Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 129,526 (bp)   Positions: 187
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
HXB2/IpcvMcwi (2019) 
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
Plpp4
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
A
A
-
-
T
C
G
A
C
C
72
C
T
T
A
G
C
A
C
T
-
G
-
C
A
T
T
T
A
A
-
C
T
T
G
A
G
A
-
G
T
A
T
A
A
G
C
T
T
-
66
A
C
T
A
A
-
A
A
A
G
A
T
C
C
T
C
-
C
G
G
A
A
G
A
G
C
A
T
T
G
T
3
G
G
G
C
T
T
T
G
3
-
A
T
A
A
A
G
C
A
G
C
T
T
T
C
G
A
A
-
-
C
G
G
G
C
A
T
T
T
C
C
A
T
C
C
T
T
A
T
T
A
G
T
C
G
C
C
A
G
G
T
A
G
T
T
T
T
C
A
C
A
T
T
-
-
G
C
6
G
A
T
T
A
A
T
A
T
A
A
T
A
C
G
T
T
A
T
T
T
G
G
C
T
  183,831,250
  183,843,765
  183,844,464
  183,854,442
  183,865,915
  183,875,657
  183,904,405
  183,906,932
  183,907,038
  183,907,129
  183,908,173
  183,909,452
  183,910,228
  183,910,274
  183,910,693
  183,910,890
  183,910,911
  183,911,299
  183,912,046
  183,912,987
  183,913,513
  183,913,627
  183,913,694
  183,913,892
  183,914,013
  183,914,177
  183,914,648
  183,914,792
  183,914,794
  183,914,796
  183,914,954
  183,915,030
  183,916,083
  183,916,233
  183,916,259
  183,916,900
  183,916,969
  183,917,073
  183,917,181
  183,917,699
  183,917,830
  183,917,831
  183,919,002
  183,919,049
  183,919,339
  183,919,442
  183,920,307
  183,920,403
  183,920,449
  183,921,308
  183,923,291
  183,923,423
  183,923,448
  183,923,655
  183,923,719
  183,923,767
  183,923,769
  183,924,360
  183,924,383
  183,925,375
  183,925,379
  183,925,598
  183,925,649
  183,925,759
  183,925,774
  183,926,229
  183,926,729
  183,927,132
  183,927,286
  183,927,938
  183,928,293
  183,928,305
  183,928,473
  183,928,483
  183,928,817
  183,928,925
  183,929,147
  183,929,893
  183,930,135
  183,930,423
  183,930,644
  183,930,888
  183,933,213
  183,933,601
  183,934,044
  183,934,271
  183,935,108
  183,935,757
  183,936,118
  183,936,235
  183,936,617
  183,936,727
  183,936,975
  183,937,280
  183,937,373
  183,937,420
  183,937,659
  183,937,669
  183,937,673
  183,938,163
  183,938,274
  183,938,306
  183,938,369
  183,938,672
  183,938,699
  183,938,839
  183,938,897
  183,938,943
  183,939,008
  183,939,446
  183,940,681
  183,941,104
  183,941,311
  183,941,599
  183,941,619
  183,943,214
  183,943,499
  183,943,501
  183,943,639
  183,943,696
  183,943,967
  183,944,131
  183,944,133
  183,944,536
  183,944,709
  183,945,193
  183,945,619
  183,946,288
  183,946,501
  183,947,057
  183,948,352
  183,948,621
  183,949,253
  183,949,415
  183,949,480
  183,949,834
  183,949,929
  183,950,006
  183,950,119
  183,950,206
  183,950,248
  183,950,482
  183,950,552
  183,950,863
  183,951,187
  183,951,395
  183,951,756
  183,951,884
  183,952,251
  183,952,804
  183,953,121
  183,953,219
  183,954,150
  183,954,342
  183,954,565
  183,954,646
  183,954,662
  183,954,664
  183,954,668
  183,954,726
  183,954,847
  183,955,166
  183,955,220
  183,955,261
  183,955,271
  183,955,346
  183,955,352
  183,955,412
  183,955,413
  183,955,425
  183,955,433
  183,955,541
  183,955,627
  183,955,909
  183,955,975
  183,956,320
  183,956,323
  183,956,558
  183,956,648
  183,956,784
  183,957,842
  183,957,860
  183,958,088
  183,958,120
  183,958,394
  183,958,415
  183,959,189
A
A
G/-
G
4
2
C
T/-
A
C
G
T
-
T/-
C
-
G
A
A
G
T
C
9
A
G
T
G
C
C
C
G
T
A
A
C/-
C
C
G
T
G
2
A
C
G
G
G
T
A
G
C
C
A
-
G
T
A
T
C
2
-
C
T
A
T
C
G
T
C
T
T
T
A
A
G
G
C
T
A
T
-
C
C
A
C
-
-
C
C
-/T
C
G
-
C
-
40
G
C
G
C
C
C
G
G
A
T
G
C
-
T
A
G
G
5
2
T
A
A
C
A
G
A
C
C
T
T
T
C
T
A
C
C
G
C
C
G
C
C
-
A
T
G
G
A
T
C
G
C
C
-
A
C
A
C
T
T
C
C
6
9
A
A
-
A
G
C
C
G
G
C
G
C
G
G
C
T
G
A
A
C
G
C
A
G
A
A
T
C