62,678,156
  62,678,191
  62,678,212
  62,678,257
  62,678,449
  62,678,708
  62,678,738
  62,678,985
  62,679,687
  62,679,710
  62,679,783
  62,681,008
  62,681,101
  62,681,152
  62,681,559
  62,681,608
  62,681,617
  62,681,644
  62,681,684
  62,681,688
  62,682,148
  62,682,172
  62,682,197
  62,682,425
  62,682,472
  62,682,479
  62,682,721
  62,682,759
  62,682,816
  62,682,821
  62,682,922
  62,682,977
  62,683,021
  62,683,115
  62,683,161
  62,683,162
  62,683,237
  62,687,001
  62,687,695
  62,687,900
  62,689,369
  62,690,101
  62,691,412
  62,693,029
  62,693,536
  62,698,656
  62,698,999
  62,700,151
  62,701,242
  62,701,946
  62,701,998
  62,703,796
  62,704,179
  62,704,741
  62,704,822
  62,704,825
  62,704,887
  62,704,896
  62,705,658
  62,705,676
  62,705,925
  62,706,525
  62,706,535
  62,706,695
  62,706,788
  62,707,013
  62,707,130
  62,709,254
  62,709,504
  62,709,551
  62,710,299
  62,711,222
  62,712,036
  62,712,049
  62,713,988
  62,714,150
  62,714,625
  62,715,648
  62,716,095
  62,716,102
  62,717,096
  62,717,498
  62,717,685
  62,718,511
  62,719,082
  62,719,206
  62,719,327
  62,719,438
  62,719,440
  62,719,662
  62,719,924
  62,720,143
  62,720,279
  62,723,440
  62,725,725
  62,726,402
  62,728,754
  62,729,222
  62,729,285
  62,730,105
  62,733,103
  62,733,491
  62,733,543
  62,733,874
  62,734,211
  62,734,901
  62,736,091
  62,737,074
  62,737,124
  62,737,890
  62,737,909
  62,737,915
  62,738,410
  62,740,223
  62,743,734
  62,744,282
  62,744,830
  62,745,474
  62,745,620
  62,745,902
  62,748,851
  62,749,187
  62,755,133
  62,755,570
  62,756,486
  62,756,820
  62,757,027
  62,757,029
  62,757,037
  62,757,039
  62,757,051
  62,757,053
  62,757,163
  62,757,549
  62,757,770
  62,758,583
  62,759,092
  62,759,924
  62,762,679
  62,763,888
  62,764,129
  62,764,135
  62,764,295
  62,764,666
  62,765,358
  62,765,866
  62,766,211
  62,767,006
  62,767,017
  62,767,087
  62,767,101
  62,767,103
  62,767,105
  62,767,336
  62,768,532
  62,768,667
  62,768,762
  62,769,207
  62,770,027
  62,770,201
  62,770,395
  62,770,604
  62,770,817
  62,770,894
  62,770,929
  62,770,938
  62,771,047
  62,771,545
  62,771,758
  62,772,099
  62,772,320
  62,772,562
  62,772,985
  62,773,067
  62,773,239
  62,773,249
  62,773,351
  62,773,633
  62,773,714
  62,773,930
  62,774,117
  62,774,181
  62,774,238
  62,774,437
  62,774,457
  62,774,459
  62,774,654
  62,774,776
  62,774,853
  62,775,330
  62,775,445
  62,776,132
  62,776,349
  62,776,926
  62,777,028
  62,777,241
  62,777,539
  62,777,559
  62,777,643
  62,778,028
  62,778,198
  62,778,560
  62,778,633
  62,778,643
  62,780,063
  62,781,032
  62,783,280
  62,783,297
  62,783,488
  62,784,228
  62,784,400
  62,784,995
  62,785,120
