Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 343,845 (bp)   Positions: 589
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
Ror1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
T
T
-
G
A
-
C
G
T
C
C
A
G
G
A
G
C
C
G
G
G
G
G
G
G
-
-
T
T
C
2
-
C
G
T
C
2
32
A
-
G
G
A
G
A
A
G
C
A
A
G
G
G
G
G
G
-
T
C
T
T
G
C
-
A
G
G
A
T
C
G
A
G
A
T
T
T
10
-
A
T
C
C
T
G
2
-
C
T
G
G
G
G
A
C
C
C
C
C
-
T
T
C
4
A
T
T
G
T
32
C
C
C
A
G
T
A
G
A
G
T
6
-
C
A
A
G
C
C
G
A
A
-
G
T
G
A
2
G
A
C
G
C
A
T
T
G
T
G
G
T
G
C
T
T
A
G
-
C
C
T
G
G
C
T
G
G
A
G
T
T
A
T
T
G
T
4
T
C
T
C
12
C
T
T
C
G
3
A
T
G
T
T
C
T
C
A
G
7
C
T
T
T
G
A
T
-
C
T
A
T
C
A
G
G
C
C
G
C
T
C
C
A
T
A
C
A
G
A
T
G
C
T
T
C
A
G
A
G
C
G
G
G
T
C
T
T
G
A
G
A
T
-
G
C
T
C
-
C
C
T
C
C
T
-
G
T
A
T
A
G
A
A
A
T
T
C
C
C
T
A
A
T
G
C
C
C
C
C
C
A
6
C
A
-
C
C
T
A
T
A
-
T
T
C
G
T
T
-
C
T
C
C
C
C
A
T
G
3
G
T
G
A
T
G
A
A
T
T
G
T
4
T
6
A
G
A
G
T
G
G
G
G
A
T
A
G
T
C
C
G
G
G
C
C
T
C
T
8
G
G
C
T
A
4
T
51
A
T
G
C
G
T
A
A
T
T
T
T
C
2
A
A
-
-
G
T
A
A
T
G
2
T
C
G
T
T
G
A
C
T
-
A
A
A
A
C
A
A
C
T
G
G
A
G
G
A
7
G
-
-
T
T
C
G
2
T
G
C
A
G
2
G
5
A
C
C
C
T
T
T
T
A
C
A
G
T
C
A
G
T
G
C
T
A
A
-
-
G
-
G
T
2
T
C
T
T
C
-
A
C
C
A
T
C
C
G
G
G
G
C
G
A
A
-
T
T
-
A
C
C
A
C
T
A
G
C
A
G
-
G
C
A
A
G
A
G
T
G
G
-
A
T
T
-
A
C
T
T
T
G
G
C
G
C
2
-
A
A
C
A
G
G
A
G
T
T
C
T
12
G
A
A
C
C
T
G
A
T
T
A
T
A
G
G
C
A
C
G
G
T
G
C
C
C
A
C
-
C
T
T
A
-
A
G
G
A
T
G
T
G
T
T
C
C
A
A
A
  114,745,446
  114,745,448
  114,745,665
  114,747,778
  114,748,919
  114,749,427
  114,749,633
  114,752,330
  114,753,111
  114,753,355
  114,755,952
  114,759,845
  114,759,972
  114,760,238
  114,761,109
  114,762,300
  114,762,487
  114,762,963
  114,765,733
  114,767,011
  114,767,013
  114,767,017
  114,767,019
  114,767,021
  114,767,023
  114,767,025
  114,767,879
  114,767,947
  114,768,018
  114,768,100
  114,768,210
  114,768,318
  114,768,323
  114,768,745
  114,769,430
  114,770,474
  114,770,515
  114,770,518
  114,770,551
  114,771,358
  114,773,509
  114,774,775
  114,774,909
  114,776,228
  114,776,740
  114,777,548
  114,778,506
  114,780,659
  114,780,844
  114,780,876
  114,781,584
  114,781,772
  114,784,317
  114,784,519
  114,784,696
  114,785,198
  114,786,394
  114,786,812
  114,786,968
  114,787,470
  114,787,586
  114,787,592
  114,787,597
  114,787,814
  114,787,917
  114,789,091
  114,790,216
  114,790,275
  114,790,285
  114,790,367
  114,790,764
  114,790,953
  114,791,135
  114,794,001
  114,797,435
  114,797,916
  114,798,022
  114,799,084
  114,799,220
  114,799,256
  114,799,380
  114,799,819
  114,800,511
  114,800,596
  114,801,603
  114,802,094
  114,802,375
  114,804,086
  114,804,670
  114,804,672
  114,805,000
  114,805,916
  114,806,078
  114,807,619
  114,807,867
  114,808,897
  114,810,121
  114,810,702
  114,810,932
  114,811,459
  114,812,711
  114,813,329
  114,813,843
  114,814,078
  114,814,266
  114,814,624
  114,815,251
  114,815,347
  114,816,204
  114,816,508
  114,818,338
  114,818,339
  114,818,634
  114,818,804
  114,819,155
  114,819,271
  114,819,454
  114,819,527
  114,819,727
  114,820,034
  114,820,115
  114,820,127
  114,820,185
  114,820,212
  114,820,250
  114,821,982
  114,822,295
  114,822,489
  114,823,065
  114,823,345
  114,824,746
  114,826,163
  114,826,369
