Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 108,598 (bp)   Positions: 337
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
M520/NRrrcMcwi (2019) 
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
Prkg2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
4
C
A
C
T
A
G
A
A
T
C
A
T
21
C
G
C
G
A
2
A
A
C
T
T
T
C
C
C
C
C
-
T
T
T
T
C
C
T
G
C
A
C
G
T
C
T
T
C
C
G
G
G
T
T
-
C
T
A
T
G
A
T
T
C
C
C
C
A
T
C
G
G
G
A
G
A
A
T
A
T
T
-
T
A
G
-
A
G
T
G
T
A
T
C
-
C
-
C
G
G
C
A
C
T
C
C
A
A
2
T
T
T
C
T
G
C
T
G
C
-
-
G
T
G
2
-
A
G
-
A
T
T
G
T
A
C
T
T
G
-
T
-
A
A
T
C
T
G
A
G
T
A
A
C
T
A
A
T
-
C
-
C
C
C
C
A
T
T
C
G
-
C
-
C
4
T
A
C
G
C
A
C
A
C
G
A
T
G
21
G
G
A
G
T
T
T
-
T
T
G
A
G
T
C
T
G
A
G
T
-
T
G
G
A
G
G
57
A
G
A
G
G
C
A
G
A
T
-
G
A
6
C
C
A
G
G
G
C
C
T
T
7
T
A
C
T
C
A
A
T
G
A
C
A
T
C
T
T
A
A
T
C
G
G
G
C
G
A
C
G
G
11
G
A
C
G
G
G
T
2
A
-
-
T
G
C
G
C
A
G
C
G
T
A
G
A
C
3
G
G
C
G
A
A
A
6
C
C
-
2
-
C
A
C
2
-
2
2
2
-
2
C
G
A
C
G
C
G
A
G
A
G
G
C
T
  10,560,413
  10,560,415
  10,560,872
  10,560,971
  10,561,240
  10,561,333
  10,561,841
  10,562,117
  10,562,156
  10,562,201
  10,562,245
  10,562,313
  10,562,437
  10,562,759
  10,563,134
  10,563,176
  10,563,184
  10,563,408
  10,563,776
  10,563,891
  10,564,172
  10,564,537
  10,564,561
  10,564,611
  10,564,632
  10,565,026
  10,565,085
  10,565,506
  10,565,560
  10,565,600
  10,565,603
  10,565,685
  10,565,978
  10,566,091
  10,566,149
  10,566,166
  10,566,168
  10,566,205
  10,566,209
  10,566,574
  10,566,914
  10,566,971
  10,566,994
  10,567,049
  10,567,096
  10,567,296
  10,567,311
  10,567,312
  10,567,402
  10,567,503
  10,567,530
  10,567,746
  10,567,748
  10,567,758
  10,567,847
  10,568,141
  10,568,144
  10,568,291
  10,568,328
  10,568,640
  10,568,645
  10,568,931
  10,569,524
  10,569,786
  10,569,795
  10,570,627
  10,570,705
  10,570,827
  10,570,921
  10,571,118
  10,571,186
  10,571,406
  10,571,565
  10,572,075
  10,572,463
  10,572,612
  10,572,734
  10,572,904
  10,572,909
  10,573,681
  10,573,762
  10,573,940
  10,574,091
  10,574,289
  10,574,349
  10,574,384
  10,574,411
  10,574,542
  10,574,549
  10,574,587
  10,574,630
  10,575,206
  10,575,585
  10,575,732
  10,575,881
  10,575,958
  10,577,608
  10,577,902
  10,577,908
  10,578,071
  10,578,585
  10,578,660
  10,578,670
  10,578,722
  10,578,926
  10,578,931
  10,578,968
  10,578,985
  10,578,986
  10,579,056
  10,579,198
  10,579,279
  10,579,375
  10,579,419
  10,579,426
  10,579,564
  10,579,571
  10,579,605
  10,579,715
  10,579,716
  10,579,774
  10,579,794
  10,579,795
  10,579,803
  10,579,805
  10,579,985
  10,580,010
  10,580,014
  10,580,021
  10,580,181
  10,580,911
  10,581,074
  10,581,177
  10,581,196
  10,581,200
  10,581,225
  10,581,390
  10,581,440
  10,581,441
  10,581,448
  10,581,935
  10,582,691
  10,582,964
  10,583,172
  10,583,206
  10,583,503
  10,583,582
  10,583,738
  10,584,097
  10,584,101
  10,584,233
  10,584,438
  10,584,591
  10,584,629
  10,585,236
  10,585,472
  10,585,518
  10,585,782
  10,586,235