  62,785,782
  62,785,950
  62,786,189
  62,786,466
  62,786,822
  62,787,087
  62,788,192
  62,788,280
  62,789,010
  62,789,332
  62,789,967
  62,790,008
  62,790,963
  62,790,987
  62,791,435
  62,792,443
  62,792,555
  62,792,791
  62,793,148
  62,794,935
  62,795,424
  62,795,652
  62,795,723
  62,795,765
  62,795,867
  62,796,037
  62,796,458
  62,798,176
  62,798,359
  62,798,910
  62,799,179
  62,800,327
  62,801,178
  62,801,427
  62,801,465
  62,801,540
  62,801,615
  62,801,634
  62,801,921
  62,801,924
  62,802,388
  62,802,450
  62,802,621
  62,802,836
  62,803,019
  62,803,048
  62,803,097
  62,803,625
  62,803,849
  62,803,940
  62,803,952
  62,804,169
  62,804,250
  62,804,458
  62,804,567
  62,805,180
  62,805,665
  62,806,590
  62,808,530
  62,809,392
  62,811,176
  62,812,107
  62,812,283
  62,816,941
  62,821,658
  62,821,660
  62,823,667
  62,824,052
  62,824,121
  62,824,131
  62,825,609
  62,827,801
  62,827,939
  62,828,377
  62,828,989
  62,829,056
  62,829,600
  62,829,946
  62,830,052
  62,830,557
  62,830,623
  62,830,735
  62,830,800
  62,830,808
  62,831,367
  62,831,721
  62,831,919
  62,832,492
  62,832,558
  62,832,802
  62,832,803
  62,833,256
  62,834,336
  62,835,544
  62,835,975
  62,836,540
  62,836,613
  62,838,346
  62,838,447
  62,838,556
  62,838,810
  62,838,929
  62,838,986
  62,839,032
  62,839,117
  62,839,159
  62,839,300
  62,839,543
  62,839,658
  62,839,844
  62,839,915
  62,839,974
  62,840,172
  62,840,772
  62,841,459
  62,841,460
  62,842,213
  62,842,492
  62,843,024
  62,843,286
  62,843,794
  62,844,024
  62,844,327
  62,844,355
  62,844,907
  62,845,787
  62,845,928
  62,848,087
  62,848,190
  62,848,435
  62,848,484
  62,848,725
  62,848,733
  62,849,506
  62,849,690
  62,850,779
  62,851,698
  62,852,100
  62,853,324
  62,855,128
  62,855,287
  62,855,367
  62,855,503
  62,855,542
  62,855,808
  62,856,368
  62,856,695
  62,856,696
  62,857,108
  62,857,409
  62,857,564
  62,857,774
  62,858,036
  62,858,084
  62,858,263
  62,858,353
  62,858,570
  62,861,006
  62,861,294
  62,863,402
  62,863,403
  62,863,437
  62,865,093
  62,865,833
  62,866,008
  62,866,450
  62,866,461
  62,866,943
  62,867,777
  62,868,515
  62,868,769
  62,873,149
  62,873,921
  62,874,466
  62,874,522
  62,874,907
  62,875,425
  62,875,945
  62,876,082
  62,876,491
  62,876,505
  62,877,450
  62,878,144
  62,878,153
  62,878,432
  62,878,471
  62,878,490
  62,878,520
  62,878,985
  62,879,187
  62,879,753
  62,882,097
  62,882,376
  62,882,761
  62,883,178
  62,883,809
  62,884,018
  62,884,111
  62,885,334
  62,885,768
  62,886,695
  62,887,077
  62,887,119
  62,887,398
  62,888,178
  62,889,173
  62,889,202
  62,890,597
  62,891,822
  62,892,130
  62,892,647
  62,893,785
