Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 85,668 (bp)   Positions: 716
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
Setd2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC108351781
LOC108351781
LOC108351781
LOC108351781
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
T
T
-
G
-
A
T
T
G
T
A
4
A
G
G
-
C
2
-
C
C
G
G
A
T
-
A
C
A
A
3
C
G
G
G
C
G
T
G
A
T
T
T
T
-
4
T
T
G
G
2
G
C
T
-
-
6
A
2
G
G
C
A
C
2
-
T
-
C
T
A
A
A
T
T
A
A
A
-
T
A
T
-
-
T
T
G
T
-
T
C
G
C
C
A
A
T
-
-
-
C
A
G
C
A
G
A
T
-
C
-
A
C
T
A
A
G
T
C
T
A
A
C
A
T
T
2
A
2
A
T
-
-
T
-
T
T
T
T
G
-
A
A
G
G
T
2
-
T
T
A
5
A
C
A
T
C
-
-
C
A
A
T
C
3
T
G
G
C
-
A
A
A
-
G
T
C
C
G
C
A
-
G
C
T
G
A
T
A
G
-
-
T
G
A
T
G
A
G
T
G
8
T
A
G
T
4
T
C
A
A
T
G
2
-
-
G
120
C
6
G
C
G
G
G
C
2
G
T
T
G
C
C
G
18
A
2
-
T
A
T
-
T
C
-
T
T
A
C
G
-
2
G
C
G
T
-
C
G
T
2
T
A
T
T
C
G
G
G
T
G
C
T
A
-
C
A
-
T
G
C
C
G
8
G
4
T
-
2
2
G
T
C
A
G
G
G
G
A
G
T
A
G
G
G
T
A
-
-
G
G
T
C
C
A
G
T
-
A
A
T
C
G
C
G
C
G
G
G
C
C
-
A
A
G
G
C
A
G
A
G
A
A
C
C
C
A
C
T
G
A
2
T
C
G
T
G
-
A
-
T
C
T
-
G
C
2
-
-
-
T
3
G
T
T
T
C
G
C
A
T
-
A
A
T
A
A
A
G
T
C
-
G
T
G
T
117
G
T
A
A
A
G
C
A
G
G
T
T
C
A
A
C
G
T
-
T
G
G
A
T
T
T
G
G
G
G
T
4
G
T
A
G
G
G
-
G
G
C
C
T
T
G
T
G
C
C
C
C
C
C
G
C
-
C
T
C
T
-
C
C
-
T
A
G
A
T
A
A
A
T
T
A
2
A
T
T
T
-
C
6
-
A
A
T
C
A
13
A
A
G
C
T
T
T
C
C
T
A
-
G
G
A
A
A
C
A
G
G
A
T
-
T
-
G
C
G
A
C
A
T
-
C
A
C
G
G
A
A
A
G
-
A
T
G
T
T
T
G
G
G
C
-
G
G
-
G
C
G
T
C
T
T
A
-
T
C
C
G
A
G
-
4
C
C
C
C
C
T
C
A
G
G
-
G
A
G
G
-
-
22
A
C
G
T
T
A
T
G
2
-
G
C
C
C
C
G
C
A
G
A
A
T
A
C
A
C
T
2
A
G
T
A
T
T
G
C
2
C
T
G
T
C
A
4
T
-
-
T
-
T
C
C
A
G
G
A
T
C
G
G
G
T
C
G
C
A
-
T
A
T
-
C
C
A
T
C
-
12
C
C
G
7
29
-
A
C
12
T
2
T
T
A
A
C
G
C
C
G
G
T
C
A
C
A
C
A
C
-
A
G
C
4
C
G
-
T
C
T
-
A
A
T
-
24
G
G
3
G
C
4
G
C
A
  110,512,292
  110,512,697
  110,512,720
  110,512,834
  110,512,876
  110,512,985
  110,513,572
  110,513,690
  110,513,711
  110,513,804
  110,513,808
  110,514,444
  110,514,584
  110,514,627
  110,514,714
  110,514,808
  110,514,847
  110,514,876
  110,514,895
  110,514,897
  110,514,931
  110,515,071
  110,515,262
  110,515,268
  110,515,285
  110,515,736
  110,516,288
  110,516,325
  110,516,379
  110,516,482
  110,516,484
  110,516,640
  110,516,660
  110,516,743
  110,516,861
  110,516,865
  110,516,911
  110,516,967
  110,516,992
  110,516,996
  110,517,357
  110,517,481
  110,517,569
  110,517,631
  110,518,311
  110,518,376
  110,518,382
  110,518,417
  110,518,693
  110,518,718
  110,518,836
  110,518,932
  110,519,142
  110,519,529
  110,519,757
  110,520,502
  110,520,905
  110,520,906
  110,520,911
  110,520,918
  110,520,922
  110,520,925
  110,520,926
  110,520,932
  110,520,936
