Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 291,945 (bp)   Positions: 676
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
Rapgef4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC103695171
LOC103695171
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
-
C
C
T
A
T
A
A
A
T
G
A
T
T
C
4
A
C
C
C
A
T
G
G
T
G
T
C
C
T
T
A
T
T
C
T
C
G
T
G
G
G
T
C
A
6
G
2
C
C
C
5
C
G
A
-
A
G
T
C
C
G
C
C
T
-
T
T
C
A
-
T
G
T
A
G
A
C
T
C
-
A
A
A
C
T
-
G
T
C
G
C
-
C
-
26
T
T
T
A
G
G
G
-
-
C
C
C
36
T
T
T
G
C
C
T
-
G
G
G
G
T
A
G
C
-
A
C
C
T
T
A
C
T
-
G
-
C
-
A
C
A
C
T
T
G
T
A
A
-
C
C
T
C
G
A
C
T
C
A
T
T
6
A
T
T
A
G
G
T
A
C
-
-
G
T
C
C
4
T
G
C
C
C
C
G
T
G
A
T
-
A
A
2
G
2
C
A
T
T
C
A
C
C
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
A
C
T
C
A
2
4
T
T
5
14
C
4
A
A
9
42
A
C
A
-
C
-
T
C
G
C
G
C
C
C
A
T
C
T
T
T
T
A
A
G
-
C
-
C
-
G
A
A
T
A
G
A
A
A
G
A
G
-
C
T
A
2
A
G
2
G
G
-
C
A
G
G
G
T
2
G
G
C
G
A
A
C
C
C
A
C
A
C
T
A
T
A
T
G
C
A
T
C
G
C
A
-
T
T
-
G
G
T
4
A
T
T
T
G
G
G
G
C
T
T
T
C
-
T
C
A
A
A
G
C
T
T
C
-
C
G
T
T
G
A
T
A
G
T
G
G
-
T
T
C
A
T
G
C
C
G
5
T
A
A
C
A
A
G
G
A
C
-
C
G
3
G
T
A
13
C
C
T
C
T
T
T
-
T
-
-
G
A
A
A
T
A
C
T
C
C
2
T
13
T
G
T
3
T
G
A
G
A
T
G
3
T
A
A
A
A
T
A
T
G
A
C
T
G
A
C
C
T
A
C
T
T
C
A
C
A
A
A
T
C
T
A
C
G
A
T
T
G
C
G
G
A
A
A
C
G
T
T
G
T
G
T
T
T
A
C
T
A
11
G
T
G
T
A
T
C
T
T
-
C
C
C
C
A
T
T
T
T
C
C
T
A
G
A
T
T
T
C
A
T
A
C
T
T
C
G
G
G
T
T
T
T
C
C
C
T
G
C
A
T
G
G
A
A
G
G
C
G
G
C
A
A
A
A
C
G
T
A
10
C
C
C
C
C
G
A
G
C
A
-
A
G
T
G
A
-
A
C
A
A
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
G
T
T
C
C
C
A
G
G
T
T
T
A
A
T
C
-
-
-
-
C
G
T
C
T
A
G
G
C
A
T
C
G
C
G
A
C
T
A
C
C
-
C
T
T
G
C
T
C
C
T
T
-
A
G
T
T
C
C
C
T
A
C
T
A
G
-
C
124
C
T
A
G
G
G
G
C
T
C
C
C
T
A
T
C
C
G
-
  56,809,466
  56,809,551
  56,809,642
  56,809,710
  56,810,374
  56,810,962
  56,810,977
  56,811,095
  56,811,125
  56,812,131
  56,812,761
  56,812,830
  56,812,970
  56,813,532
  56,813,831
  56,815,047
  56,815,129
  56,815,151
  56,815,281
  56,816,917
  56,816,973
  56,817,474
  56,818,790
  56,820,072
  56,820,634
  56,820,662
  56,820,995
  56,821,005
  56,822,095
  56,822,360
  56,822,661
  56,822,982
  56,823,955
  56,824,013
  56,824,107
  56,825,280
  56,825,689
  56,825,710
  56,825,833
  56,825,918
  56,826,278
  56,827,378
  56,827,388
  56,827,430
  56,827,902
  56,828,023
  56,828,919
  56,832,458
  56,837,332
  56,838,521
  56,840,997
  56,843,111
  56,859,330
  56,861,617
  56,862,365
  56,863,125
  56,865,601
  56,866,154
  56,870,955
  56,871,452
  56,871,663
  56,871,750
  56,871,776
  56,871,831
  56,872,279
  56,872,355
  56,872,518
  56,872,567
  56,872,569
  56,873,008
  56,873,179
  56,873,183
  56,873,411
  56,873,788
  56,875,144
  56,876,450
  56,877,002
  56,877,040
  56,877,108
  56,877,317
  56,878,024
  56,878,277
  56,878,502
  56,879,345
  56,879,604
  56,880,045
  56,880,075
  56,880,230
  56,880,290
  56,880,362
  56,880,373
  56,880,531
  56,881,270
  56,881,384
  56,881,838
  56,881,883
  56,882,116
  56,882,408
  56,882,425
