Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 198,642 (bp)   Positions: 653
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BUF/N (2020) 
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
Rimbp2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
26
A
T
33
T
-
A
-
T
C
T
A
A
T
G
8
A
-
T
G
G
53
G
A
C
C
T
-
T
C
A
G
A
G
C
T
G
T
C
C
C
G
C
C
-
C
C
G
G
A
-
G
12
2
C
A
A
C
T
T
G
G
C
A
G
G
10
C
A
A
C
T
T
G
19
G
A
T
T
G
G
T
A
C
C
4
C
T
G
C
A
T
G
-
T
T
T
T
T
A
G
C
A
T
G
G
C
A
T
-
T
T
A
T
C
C
T
T
A
T
G
C
C
C
C
C
C
T
T
A
T
C
A
A
G
A
-
A
T
-
T
G
G
C
C
A
G
G
-
-
C
A
2
T
C
G
T
G
T
T
A
G
A
A
C
A
T
T
A
G
G
C
-
A
12
C
A
G
A
T
C
2
A
T
C
A
G
C
C
A
A
T
C
T
T
A
A
A
T
T
G
C
-
C
-
T
C
A
A
-
C
A
-
T
A
G
T
A
A
G
G
C
A
A
T
7
G
T
C
A
T
C
G
G
2
2
C
G
T
-
6
-
-
-
G
G
C
G
G
G
C
C
G
C
T
G
A
C
T
C
C
G
A
A
G
C
C
8
A
T
107
C
G
T
A
T
C
G
A
A
C
A
2
A
T
A
G
C
A
G
T
A
A
C
C
T
C
A
C
C
G
C
A
G
T
G
-
G
C
C
T
A
G
C
A
T
C
C
13
T
A
C
A
T
C
A
A
T
-
G
C
A
T
A
A
T
T
T
G
T
G
G
C
G
T
T
T
A
C
G
G
T
T
A
G
A
C
C
G
A
-
C
A
G
A
C
C
C
-
-
A
A
A
G
T
2
-
C
T
C
A
A
8
A
A
C
A
C
C
G
C
C
G
A
3
A
-
-
C
G
T
G
C
G
A
C
T
C
A
T
C
A
G
T
G
T
G
G
C
11
T
C
G
A
A
C
-
G
G
A
-
C
A
A
-
C
T
-
-
G
T
G
C
T
10
C
T
G
C
G
C
A
C
A
C
G
6
G
C
-
T
A
C
T
C
C
A
G
G
G
A
G
14
C
-
G
C
-
G
A
T
C
G
G
A
A
A
T
G
T
A
-
C
G
A
G
G
C
C
T
G
T
A
C
C
6
2
C
G
G
A
-
G
G
T
-
T
-
G
A
C
A
T
8
G
C
T
C
C
C
A
G
-
C
G
A
T
G
-
G
T
T
A
A
A
T
G
G
T
G
A
A
C
C
C
C
C
A
C
A
A
G
C
T
G
T
G
C
T
A
A
A
G
A
A
T
C
G
T
-
C
C
A
G
T
C
G
T
A
G
-
7
G
-
C
C
T
G
C
C
C
T
T
T
T
A
A
10
T
G
A
C
5
-
A
A
A
T
T
G
C
-
T
C
C
-
A
C
C
C
C
T
3
T
C
G
T
C
G
A
G
G
A
C
G
A
G
A
C
A
-
-
C
  27,747,745
  27,747,770
  27,748,037
  27,748,039
  27,748,436
  27,748,911
  27,749,288
  27,751,018
  27,751,064
  27,751,117
  27,751,246
  27,751,292
  27,751,847
  27,751,878
  27,752,022
  27,752,362
  27,752,367
  27,752,481
  27,752,486
  27,752,522
  27,752,870
  27,752,998
  27,754,183
  27,754,427
  27,754,902
  27,756,047
  27,756,663
  27,757,713
  27,757,899
  27,757,961
  27,758,427
  27,758,490
  27,759,006
  27,759,053
  27,759,850
  27,760,182
  27,760,321
  27,760,325
  27,760,377
  27,760,796
  27,760,829
  27,760,858
  27,760,891
  27,761,001
  27,761,017
  27,761,025
  27,761,112
  27,761,150
  27,761,362
  27,761,452
  27,761,467
  27,761,559
  27,761,816
  27,762,023
  27,762,027
  27,762,245
  27,762,341
  27,763,152
  27,763,289
  27,763,405
  27,763,421
  27,763,450
  27,763,618
  27,763,814
  27,763,864
  27,764,658
  27,764,837
  27,764,849
  27,765,903
  27,766,360
  27,766,453
  27,766,524
  27,767,201
  27,767,952
  27,768,290
  27,768,782
  27,769,108
  27,769,514
  27,769,925
  27,770,523
  27,770,527
  27,770,737
  27,770,738
  27,770,840
  27,771,295
  27,771,529
  27,771,678
  27,771,918
  27,772,084
  27,772,315
  27,772,333
  27,772,351
  27,772,464
  27,772,542
  27,772,614
  27,772,781
  27,773,007
  27,773,141
  27,773,364
  27,773,414
  27,773,632
  27,773,811
  27,773,818
  27,773,863
  27,773,864
  27,773,875
  27,773,882
  27,773,939
  27,774,260
  27,774,393
  27,774,445
  27,774,775
  27,774,788
  27,774,992
  27,775,206
  27,775,711
  27,775,819
  27,776,049
  27,776,271
  27,776,794
  27,776,800
  27,777,202
  27,777,258
  27,777,313
  27,777,429
  27,777,511
  27,777,622
  27,777,770
  27,777,783
  27,777,801
  27,777,887
  27,778,071
  27,778,406
  27,778,429
  27,778,588
  27,778,607
  27,778,629