  62,893,797
  62,893,800
  62,893,805
  62,893,824
  62,894,144
  62,894,153
  62,894,482
  62,894,676
  62,894,963
  62,895,334
  62,895,386
  62,895,418
  62,896,040
  62,896,529
  62,896,564
  62,896,702
  62,898,323
  62,898,761
  62,901,137
  62,901,625
  62,902,124
  62,903,329
  62,905,065
  62,907,294
  62,909,585
  62,910,323
  62,910,325
  62,911,761
  62,912,066
  62,912,072
  62,912,679
  62,913,186
  62,913,621
  62,914,033
  62,914,038
  62,914,991
  62,915,290
  62,919,702
  62,922,624
  62,923,756
  62,924,915
  62,925,583
  62,929,466
  62,931,854
  62,935,814
  62,936,291
  62,937,223
  62,937,269
  62,938,210
  62,938,213
  62,938,235
  62,938,296
  62,938,773
  62,938,983
  62,939,744
  62,940,181
  62,940,288
  62,940,781
  62,941,426
  62,941,638
  62,942,041
  62,942,376
  62,943,269
  62,943,298
  62,943,398
  62,943,582
  62,944,117
  62,944,499
  62,944,669
  62,945,104
  62,945,535
  62,946,340
  62,946,705
  62,946,914
  62,946,942
  62,947,397
  62,947,415
  62,947,757
  62,948,336
  62,949,215
  62,949,757
  62,950,052
  62,950,691
  62,950,731
  62,951,437
  62,951,702
  62,951,731
  62,951,732
  62,951,779
  62,951,781
  62,951,968
  62,953,585
  62,953,981
  62,953,995
  62,955,071
T
A
A
G
A
A
T
G
T
A
A
A
G
T
T
A
T
T
A
A
C
G
A
-
A
A
A
A
G
T
A
A
T
A
A
A
T
G
C
G
T
A
A
C
C
G
T
G
T
A
A
T
G
G
T
A
C
A
G
T
A
C
T
-
C
C
C
A
G
T
T
A
C
G
A
C
A
G
A
C
G
A
T
T
G
T
G
A
A
A
G
-
T
C
T
C
C
T
G
C
C
A
C
C
G
G
G
G
G
G
A
C
G
T
G
A/A
T
-
T
C
C
C
G
T
T
T
-
C
-
A
G
T
C
A
G
G
T
A
G
A
T
G
C
-
G
A
C
C
T
G
A
A
G
G
C
T
T
G/-
G/-
G/-
-/G
G
G
G
G
G
C
-
C
T
T
T
T
G
A
G
T
T
G
A
T
A
G
C
G
T
T
A
A
G
G
A
T
T
G
A
A
-
A
-/A
A/-
-/T
A
G
T
A
A
A
G
T
T
T
T
G
C
C
C
A
T
-
A
T
T
T
4
T
C
G
-
A
C
T
G
G
T
T
G
G
T
G
T
T
A
C
C
T
2
A/-
C
C
-
A
G
A
A
C
T
C
C
T
T
4
G
G
C
T
-
G
G
C
A
C
A
A
C
G
G
A
G
C
A
G
C
G
G
G
T
A
C
A
G
A
-
G
G
-
A
C
G
C
A
-
-/T
-
C
-
C
C
T
T
G
G
-
C
T
-
2
A
-
T
G
A
A
C
-
A
-
C
-
-
-
C/A
C
C
C
T
T
C
C
A
T
C
-
-
A
A/-
A/-
A/-
-/A
-/A
A/-
G
G
A
-
T
T
C
C
T
A
T
G
A
C
A
C
-/G
-
T/-
T
T
A
C
C
G
T
A
G
C
T
C
A
G
T
A
A
C
T
T
A
A
G
C
A
A
T
T
G
G
T
G
T
C
A
C
G
A
G
G
T
T
C
A
T
A
G
G
T
T
C
T
C
A
A
A
A
G
C
C
A
A
C
A
A
G
T
A
T
C
C
A
T
A
T
T
A
G
G
C
A
G
G
T
G
A
A
3/-
G
T
T
C
A
A
T
-
C
T
T
C
G
G
T
-
A
C
A
C
T
-
A
A
C
A
G
T
G
G
-
-
A
A
G
C
T
-
A
-
A
T
G
A
C
T
T
A
G
G
A
-
-
A
-
T
T
G
G
68/-
-
C
3
C
A
A
T
C
C
-
T
G
C
G
C
A
-
A
G
T
T
T
G
C
C
C
T
C
C
C
A
C
A
T
A
T
G
A
A
-
-
C
T
G
C
G
T
A
T
C
G
G
A
A
T
G
A
-
A
A
A
T
A
A
T
G
G
A
5
T
G
G
T
2
-/G
C
C
A
A
C
T
G
-
T
C
C
-
A
C
T
C
T
2
C
T
T
G
C
2
T
-
C
-
C
C
T
G
A
C
G
G
G
G
G
T
A
A
A
C
G
G
T
6
C
A
C/-
T/-
-
T/-
T
T
G
C
A
A
T
C
G
C
G
A
4
A
C
G
A
C
A
A
G
T
A/G
A/G
T
-
A
T
C
G
G
G
A
G
-
A
G
G
T
-
A
A
G
-/2
-/G
C
G
A
G
C
G
C
A
C
C
C
T
G
A
G
G
A
C
T
G
A
A
G
C
T
C
A
C
-
C
T
T
G
C
C
C
A
-
A
G
A
C
G
T
A
T
T