Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 217,137 (bp)   Positions: 359
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
GK/FarMcwi (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
Rap1gap2
2
C
A
G
A
A
C
G
T
A
7
G
G
A
C
A
T
A
G
C
T
G
C
3
G
A
G
-
A
T
T
A
-
A
G
A
G
T
A
T
C
-
A
A
C
4
T
C
T
A
A
T
G
G
A
G
G
A
T
T
A
G
A
G
A
G
G
2
T
A
-
T
-
C
T
T
T
2
T
G
-
T
C
T
T
T
G
C
T
A
A
A
T
T
-
A
C
T
-
A
G
A
A
G
A
A
A
A
A
C
-
T
G
A
-
A
G
-
-
T
A
A
T
G
T
C
C
A
T
-
T
G
G
G
A
T
C
C
A
A
A
G
C
A
A
G
G
C
C
T
A
A
4
G
T
A
T
T
G
T
G
C
-
C
A
G
A
A
-
C
A
G
C
G
G
C
A
G
T
A
T
A
A
A
A
C
A
C
T
A
A
T
T
A
G
G
2
-
A
T
A
T
A
G
G
T
G
C
2
T
C
T
G
A
G
-
-
A
A
C
A
4
A
C
T
G
-
G
A
G
G
2
2
31
G
G
A
A
-
T
-
T
G
G
G
T
A
-
G
A
A
3
T
A
A
G
C
T
A
G
A
-
-
A
A
C
A
C
A
G
T
T
G
C
G
G
C
G
-
-
C
A
T
-
A
T
A
C
T
C
C
C
G
A
C
A
G
A
T
G
T
G
C
G
A
C
A
G
G
G
G
A
T
C
C
-
T
C
G
C
A
G
-
-
C
T
T
T
A
A
T
T
C
C
A
A
G
C
C
G
G
T
A
T
12
A
G
G
G
A
T
T
-
C
G
A
A
T
T
  59,256,191
  59,257,465
  59,258,477
  59,261,585
  59,261,952
  59,262,586
  59,264,577
  59,265,680
  59,267,402
  59,269,080
  59,270,223
  59,270,969
  59,271,858
  59,271,950
  59,272,500
  59,272,757
  59,274,504
  59,275,115
  59,275,644
  59,275,911
  59,276,434
  59,277,547
  59,277,822
  59,278,102
  59,278,380
  59,279,832
  59,280,692
  59,281,347
  59,283,683
  59,284,397
  59,285,026
  59,286,387
  59,287,919
  59,289,451
  59,289,778
  59,290,964
  59,291,965
  59,292,165
  59,292,171
  59,292,182
  59,292,240
  59,292,736
  59,296,750
  59,297,555
  59,299,060
  59,299,429
  59,301,705
  59,302,228
  59,303,298
  59,309,264
  59,309,330
  59,317,127
  59,317,388
  59,318,336
  59,319,080
  59,320,795
  59,323,712
  59,323,909
  59,324,461
  59,324,562
  59,324,635
  59,325,007
  59,325,031
  59,325,051
  59,325,178
  59,325,347
  59,326,182
  59,326,302
  59,326,418
  59,326,715
  59,326,786
  59,326,939
  59,327,121
  59,327,697
  59,328,098
  59,328,485
  59,328,908
  59,329,051
  59,329,144
  59,329,911
  59,329,977
  59,329,990
  59,331,229
  59,331,276
  59,331,924
  59,332,428
  59,332,801
  59,334,830
  59,335,613
  59,336,249
  59,336,313
  59,336,872
  59,336,893
  59,336,919
  59,337,092
  59,337,531
  59,337,559
  59,337,606
  59,338,349
  59,338,378
  59,338,380
  59,338,454
  59,338,457
  59,338,721
  59,338,816
  59,339,177
  59,339,297
  59,339,330
  59,339,487
  59,340,269
  59,341,087
  59,341,286
  59,341,829
  59,341,997
  59,342,072
  59,342,183
  59,342,672
  59,342,946
  59,343,175
  59,343,663
  59,343,856
  59,344,136
  59,344,137
  59,344,160
  59,344,223
  59,344,310
  59,344,746
  59,345,014
  59,345,155
  59,345,435
  59,346,011
  59,346,302
  59,346,878
  59,347,109
  59,347,913
  59,348,494
  59,348,747
  59,349,336
  59,349,837
  59,350,042
  59,350,403
  59,350,639
  59,351,141
  59,351,168
  59,351,231
  59,351,386
  59,351,615
  59,351,913
  59,352,359
  59,353,700
  59,353,964
  59,354,113
  59,354,268
  59,354,273
  59,354,279
  59,354,458
  59,354,739
  59,354,997
  59,355,155
  59,355,299
  59,355,552
  59,357,670
  59,359,737
  59,360,063
  59,360,107
  59,361,319
  59,362,300
  59,362,582
  59,362,613
  59,365,884
  59,366,052
  59,366,091
  59,366,460
