Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 215,346 (bp)   Positions: 640
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
Rcan2
T
A
A
G
C
A
2
13
C
-
3
T
A
C
T
C
C
A
T
C
A
C
C
G
A
-
C
A
T
G
A
A
G
A
G
-
T
T
T
T
C
A
C
C
A
C
T
C
-
A
G
T
G
A
A
T
G
T
C
A
A
T
T
A
A
C
A
-
-
T
4
T
T
3
T
T
T
12
C
6
A
-
C
C
A
A
T
A
C
A
A
T
G
C
C
C
G
T
G
A
C
C
G
A
G
T
G
T
A
C
T
A
C
C
G
T
T
C
A
G
A
T
T
A
A
T
C
T
G
T
T
G
C
G
T
G
C
A
C
T
7
T
T
-
-
T
T
A
A
A
A
G
A
C
G
A
T
C
G
G
G
G
G
T
G
A
C
A
A
G
T
T
-
T
C
A
G
C
C
T
A
A
G
G
A
T
T
A
T
T
T
A
A
A
A
A
A
G
T
C
-
A
T
T
A
C
C
A
A
A
C
8
-
G
A
T
T
-
G
C
T
C
2
C
A
A
3
A
-
C
7
C
A
C
4
C
-
C
G
G
T
G
T
C
C
G
G
C
A
T
T
T
T
T
T
T
-
G
-
A
A
G
T
-
G
A
-
A
A
C
G
T
T
A
A
-
A
T
T
G
T
C
-
A
T
2
G
A
T
-
T
T
C
C
G
A
G
G
A
C
A
G
C
G
C
G
A
T
2
-
G
C
T
G
C
G
T
C
G
T
G
G
C
G
G
A
A
A
G
T
T
-
T
2
-
A
C
A
A
G
T
G
T
T
T
A
-
G
T
T
G
2
G
A
C
G
C
A
-
T
2
A
T
G
G
G
A
T
A
A
G
C
G
A
A
A
C
-
T
A
-
T
A
C
A
-
A
A
A
A
C
A
9
A
4
G
A
T
C
A
11
-
A
G
C
C
G
T
G
G
A
T
G
T
G
A
A
T
T
C
A
-
A
A
A
C
C
G
4
G
T
A
A
T
A
8
C
C
A
A
G
A
G
C
C
G
A
A
G
C
T
T
G
C
T
T
-
A
T
A
T
A
G
G
G
A
C
G
C
C
T
G
G
G
-
T
G
A
G
G
G
G
A
C
A
G
C
G
T
G
A
G
T
G
A
G
C
A
G
G
T
G
T
A
C
G
C
A
A
-
G
A
C
C
T
A
2
A
T
G
A
T
C
G
C
T
C
G
T
-
A
G
T
A
A
-
C
A
C
A
T
C
A
A
T
A
C
A
A
T
-
C
G
T
A
T
G
A
-
G
A
A
G
9
G
-
A
C
A
-
G
-
A
A
G
A
T
-
C
T
G
A
T
A
G
T
A
C
G
T
A
C
T
A
C
C
A
-
G
G
20
C
C
T
T
A
C
A
G
A
T
A
C
A
A
A
C
C
G
A
A
A
A
G
-
T
A
G
A
G
G
G
T
G
2
-
T
A
T
G
  16,959,519
  16,960,123
  16,961,005
  16,964,532
  16,965,909
  16,966,258
  16,966,476
  16,966,479
  16,966,491
  16,966,705
  16,967,272
  16,967,455
  16,968,242
  16,969,120
  16,969,615
  16,969,702
  16,969,884
  16,969,918
  16,970,085
  16,970,086
  16,970,131
  16,970,891
  16,971,313
  16,971,528
  16,971,538
  16,971,722
  16,971,750
  16,971,840
  16,972,612
  16,972,649
  16,972,777
  16,973,396
  16,973,423
  16,973,546
  16,973,657
  16,973,784
  16,973,933
  16,973,936
  16,973,957
  16,973,969
  16,973,981
  16,973,997
  16,974,021
  16,974,038
  16,974,401
  16,975,171
  16,975,216
  16,975,416
  16,975,442
  16,975,662
  16,975,720
  16,975,751
  16,975,822
  16,975,922
  16,976,059
  16,976,150
  16,976,213
  16,976,275
  16,976,310
  16,976,421
  16,977,049
  16,979,039
  16,979,123
  16,979,139
  16,979,162
  16,979,163
  16,979,203
  16,979,379
  16,979,413
  16,979,439
  16,979,493
  16,979,496
  16,979,687
  16,979,787
  16,980,027
  16,981,237
  16,981,970
  16,982,071
  16,982,140
  16,982,155
  16,982,196
  16,982,204
  16,982,244
  16,982,254
  16,982,261
  16,982,266
  16,982,309
  16,982,313
  16,982,358
  16,982,369
  16,982,441
  16,982,477
  16,982,545
  16,982,548
  16,982,643
  16,982,917
  16,982,943
  16,983,195
  16,983,470
  16,983,624
  16,984,784
  16,985,711
  16,986,399
