Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 215,346 (bp)   Positions: 682
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
T
A
A
5
G
C
2
G
T
G
A
G
C
A
-
T
-
T
G
A
T
-
C
2
A
C
A
A
G
A
G
-
A
C
T
A
A
G
T
12
6
A
-
C
C
A
A
T
A
C
A
A
T
G
C
C
C
G
T
A
G
T
G
C
G
T
G
C
A
G
A
A
A
C
A
T
G
G
T
T
G
C
C
T
C
A
T
C
-
G
A
A
C
4
T
C
A
A
A
A
G
G
A
2
T
T
T
A
T
C
A
T
T
A
T
C
G
G
G
T
C
2
4
-
T
20
C
C
C
C
-
G
A
A
T
C
T
T
T
-
T
G
G
A
G
A
C
A
T
G
C
G
C
G
A
T
2
-
G
C
T
G
C
G
T
C
G
T
G
G
C
G
G
G
G
A
T
G
-
T
C
G
A
-
A
T
T
2
C
C
-
C
G
C
C
C
C
C
C
G
A
C
A
G
T
A
T
C
T
G
T
T
T
A
-
G
T
T
G
2
G
A
C
G
C
A
-
T
2
A
T
G
G
A
T
A
A
G
C
C
C
C
T
A
T
A
2
14
G
14
G
A
C
T
G
A
C
C
A
C
T
A
A
A
A
G
G
2
-
C
C
C
A
A
A
T
12
T
4
-
-
T
G
C
-
T
C
A
T
7
2
2
G
T
C
C
G
G
G
T
C
C
C
G
T
G
G
G
G
G
A
T
A
T
G
A
A
A
C
C
C
G
G
A
C
A
T
C
C
A
T
A
A
-
-
A
G
T
A
C
G
G
6
T
G
A
A
A
G
A
-
3
3
3
G
-
C
T
C
G
-
T
G
C
G
-
C
A
5
A
G
T
T
A
A
-
A
T
A
T
A
A
G
G
T
G
T
A
A
-
C
A
-
A
A
G
C
A
-
T
A
G
-
-
A
-
A
2
C
C
C
C
-
-
A
A
A
A
C
A
-
A
G
A
C
G
G
C
G
A
T
G
C
T
C
A
G
-
C
G
G
C
G
A
2
-
A
-
G
-
A
C
T
A
A
C
G
C
C
G
C
C
C
C
T
G
G
G
A
T
T
T
-
5
G
-
A
A
C
C
G
4
G
T
A
A
T
A
T
C
A
A
G
A
A
A
A
G
A
G
C
T
C
T
T
G
T
T
-
C
C
A
T
A
C
A
G
G
G
C
T
T
G
A
C
C
G
G
A
T
T
C
G
A
C
G
A
-
G
G
A
-
C
C
A
2
A
T
G
T
T
G
T
C
G
T
G
T
T
G
T
A
A
-
C
A
C
C
T
A
T
C
A
G
A
A
A
G
A
T
-
C
G
T
A
T
G
A
G
-
A
A
-
G
-
A
A
G
A
-
T
T
C
G
T
T
A
A
G
T
A
C
-
C
T
A
G
2
A
9
-
C
G
G
C
A
20
C
C
T
C
T
T
G
T
-
C
C
A
C
A
G
A
A
C
T
2
A
A
A
C
C
-
A
C
C
G
G
T
G
2
4
T
C
T
C
C
-
A
10
2
T
-
-
G
T
C
C
A
A
T
G
  16,959,519
  16,960,123
  16,961,005
  16,962,146
  16,962,614
  16,963,192
  16,964,134
  16,964,231
  16,965,006
  16,965,399
  16,965,645
  16,965,662
  16,965,909
  16,966,258
  16,966,705
  16,966,731
  16,966,740
  16,967,138
  16,967,288
  16,967,291
  16,967,455
  16,969,061
  16,969,120
  16,970,358
  16,971,108
  16,971,313
  16,972,777
  16,974,401
  16,974,582
  16,974,737
  16,974,824
  16,974,910
  16,974,948
  16,975,171
  16,975,216
  16,975,922
  16,977,049
  16,980,224
  16,981,970
  16,982,071
  16,982,155
  16,982,196
  16,982,204
  16,982,244
  16,982,254
  16,982,261
  16,982,266
  16,982,309
  16,982,313
  16,982,358
  16,982,369
  16,982,441
  16,982,477
  16,982,545
  16,982,548
  16,982,643
  16,982,917
  16,982,943
  16,983,195
  16,983,624
  16,983,709
  16,983,958
  16,984,726
  16,984,784
  16,986,399
  16,988,282
  16,988,912
  16,989,236
  16,990,662
  16,991,321
  16,991,453
  16,992,200
  16,992,254
  16,992,386
  16,992,734
  16,993,187
  16,994,039
  16,994,125
  16,994,133
  16,994,175
  16,994,215
  16,994,222
  16,994,498
  16,994,547
  16,995,328
  16,995,425
  16,995,508
  16,996,575
  16,996,631
  16,996,795
  16,997,016
  16,997,337
  16,997,527
  16,997,575
  16,997,585
  16,997,595
  16,997,807
  16,997,809
  16,998,000
  16,998,423
  16,998,447
  16,998,455
  16,998,473
  16,998,517
  16,998,518
  16,998,702
  16,998,755
  16,998,773
  16,998,788
  16,999,134
  16,999,135
