Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly mRatBN7.2

Genes ( + )

Genes ( + )

Genes ( - )

mRatBN7.2

F344/DuCrl (2019)


Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere										Rere
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	LOC120103044										LOC120103044							--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
-	4	-	G	T	T	T	C	A	C	A	A	G	A	A	-	12	C	T	T	T	T	T	-	G	A	T	A	-	A	G	T	A	3	C	C	C	G	A	T	T	T	G	T	A	C	T	T	A	C	34	T	T	A	-	-	A	A	A	G	A	G	-	C	A	G	A	T	C	G	G	C	G	A	28	A	G	A	T	C	C	C	G	C	G	T	G	C	G	-	G	T	A	C	C	T	A	C	C	G	C	G	A	A	G	A	A	G	A	C	C	T	T	-	A	G	22	A	C	T	C	C	T	-	C	A	A	T	T	C	3	T	A	G	G	T	C	C	G	T	C	C	4	T	C	C	C	G	7	A	G	-	T	C	G	-	T	T	C	C	A	G	G	C	C	G	G	A	A	C	C	G	A	A	6	T	20	A	T	G	G	G	G	G	20	A	3	-	T	C	C	C	C	G	G	9	T	C	T	2	G	A	3	G	G	A	T	C	G	T	-	4	5	T	C	A	C	A	C	G	2	8	A	A	A	-	A	A	A	A	G	C	-	T	A	T	T	-	A	C	A	G	C	C	T	T	4	C	-	T	C	A	C	A	A	A	4	T	T	-	-	G	A	-	C	T	T	G	C	G	G	G	A	A	A	A	C	C	C	A	G	C	15	T	G	A	T	T	T	G	C	G	A	T	T	15	G	G	T	G	T	G	T	4	C	A	C	C	C	T	C	G	T	T	T	T	C	-	G	G	A	A	C	C	T	C	4	C	4	T	A	A	-	T	C	T	A	A	G	A	A	C	G	-	2	-	T	A	C	-	A	-	T	C	G	A	C	A	T	-	T	A	G	G	T	A	T	A	T	C	G	T	A	C	G	-	T	G	G	C	C	C	T	G	C	C	C	A	A	T	C	G	G	G	G	C	C	C	G	G	T	T	G	-	5	G	A	T	G	T	C	-	T	G	C	G	C	A	T	T	G	G	C	A	C	A	G	T	-	G	G	G	G	G	G	G	G	G	-	T	2	G	G	C	A	A	G	G	A	C	T	T	T	G	T	T	-	T	A	T	A	C	A	-	T	C	T	C	G	G	C	G	C	C	A	G	G	T	T	A	C	C	-	C	A	-	C	C	A	T	-	-	-	C	T	G	T	C	-	G	A	G	T	G	-	G	A	G	A	A	-	2	A	A	T	A	C	A	G	13	T	C	G	A	G	T	A	G	-	T	T	C	C	C	A	4	G	G	G	C	T	G	T	A	G	A	C	A	C	C	C	T	G	-	A	-	-	T	T	G	A	T	T	T	T	26	C	C	C	A	T	G	T	C	C	A	2	A	T	G	A	T	T	C	C	A
160,767,682	160,767,714	160,767,731	160,769,167	160,769,936	160,769,937	160,770,071	160,771,178	160,771,575	160,771,707	160,772,075	160,772,435	160,773,479	160,773,910	160,773,911	160,773,945	160,774,743	160,774,759	160,774,767	160,774,771	160,774,793	160,774,797	160,774,801	160,774,835	160,775,175	160,776,420	160,776,780	160,776,782	160,778,102	160,778,175	160,778,587	160,778,772	160,778,817	160,779,949	160,780,269	160,780,516	160,781,033	160,781,342	160,781,381	160,781,529	160,781,947	160,782,509	160,782,510	160,782,514	160,782,983	160,783,694	160,783,709	160,786,311	160,786,314	160,786,315	160,786,349	160,786,921	160,787,924	160,787,944	160,789,278	160,789,644	160,790,171	160,790,591	160,790,846	160,790,908	160,791,457	160,792,033	160,792,097	160,792,533	160,792,616	160,793,369	160,793,930	160,794,373	160,794,423	160,794,727	160,795,512	160,796,684	160,797,908	160,799,287	160,799,624	160,799,660	160,799,861	160,800,651	160,800,735	160,801,761	160,801,778	160,803,181	160,803,670	160,804,836	160,805,927	160,806,059	160,806,494	160,806,667	160,807,542	160,807,694	160,808,864	160,809,444	160,811,808	160,812,352	160,812,364	160,812,659	160,815,001	160,815,585	160,817,091	160,817,358	160,817,918	160,817,993	160,817,998	160,819,445	160,819,953	160,821,101	160,821,131	160,821,277	160,821,331	160,821,824	160,821,861	160,822,123	160,822,422	160,823,047	160,823,716	160,823,752	160,823,871	160,824,779	160,825,127	160,825,324	160,825,364	160,826,399	160,826,608	160,827,032	160,827,557	160,827,911	160,828,315	160,828,395	160,828,577	160,830,031	160,830,978	160,831,140	160,832,063	160,832,091	160,832,845	160,833,290	160,833,602	160,833,985	160,834,625	160,835,469	160,835,836	160,836,480	160,836,845	160,836,848	160,836,854	160,836,858	