  114,830,716
  114,831,099
  114,831,770
  114,834,599
  114,835,691
  114,836,310
  114,836,369
  114,837,032
  114,837,237
  114,837,259
  114,837,806
  114,837,911
  114,837,992
  114,838,247
  114,838,822
  114,839,577
  114,840,623
  114,840,760
  114,841,719
  114,842,232
  114,842,672
  114,842,752
  114,843,425
  114,843,767
  114,843,971
  114,844,499
  114,844,590
  114,844,849
  114,845,010
  114,845,143
  114,845,520
  114,845,704
  114,845,733
  114,845,756
  114,845,776
  114,846,068
  114,846,256
  114,846,654
  114,846,933
  114,847,660
  114,848,506
  114,848,614
  114,849,222
  114,849,247
  114,849,415
  114,850,056
  114,850,202
  114,850,721
  114,850,816
  114,852,292
  114,852,303
  114,852,357
  114,852,534
  114,852,544
  114,852,551
  114,852,665
  114,853,494
  114,854,237
  114,854,400
  114,854,570
  114,854,669
  114,854,708
  114,854,901
  114,855,015
  114,855,163
  114,855,404
  114,855,664
  114,856,818
  114,856,920
  114,858,604
  114,858,995
  114,860,340
  114,860,707
  114,865,394
  114,865,914
  114,868,343
  114,869,099
  114,871,112
  114,871,562
  114,873,998
  114,874,585
  114,875,053
  114,877,203
  114,877,525
  114,878,240
  114,878,523
  114,878,528
  114,878,880
  114,879,216
  114,879,593
  114,880,548
  114,880,569
  114,880,757
  114,880,789
  114,881,570
  114,882,304
  114,882,313
  114,883,011
  114,883,209
  114,883,312
  114,883,340
  114,884,678
  114,886,041
  114,886,299
  114,886,671
  114,887,586
  114,888,111
  114,888,603
  114,889,367
  114,889,422
  114,889,697
  114,890,235
  114,890,311
  114,890,487
  114,890,609
  114,890,916
  114,891,469
  114,891,772
  114,891,788
  114,891,853
  114,892,599
  114,892,878
  114,893,334
  114,893,871
  114,894,050
  114,896,111
  114,896,248
  114,896,257
  114,896,268
  114,896,416
  114,897,882
  114,900,396
  114,900,795
  114,901,610
  114,902,817
  114,903,389
  114,903,797
  114,904,869
  114,906,794
  114,907,685
  114,908,157
  114,909,529
  114,910,241
  114,910,680
  114,911,267
  114,911,953
  114,912,145
  114,912,872
  114,915,013
  114,915,523
  114,915,988
  114,916,389
  114,916,715
  114,916,750
  114,919,703
  114,921,437
  114,921,699
  114,921,701
  114,921,771
  114,924,399
  114,928,064
  114,929,017
  114,929,111
  114,929,178
  114,929,271
  114,929,325
  114,930,885
  114,931,469
  114,931,518
  114,931,715
  114,931,829
  114,932,234
  114,932,570
  114,933,203
  114,933,596
  114,934,154
  114,934,340
  114,934,910
  114,935,688
  114,936,082
  114,936,884
  114,936,949
  114,936,971
  114,937,052
  114,938,188
  114,938,563
  114,939,695
  114,940,898
  114,941,332
  114,941,497
  114,943,043
  114,943,102
  114,943,318
  114,944,373
  114,944,390
  114,945,190
  114,945,457
  114,945,991
  114,946,177
  114,946,372
  114,946,441
  114,946,460
  114,946,703
  114,946,842
  114,947,039
  114,947,210
  114,947,270
  114,947,719
  114,948,382
  114,949,579
  114,949,604
  114,949,748
  114,950,116
  114,950,208
  114,950,313
  114,950,579
  114,950,858
  114,951,417
  114,951,558
  114,951,728
  114,951,869
  114,952,879
  114,953,182
  114,953,347
  114,953,691
  114,953,892
  114,954,428
  114,955,274
  114,956,388
  114,957,011
  114,957,530