  17,001,891
  17,001,937
  17,002,190
  17,003,184
  17,003,260
  17,003,541
  17,003,824
  17,003,888
  17,004,654
  17,004,828
  17,005,082
  17,005,086
  17,005,091
  17,005,449
  17,005,590
  17,005,912
  17,006,360
  17,006,455
  17,006,891
  17,008,461
  17,010,907
  17,014,254
  17,014,299
  17,016,847
  17,020,061
  17,022,321
  17,022,325
  17,022,329
  17,031,547
  17,032,323
  17,032,610
  17,034,261
  17,038,626
  17,038,729
  17,038,875
  17,039,022
  17,039,038
  17,039,259
  17,039,348
  17,039,368
  17,039,466
  17,039,563
  17,039,860
  17,039,872
  17,040,049
  17,040,471
  17,040,477
  17,040,492
  17,040,509
  17,040,536
  17,040,578
  17,040,598
  17,040,624
  17,040,632
  17,040,638
  17,040,870
  17,040,940
  17,040,951
  17,040,979
  17,040,988
  17,040,997
  17,041,033
  17,041,587
  17,041,757
  17,042,757
  17,043,079
  17,043,487
  17,043,526
  17,043,697
  17,043,944
  17,043,987
  17,044,700
  17,044,917
  17,044,966
  17,045,010
  17,045,042
  17,045,513
  17,045,536
  17,045,807
  17,045,860
  17,045,918
  17,046,408
  17,046,584
  17,046,740
  17,046,863
  17,046,992
  17,047,137
  17,047,271
  17,047,340
  17,047,733
  17,047,960
  17,048,270
  17,049,357
  17,049,417
  17,049,648
  17,049,895
  17,049,903
  17,050,136
  17,051,357
  17,051,554
  17,051,584
  17,051,666
  17,051,667
  17,051,834
  17,052,278
  17,052,361
  17,052,396
  17,052,412
  17,052,414
  17,052,450
  17,052,453
  17,052,516
  17,052,596
  17,052,651
  17,052,668
  17,052,717
  17,052,718
  17,052,737
  17,052,840
  17,052,844
  17,052,852
  17,052,899
  17,053,065
  17,053,078
  17,053,321
  17,053,338
  17,053,585
  17,053,831
  17,054,372
  17,054,508
  17,055,308
  17,056,978
  17,057,286
  17,057,317
  17,058,992
  17,059,139
  17,059,192
  17,059,205
  17,059,240
  17,059,293
  17,059,597
  17,060,099
  17,060,410
  17,062,675
  17,062,709
  17,063,377
  17,063,389
  17,064,660
  17,064,778
  17,065,354
  17,065,562
  17,065,780
  17,065,782
  17,065,784
  17,065,820
  17,065,866
  17,065,932
  17,065,942
  17,066,084
  17,066,104
  17,066,230
  17,066,529
  17,066,637
  17,066,815
  17,066,923
  17,067,657
  17,067,668
  17,067,784
  17,067,843
  17,067,847
  17,068,048
  17,068,370
  17,068,676
  17,068,743
  17,068,762
  17,069,400
  17,069,803
  17,070,305
  17,070,307
  17,070,315
  17,070,466
  17,070,989
  17,071,353
  17,072,419
  17,073,273
  17,074,231
  17,074,761
  17,075,963
  17,076,461
  17,076,925
  17,076,927
  17,077,052
  17,077,535
  17,078,035
  17,078,214
  17,079,030
  17,079,219
  17,079,275
  17,079,335
  17,079,354
  17,079,370
  17,079,375
  17,079,530
  17,079,748
  17,079,750
  17,079,780
  17,079,955
  17,079,993
  17,080,121
  17,080,401
  17,080,438
  17,080,443
  17,080,452
  17,080,494
  17,080,609
  17,080,651
  17,080,739
  17,080,750
  17,081,200
  17,081,210
  17,081,357
  17,081,440
  17,081,491
  17,081,530
  17,081,589
  17,081,765
  17,081,768
