Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 148,569 (bp)   Positions: 359
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
Slit1
A
C
C
T
A
C
T
A
A
A
G
C
C
G
G
A
G
T
C
A
A
G
C
A
C
-
T
C
G
A
G
A
C
G
A
T
C
T
2
-
46
T
C
A
G
G
G
T
A
G
C
A
T
-
-
T
-
T
C
T
G
G
A
G
G
C
A
T
-
G
T
C
A
A
-
A
C
T
A
G
C
A
A
C
G
C
A
G
20
A
A
C
C
T
T
G
T
A
C
T
T
A
C
T
G
A
C
A
C
G
2
G
T
T
C
T
G
C
C
T
G
G
G
T
G
A
12
2
A
G
A
G
G
T
T
T
G
T
G
C
T
C
A
T
A
T
A
G
A
4
-
T
A
G
G
A
C
A
C
A
T
115
T
T
A
G
A
G
A
C
T
T
T
-
G
A
G
A
C
T
G
T
C
A
G
G
G
A
C
G
G
C
T
G
A
20
A
T
G
A
C
C
A
A
T
C
A
C
T
-
G
-
C
A
G
C
G
G
T
A
G
T
A
2
T
2
C
C
C
C
C
G
G
-
-
A
A
A
-
-
T
G
-
-
-
C
-
-
T
G
A
C
T
C
C
A
C
A
T
-
T
A
G
T
-
A
26
T
G
A
G
G
C
A
T
C
T
T
G
A
G
A
A
T
G
C
C
C
G
A
C
G
G
A
C
T
C
C
T
C
G
C
T
C
G
-
-
C
C
T
G
A
T
G
C
T
G
G
C
T
A
T
-
T
A
A
G
A
G
G
G
T
T
T
T
T
T
C
C
A
G
-
G
A
C
G
G
C
12
A
C
T
T
G
C
T
T
C
G
  240,410,214
  240,410,314
  240,411,788
  240,411,949
  240,411,984
  240,412,160
  240,412,253
  240,412,319
  240,412,597
  240,412,830
  240,413,008
  240,413,193
  240,413,254
  240,414,343
  240,414,361
  240,414,367
  240,416,387
  240,417,260
  240,417,412
  240,417,569
  240,418,157
  240,418,158
  240,418,180
  240,418,445
  240,419,306
  240,420,069
  240,421,551
  240,422,358
  240,422,458
  240,423,471
  240,423,983
  240,424,055
  240,424,347
  240,424,437
  240,424,906
  240,425,310
  240,426,410
  240,426,892
  240,428,731
  240,429,084
  240,430,205
  240,430,449
  240,430,505
  240,430,764
  240,430,834
  240,431,036
  240,431,346
  240,431,642
  240,432,347
  240,432,444
  240,432,601
  240,432,945
  240,432,949
  240,433,065
  240,433,066
  240,433,206
  240,433,311
  240,433,347
  240,433,631
  240,433,711
  240,435,017
  240,435,077
  240,435,581
  240,435,593
  240,436,364
  240,436,537
  240,436,569
  240,436,614
  240,437,749
  240,438,875
  240,439,713
  240,439,932
  240,441,814
  240,441,872
  240,442,065
  240,442,178
  240,442,305
  240,442,497
  240,442,861
  240,443,044
  240,443,050
  240,443,086
  240,443,087
  240,443,118
  240,443,157
  240,443,165
  240,443,166
  240,443,201
  240,443,367
  240,443,426
  240,443,653
  240,443,695
  240,443,707
  240,443,909
  240,443,954
  240,443,955
  240,444,308
  240,444,619
  240,444,946
  240,444,956
  240,445,480
  240,445,978
  240,446,345
  240,447,245
  240,447,277
  240,447,495
  240,447,856
  240,448,746
  240,449,311
  240,450,063
  240,450,625
  240,450,630
  240,450,797
  240,450,901
  240,451,307
  240,451,471
  240,451,528
  240,451,595
  240,451,868
  240,452,189
  240,452,368
  240,452,758
  240,452,807
  240,453,014
  240,453,180
  240,453,395
  240,453,769
  240,454,033
  240,454,050
  240,454,099
  240,454,100
  240,454,428
  240,454,790
  240,454,949
  240,455,073
  240,455,134
  240,458,276
  240,458,395
  240,463,843
  240,464,232
  240,470,223
  240,470,309
  240,470,330
  240,470,339
  240,470,395
  240,470,454
  240,470,471
  240,470,735
  240,472,488
  240,472,549
  240,473,275
  240,473,602
  240,474,197
  240,474,409
  240,474,844
  240,474,847
  240,475,241
  240,475,809
  240,476,741
  240,477,626
  240,478,350
  240,479,791
  240,480,171
  240,480,706
  240,480,981
  240,482,143
  240,482,408
  240,482,675
  240,482,814
  240,482,878
  240,482,880
  240,483,620
  240,483,750
  240,483,761
  240,484,468