  110,520,938
  110,520,941
  110,520,945
  110,520,952
  110,520,961
  110,521,280
  110,521,305
  110,521,306
  110,521,424
  110,521,465
  110,521,700
  110,521,745
  110,521,765
  110,521,820
  110,521,843
  110,523,064
  110,523,239
  110,523,255
  110,523,280
  110,523,323
  110,523,383
  110,523,636
  110,524,217
  110,524,397
  110,524,473
  110,524,494
  110,524,761
  110,524,793
  110,524,808
  110,524,834
  110,524,840
  110,524,844
  110,524,865
  110,524,869
  110,525,043
  110,525,062
  110,525,257
  110,525,286
  110,525,317
  110,525,355
  110,525,423
  110,525,569
  110,525,650
  110,525,835
  110,525,987
  110,526,054
  110,526,066
  110,526,076
  110,526,259
  110,526,273
  110,526,694
  110,526,731
  110,526,732
  110,526,767
  110,526,806
  110,526,876
  110,527,019
  110,527,094
  110,527,100
  110,527,154
  110,527,256
  110,527,338
  110,527,400
  110,527,453
  110,527,487
  110,527,490
  110,527,532
  110,527,535
  110,527,553
  110,527,560
  110,527,563
  110,527,567
  110,527,581
  110,527,592
  110,527,605
  110,527,712
  110,527,732
  110,527,847
  110,527,895
  110,527,954
  110,528,220
  110,528,254
  110,528,265
  110,528,267
  110,528,270
  110,528,300
  110,528,371
  110,528,376
  110,528,422
  110,528,572
  110,528,653
  110,528,937
  110,529,015
  110,529,228
  110,529,434
  110,529,609
  110,529,611
  110,529,890
  110,530,177
  110,530,183
  110,530,196
  110,530,206
  110,530,249
  110,530,250
  110,530,265
  110,530,343
  110,530,559
  110,530,890
  110,530,909
  110,530,971
  110,530,980
  110,531,598
  110,531,624
  110,531,627
  110,531,673
  110,531,679
  110,531,798
  110,531,826
  110,533,512
  110,533,545
  110,533,842
  110,534,080
  110,534,560
  110,534,587
  110,534,600
  110,534,706
  110,535,482
  110,535,628
  110,535,631
  110,535,652
  110,535,749
  110,535,789
  110,535,895
  110,536,012
  110,536,066
  110,536,076
  110,536,149
  110,536,214
  110,536,254
  110,536,424
  110,536,437
  110,536,571
  110,536,586
  110,536,801
  110,536,825
  110,537,080
  110,537,535
  110,537,674
  110,537,903
  110,538,095
  110,538,098
  110,538,101
  110,538,103
  110,538,277
  110,538,413
  110,538,484
  110,538,648
  110,538,701
  110,538,773
  110,538,779
  110,538,903
  110,538,905
  110,538,913
  110,538,929
  110,538,933
  110,538,953
  110,538,990
  110,539,004
  110,539,016
  110,539,087
  110,539,108
  110,539,935
  110,540,350
  110,540,778
  110,541,200
  110,541,351
  110,541,379
  110,541,583
  110,541,737
  110,542,080
  110,542,256
  110,542,373
  110,542,559
  110,542,588
  110,542,962
  110,543,076
  110,543,171
  110,543,225
  110,543,372
