Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 262,919 (bp)   Positions: 348
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
Sgms1
T
-
-
C
T
G
A
C
T
-
C
G
T
G
C
C
C
C
G
-
G
5
G
T
G
C
C
G
G
A
T
G
G
A
G
A
G
C
G
A
C
A
T
A
C
A
T
G
C
A
T
5
A
T
A
G
G
A
T
G
C
8
T
G
T
A
G
T
G
A
-
-
G
A
A
G
C
A
A
2
G
A
G
C
C
G
A
T
G
C
G
G
A
4
A
T
A
-
T
T
T
C
A
T
C
G
C
A
A
G
T
A
C
G
A
3
C
A
C
T
G
C
A
A
4
T
A
G
A
A
G
A
G
T
T
G
T
G
T
A
A
T
T
G
A
4
C
C
C
C
C
C
G
T
T
C
G
13
G
T
6
C
A
T
G
A
C
A
A
A
C
T
G
-
C
T
T
G
T
G
T
A
G
C
G
-
A
G
G
-
G
-
G
-
A
T
G
A
T
G
A
-
C
A
-
C
C
A
G
C
T
T
G
A
T
C
C
A
C
T
A
C
C
C
A
C
C
C
-
C
A
C
C
T
T
T
G
G
A
A
A
3
-
3
A
T
3
G
A
C
T
T
A
T
T
G
T
G
T
G
T
A
G
C
T
A
T
C
A
A
C
-
G
A
C
G
A
G
G
A
2
8
G
C
C
A
-
C
T
A
-
A
G
C
A
A
A
3
G
T
-
T
A
C
C
2
A
T
C
A
C
T
C
4
T
T
-
C
G
G
A
G
T
-
A
C
C
T
C
T
G
T
-
T
A
G
2
T
A
2
C
8
G
A
6
A
C
G
  229,996,804
  229,996,850
  229,997,028
  229,998,276
  230,002,638
  230,003,056
  230,004,556
  230,004,747
  230,004,748
  230,004,999
  230,005,125
  230,008,662
  230,012,645
  230,013,480
  230,014,246
  230,014,480
  230,014,910
  230,015,066
  230,015,141
  230,015,161
  230,015,530
  230,015,682
  230,015,866
  230,017,363
  230,017,573
  230,017,895
  230,018,006
  230,018,576
  230,020,073
  230,020,340
  230,020,346
  230,020,763
  230,021,298
  230,021,837
  230,022,227
  230,022,429
  230,022,447
  230,022,482
  230,023,102
  230,023,183
  230,023,196
  230,023,808
  230,024,700
  230,024,909
  230,025,007
  230,025,123
  230,025,551
  230,026,208
  230,026,587
  230,027,001
  230,027,041
  230,027,102
  230,027,227
  230,027,305
  230,027,526
  230,027,527
  230,027,620
  230,027,621
  230,027,680
  230,028,283
  230,028,290
  230,028,298
  230,028,764
  230,029,512
  230,029,927
  230,030,166
  230,031,137
  230,031,207
  230,031,226
  230,031,401
  230,031,512
  230,031,517
  230,031,807
  230,032,385
  230,035,000
  230,035,020
  230,035,134
  230,035,257
  230,035,322
  230,035,758
  230,036,202
  230,036,993
  230,037,030
  230,037,237
  230,037,670
  230,038,205
  230,038,274
  230,038,511
  230,038,594
  230,038,666
  230,038,729
  230,039,022
  230,039,647
  230,039,938
  230,040,017
  230,040,765
  230,041,033
  230,041,603
  230,041,901
  230,042,725
  230,043,899
  230,044,439
  230,044,487
  230,044,588
  230,044,669
  230,044,921
  230,044,967
  230,045,620
  230,046,025
  230,046,179
  230,046,275
  230,047,410
  230,047,921
  230,048,020
  230,048,903
  230,049,104
  230,049,155
  230,049,171
  230,049,429
  230,049,568
  230,049,624
  230,049,757
  230,050,140
  230,050,210
  230,050,260
  230,050,903
  230,050,968
  230,051,199
  230,051,596
  230,051,925
  230,052,297
  230,052,644
  230,053,126
  230,053,415
  230,053,919
  230,054,505
  230,054,870
  230,055,898
  230,056,023
  230,056,465
  230,056,699
  230,057,686
  230,058,566
  230,058,759
  230,058,824
  230,058,843
  230,058,984
  230,058,986
  230,058,988
  230,058,990
  230,058,992
  230,059,619
  230,059,813
  230,060,031
  230,060,366
  230,060,586
  230,061,175
  230,061,284
  230,061,475
  230,062,698
  230,062,720
  230,062,740
  230,065,688
  230,067,002
  230,067,260
  230,067,337
  230,067,641
  230,068,175
  230,068,459
  230,069,362