  27,778,640
  27,778,673
  27,778,775
  27,778,781
  27,778,793
  27,778,801
  27,778,830
  27,778,831
  27,778,850
  27,778,911
  27,778,915
  27,778,921
  27,778,924
  27,778,930
  27,778,931
  27,778,934
  27,778,943
  27,778,947
  27,778,956
  27,778,962
  27,778,963
  27,778,968
  27,778,991
  27,779,031
  27,779,120
  27,779,141
  27,779,153
  27,779,231
  27,779,232
  27,779,308
  27,779,554
  27,779,736
  27,780,301
  27,780,335
  27,780,378
  27,780,692
  27,780,718
  27,780,728
  27,781,014
  27,781,149
  27,781,239
  27,781,298
  27,781,342
  27,781,415
  27,781,803
  27,781,897
  27,782,113
  27,782,266
  27,782,513
  27,782,525
  27,782,558
  27,782,580
  27,782,584
  27,782,668
  27,782,700
  27,782,854
  27,782,871
  27,782,977
  27,783,000
  27,783,005
  27,783,046
  27,783,131
  27,783,264
  27,783,274
  27,783,275
  27,783,285
  27,783,368
  27,783,493
  27,783,506
  27,783,599
  27,784,131
  27,784,318
  27,784,399
  27,784,429
  27,784,726
  27,785,016
  27,785,133
  27,785,154
  27,785,196
  27,785,319
  27,785,584
  27,785,593
  27,785,610
  27,785,649
  27,785,727
  27,785,741
  27,785,901
  27,786,040
  27,786,056
  27,786,084
  27,786,244
  27,786,459
  27,786,948
  27,787,104
  27,787,331
  27,787,345
  27,787,674
  27,787,726
  27,787,785
  27,787,899
  27,787,997
  27,788,013
  27,788,188
  27,788,214
  27,788,272
  27,788,292
  27,788,306
  27,788,343
  27,788,382
  27,788,938
  27,789,166
  27,789,705
  27,790,589
  27,790,595
  27,790,673
  27,790,782
  27,791,210
  27,791,395
  27,792,338
  27,792,579
  27,792,748
  27,792,925
  27,793,140
  27,793,260
  27,793,514
  27,793,875
  27,794,238
  27,794,514
  27,796,800
  27,797,712
  27,797,813
  27,797,977
  27,798,644
  27,799,055
  27,799,711
  27,800,162
  27,800,677
  27,800,995
  27,801,243
  27,801,250
  27,801,338
  27,801,339
  27,801,341
  27,801,658
  27,802,253
  27,802,301
  27,802,694
  27,803,483
  27,804,764
  27,804,916
  27,805,139
  27,805,312
  27,807,521
  27,807,797
  27,808,066
  27,808,178
  27,808,714
  27,808,900
  27,809,222
  27,809,374
  27,809,422
  27,809,441
  27,812,628
  27,812,693
  27,812,700
  27,812,713
  27,813,198
  27,813,367
  27,813,406
  27,813,704
  27,813,728
  27,813,729
  27,813,874
  27,814,009
  27,814,097
  27,814,108
  27,814,178
  27,814,736
  27,814,972
  27,815,203
  27,815,296
  27,815,445
  27,815,569
  27,815,646
  27,815,688
  27,816,209
  27,816,684
  27,816,772
  27,816,912
  27,817,085
  27,817,297
  27,817,484
  27,818,251
  27,818,279
  27,821,454
  27,822,088
  27,822,358
  27,822,937
  27,823,686
  27,824,171
  27,825,780
  27,826,377
  27,826,840
  27,828,850
  27,829,014
  27,829,092
  27,829,217
  27,829,752
  27,829,920
  27,830,898
  27,831,116
  27,831,654
  27,832,292
  27,832,606
  27,832,811
  27,833,475
  27,834,922
  27,835,730
  27,836,315
  27,836,348
  27,836,513
  27,837,242
  27,837,324
  27,837,938
  27,838,077
  27,838,390
  27,838,824
  27,839,015
  27,839,360
  27,839,369
  27,839,487
  27,839,625
  27,839,869
  27,840,543
  27,840,715
  27,840,727
  27,841,475
  27,841,596
  27,842,438
  27,842,444
  27,842,753
  27,842,890
  27,843,159
  27,843,172
  27,843,173
  27,843,176
  27,843,646
  27,843,741
  27,844,307
  27,844,682
  27,845,342
  27,845,572
  27,845,965
  27,845,984
  27,846,266
  27,847,651
  27,848,071
  27,848,512