  17,081,972
  17,082,043
  17,082,634
  17,082,640
  17,082,725
  17,083,014
  17,083,018
  17,083,170
  17,083,216
  17,083,253
  17,083,336
  17,083,384
  17,083,443
  17,083,444
  17,083,449
  17,083,453
  17,083,538
  17,083,598
  17,083,697
  17,083,905
  17,083,911
  17,084,199
  17,084,243
  17,084,526
  17,084,571
  17,084,814
  17,085,423
  17,086,590
  17,086,837
  17,088,363
  17,088,591
  17,089,805
  17,090,005
  17,090,378
  17,092,126
  17,092,139
  17,092,141
  17,092,235
  17,092,754
  17,092,786
  17,092,800
  17,094,380
  17,096,832
  17,097,112
  17,098,315
  17,098,391
  17,098,645
  17,099,615
  17,099,638
  17,099,941
  17,100,259
  17,100,476
  17,102,091
  17,102,092
  17,102,095
  17,102,096
  17,103,272
  17,103,565
  17,103,748
  17,103,955
  17,104,202
  17,104,203
  17,105,136
  17,106,418
  17,106,704
  17,106,711
  17,106,731
  17,106,744
  17,106,748
  17,106,752
  17,106,754
  17,106,756
  17,106,764
  17,106,765
  17,107,376
  17,107,404
  17,107,407
  17,107,427
  17,107,581
  17,107,718
  17,107,749
  17,107,890
  17,108,051
  17,108,102
  17,108,155
  17,108,368
  17,108,945
  17,109,336
  17,109,400
  17,109,562
  17,109,605
  17,109,613
  17,109,621
  17,109,662
  17,109,739
  17,109,973
  17,110,129
  17,110,760
  17,110,781
  17,110,908
  17,110,959
  17,111,051
  17,111,056
  17,111,059
  17,111,063
  17,111,119
  17,111,150
  17,111,229
  17,111,243
  17,111,274
  17,111,634
  17,111,673
  17,111,734
  17,111,792
  17,111,975
  17,112,010
  17,112,206
  17,112,308
  17,112,497
  17,112,537
  17,112,593
  17,112,773
  17,113,157
  17,113,943
  17,114,797
  17,114,817
  17,115,032
  17,115,156
  17,115,239
  17,115,471
  17,115,528
  17,115,658
  17,115,823
  17,116,730
  17,116,966
  17,117,009
  17,117,353
  17,117,544
  17,118,434
  17,118,482
  17,118,827
  17,118,842
  17,119,040
  17,119,105
  17,119,550
  17,119,605
  17,119,618
  17,119,638
  17,120,441
  17,120,442
  17,120,681
  17,120,809
  17,121,948
  17,122,483
  17,123,152
  17,123,508
  17,123,582
  17,123,584
  17,124,157
  17,124,344
  17,125,879
  17,126,021
  17,126,342
  17,126,534
  17,127,492
  17,127,956
  17,128,018
  17,128,033
  17,128,148
  17,128,245
  17,128,401
  17,128,689
  17,129,006
  17,129,078
  17,129,463
  17,130,313
  17,130,520
  17,132,326
  17,132,468
  17,132,872
  17,133,501
  17,133,581
  17,133,805
  17,133,812
  17,133,917
  17,134,352
  17,134,626
  17,134,637
  17,134,639
  17,134,880
  17,135,340
  17,135,550
  17,135,621
  17,136,049
  17,136,121
  17,136,399
  17,136,615
  17,137,193
  17,137,341
  17,137,388
  17,137,830
  17,137,892
  17,138,450
  17,138,846
  17,138,851
  17,139,045
  17,139,236
  17,139,238
  17,139,240
  17,139,243
  17,139,455
  17,139,880
  17,142,685
  17,143,139
  17,143,200
  17,143,242
  17,143,285
  17,143,633
  17,144,277
  17,145,541
  17,145,805
  17,146,140
  17,146,561
  17,147,029
  17,147,166
  17,147,168
  17,147,202