  16,987,144
  16,988,199
  16,988,282
  16,989,051
  16,989,483
  16,989,594
  16,990,119
  16,990,565
  16,990,662
  16,990,943
  16,991,115
  16,991,227
  16,991,261
  16,991,262
  16,991,878
  16,991,972
  16,992,188
  16,992,254
  16,992,277
  16,992,298
  16,992,299
  16,992,957
  16,993,187
  16,993,263
  16,993,701
  16,994,125
  16,994,133
  16,994,175
  16,994,215
  16,994,222
  16,994,260
  16,994,355
  16,994,361
  16,994,362
  16,994,364
  16,994,391
  16,994,422
  16,994,426
  16,994,436
  16,994,547
  16,994,632
  16,994,715
  16,994,837
  16,994,856
  16,994,885
  16,994,892
  16,994,910
  16,994,912
  16,995,030
  16,995,123
  16,995,223
  16,995,282
  16,995,357
  16,995,508
  16,995,534
  16,995,638
  16,995,639
  16,995,660
  16,995,745
  16,995,765
  16,995,948
  16,995,984
  16,996,070
  16,996,093
  16,996,175
  16,996,226
  16,996,239
  16,996,353
  16,996,424
  16,996,631
  16,996,699
  16,996,761
  16,997,016
  16,997,023
  16,997,038
  16,997,072
  16,997,110
  16,997,337
  16,998,423
  16,998,447
  16,998,455
  16,998,473
  16,998,702
  16,998,755
  16,998,773
  16,998,788
  16,998,995
  16,999,033
  16,999,244
  16,999,283
  16,999,348
  16,999,446
  16,999,592
  17,006,966
  17,007,416
  17,007,420
  17,007,423
  17,008,502
  17,008,882
  17,008,951
  17,009,058
  17,009,149
  17,009,241
  17,010,124
  17,010,156
  17,010,888
  17,010,890
  17,010,933
  17,010,994
  17,011,320
  17,011,512
  17,012,035
  17,012,175
  17,012,205
  17,013,393
  17,013,414
  17,013,470
  17,013,574
  17,013,642
  17,014,179
  17,014,193
  17,014,203
  17,014,208
  17,014,253
  17,014,254
  17,014,263
  17,014,268
  17,014,272
  17,014,286
  17,014,299
  17,014,315
  17,014,438
  17,014,511
  17,014,520
  17,015,194
  17,015,987
  17,016,195
  17,016,604
  17,016,699
  17,016,847
  17,017,250
  17,018,376
  17,019,788
  17,021,474
  17,021,479
  17,021,596
  17,021,698
  17,022,468
  17,023,491
  17,023,496
  17,023,575
  17,023,975
  17,024,183
  17,024,278
  17,024,620
  17,025,028
  17,025,074
  17,025,789
  17,026,244
  17,026,814
  17,027,363
  17,027,387
  17,027,435
  17,027,538
  17,028,576
  17,028,798
  17,029,491
  17,029,821
  17,029,945
  17,030,556
  17,030,651
  17,031,132
  17,031,681
  17,031,709
  17,032,323
  17,033,131
  17,033,196
  17,033,278
  17,033,774
  17,034,639
  17,034,694
  17,034,753
  17,035,035
  17,035,038
  17,035,068
  17,035,212
  17,035,300
  17,035,916
  17,036,040
  17,036,181
  17,036,265
  17,036,268
  17,036,526
  17,036,703
  17,038,729
  17,038,875
  17,039,022
  17,039,038
  17,039,348
  17,039,368
  17,039,513
  17,039,563
  17,039,860
  17,039,872
  17,040,049
  17,040,471
  17,040,477
  17,040,492
  17,040,509
  17,040,536
  17,040,578
  17,040,598
  17,040,624