  27,849,844
  27,849,999
  27,850,002
  27,850,065
  27,850,068
  27,850,082
  27,850,103
  27,850,273
  27,850,278
  27,850,325
  27,850,458
  27,850,502
  27,850,560
  27,850,593
  27,850,616
  27,850,661
  27,850,795
  27,850,923
  27,850,946
  27,850,954
  27,851,324
  27,851,326
  27,851,331
  27,852,332
  27,852,334
  27,852,339
  27,852,340
  27,852,620
  27,852,906
  27,853,644
  27,853,673
  27,854,907
  27,855,566
  27,855,579
  27,855,949
  27,856,558
  27,856,886
  27,856,900
  27,857,161
  27,859,407
  27,859,531
  27,859,735
  27,859,990
  27,860,183
  27,860,234
  27,860,288
  27,860,353
  27,860,612
  27,861,147
  27,861,190
  27,861,264
  27,861,362
  27,861,441
  27,861,451
  27,861,457
  27,861,483
  27,861,484
  27,861,485
  27,861,491
  27,861,632
  27,861,677
  27,861,812
  27,862,434
  27,862,571
  27,862,874
  27,862,882
  27,863,882
  27,864,785
  27,865,035
  27,865,143
  27,865,163
  27,865,349
  27,865,732
  27,866,167
  27,866,371
  27,866,691
  27,866,768
  27,866,866
  27,866,937
  27,866,987
  27,868,062
  27,868,382
  27,869,082
  27,870,211
  27,870,261
  27,870,558
  27,870,643
  27,870,651
  27,871,388
  27,871,615
  27,872,090
  27,872,274
  27,872,693
  27,872,894
  27,873,227
  27,873,280
  27,874,007
  27,874,018
  27,874,104
  27,874,108
  27,874,552
  27,874,558
  27,878,381
  27,878,933
  27,879,042
  27,879,268
  27,879,870
  27,880,866
  27,881,385
  27,882,919
  27,882,955
  27,883,100
  27,884,022
  27,884,872
  27,884,876
  27,884,930
  27,884,946
  27,885,430
  27,886,368
  27,886,370
  27,886,373
  27,889,977
  27,891,046
  27,891,758
  27,891,787
  27,891,805
  27,893,396
  27,893,486
  27,895,846
  27,896,489
  27,899,484
  27,899,498
  27,899,794
  27,900,012
  27,901,358
  27,902,114
  27,902,174
  27,902,176
  27,902,251
  27,902,375
  27,902,684
  27,902,767
  27,902,783
  27,903,103
  27,903,114
  27,903,254
  27,903,559
  27,904,162
  27,904,332
  27,905,755
  27,905,991
  27,906,552
  27,906,652
  27,906,691
  27,906,821
  27,906,881
  27,906,956
  27,907,005
  27,907,121
  27,907,133
  27,907,400
  27,907,541
  27,907,742
  27,907,817
  27,908,304
  27,908,833
  27,909,018
  27,909,330
  27,909,392
  27,909,884
  27,910,410
  27,910,489
  27,910,509
  27,910,559
  27,910,710
  27,911,019
  27,911,041
  27,911,326
  27,911,385
  27,911,489
  27,911,493
  27,911,797
  27,911,861
  27,911,930
  27,912,125
  27,912,468
  27,912,488
  27,913,379
  27,913,872
  27,914,048
  27,915,626
  27,916,344
  27,916,588
  27,916,618
  27,916,769
  27,916,859
  27,918,388
  27,918,440
  27,921,620
  27,922,832
  27,923,144
  27,923,407
  27,923,481
  27,923,652
  27,923,654
  27,924,045
  27,924,432
  27,924,578
  27,925,130
  27,925,207
  27,925,470
  27,925,498
  27,925,610
  27,925,720
  27,926,150
  27,926,162
  27,926,444
  27,927,074
  27,927,080
  27,927,929
  27,927,937
  27,927,969
  27,928,543
  27,928,849
  27,929,413
  27,929,820
  27,930,485
  27,930,893
  27,931,281
  27,931,347
  27,931,421
  27,931,663
  27,931,725
  27,931,836
  27,932,155
  27,932,242
  27,932,269
  27,932,298
  27,932,318
  27,932,475
  27,932,520
  27,932,871
  27,932,939
  27,932,957
  27,932,978
  27,933,070
  27,933,127
  27,933,140
  27,933,166
  27,933,182
  27,933,453
  27,941,688
  27,942,207
  27,942,385
  27,943,036
  27,943,500
  27,944,435
  27,944,661
26/-
?