  56,882,712
  56,883,032
  56,883,348
  56,883,448
  56,883,468
  56,883,485
  56,883,503
  56,883,554
  56,883,558
  56,883,562
  56,883,569
  56,883,655
  56,883,771
  56,884,675
  56,885,134
  56,887,237
  56,887,431
  56,887,870
  56,887,947
  56,888,133
  56,888,202
  56,888,361
  56,888,720
  56,888,829
  56,889,265
  56,889,423
  56,889,572
  56,889,918
  56,890,033
  56,890,256
  56,891,012
  56,891,136
  56,891,245
  56,891,467
  56,891,495
  56,891,636
  56,891,704
  56,891,737
  56,891,815
  56,892,158
  56,892,169
  56,892,223
  56,892,375
  56,892,662
  56,892,804
  56,892,975
  56,893,148
  56,893,353
  56,893,725
  56,894,767
  56,894,880
  56,894,996
  56,895,299
  56,895,452
  56,895,562
  56,896,073
  56,896,233
  56,896,243
  56,896,457
  56,896,865
  56,896,943
  56,897,091
  56,897,435
  56,897,483
  56,897,799
  56,897,946
  56,898,122
  56,898,229
  56,900,970
  56,902,044
  56,902,404
  56,902,637
  56,903,284
  56,903,912
  56,904,004
  56,904,005
  56,904,014
  56,904,200
  56,905,504
  56,905,662
  56,908,218
  56,908,521
  56,909,596
  56,909,795
  56,909,797
  56,909,799
  56,909,805
  56,910,367
  56,911,715
  56,912,428
  56,913,082
  56,913,457
  56,914,226
  56,915,051
  56,917,498
  56,917,947
  56,917,979
  56,918,208
  56,918,550
  56,919,076
  56,920,147
  56,920,149
  56,920,380
  56,921,153
  56,921,782
  56,921,783
  56,922,082
  56,922,357
  56,922,359
  56,922,361
  56,922,363
  56,922,365
  56,922,367
  56,922,369
  56,922,371
  56,922,373
  56,922,375
  56,922,377
  56,923,059
  56,923,162
  56,923,507
  56,923,768
  56,924,401
  56,924,523
  56,924,530
  56,924,547
  56,924,633
  56,924,740
  56,924,817
  56,924,873
  56,925,222
  56,925,389
  56,925,405
  56,925,412
  56,925,779
  56,926,247
  56,926,328
  56,926,421
  56,926,430
  56,926,551
  56,926,864
  56,927,174
  56,927,660
  56,927,874
  56,928,041
  56,928,272
  56,928,357
  56,928,360
  56,928,671
  56,928,761
  56,928,957
  56,929,044
  56,929,168
  56,929,334
  56,929,519
  56,929,720
  56,930,272
  56,931,051
  56,931,204
  56,931,364
  56,931,502
  56,931,848
  56,931,986
  56,932,318
  56,932,524
  56,933,668
  56,933,959
  56,935,088
  56,935,237
  56,935,400
  56,936,179
  56,936,886
  56,937,134
  56,937,514
  56,937,642
  56,938,374
  56,940,238
  56,941,029
  56,941,288
  56,941,612
  56,941,989
  56,942,291
  56,944,064
  56,945,069
  56,945,181
  56,946,288
  56,946,292
  56,946,711
  56,947,104
  56,947,782
  56,947,987
  56,948,089
  56,948,388
  56,949,143
  56,949,164
  56,949,199
  56,949,273
  56,949,297
  56,950,218
  56,950,860
  56,951,323
  56,951,687
  56,952,242
  56,953,201
  56,954,558
  56,954,871
  56,954,976
  56,955,285
  56,955,286
  56,956,655
  56,957,481
  56,957,599
  56,957,982
  56,958,176
  56,958,477
  56,960,896
  56,961,191
  56,962,538
  56,963,089
  56,963,132
  56,963,138
  56,963,437
  56,963,784
  56,967,734
  56,968,483
  56,969,190
  56,972,710
  56,972,759
  56,978,051
  56,978,133