160,836,860	160,837,271	160,837,538	160,837,544	160,837,736	160,838,106	160,838,561	160,838,573	160,838,843	160,839,474	160,839,495	160,840,235	160,840,682	160,840,696	160,841,476	160,841,999	160,842,739	160,842,846	160,845,702	160,846,071	160,847,618	160,847,631	160,848,852	160,849,990	160,851,398	160,851,681	160,852,015	160,853,340	160,854,631	160,854,951	160,854,958	160,855,162	160,855,653	160,856,337	160,856,448	160,856,901	160,856,915	160,857,187	160,858,678	160,858,745	160,859,378	160,859,382	160,859,569	160,860,002	160,860,116	160,860,119	160,860,128	160,860,300	160,860,685	160,860,990	160,861,000	160,861,318	160,862,753	160,862,871	160,863,754	160,864,621	160,865,794	160,866,986	160,867,907	160,868,231	160,868,429	160,868,979	160,869,862	160,870,037	160,870,084	160,870,140	160,870,634	160,870,830	160,870,833	160,870,972	160,871,400	160,871,493	160,871,501	160,872,083	160,872,252	160,872,269	160,872,274	160,872,278	160,872,280	160,872,287	160,872,294	160,872,296	160,872,298	160,872,300	160,872,545	160,873,248	160,873,398	160,873,688	160,874,786	160,875,115	160,875,238	160,875,640	160,876,498	160,877,748	160,878,551	160,878,950	160,879,705	160,880,220	160,880,610	160,880,973	160,880,975	160,881,768	160,881,840	160,882,246	160,882,630	160,882,750	160,882,933	160,883,051	160,883,542	160,883,667	160,883,678	160,883,845	160,883,866	160,885,674	160,885,965	160,887,884	160,888,197	160,888,898	160,888,946	160,890,412	160,891,303	160,891,734	160,892,058	160,892,169	160,892,183	160,892,288	160,893,559	160,893,561	160,893,563	160,893,565	160,893,974	160,894,114	160,894,860	160,895,085	160,895,125	160,896,895	160,897,098	160,897,270	160,897,271	160,897,472	160,898,218	160,898,931	160,899,354	160,899,480	160,899,534	160,899,679	160,899,742	160,899,907	160,899,908	160,900,387	160,901,692	160,901,950	160,903,807	160,904,557	160,905,459	160,907,644	160,908,628	160,911,583	160,914,281	160,914,760	160,917,212	160,917,214	160,917,216	160,917,566	160,919,379	160,923,932	160,926,807	160,926,824	160,926,825	160,926,841	160,929,670	160,930,508	160,932,760	160,937,321	160,937,432	160,938,699	160,939,173	160,942,027	160,942,588	160,942,611	160,944,204	160,945,604	160,947,331	160,947,585	160,947,967	160,949,192	160,950,410	160,951,115	160,951,620	160,951,645	160,952,892	160,953,225	160,955,097	160,956,011	160,956,703	160,958,525	160,959,179	160,960,574	160,961,023	160,961,333	160,961,646	160,961,689	160,961,992	160,962,107	160,962,712	160,962,971	160,962,977	160,962,980	160,963,959	160,964,005	160,964,008	160,964,082	160,964,226	160,964,393	160,965,022	160,965,206	160,965,388	160,965,391	160,966,476	160,966,575	160,966,592	160,966,970	160,967,011	160,967,026	160,967,278	160,967,935	160,969,366	160,969,403	160,970,462	160,970,598	160,970,744	160,970,987	160,971,279	160,971,415	160,971,568	160,971,646	160,971,789	160,971,917	160,971,996	160,972,114	160,972,179	160,972,247	160,972,409	160,973,177	160,973,527	160,974,333	160,974,469	160,974,475	160,974,479	160,974,562	160,974,563	160,974,774	160,974,907	160,974,909	160,974,937	160,975,059	160,975,100	160,975,138	160,975,254	160,975,665	160,975,678	160,976,062	160,976,092	160,976,111	160,976,365	160,976,542	160,976,650	160,976,775	160,977,250	160,977,266	160,977,471	160,977,950	160,978,149	160,978,167	160,978,495	