  114,958,094
  114,958,122
  114,958,123
  114,958,131
  114,958,159
  114,958,178
  114,958,181
  114,958,527
  114,959,150
  114,959,187
  114,959,370
  114,959,453
  114,960,599
  114,963,826
  114,964,177
  114,964,418
  114,966,542
  114,967,050
  114,968,519
  114,969,856
  114,969,981
  114,970,308
  114,970,431
  114,970,573
  114,970,950
  114,972,389
  114,976,195
  114,976,220
  114,976,421
  114,976,977
  114,977,315
  114,977,366
  114,977,410
  114,977,549
  114,977,646
  114,977,833
  114,978,253
  114,978,282
  114,978,500
  114,978,564
  114,978,704
  114,978,739
  114,978,848
  114,979,135
  114,979,478
  114,979,482
  114,979,690
  114,979,874
  114,980,078
  114,980,352
  114,980,675
  114,980,676
  114,981,380
  114,981,689
  114,982,563
  114,982,617
  114,982,732
  114,982,897
  114,983,122
  114,983,205
  114,983,208
  114,983,582
  114,983,762
  114,984,029
  114,984,272
  114,984,314
  114,984,323
  114,984,379
  114,984,387
  114,984,405
  114,984,410
  114,984,797
  114,985,117
  114,985,120
  114,985,231
  114,985,232
  114,985,271
  114,985,389
  114,985,894
  114,986,069
  114,986,247
  114,986,337
  114,986,790
  114,987,524
  114,987,664
  114,987,955
  114,987,969
  114,987,980
  114,988,145
  114,988,832
  114,988,833
  114,989,356
  114,989,368
  114,989,509
  114,989,626
  114,989,672
  114,989,776
  114,989,814
  114,989,872
  114,990,159
  114,990,400
  114,991,128
  114,991,258
  114,992,014
  114,992,186
  114,992,244
  114,992,476
  114,992,775
  114,992,957
  114,992,986
  114,993,228
  114,993,241
  114,993,359
  114,993,396
  114,993,780
  114,994,213
  114,994,451
  114,996,376
  114,996,452
  114,997,964
  114,998,125
  114,998,364
  114,998,401
  114,998,425
  114,998,557
  114,998,973
  114,999,790
  115,000,056
  115,000,065
  115,001,237
  115,001,330
  115,001,525
  115,001,645
  115,001,770
  115,002,157
  115,003,872
  115,004,326
  115,005,550
  115,006,826
  115,008,241
  115,008,467
  115,008,631
  115,008,647
  115,009,637
  115,009,781
  115,009,993
  115,010,136
  115,010,584
  115,010,803
  115,010,947
  115,011,280
  115,011,447
  115,012,156
  115,012,177
  115,012,401
  115,013,746
  115,013,792
  115,013,850
  115,014,291
  115,014,489
  115,014,511
  115,015,481
  115,016,312
  115,017,048
  115,017,262
  115,017,295
  115,018,096
  115,018,188
  115,018,498
  115,018,501
  115,019,162
  115,019,310
  115,019,611
  115,019,612
  115,019,999
  115,020,289
  115,020,395
  115,021,556
  115,022,446
  115,028,593
  115,028,602
  115,028,634
  115,029,738
  115,031,392
  115,032,411
  115,034,443
  115,034,944
  115,034,948
  115,034,950
  115,034,958
  115,037,892
  115,037,894
  115,039,032
  115,040,743
  115,043,899
  115,044,500
  115,048,903
  115,049,000
  115,050,831
  115,051,408
  115,051,817
  115,052,359
  115,053,438
  115,053,723
  115,056,593
  115,057,794
  115,058,646
  115,058,931
  115,059,274
  115,060,409
  115,060,856
  115,061,230
  115,063,654
  115,064,782
  115,066,222
  115,066,966
  115,067,360
  115,069,885
  115,074,397
  115,074,673
  115,074,772
  115,075,123
  115,075,408
  115,076,134
  115,087,567
-/C
C/-
G
G
A
C
16
T
A
C
T
T
G
A
A
-
A
T
A/-
-/C
C/-
-/C
C/-
-/C
C/-
C/-
2
2
C
C/-
T
-
8
T
A
-
?