  56,978,143
  56,978,280
  56,978,644
  56,978,817
  56,979,204
  56,979,916
  56,980,013
  56,980,537
  56,980,933
  56,981,166
  56,981,168
  56,981,174
  56,981,351
  56,981,397
  56,981,927
  56,981,966
  56,981,972
  56,982,162
  56,982,340
  56,982,516
  56,982,533
  56,982,572
  56,982,650
  56,982,962
  56,983,175
  56,983,440
  56,983,597
  56,983,639
  56,983,702
  56,983,842
  56,983,874
  56,983,914
  56,983,943
  56,984,022
  56,984,100
  56,984,111
  56,984,266
  56,984,363
  56,984,411
  56,984,530
  56,985,174
  56,985,278
  56,985,376
  56,985,449
  56,985,746
  56,985,831
  56,986,674
  56,987,058
  56,987,154
  56,987,279
  56,988,361
  56,989,097
  56,989,614
  56,989,813
  56,990,340
  56,991,179
  56,991,503
  56,991,748
  56,993,236
  56,993,697
  56,993,857
  56,994,479
  56,994,488
  56,994,641
  56,995,402
  56,995,571
  56,995,595
  56,995,674
  56,995,874
  56,995,979
  56,996,235
  56,996,308
  56,996,610
  56,996,614
  56,996,705
  56,997,345
  56,997,506
  56,997,612
  56,997,628
  56,997,678
  56,997,948
  56,999,636
  57,001,265
  57,001,464
  57,001,605
  57,001,801
  57,001,891
  57,002,041
  57,002,327
  57,002,352
  57,002,475
  57,002,763
  57,002,867
  57,002,905
  57,003,005
  57,003,083
  57,003,199
  57,003,280
  57,003,314
  57,003,444
  57,003,490
  57,003,512
  57,004,292
  57,004,356
  57,004,423
  57,004,524
  57,004,613
  57,004,618
  57,004,619
  57,004,687
  57,004,883
  57,004,966
  57,005,507
  57,005,942
  57,006,108
  57,006,451
  57,006,618
  57,006,766
  57,006,820
  57,007,126
  57,007,612
  57,007,917
  57,008,323
  57,008,416
  57,009,140
  57,010,242
  57,010,457
  57,010,792
  57,011,381
  57,012,484
  57,012,789
  57,013,045
  57,013,703
  57,013,850
  57,014,590
  57,014,632
  57,014,784
  57,015,028
  57,015,218
  57,015,880
  57,016,110
  57,016,437
  57,016,438
  57,016,818
  57,017,540
  57,017,814
  57,018,057
  57,018,819
  57,018,844
  57,019,094
  57,019,203
  57,019,420
  57,019,537
  57,019,866
  57,019,896
  57,020,222
  57,020,675
  57,020,877
  57,020,990
  57,021,033
  57,021,081
  57,021,260
  57,021,316
  57,021,711
  57,022,882
  57,023,104
  57,023,330
  57,024,392
  57,024,480
  57,024,561
  57,024,730
  57,025,082
  57,026,431
  57,026,965
  57,027,376
  57,027,541
  57,027,543
  57,027,556
  57,027,558
  57,027,626
  57,028,271
  57,033,915
  57,036,391
  57,037,070
  57,037,159
  57,037,202
  57,037,298
  57,037,335
  57,037,511
  57,037,560
  57,037,665
  57,037,710
  57,037,776
  57,037,953
  57,038,131
  57,038,133
  57,038,135
  57,038,743
  57,038,929
  57,039,587
  57,039,734
  57,039,773
  57,040,026
  57,040,201
  57,040,302
  57,040,754
  57,041,065
  57,043,265
  57,043,563
  57,044,055
  57,044,779
  57,046,023
  57,046,052
  57,047,064
  57,047,091
  57,047,520
  57,047,696
  57,047,937
  57,048,527
  57,049,389
  57,054,230
  57,062,471
  57,065,964
  57,066,172
  57,067,170
  57,067,221
  57,067,701
  57,067,747
  57,067,754
  57,067,756
  57,067,758