160,978,760	160,979,274	160,980,039	160,980,247	160,980,633	160,980,668	160,980,669	160,980,828	160,981,142	160,981,144	160,981,146	160,981,148	160,981,150	160,981,152	160,981,154	160,981,156	160,981,158	160,981,696	160,982,303	160,982,676	160,983,247	160,983,257	160,983,264	160,983,265	160,983,273	160,983,302	160,983,323	160,983,330	160,983,361	160,983,939	160,983,942	160,984,310	160,984,390	160,984,400	160,984,512	160,984,644	160,984,834	160,985,313	160,985,515	160,985,555	160,985,574	160,985,712	160,986,132	160,986,133	160,986,409	160,986,482	160,988,452	160,988,525	160,988,650	160,988,683	160,988,758	160,990,809	160,990,961	160,993,057	160,994,035	160,994,171	160,997,780	160,997,782	160,998,780	160,999,225	161,000,405	161,002,563	161,004,303	161,004,425	161,004,508	161,004,510	161,004,513	161,004,519	161,004,522	161,004,526	161,004,543	161,004,643	161,008,085	161,008,482	161,008,551	161,008,604	161,008,684	161,009,243	161,009,712	161,010,422	161,011,396	161,012,516	161,012,953	161,012,973	161,013,074	161,013,817	161,016,426	161,016,515	161,016,830	161,017,558	161,018,643	161,018,644	161,019,518	161,020,093	161,022,404	161,023,249	161,023,347	161,023,449	161,023,683	161,027,017	161,028,481	161,029,578	161,032,111	161,034,034	161,034,125	161,034,177	161,034,428	161,035,786	161,036,063	161,037,064	161,038,229	161,040,282	161,046,520	161,046,542	161,046,568	161,051,539	161,052,324	161,053,132	161,055,482	161,056,236	161,057,366	161,058,421	161,059,816	161,060,705	161,061,766	161,061,882	161,062,496	161,065,964	161,065,990	161,065,992	161,066,868	161,069,091	161,070,992	161,072,586	161,073,161	161,073,271	161,073,384	161,074,262	161,074,965	161,075,578	161,076,521	161,076,525	161,076,529	161,077,772	161,079,554	161,079,575	161,079,621	161,080,061	161,081,134	161,081,148	161,083,194	161,084,819	161,086,412	161,086,793	161,086,889	161,090,164	161,092,224	161,092,279	161,092,303	161,092,312	161,092,336	161,092,344	161,092,526	161,094,564	161,097,081
2	-	T	A	G	A	C	-/T	C	G	G	G	C	G/-	G/-	-/A	-	-/T	C/-	C/-	A	A	A	T	C	G	A	T	-/2	G	A	C	G	-	T	T	T	A	-	C	C	C	A	C	C	T	C	G	G	G	-	C	-/G	-/T	3	19	T	G	G	T	G	T	G	T	G	A	G	C	T	A	A	T	C	-	-	G	A	G	G	T	T	A	A	T	T	-	A	T	A	G	A	C	C	-/T	-/A	C	G	T	T	A	T	A	G	G	A	T	G/-	C	T	T	T	C	C	G	G	A	-	T	G	-	A	T	C	15	G	G	G	C	G	T	-	A	G	A	A	C	G	T	A	C	T	T	-	-/C	T	T	G	A	-	-/G	A	4	G	T	-	2	-	G	T	T	G	A	T	T	T	A	A	G	G	T	T	A	T	G	-	C	-	G	C	T	T	A	A	T	-	G	-	11	C	T	-/T	C/T	C/G	A	C/-	-	G	T	G	-	A	G	-	A	A	T	C	T	T	-	C	-	-	C	T	G	A	G	G	A	-	-	-/G	-/G	G	2	G	G	G	G	A	T	T	G	G	C	C	8	T	G	G	T	G	A	C	-	-	T	8	C	A	G	T	G	G	G	-	C	C	32	T	A	G	7	A	C	C	A	T	C	C	A	-/T	-/T	-/T	A/T	T	T	T	T	A	-	-	C	T	G	A	C	C	C	G	A	G	G/-	-/G	-	A	A	C	A	G	A	C	-	T	G	-/G	G/-	-/G	A	T	C	-/G	G/-	T/G	G	T	T	A	A	G	G	T	T	C	T	-	T	-	G	G	G	2	A	G	C	G	G	A	G	G/-	T	T	C	-	3	A	G	A	A	G	T	C	A	C	G	T	G	A	2	G	G	-/A	-/A	C	G	C	G	-	G	A	C	-	T	A	T	G/-	T	C	T	T	T	C	A	T	T	T	T	C	G	A	A	A	A	A	T	T	T	T	A	C	C	A	T	-	A	G	C	A	C	T	2	C	T	T	A	T	C	C	C	A	A	G	G	G	G	C	C	A	-/C	C/-	C/-	-/C	C/-	-/C	-/C	C/-	C/-	A	C	-	A	C	A	G	G	A	C	C	T	G	G	-	T	C	C	T	C	T	C	T	G	G	G	G/-	T/-	C	G	A	A	G	A	A	T	C	A	A	-/C	C/-	T	T	T	2	G/-	-/G	3	T/A	G/T	G	G	9	2	9	T	C	A	C	T	C	A	C	T	C	A	5	A	T/-	A	G	G	3	2/-	C/-	G	C	G	T	C	A	-	C	A	C	G	A	C	-	A	8	C/-	G	T	T	G	G	-	-/C	A	A	G	-	A	C	G	A	G	T	T	-/T	-/T	C/T	G	A	-/2	G	T	11	C	C	A	C	G/-	-/G	G/-	C	26/-	G/-	-/G	T	-	-/C	A	T/-	T	T	G	-	G	C	-	-/G	C	C	G	G	C