  110,543,410
  110,543,518
  110,543,614
  110,543,702
  110,543,734
  110,543,754
  110,543,756
  110,543,856
  110,544,033
  110,544,145
  110,544,162
  110,544,250
  110,544,509
  110,544,893
  110,545,157
  110,545,205
  110,545,820
  110,545,942
  110,546,089
  110,546,204
  110,546,259
  110,546,311
  110,546,572
  110,546,646
  110,546,682
  110,547,333
  110,547,346
  110,547,513
  110,547,619
  110,547,804
  110,547,862
  110,547,896
  110,548,208
  110,548,255
  110,548,487
  110,548,602
  110,548,679
  110,548,683
  110,548,874
  110,548,881
  110,548,914
  110,548,980
  110,549,089
  110,549,091
  110,549,097
  110,549,103
  110,549,105
  110,549,141
  110,549,228
  110,549,342
  110,549,450
  110,549,581
  110,550,158
  110,550,259
  110,550,486
  110,550,516
  110,550,518
  110,550,645
  110,550,823
  110,550,954
  110,550,973
  110,551,025
  110,551,439
  110,551,668
  110,551,881
  110,551,994
  110,552,033
  110,552,040
  110,552,046
  110,552,106
  110,552,349
  110,552,653
  110,552,792
  110,552,852
  110,552,888
  110,552,896
  110,552,972
  110,552,994
  110,553,039
  110,553,077
  110,553,125
  110,553,158
  110,553,166
  110,553,190
  110,553,275
  110,553,327
  110,553,722
  110,554,005
  110,554,089
  110,554,299
  110,554,474
  110,554,800
  110,554,877
  110,554,903
  110,554,920
  110,554,989
  110,555,515
  110,555,577
  110,555,593
  110,555,651
  110,555,774
  110,555,948
  110,556,050
  110,556,064
  110,556,288
  110,556,451
  110,556,579
  110,556,751
  110,556,909
  110,557,204
  110,557,794
  110,557,834
  110,557,983
  110,558,254
  110,558,405
  110,558,424
  110,558,432
  110,558,476
  110,558,484
  110,558,671
  110,558,914
  110,559,012
  110,559,106
  110,559,241
  110,559,400
  110,559,450
  110,559,660
  110,559,815
  110,559,905
  110,560,025
  110,560,114
  110,560,202
  110,560,421
  110,560,639
  110,560,684
  110,560,741
  110,560,772
  110,561,344
  110,561,580
  110,561,902
  110,562,209
  110,562,359
  110,562,395
  110,562,415
  110,562,519
  110,562,694
  110,562,847
  110,562,919
  110,562,920
  110,562,965
  110,563,035
  110,563,052
  110,563,407
  110,563,494
  110,563,904
  110,563,956
  110,564,176
  110,564,470
  110,564,613
  110,564,688
  110,564,836
  110,564,926
  110,564,972
  110,565,189
  110,565,371
  110,565,381
  110,565,401
  110,565,478
  110,565,496
  110,565,633
  110,565,674
  110,565,991
  110,566,185
  110,566,221
  110,566,522
  110,566,799
  110,567,130
  110,567,372
  110,567,393
  110,567,931
  110,567,935
  110,568,308
  110,568,309
  110,568,367
  110,568,416
  110,568,435
  110,568,476
  110,568,531
  110,568,634
  110,568,672