  57,067,774
  57,068,221
  57,068,224
  57,068,522
  57,068,574
  57,069,001
  57,069,250
  57,069,357
  57,069,409
  57,069,810
  57,070,479
  57,071,193
  57,071,578
  57,071,944
  57,072,086
  57,072,238
  57,072,312
  57,072,317
  57,072,460
  57,072,623
  57,072,625
  57,072,627
  57,072,629
  57,072,631
  57,072,635
  57,072,637
  57,072,639
  57,072,641
  57,072,642
  57,072,647
  57,072,649
  57,072,839
  57,072,906
  57,073,144
  57,073,149
  57,073,358
  57,073,463
  57,073,754
  57,073,967
  57,074,018
  57,074,052
  57,074,082
  57,074,155
  57,074,375
  57,074,453
  57,074,454
  57,074,457
  57,074,460
  57,074,506
  57,074,525
  57,074,534
  57,074,540
  57,074,564
  57,074,565
  57,074,661
  57,074,669
  57,074,937
  57,075,057
  57,075,262
  57,075,269
  57,075,365
  57,075,526
  57,075,568
  57,075,579
  57,075,618
  57,075,721
  57,075,814
  57,075,883
  57,075,941
  57,075,954
  57,075,992
  57,076,010
  57,076,357
  57,076,373
  57,076,374
  57,076,387
  57,076,668
  57,076,703
  57,076,765
  57,076,815
  57,077,087
  57,077,102
  57,077,123
  57,077,126
  57,077,187
  57,078,340
  57,079,034
  57,080,094
  57,081,329
  57,085,718
  57,085,734
  57,087,967
  57,088,033
  57,088,059
  57,089,701
  57,090,099
  57,091,557
  57,092,857
  57,093,312
  57,093,666
  57,093,912
  57,093,914
  57,093,926
  57,093,930
  57,094,093
  57,094,792
  57,095,704
  57,095,984
  57,096,648
  57,096,805
  57,097,585
  57,098,202
  57,098,470
  57,098,730
  57,099,913
  57,100,153
C
G
T
T
A
C
G
T
C
G
C
A
G
C
-
-
-
-/G
T
T
T
C
A
A
A
A
A
C
T
T
C
C
G
A
C
T
C
T
T
C
A
C
C
C
A
T
-
A
2/-
T/-
G
-/T
-
T
A
-
19
-/T
A
C
T
A
A
T
T
C
T
-/C
-/C
T
G
C
C
A
A
C
A
G
T
C
G/T
T
G
G
-
T
A
2
A
C
T
A
T
4
T
8
-
A
G
G/-
G
A
T
A
6
6
T
T
T
-
C
C
A
-
T
T
C
10
A
A
T/C
A
C
C
T
T
4
G
T
T/-
C
C
G
T
C
2
A
8
G
T
G
G
T
T
C
C
T
C
G
G
8
G
T
A
T
A
G
T
C
A
G
C
A
-
G
C
-
G
A
A
A
T
A
2
G
C
C
A
T
-
C
T
G
G
G
G
A
-
A
T
C
G
-
G
-
A
-
T
T
-
G
A
G
A
G
A
-/A
A/-
A/-
-/A
-/A
A/-
-/A
A
A
A
A
G
T
G
A
G
-
-
C
C
-
-
T
-
C
G
-
-
G
T
G
5
T
4
C
T
A
T
C
T
T
T
G
A
T
A
G
C
C
-
-
A
C
T
2
G
2
A
G
G
C
G
A
T
C
G
A
G
A
T
A
C
G
-
G
T
-
A
T
12
T
C
A
A
A
A
-
A
T
T
A
T
G
T
T
T
G
A
T
T
A
G
C
G
C
T
T
T
-
T
C
A/-
A/G
-/13
C
C
A
A
A
C
-
T
C
C
C
A
A
A
A
T
C
A/-
G
T
11
C
T
G
-
G
A
T/-
C/-
A/-
A
A
T
A
C
C
C
G
C
-
A
C
T
A
9
C/-
C
T
T
C
A
G
T
A
-
G
T
G
A
G
G
A
A
G
A
A
G
A
-
A
C
G
-
T
T
C
T
C
C
C
5
C
2
2
A
G
-/G
G
C
T
T
C
A
T
-
A
-
C
A
C
-
C
A
G
A
G
C
A
-
C
C
G
G
G
C
-
-
C
G
T
G
A
C
T
T
A
T
T
C
C
T/-
G
T
C/-
T
T
C
A
C
G
T
A
G
C
C
A
A
A
A
G
-
G
G
A
-
C
A
C
A
C
C
C
G
T
G
T
-
A
C
A
C
G
A
T
C
A
T
T
-/G
G
A
T
C/-
C/-
A/-
-/A
C/T
T
-
C
-
G
-
C
C
T
G
A
G
T
C
C
T
A/-
A/-
-/A
C
G
C
C
A
T
T
C
A
T
G
-
A
A
G
G
A
A
T
-
T
T
G
T
G
G
T
A
G
G
10/-
-/T
-/T
T/-
T
T
-
G
A
T
G
T
G
A
G
C
G
9
T
T
G
C
C
A/-
-/A
-/A
-/A
-/A
A/-
-/A
A/-
A/-
C/-
A
A
T
-
T
C
T
A
G
C
C
G
C
G
T
2
2
47
142
T
T
C
T
G
C
C
A
A
G
A
T
T
T
A
G
T
C
T
A
G
7
A
C
C
-
A
G
G
G
C
-
2
G
A
C
C
A
A
G
C
G
T
-
G
A
2
T
124/-
G
C
G
C/-
C/-
C/-
C
-
G
T
T
-/A
C
G
C
T
T/-
A
G