  17,040,632
  17,040,638
  17,040,870
  17,040,940
  17,040,951
  17,040,979
  17,040,988
  17,040,997
  17,041,033
  17,041,615
  17,042,757
  17,042,816
  17,043,041
  17,043,079
  17,043,697
  17,044,917
  17,045,050
  17,045,489
  17,045,519
  17,045,697
  17,046,152
  17,047,637
  17,048,270
  17,049,325
  17,049,417
  17,051,357
  17,051,554
  17,051,584
  17,051,666
  17,051,667
  17,051,834
  17,052,278
  17,052,361
  17,052,396
  17,052,412
  17,052,414
  17,052,450
  17,052,453
  17,052,516
  17,052,596
  17,052,651
  17,052,668
  17,052,717
  17,052,718
  17,052,737
  17,052,840
  17,052,844
  17,052,852
  17,052,899
  17,052,900
  17,053,065
  17,053,078
  17,053,321
  17,053,338
  17,053,585
  17,054,022
  17,073,003
  17,096,832
  17,097,112
  17,097,318
  17,098,152
  17,099,281
  17,099,638
  17,100,259
  17,101,193
  17,101,722
  17,101,727
  17,102,091
  17,102,092
  17,102,095
  17,102,096
  17,102,431
  17,103,272
  17,103,657
  17,103,748
  17,103,955
  17,106,322
  17,106,325
  17,107,499
  17,108,111
  17,108,368
  17,110,533
  17,110,556
  17,111,212
  17,111,615
  17,111,673
  17,111,734
  17,111,876
  17,112,658
  17,114,797
  17,114,836
  17,115,032
  17,115,156
  17,115,352
  17,115,528
  17,115,823
  17,116,410
  17,116,677
  17,116,967
  17,117,060
  17,117,243
  17,117,344
  17,117,357
  17,117,415
  17,117,433
  17,117,544
  17,118,336
  17,118,434
  17,118,482
  17,118,501
  17,118,842
  17,119,040
  17,119,105
  17,119,550
  17,119,605
  17,119,618
  17,119,638
  17,120,441
  17,120,442
  17,120,642
  17,120,766
  17,120,809
  17,121,948
  17,122,483
  17,123,152
  17,123,508
  17,123,939
  17,124,295
  17,124,414
  17,124,586
  17,124,800
  17,124,915
  17,124,937
  17,125,630
  17,125,705
  17,126,534
  17,127,161
  17,127,492
  17,127,956
  17,128,148
  17,128,401
  17,129,078
  17,129,463
  17,130,073
  17,130,107
  17,130,313
  17,130,474
  17,130,549
  17,130,901
  17,130,929
  17,130,968
  17,131,020
  17,131,077
  17,131,574
  17,131,980
  17,132,060
  17,132,073
  17,132,075
  17,132,083
  17,132,121
  17,132,168
  17,132,326
  17,132,468
  17,132,717
  17,132,872
  17,133,000
  17,133,181
  17,133,370
  17,133,387
  17,133,501
  17,133,581
  17,133,731
  17,133,805
  17,133,868
  17,134,352
  17,134,367
  17,134,424
  17,134,570
  17,134,632
  17,134,880
  17,135,306
  17,135,340
  17,135,375
  17,135,528
  17,135,550
  17,135,551
  17,135,621
  17,135,789
  17,136,049
  17,136,129
  17,136,341
  17,136,399
  17,137,341
  17,137,388
  17,137,866
  17,138,450
  17,138,853
  17,139,045
  17,139,052
  17,139,236
  17,139,238
  17,139,240
  17,139,243
  17,139,417
  17,139,433
  17,143,200
  17,143,242
  17,143,285
  17,143,611
  17,143,633
  17,144,267
  17,144,277
  17,145,541