  59,366,787
  59,366,801
  59,366,856
  59,367,056
  59,367,238
  59,367,397
  59,368,243
  59,368,325
  59,368,526
  59,368,842
  59,368,858
  59,369,014
  59,369,539
  59,369,691
  59,369,907
  59,370,226
  59,370,562
  59,370,730
  59,370,795
  59,370,979
  59,371,131
  59,371,326
  59,371,974
  59,372,732
  59,372,823
  59,372,961
  59,373,041
  59,373,173
  59,373,672
  59,374,161
  59,374,170
  59,374,246
  59,374,287
  59,374,367
  59,374,423
  59,374,482
  59,374,520
  59,374,682
  59,374,801
  59,375,277
  59,375,367
  59,375,491
  59,376,034
  59,376,088
  59,376,325
  59,376,615
  59,376,793
  59,376,794
  59,377,468
  59,378,038
  59,378,192
  59,378,209
  59,379,428
  59,380,414
  59,381,852
  59,382,548
  59,382,726
  59,383,046
  59,383,476
  59,383,662
  59,383,854
  59,383,862
  59,384,128
  59,385,126
  59,385,314
  59,386,800
  59,389,039
  59,393,871
  59,394,304
  59,394,644
  59,395,526
  59,396,465
  59,397,845
  59,398,563
  59,399,027
  59,399,805
  59,400,504
  59,400,686
  59,400,790
  59,401,141
  59,401,666
  59,401,845
  59,402,316
  59,402,698
  59,402,901
  59,404,343
  59,404,550
  59,404,564
  59,406,723
  59,406,777
  59,407,391
  59,408,463
  59,409,710
  59,410,015
  59,411,864
  59,411,865
  59,411,935
  59,412,091
  59,412,123
  59,413,029
  59,413,076
  59,413,219
  59,414,292
  59,414,749
  59,415,267
  59,415,640
  59,415,859
  59,416,702
  59,416,901
  59,417,199
  59,417,257
  59,417,271
  59,419,896
  59,420,170
  59,421,301
  59,421,582
  59,422,779
  59,423,223
  59,423,376
  59,423,534
  59,423,760
  59,423,833
  59,424,133
  59,424,178
  59,424,179
  59,425,709
  59,426,059
  59,426,588
  59,427,123
  59,427,173
  59,427,406
  59,427,469
  59,427,472
  59,427,477
  59,427,478
  59,427,482
  59,427,486
  59,427,490
  59,427,922
  59,429,129
  59,430,404
  59,435,219
  59,437,150
  59,437,341
  59,437,925
  59,439,031
  59,439,950
  59,441,727
  59,441,830
  59,444,102
  59,444,354
  59,447,302
  59,448,460
  59,449,878
  59,450,030
  59,450,617
  59,452,936
  59,455,543
  59,456,074
  59,456,107
  59,456,780
  59,457,354
  59,459,026
  59,459,139
  59,459,204
  59,459,242
  59,459,476
  59,460,979
  59,461,095
  59,461,663
  59,462,618
  59,462,761
  59,463,105
  59,464,259
  59,464,658
  59,464,663
  59,465,880
  59,466,462
  59,467,455
  59,467,807
  59,468,071
  59,468,163
  59,468,296
  59,469,130
  59,470,461
  59,471,468
2/-
T
G
C
T
-
G
T
C
G
-
A
T
G
T
G
C
G
A
T
C
A
A
-
T
-
A
2
G
C
G
G
15
T
T
-
A
-
C/-
C
T
5
G
G
T
-
-
A
C
C
T
C
A
A
G
A
A
G
G
C
C
A
G
A
G
A
A
-
C
G
2
C
G
T
C
G
C
-
C
A
T
-
T
C
C
-/A
A
A
C
G
G
G
C
C
T
C
T
A
6
G
A
G
C
A
T
G
T
G
T
T
13
C
A
G
G
G
A
4
2
A
G
G
C
C
C
G
T
T
C
T
C
A
A
C/-
G
A
A
T
G
G
G
A
T
G
G
A
A
T
T
C
C
G
-
T
A
T
C
A
A
C
A
T
-/C
T
G
A
G
G
G
T
G
A
T
A
A
T
G
A
G
-/G
G
T
-
G
G
-
G
G
C
G
G
G
C
T
A
A
-
2
C
A
G
-
G
A
A
C
T
A
-
A
T
C
A
G
A
2
57
G
G
T
G
-
G
T
-/G
A
C
T
G
A
A
-
-
-
-/A
A
G
G
G
C
3
-
C
A
A
C
G
2
A
G
G
-
C
C
C/-
A
T
G
C
A
G
A
A
G
G
T
C
-/A
C/-
A
C
G
A
T
A
A
T
C
14
A
T
G
C
T
-
C
G
T
C
T
G
T
C
C
T
C
C
T
C
A
C
A
T
A
G
T
-/G
C/-
C/-
-/C
-/C
C/-
C
T
A
C
C
T
A
T
G
A
-/A
A
T
C
A
C
G
T
C
C
T
T
T
G
A
T
G
A
A
G
G
C
-
G
A
-
A
G
C
C
11
T
A
G
G
G
A