  10,586,291
  10,587,163
  10,587,678
  10,587,708
  10,588,684
  10,588,702
  10,588,717
  10,588,727
  10,588,728
  10,589,923
  10,590,816
  10,592,833
  10,593,019
  10,593,041
  10,593,044
  10,596,285
  10,596,364
  10,596,506
  10,596,547
  10,596,620
  10,596,679
  10,596,687
  10,596,689
  10,597,218
  10,597,857
  10,598,245
  10,598,332
  10,599,069
  10,601,176
  10,601,258
  10,601,393
  10,601,440
  10,601,723
  10,601,806
  10,601,817
  10,601,882
  10,602,022
  10,602,311
  10,602,352
  10,607,074
  10,607,469
  10,609,199
  10,609,210
  10,609,332
  10,609,660
  10,609,810
  10,609,852
  10,609,930
  10,610,308
  10,610,591
  10,610,600
  10,610,708
  10,610,806
  10,610,855
  10,611,043
  10,611,102
  10,611,114
  10,611,117
  10,611,189
  10,611,356
  10,611,538
  10,611,715
  10,611,737
  10,611,744
  10,611,746
  10,611,858
  10,612,137
  10,612,253
  10,612,314
  10,612,419
  10,612,515
  10,612,670
  10,612,769
  10,612,881
  10,612,971
  10,613,053
  10,613,396
  10,613,654
  10,613,670
  10,613,680
  10,613,733
  10,614,057
  10,615,321
  10,615,758
  10,615,788
  10,615,866
  10,615,976
  10,616,159
  10,616,451
  10,616,911
  10,617,000
  10,617,011
  10,617,059
  10,617,082
  10,617,136
  10,617,167
  10,617,169
  10,617,172
  10,617,183
  10,617,214
  10,617,215
  10,617,232
  10,617,276
  10,617,455
  10,617,485
  10,617,526
  10,617,556
  10,617,569
  10,617,659
  10,617,681
  10,617,820
  10,618,048
  10,618,142
  10,618,214
  10,618,753
  10,618,971
  10,619,154
  10,619,222
  10,619,325
  10,619,426
  10,620,136
  10,620,350
  10,620,360
  10,620,405
  10,620,689
  10,620,745
  10,620,747
  10,620,907
  10,620,968
  10,621,173
  10,621,453
  10,621,773
  10,621,832
  10,622,352
  10,622,605
  10,622,913
  10,622,939
  10,622,943
  10,623,131
  10,623,557
  10,623,624
  10,623,816
  10,623,887
  10,624,206
  10,624,424
  10,624,425
  10,624,598
  10,624,676
  10,624,692
  10,624,697
  10,624,707
  10,624,754
  10,624,758
  10,624,763
  10,624,783
  10,624,784
  10,624,793
  10,624,873
  10,624,914
  10,624,951
  10,625,009
  10,625,070
  10,625,104
  10,625,414
  10,626,164
  10,626,346
  10,627,158
  10,627,414
  10,627,444
  10,627,529
  10,627,942
  10,627,971
  10,628,010
  10,628,138
  10,642,910
  10,642,990
  10,648,649
  10,663,884
-
-
A
G
G
G
G
A
G
G
C
A
T
G
-
T
A
T
A
G
-
G
C
T
C
A
A
T
T
T
A
T
3
G
C/-
T/C
T/C
A
A
C
A
A
G
T
A
C
T
A
C
T
T
A
C
A
C
C
2
T
G
C
G
A
G
A
G
T
A
T
-/T
G
G
T
A
A
T
G
A
G
G
C
-
C
C
19
C
C
A
2
G
A
G
A
C
G
C
G
2
T
2
T
T
A
T
T
T
C
T
A
C
G
-
C
C
C
T
A
A
T
C
A
T
C
18
A
C
A
-
2
G
A
T
G
C
G
A
C
T
T
C
C
A
G
G
38
G
G
-
T
A
T
-
A
C
G
G
T
C
G
G
C
G
T
C
G
T
T
T
G
-
A
T
C
9
G
A
G
-
C
G
T
C
T
G
G
G
T
A
G
C
A
-
A
A
G
A
C
C
C
-/A
T/G
C
C
G
A
C
T
C
C
T
A
C
T
C
A
C
G
-
A
-
-
T
G
A
A
T
G
A
T/-
C
A
A
G
-
T
G
G
-
A
C
T
T
-
C
-
C
G
T
C
T
T
T
C
A
G
A
G
C
T
C
C
C
G
C
T
T
T
C
T
A
G
T
A
A
-
A
T
T
A
A
T
A
-
-/T
A
A
A
A
T
T
T
G
A
T
T
C
G
A
G
T
-
T
C
T
C
C
G
G/-
-
-/A
T
2
-
6
-/A
G/-
-/T
-
2
-
-
-
2
-
T
A
G
T
T
T
T
-
A
G
A
A
T
C