  17,147,211
  17,147,458
  17,147,709
  17,147,804
  17,147,937
  17,147,993
  17,148,143
  17,148,205
  17,148,217
  17,148,394
  17,148,429
  17,148,615
  17,148,619
  17,148,754
  17,148,903
  17,148,922
  17,148,925
  17,148,934
  17,148,993
  17,149,029
  17,149,046
  17,149,099
  17,149,104
  17,149,140
  17,149,278
  17,149,326
  17,149,418
  17,149,705
  17,149,732
  17,149,756
  17,149,773
  17,149,874
  17,150,287
  17,150,366
  17,150,499
  17,150,549
  17,150,550
  17,150,579
  17,151,165
  17,151,289
  17,151,431
  17,151,904
  17,152,241
  17,152,248
  17,152,253
  17,152,489
  17,152,594
  17,152,621
  17,152,665
  17,152,722
  17,153,042
  17,153,551
  17,153,745
  17,153,749
  17,153,752
  17,153,818
  17,153,930
  17,154,236
  17,154,275
  17,154,640
  17,154,645
  17,154,719
  17,154,842
  17,155,137
  17,155,226
  17,155,614
  17,155,971
  17,155,978
  17,156,763
  17,158,102
  17,158,300
  17,158,305
  17,158,414
  17,158,727
  17,159,241
  17,160,691
  17,160,917
  17,162,221
  17,163,876
  17,164,465
  17,164,496
  17,165,044
  17,165,054
  17,165,413
  17,166,334
  17,166,743
  17,167,820
  17,168,758
  17,169,649
  17,169,679
  17,169,828
  17,169,950
  17,170,583
  17,171,042
  17,171,056
  17,171,245
  17,171,253
  17,171,274
  17,171,281
  17,171,282
  17,171,287
  17,171,289
  17,171,295
  17,171,306
  17,171,308
  17,171,323
  17,171,378
  17,171,402
  17,171,488
  17,171,835
  17,171,956
  17,171,992
  17,172,443
  17,172,475
  17,172,677
  17,172,895
  17,173,083
G
C
G
-
C
T
2/-
T
C
A
T
T
T
G
17
C
C
C
A/-
G/-
A
A
T
-
G
A
G
G
A
G
A
5
G/-
A
C
G
T
A
C
-
-
C
T
A
G
G
T
C
C
T
G
G
G
C
T
A
T
C
C
G
A
A
T
G
A
C
A
T
G
-
-
G
C
T
-
C
-/A
A
G
C
A
T
T
C
T
G
C
T
G
A
T
G
G
-
C
T
G
C
G
-
A
A
C
2/-
-/G
C
C
G
C
T
G
-
C
T
C
A
A
A
A
C
G
-
-
2
C
20/-
A
T
T
T
12
C
-/C
-/C
C
-/T
-/C
C/-
-/C
2
C
A
A
T
A
G
T
T
A
T
T
A
T
A
T
C
-
G
A
T
A
A
T
A
A
T
A
A
A
A
T
T
A
A
A
G
C
A
2
G
A
A
G
C
G
C
A/-
-
G
T
A
T
A
T
A
T
-
A
T
C
G
T
G
A
C
G
C
A
C
A
A
G
A
G
T
A
C
C
-
-
T
G
T
A
G
G
8
C
-
C
G
C
A
G
C
G
G
A
T
T
A
T
C
G
G
G
-
-
C/-
-
-/C
G
T
G
A
-
T
T
G
T
C
G
A/T
A/T
A/T
A/-
A
-
2
G
A
T
T
C
G
G
-
G/-
-
A
9
G
A
-
11
C
G
G
-
-
-
-
A
C
T
T
G/A
T
A
C
C/T
C/T
A
A
G
A
C
T
A
A
G
C
C
C
C
G
G
G
G
G
A
T
A
C
T
G
G
T
T
G
C
G
G
C
C
G
A
C
T
G
A
A
-
G
A
G
C
-
A
G
3
-
-
-
T
3
T
C
T
A
4
C
A
A
A
2
T
G
-
G
C
C
C
G
G
A
G
-
C
C
G
G
-
A
C
A
A
T
T
8
G
G
T
T/CG
G
A
G
G
2
C
G
A
2
2
G
8
T
-
T
T
T
G
C
G
G
G
G
G
A
G
C
G
C
G
G
T
A
T
A
C
-
A
T
C
T
G
A
C
T
A
T
T
T
G
-
6
-/G
11
A
T
-
A
C
G
G
T
C
T
T
A
T
T
T
T
C
T
A
A
G
C
C
G
4
-
A
27
G
G
A
T
C
-
A
G
C
G
C
G
G
T
C
T
C/-
G
G/-
-/G
G
A
G
A
T
C
T
C
A/-
T
C
C
14
T
G
G
C
-
T
G
C
A
T
T
-
C
A
G
A
T
T
C
G
C
C
T
T
G
A
A
G
T
A
A
G
2
A/-
T
G
-
C
-
A
C
-
A
G
A
A
A
A/-
C
G
A
C
G
G
A
T
G
T
G
A
G
G
T
T
A
G
G
G
A
G
C
9
G
A
A
G
G
A
G
A
T
G
G
T
A
2
G
G
T
G
T
C
A
-
A
G
G
G
C
A
C
T
A
C
T
C
G
A
-
-
-
2
T
A
A
G
G
-
T
T
G
T
-
A
A
C
2
T
T
G
T
G
A
G
-
A
-
?
G
G
G
T
T
C
G
T
A
A
A
C
C
-
-
A
T
A
G
G
2
T
-
-
A/-
2
2
A
C
T
G
G
G
C
A