  17,145,612
  17,145,637
  17,146,140
  17,146,561
  17,147,029
  17,147,166
  17,147,168
  17,147,202
  17,147,211
  17,147,458
  17,147,937
  17,147,993
  17,148,143
  17,148,205
  17,148,394
  17,148,404
  17,148,429
  17,148,493
  17,148,615
  17,148,754
  17,148,903
  17,148,922
  17,148,925
  17,148,934
  17,148,993
  17,149,029
  17,149,046
  17,149,099
  17,149,104
  17,149,135
  17,149,140
  17,149,154
  17,149,157
  17,149,182
  17,149,186
  17,149,191
  17,149,278
  17,149,326
  17,149,417
  17,149,418
  17,149,705
  17,149,732
  17,149,756
  17,149,773
  17,150,247
  17,150,287
  17,150,366
  17,150,605
  17,151,004
  17,151,090
  17,151,124
  17,151,165
  17,151,210
  17,151,289
  17,151,297
  17,151,303
  17,151,431
  17,151,904
  17,152,068
  17,152,248
  17,152,253
  17,152,489
  17,152,594
  17,152,722
  17,153,042
  17,153,519
  17,153,559
  17,153,561
  17,153,818
  17,154,236
  17,154,275
  17,154,719
  17,154,842
  17,155,095
  17,155,177
  17,155,226
  17,155,474
  17,155,547
  17,155,554
  17,157,273
  17,157,921
  17,158,102
  17,158,727
  17,160,118
  17,160,691
  17,162,221
  17,163,876
  17,164,300
  17,164,465
  17,164,652
  17,165,044
  17,165,054
  17,165,413
  17,166,334
  17,167,645
  17,168,758
  17,169,212
  17,169,340
  17,169,390
  17,169,649
  17,169,950
  17,170,562
  17,170,583
  17,171,042
  17,171,056
  17,171,447
  17,171,488
  17,171,956
  17,172,677
  17,172,895
  17,173,653
G
C
G
A
T
G
-
-
-/T
17
-
A
T
T
C
T
T
G
A
A
G
T
A
A
G
4
T
G
G
A
G
G
T
G
T
T
C
C
C
C
T
G
T
G
G
A
C
T
9
C
A
C
A
G
C
C
A
G
T
G
T
G
G
G
G
T
G
2
T
C
-
C/-
C
-
A
C
C
-
T
-
C
T
A
G
G
T
C
C
T
G
G
G
C
T
A
T
C
C
T
G
G
A
A
C
A
C
C
G
G
T
C
G
T
A
A
G
A
T
T
A
C
C
C
G
G
C
T
G
A
G
C
A
T
A
C
C
T
G
T
C
-
C
C
12
3
C
C
G
G
T
G
A
T
G
A
C
C
T
A
T
A
T
A
C
A
C
T
T
G
T
C
C
G
G
T
T
A
T
A
C
G
-
A
A
C
C
C
G
C
C
C
T
G
G
G
C
G
C
A
T
T
-
C
C
G
A
T
-
T
T
G
-
T
A
G
C
C
3
A
T
C
T
-
G
C
C
-
-/C
C
A
-
A
-/C
T/-
-
G
G
G
A
C
A
A
C
T
A
T
C
A
G
C
-
-
C
C
C
A
2
A
T
G
G
A
C
T
A
G
T
G
G
T
A
-
G
G
G
A
T
C
A
A
A/-
T
A
G
C
-
A
C
A
12
C
C
T
G
A
G
T
A
G
T
T
T
T
A
T
A
T
C
-
G
A
T
A
A
T
A
A
T
A
A
A
A
T
T
A
G
G
C
A
C
G
C
C
-
6
-
T
G
G
A
C
A
A
G
A
G
T
A
C
C
-
-
T
G
T
A
G
G
8
C
-
C
G
C
A
A
G
C
G
G
A
G
T
G
G
G
T
A
A
T
A
C
G
G
G
T
T/CG
G
G
G
G
G
-
C/-
-
A
G
G
T
C
-
T
-
A
T
T
A
C
T
A
G
C
T
C
A
G
G
G
C
T
-
27
C
G
G
T
T
C
-
A
G
C
G
C
G
-
A
T
C
T
-/C
G
A
G
A
A
G
G
C
G
C
C
A
T
C
C
14
G
C
G
C
-
A
A
A
C
G
A
T
A
-
A
A
A
G
C
A
G
C
A
A
A
C
G
G
T
T
A
-
A
G
A
-
A
G
C
T
G
A
A
C
A
C
G
T
T
T
G
G
T
A
G
-/A
T
C
G
-
C
-
A
C
G
A
A
T
A
C/-
A/-
C
3
G/-
A
C
G
G
A
T
G
T
G
G
T
T
G
-
G
T
G
G
C
9
G
A
A
G
G
A
G
2
A/-
G
G
-
-
A/-
T
G
T
G
T
A
2
G
C
T
G
C
5
T
C
A
G
G
G
A
G
G
A
A
C
T
A
C
G
T
T
T
2
A
A
-
T
G
A
G
G
T
G
C
G
C
G
T
G
G
-
A
A
C
G/-
G
G
G
A
C
C
G
A
G
A
A
A
C
C
-
2
C
G
C
C