  110,568,754
  110,568,760
  110,568,761
  110,568,773
  110,568,788
  110,568,803
  110,568,839
  110,568,859
  110,568,871
  110,568,890
  110,568,915
  110,568,923
  110,569,000
  110,569,027
  110,569,054
  110,569,071
  110,569,075
  110,569,103
  110,569,115
  110,569,125
  110,569,161
  110,569,210
  110,569,251
  110,569,604
  110,569,793
  110,569,840
  110,569,874
  110,569,936
  110,569,939
  110,569,942
  110,569,959
  110,569,968
  110,570,056
  110,570,106
  110,570,136
  110,570,325
  110,570,359
  110,570,370
  110,570,574
  110,570,807
  110,571,313
  110,571,314
  110,571,356
  110,571,467
  110,571,473
  110,571,515
  110,571,574
  110,571,995
  110,572,010
  110,572,183
  110,572,233
  110,572,562
  110,572,623
  110,572,647
  110,573,408
  110,573,624
  110,573,683
  110,573,747
  110,573,901
  110,574,035
  110,574,062
  110,574,605
  110,574,774
  110,574,817
  110,574,857
  110,575,182
  110,575,408
  110,575,514
  110,575,641
  110,575,679
  110,575,847
  110,575,854
  110,575,891
  110,575,984
  110,576,327
  110,576,621
  110,576,697
  110,576,947
  110,576,966
  110,577,105
  110,577,203
  110,577,206
  110,577,328
  110,577,597
  110,577,758
  110,577,862
  110,577,875
  110,577,969
  110,578,244
  110,578,320
  110,578,536
  110,578,761
  110,578,982
  110,579,007
  110,579,009
  110,579,158
  110,579,182
  110,579,247
  110,579,256
  110,579,315
  110,579,450
  110,579,476
  110,579,489
  110,579,554
  110,579,574
  110,579,870
  110,579,924
  110,580,083
  110,580,207
  110,580,214
  110,580,488
  110,580,820
  110,581,417
  110,581,628
  110,581,795
  110,581,832
  110,581,926
  110,582,073
  110,582,255
  110,582,287
  110,582,722
  110,582,736
  110,582,740
  110,582,744
  110,582,752
  110,582,756
  110,582,836
  110,582,844
  110,582,920
  110,583,168
  110,583,191
  110,583,409
  110,583,459
  110,583,526
  110,583,610
  110,583,650
  110,583,734
  110,583,789
  110,584,197
  110,584,246
  110,584,282
  110,584,358
  110,584,359
  110,584,375
  110,584,379
  110,584,381
  110,584,590
  110,584,659
  110,584,708
  110,584,718
  110,584,731
  110,584,760
  110,584,883
  110,584,987
  110,585,046
  110,585,101
  110,585,115
  110,585,167
  110,585,267
  110,585,355
  110,585,373
  110,585,379
  110,585,403
  110,585,556
  110,585,594
  110,585,597
  110,585,613
  110,585,635
  110,585,746
  110,585,898
  110,585,907
  110,585,928
  110,585,940
  110,586,107
  110,586,209
  110,586,309
  110,586,360
  110,586,483
  110,586,589
  110,586,645
  110,586,888
  110,587,121
  110,587,323
  110,587,471
  110,587,700
  110,587,972
  110,587,976
  110,587,983
  110,588,012