  230,069,557
  230,070,207
  230,070,787
  230,070,983
  230,072,318
  230,072,474
  230,072,881
  230,073,683
  230,076,135
  230,076,561
  230,077,481
  230,077,494
  230,079,305
  230,079,384
  230,080,220
  230,080,514
  230,080,845
  230,080,962
  230,081,278
  230,081,334
  230,081,450
  230,082,232
  230,082,301
  230,082,482
  230,082,562
  230,082,653
  230,083,047
  230,083,064
  230,083,376
  230,084,113
  230,084,546
  230,084,633
  230,084,702
  230,084,921
  230,085,183
  230,085,221
  230,085,404
  230,085,438
  230,085,611
  230,085,771
  230,085,902
  230,085,904
  230,085,983
  230,086,165
  230,086,272
  230,086,288
  230,086,457
  230,086,680
  230,087,134
  230,087,619
  230,087,913
  230,088,613
  230,089,245
  230,089,795
  230,089,820
  230,090,032
  230,090,172
  230,090,300
  230,090,349
  230,090,390
  230,090,429
  230,090,431
  230,090,730
  230,090,894
  230,090,905
  230,090,952
  230,090,970
  230,091,044
  230,091,048
  230,091,065
  230,091,167
  230,091,189
  230,091,195
  230,091,202
  230,091,275
  230,091,403
  230,091,526
  230,091,529
  230,091,629
  230,091,742
  230,091,909
  230,092,214
  230,092,276
  230,092,509
  230,092,525
  230,092,787
  230,092,826
  230,092,848
  230,093,113
  230,093,228
  230,093,515
  230,093,604
  230,093,809
  230,094,151
  230,094,176
  230,094,449
  230,094,540
  230,094,561
  230,094,584
  230,094,613
  230,094,742
  230,094,832
  230,094,837
  230,094,906
  230,095,060
  230,095,125
  230,095,313
  230,095,341
  230,095,422
  230,099,803
  230,100,755
  230,100,966
  230,101,413
  230,101,543
  230,101,610
  230,101,708
  230,101,833
  230,101,900
  230,101,927
  230,101,947
  230,101,953
  230,102,028
  230,102,315
  230,102,391
  230,102,401
  230,103,027
  230,103,165
  230,103,178
  230,103,896
  230,104,015
  230,104,162
  230,104,278
  230,104,572
  230,104,639
  230,105,131
  230,105,161
  230,105,252
  230,105,707
  230,105,873
  230,105,876
  230,105,878
  230,106,307
  230,106,316
  230,106,385
  230,107,391
  230,107,413
  230,108,033
  230,108,143
  230,108,358
  230,108,462
  230,108,490
  230,110,477
  230,111,598
  230,111,615
  230,112,302
  230,114,063
  230,114,319
  230,115,324
  230,115,614
  230,115,633
  230,118,635
  230,119,893
  230,156,115
  230,156,351
  230,166,902
  230,173,665
  230,173,676
  230,186,116
  230,188,390
  230,189,459
  230,212,713
  230,216,596
  230,225,656
  230,225,865
  230,240,110
  230,244,313
  230,259,085
  230,259,486
C
G
2
T
C
A
C
T
C
A
T
T
C
A
T
T
T
T
A
G
A
-
-
C
A
T
T
A
A
G
C
A
A
G
A
G
A
T
A
G
T
G
G
G
T
T
C
A
T
G
C
-
G
C
G
A
T
C
C
A
T
-
C
A
G
T
A
C
C
G
A
C
A
T
T
A
T
G
G
-
A
-
A
G
T
A
G
C
A
T
A
A
G
-
G
G
G
2
C
G
A
G
G
C
T
C
T
G
G
T
A
G
T
A
T
-
T
G
T
C
A
T
G
G
-
G
G
A
-
C
A
G
A
C
-
A
A
A
A
G/G
G
G
C
A
-
-
C/G
C/G
C/G
C/G
C/G
T
T
C
C
T
A
-
A
C
-
A
C
G
T
T
T
G
G
-
A
G
A
G
T
C
C
A
C
T
C
G
A
T
C
6
G
T
C
A
C
A
A
7
G
C
A
G
C
A
G
A
T
G
5
T
T
C
-
T
C
C
A
T
C
T
T
-
T
C
G
T
T
T
G
G
T
G
4
T
T
A
T
C
C
G
T
T
G
G
G
-
3
-
G
C
-
C
G
G
C
C
C
C
C
A
G
T
C
T
-
C
A
T
C
G
-
G
G
G
T
C
C
T
A
T
C
A
T
C
-
-
A
T
T
G
A
T
C
G
G
G
T
T
G
G
-
-
A
C
17
G
C
T
T
-
C
G
A
G
G
C
T
-
C
G
2
A
A
T
G
C/T
C
4
C
T
T
C
T
C
T
C
-/2
C
-
C
-
C
G
2/-
T
8/-
A
C
-
G
T
T