-
-
C
G
A
C
G
A
G
G
C
G
G
G
A
A
A
A
A
A
12
C
T
-
C
A
T
T
G
A
A
G
C
T
C
G
A
C
A
C
C
-
T
G
C
T
G
C/-
A
-
9
T
C
A
A
A
A
-/C
T
T
T
T
T
T
C
C
T
-
G
A
C
A
C
-
T/-
T
A
C
A
C
G
A
G
A
C
-
3
T
G
G
-
T
T
-
C
G
G
A
C
A
G
-
A
G
A
A
G
G
C
G
C
C
A
A
G
A
T
G
C
T
A
25
T
T
A
A
A
T
-
C
T
G
A
G
C
C
C
C
A
C
-
C
T
C
T
-
-/G
-/A
C
G
A
-
G
C
T
C
A
T
C
T
G
A
-
T
C
C
C
A
-/T
C
-/T
T
A
-
A
T
T
-
A
T
T
A
T
C
T
T
G
C
G
T
G
A
T
C
A
T
C
C
T
G
A
G
A
T
A
T
C
A
T
-
G
T
T
A
G
C
8
A
T
A
T
C
A
T
C
A
T
C
4
A
-/A
G
C
G
T
G
G
G
C
-
G
G
G
C
T
T
C
A
-/T
T/-
T
T
G
G
G
-
T
C
A
T
G
G
G
C
T
3
A/-
G
G
A
-
C
T
-
C
T
T
-
G
G
C
A
-
A
C
C
C
G
A
G
G
-
C
A
C
-
G
-
G
T
-
A
C
T
A
A
A
-
C
T
T/-
C
T
T
A
A
A
T
A
G
A
C
-
A
A
G
-
G
-
A/-
-
-/G
-/A
A/-
G/A
A
C
T
-
C
A
C
C
T
-
G
G
A
A
A
-
T
T
C
A
-
C
T
C
C
C
-
G
T
C
C
G
G
G
G
T
G
T
A
C
A
T
G
C
A
G
-
A
2
10
A
G
T
A
-
A
C
T
G
T
-
A
-
G
A
T
T
C
G
C
C
G
G
T
A
-
T
G
T
G
A
G
C
G
T
2
T
C
G
-/T
C
-
-
T
-
-
T
2
G
T
T
T
A
G
G
T
C
T
A
T
C
G
G
2
-
G
A
G
T
G
G
G
C
G
T
T
T
C
A
A
T
G
-
A
G
A
-
A
T
C
C
A
C
-/16
T
T
G
G
C
C
T
A
A
T
-
8
G
G
T
G
A
A
G
T
C
C
T
A
-
A
C
G
A
T
G
C
G
C
T/C
A/T
T/A
A/G
A/-
A/-
T
G
A
A
T/C
C
C
A
G
T
G
T
3
G
C
A
G
G
C
A
A
G
G
T
G
-
C
C
T
-
C
G
G