  110,588,229
  110,588,236
  110,588,245
  110,588,286
  110,588,362
  110,588,381
  110,588,523
  110,588,761
  110,588,830
  110,588,883
  110,589,203
  110,589,686
  110,589,702
  110,589,718
  110,590,601
  110,590,669
  110,590,686
  110,590,783
  110,591,040
  110,591,073
  110,591,538
  110,591,722
  110,591,800
  110,591,999
  110,592,127
  110,592,132
  110,592,319
  110,592,388
  110,592,470
  110,592,592
  110,592,593
  110,592,596
  110,592,606
  110,592,638
  110,592,699
  110,593,025
  110,593,058
  110,593,112
  110,593,127
  110,593,134
  110,593,329
  110,593,396
  110,593,754
  110,593,773
  110,593,792
  110,593,823
  110,593,830
  110,593,897
  110,593,963
  110,594,017
  110,594,052
  110,594,053
  110,594,089
  110,594,171
  110,594,207
  110,594,624
  110,594,701
  110,594,724
  110,594,754
  110,594,846
  110,594,891
  110,594,989
  110,595,021
  110,595,084
  110,595,114
  110,595,340
  110,595,402
  110,595,616
  110,595,716
  110,595,789
  110,595,899
  110,595,900
  110,595,958
  110,596,024
  110,596,088
  110,596,581
  110,596,633
  110,596,926
  110,596,954
  110,597,211
  110,597,227
  110,597,337
  110,597,354
C
C
A
G
2
T
A
G
C
C
A
C
G
-
G
C
A
2
-
-
3
T
T
A
A
G
A
4
C
A
G
T
-
-
T
T
A
T
C
A
T
G
C
A
C
A
3
-
C
C
A
T
-
A
T
C
2
5
-
T
-
A
A
T
T
A
-
2
A
3
T
C
T
T
C
C
C
G
G
T
C
C
C
C
G
T
C
A
A
A
T
-/A
-
A
T
T
-
G
C
6
T
G
T
-/T
T
T
G
A
G
C
2
T
T
G
G
C
G
T
T
C
T
C
G
G
T
G
C
C
-
G
-
G
C
3
24
G
26
G
G
G
C
C
C
G
G
A
C
A
-
3
C
C
G
-
T
T
G
C
T
2
3
G
G
C
C
-
-
C
A
A
T
8
-
-
G
A
C
C
T
A
T
T
G
15
A
T
C
C
G
C
C
C
10
51
G
A
G
G
T
G
A
C
C
-
G
C
A
C
-
C
T
T
G
A
T
-
2
5
A
-
T/-
-
A
T
A
A
A
T
-
C
A
C
A
T
G
A
-
G
-
T
C
G
C
T
C
T
G
C
C
G
-
A
A
-
A
T
C
C
G
T
T
C
-
C
G
C
C
T
-/T
C
A
C
A
T
G
G
T
A
G
3
-
C
T
T
A
-
T
-
C
3
-
-
A
G
T
G
-/A
A/-
A/-
-/A
-/G
-/A
C
G
T
A
A
C
G
6
3
A
C
C
T
T
G
A
C
A
C
G
G
G
C
T
-/T
G
A
A
A
T
A
2
G
G
A
A
T
T
A
T
T
G
G
T
T
T
T/-
G
C
A
G
-
C
T
A
C
A
4
G
A
G
T
G
6
C
T
-
T
4
4
G
-
T
C
C
C
T
A
T
C
C
A
G
T
A
G
C
T
A
G
T
G
A
C
A
-
-
A
C
T/-
-/T
T
A
T
G
A
A
C
-
G
G
G
A
A
C
T
C
A
T
G
A
C
A
A
T
A
A
C
-
C
C
G
A
A
T
2
A
-
T
T
C
C
T
C
A
A
T
G
A
T
T
T
T
A
G
C
T
C
A
T
T
A
C
C
A
G
C
C
C
G
-
G
G
-
G
C
?
G
2
G
?
A
G
G
G
T
C
-
C
G
C
T
C
G
G
A
T
C
G
12
T
A
G
G
-
T
G
A
A
T
C
70
C
2
A
T
A
G
T
T/-
C
2
T
G
A
A
T
G
T
C
C
9
G
C
A
G/-
G/-
A
A
T
A
T
26
T
A
A
A
A
A
C
T
G
C
T
2
C
T
T
A
G
A
T
-
A/-
-/A
A
-
-/A
C
T
C
A
C
3
A
G
T
A
3
15
-
G
T
A
G
A
G
C
A
-
G
A
T
T
T
G
A
A
T
A
C
-
C
G
T
G
A
C
-
G
A
G
G
A
C
A
T
-
T
A
A
C
T
G
-
C
2
28
C
T
-
A/-
-
-
C
A
G
G
T
-
A
T
C
A
A
T
T
A
-
G
C
8
T
G
G
C
T
54
-
T
T
T
-
-
2
G
T
-
C
-
?
G
G
G
T
T
T
T
A
A
C
T
G
G
T
T
G
T
C
G
A
T
-
-
A
5
C
T
C
3
G
G
C
2
-
A
A
-
A
T
-
T
-
G