-
-
G
5
G
T
C
T
C
G
G
C
C
-
C/-
4
C
A
A
-
A
C
A
T
G
2
A
G
C
A
G
-
T
-
A
G
T
T
T/-
T
T
A
C
T
T
C
A
G
C
A
-
-
T
C
T
T
C
C
A
-/A
T
G
A
A
-
-
C
G
T
G
A
T
-
T
G
C
C
T
G/T
-/C
C
T
A
-
T
A/C
A
G
G
C
A
18
C
-
C
C
C
C
A
T
C
C
C
A
T
G
C
2
-/C
C
G
C
T
T
C
C
G
A
A
T
T
T
T
T
T/-
C
C
G
C
T
C
G
T
C
4
G
C
2
G
A
C
T
G
G
A
A
2
G/A
-
T
-
C
T
T
C
A
C
C
G
A
G/C
G
T
G
A
C
G
T
A
T
6
T
-
T
G
-
G
A
A
-
T
G
T
G
A
T
T
T
G
A
-
C
G
G
G
G
C
A
C
T
2
T
A
C
A
G
G
4
G
G
18
C
G
A
C
G
-
A
A
T
-
G
C
-
C
C
T
G
A
T
T
T
-
-
A
A
G
4
-
2
2
2
A
A
A
A
-/A
A
T
T
T
T
C
A
C
T
C
T
T
A
C
G
C
T
T
-
G
C
-
T
C
G
G
C
A
A
C
G
T
G
-
G
A
G
A
G
G
A
C
G
G
T
T
C
T
G
A
G
T
T
G
T
C
C
G
T
T
T
C
G
-
A
G
G
-
T
-
C
G
G
G
C
T
G
T
C
A
A
T
G
C
G
G
C
C
C
-
C
A
A
T
A
C
-
C
G
T
-/A
A
C
-
G
A
G
A
G
A
G
T
T
G
A
G
T
A
T
G
T
G
G
G
A
C
-
3
G
C
T
G
G
-
G
G
T
C
T
T
C
T
T
A
C
-
G
5
53
T
A
A
C
T
A
G
T
G
T
G
C
T
G
A
C
A
C
A
A
-
-
-/A
-/T
T
G
C
T
C
A
A
G
A
T
G
T
T
T
C
2
G
C
C
A
T
C
-
T
A
A
T
A
G
G
G
G
A
C
-
A
T
C
C
T
T
A
T
G
G
A
T
A
G
A
-
T
A
A
T
4
A
G
C
A
A
T
G
G
G
C
A
C
G
G
T
A
G
A
A
T
A
C
A
C
T
-/T
T
-
-
T
A/-
A/-
C
8
A
G/C
T/C
-/5
C
G
T
G
T
C
C
-
A
T
G
T
T
T
C
T
2
T
T
C
A
A
20
A
-
G
G
G
G
C
C
A
C
A
-
G
A
T
T
T
T
G
T
G
G
A
T
C
A
C
A
T
C
G
G
G
T
G
G
A
A
A
C
3
A
T
G
C
A
G
T
A
G
A
G
-
A
A
T
T
C
A
T/A
-/A
G
C
C
C
C
-
-
-
A
A
G
T
-
2
G
C
C
C
C
A
T
2
G
T
T
T
C
A
T
T
T
A
-
C
A
-/A
C
T
A
G
A
C
C
T
-
G
C
G
A
G
T
2
T