  240,485,247
  240,485,596
  240,486,718
  240,487,212
  240,488,015
  240,488,191
  240,488,222
  240,489,698
  240,489,702
  240,491,468
  240,491,741
  240,492,514
  240,492,941
  240,492,986
  240,493,676
  240,493,700
  240,493,973
  240,495,222
  240,495,363
  240,496,006
  240,496,514
  240,496,795
  240,496,850
  240,496,970
  240,497,292
  240,497,512
  240,497,559
  240,497,570
  240,497,739
  240,497,792
  240,498,067
  240,498,440
  240,498,455
  240,498,659
  240,499,124
  240,499,242
  240,499,374
  240,499,925
  240,500,197
  240,500,561
  240,500,594
  240,500,692
  240,501,393
  240,501,577
  240,501,896
  240,502,086
  240,503,699
  240,504,234
  240,505,544
  240,506,410
  240,506,557
  240,507,332
  240,507,334
  240,507,336
  240,507,342
  240,508,744
  240,508,917
  240,509,226
  240,509,280
  240,509,496
  240,509,957
  240,510,234
  240,510,619
  240,510,644
  240,510,660
  240,510,789
  240,510,910
  240,511,244
  240,511,302
  240,511,469
  240,511,585
  240,513,943
  240,516,444
  240,516,719
  240,518,015
  240,518,748
  240,519,382
  240,519,916
  240,520,142
  240,520,360
  240,520,515
  240,520,799
  240,521,506
  240,522,357
  240,522,873
  240,525,109
  240,526,497
  240,527,328
  240,527,597
  240,527,853
  240,528,871
  240,529,141
  240,529,340
  240,529,564
  240,530,087
  240,530,105
  240,530,185
  240,530,400
  240,531,085
  240,531,148
  240,531,186
  240,531,274
  240,531,418
  240,531,487
  240,531,500
  240,531,657
  240,531,698
  240,531,817
  240,531,822
  240,532,108
  240,532,385
  240,532,792
  240,533,174
  240,533,610
  240,533,813
  240,533,984
  240,534,090
  240,534,201
  240,534,605
  240,535,334
  240,535,340
  240,535,580
  240,535,616
  240,535,619
  240,535,663
  240,535,676
  240,536,054
  240,536,219
  240,536,402
  240,536,506
  240,536,779
  240,536,811
  240,536,930
  240,536,938
  240,537,052
  240,537,249
  240,537,402
  240,537,607
  240,538,183
  240,538,526
  240,539,100
  240,539,101
  240,540,157
  240,540,169
  240,540,520
  240,541,435
  240,543,926
  240,543,928
  240,545,642
  240,545,993
  240,546,106
  240,546,455
  240,547,691
  240,547,741
  240,547,835
  240,549,135
  240,549,472
  240,549,931
  240,550,291
  240,550,537
  240,550,606
  240,551,040
  240,551,247
  240,551,484
  240,551,650
  240,552,047
  240,552,426
  240,553,151
  240,553,174
  240,553,499
  240,553,664
  240,553,684
  240,554,018
  240,554,025
  240,554,117
  240,554,187
  240,554,682
  240,554,866
  240,555,632
  240,555,715
  240,556,841
  240,557,602
  240,557,993
  240,558,109
G
A
T
C
-
G
C
G
G
G
C
T
T
A
A
G
A
G
T
T
G
A
T
G
T
3
C
T
A
T
A
-
T
A
C
C
T
C
-
3
-
C
T
G
A
A
C
C
T
A
T
G
C
3
C
C
T
A
T
C
T
T
-
A
T
T
G
C
10
A
C
T
G
C
T
T
T
C
G
C
T
-
C
A
A
T
G
A
-
G
T
T
T
C
C
A
C
G
A
C
C
G
A
G
A
G
T
G
T
A
2/-
A
C
G
T
C
A
A
G
C
A
C
C
C
A
G
-
-
G
A
G
-
A
C
C
C
A
G
T
T
G
T
G
C
G
C
-
A
G
-
C
C
G
A
A
G
T
G
T
G
C
-
C
C
C
A
G
A
G
T
C
A
C
10
A
T
A
G
T
G
A
C
T
C
T
C
A
G
T
A
A
G
C
C
C
-
G
C
T
G
T
T
G
G
C
T
G
T
C
C
A
2
T
G
A
T
-
A
C
G
A
C
G
-
C
-
C/G
G
G
G
T
-
A
G
A
G
T
G
2
G
C
A
13
C
3
A
T
8
C
A
C
T
C
T
G
G
T
G
C
C
C
C
C
C
C
G
26/-
-
A
G
A
A
T
T
C
T
C
-
A
T
A
-
G
C
A
G
T
T
A
G
T
T
A
G
T
C
T
T
A
T
A
T
C
A
A
A
4
T
T
C
A
A/C
C
A
T
C
A
C
C/G
C
G
C
2
C
G
T
A
C
A
A
C
C
C
C
C
C
C
T
T
G
A
C
T
G
T
A
A
T
-
C
-
C
C
A
T
C
G
T
A