Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 59,683 (bp)   Positions: 175
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
HXB2/IpcvMcwi (2019) 
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
Slc5a11
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
-
G
-
C
G
T
T
T
G
T
-
T
C
C
T
C
G
T
T
T
G
G
C
C
G
G
A
C
-
A
G
G
2
A
G
C
T
G
2
A
-
C
G
G
-
-
C
2
2
C
T
G
A
T
G
-
T
C
T
T
C
C
A
G
G
C
-
T
C
T
C
G
2
T
A
T
T
G
C
C
G
A
A
T
3
C
C
C
3
G
-
A
C
A
G
T
T
T
C
T
A
A
G
-
T
C
G
A
T
G
18
G
G
A
-
A
C
A
A
T
T
G
G
T
C
G
A
C
C
T
C
G
-
-
A
A
G
-
A
C
C
G
G
A
G
C
G
G
C
C
-
C
C
C
G
G
G
G
C
A
A
C
G
A
C
T
T
G
-
G
A
A
C
T
T
  177,737,547
  177,739,015
  177,739,023
  177,744,605
  177,745,261
  177,746,612
  177,746,863
  177,746,879
  177,747,368
  177,747,759
  177,747,976
  177,748,759
  177,749,075
  177,749,279
  177,750,523
  177,750,712
  177,750,826
  177,751,173
  177,751,525
  177,751,789
  177,751,911
  177,752,101
  177,752,127
  177,752,164
  177,752,920
  177,753,102
  177,753,760
  177,754,176
  177,754,824
  177,754,923
  177,755,087
  177,755,188
  177,755,371
  177,755,413
  177,755,979
  177,756,007
  177,756,248
  177,756,938
  177,756,947
  177,756,994
  177,757,279
  177,757,316
  177,757,326
  177,757,487
  177,757,669
  177,757,695
  177,757,716
  177,757,943
  177,758,670
  177,758,672
  177,758,749
  177,758,785
  177,758,927
  177,758,930
  177,759,170
  177,759,787
  177,759,820
  177,760,066
  177,760,395
  177,760,595
  177,760,643
  177,760,865
  177,760,882
  177,760,905
  177,760,919
  177,760,941
  177,761,038
  177,761,259
  177,761,889
  177,761,981
  177,762,186
  177,762,926
  177,762,931
  177,763,030
  177,763,056
  177,763,471
  177,763,893
  177,764,442
  177,764,825
  177,764,916
  177,765,801
  177,765,924
  177,767,722
  177,767,927
  177,768,076
  177,768,083
  177,768,086
  177,768,091
  177,768,101
  177,768,594
  177,768,825
  177,768,835
  177,769,635
  177,769,843
  177,770,535
  177,770,905
  177,770,993
  177,771,382
  177,771,885
  177,772,072
  177,772,388
  177,772,904
  177,773,289
  177,773,851
  177,774,104
  177,774,488
  177,774,685
  177,774,811
  177,774,930
  177,774,943
  177,774,948
  177,774,975
  177,775,106
  177,775,617
  177,775,820
  177,776,018
  177,776,994
  177,777,378
  177,777,404
  177,778,283
  177,778,408
  177,779,717
  177,779,769
  177,779,854
  177,780,160
  177,780,411
  177,780,786
  177,781,063
  177,781,360
  177,781,870
  177,782,026
  177,782,992
  177,783,197
  177,783,300
  177,783,302
  177,783,304
  177,783,789
  177,784,368
  177,784,460
  177,784,584
  177,784,791
  177,785,268
  177,785,404
  177,785,752
  177,785,935
  177,786,526
  177,786,812
  177,786,908
  177,787,157
  177,787,210
  177,787,461
  177,787,589
  177,787,951
  177,787,977
  177,788,243
  177,788,244
  177,788,246
  177,788,466
  177,788,664
  177,789,138
  177,789,178
  177,789,294
  177,790,195
  177,790,418
  177,791,027
  177,791,030
  177,791,032
  177,791,162
  177,791,847
  177,792,522
  177,792,667
  177,792,711
  177,792,827
  177,793,135
  177,793,223
4
T
2
T
C
C
G/-
-/G
A
C
4
C
T
T
G
T
T
-
C
-
A
A
T
T
A
A
T
T
6
G
A
A
-
G
T
T
A
A
-
T
2
G
C
G/-
2
4
T
-
-
G
C
A
G
C
A
A
-
G
C
C
T
A
G
A
A
A
-/4
A
T
A
T
-
-
C
G
C
C
A
T
T
A
C
G
C
-
-
T/-
T
-
C
3
T/-
A
G
A
G
C
C
T
-
G
G
A
4
C
T
-
G
C
A/-
-
A
T
G
-/6
G
T
C
C
C
C
-
T/-
G/-
-
A
G
T
A
C
T
A
A
-/2
T/-
-/T
A
C
C
T
A
-/A
A
-
A
T
A
C
T
T
C
T
G
T
C/-
C/-
C/-
A
T
C
G
T
A
G
A
G
G
A
T
A
-
G
T
A
G