Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 99,245 (bp)   Positions: 450
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
MR/N (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
Plekhh2
G
-
G
C
-
A
-
A
A
C
A
C
-
-
C
C
G
-
G
T
G
G
T
C
-
2
-
A
A
-
T
C
-
-
A
C
A
A
G
T
T
T
C
T
T
T
C
T
T
A
C
G
C
A
C
C
G
-
-
2
A
A
C
C
-
A
A
G
-
A
-
C
T
G
A
A
T
C
-
A
C
T
G
2
G
G
C
G
G
G
T
G
C
T
C
G
G
-
C
A
-
2
-
-
A
-
A
-
2
G
-
G
C
-
C
-
T
C
T
G
G
-
A
C
C
C
G
G
T
C
G
-
G
C
C
2
T
-
T
T
2
2
A
-
-
T
T
G
G
A
-
A
G
-
-
2
G
G
A
C
C
G
G
G
G
T
-
C
2
G
C
G
G
C
A
G
C
C
G
T
G
C
2
C
12
8
G
A
T
A
T
C
T
2
C
A
C
A
A
A
G
T
G
T
G
T
G
-
A
T
A
G
3
C
A
-
C
C
G
G
-
G
A
T
G
C
G
A
G
G
A
A
A
G
-
T
T
A
A
C
C
C
T
C
C
G
4
A
G
G
A
-
C
T
A
2
-
G
C
G
A
A
A
G
A
-
C
A
C
A
T
C
T
-
G
-
A
G
G
C
A
A
T
C
T
A
-
T
T
G
-
A
C
A
T
T
A
A
T
G
-
-
A
G
T
-
G
T
C
T
A
-
T
A
G
A
A
C
T
-
T
-
-
-
-
-
A
-
T
-
C
A
A
T
-
A
A
T
A
T
-
2
G
G
T
A
C
-
C
C
A
-
G
A
G
2
-
G
-
T
G
C
G
-
-
2
A
-
C
T
2
-
-
G
T
-
-
T
G
T
T
A
T
-
-
G
T
T
A
G
A
-
-
-
G
C
G
A
-
T
T
T
T
2
T
C
C
-
G
T
-
G
A
-
-
-
-
A
A
A
-
C
-
A
T
G
T
T
A
-
G
A
C
C
G
-
8
A
T
C
G
T
T
T
-
-
A
-
-
C
  10,041,114
  10,067,139
  10,067,313
  10,067,387
  10,067,433
  10,067,493
  10,067,789
  10,067,852
  10,067,857
  10,068,416
  10,068,493
  10,068,523
  10,068,861
  10,069,576
  10,069,612
  10,069,703
  10,069,717
  10,069,929
  10,069,991
  10,070,165
  10,070,797
  10,070,799
  10,071,723
  10,071,734
  10,071,803
  10,071,883
  10,071,967
  10,072,381
  10,072,395
  10,072,433
  10,072,453
  10,072,729
  10,072,782
  10,073,019
  10,073,512
  10,073,549
  10,073,656
  10,073,713
  10,073,729
  10,073,734
  10,073,792
  10,073,917
  10,073,986
  10,074,009
  10,074,040
  10,074,052
  10,074,095
  10,074,124
  10,074,135
  10,074,149
  10,074,364
  10,074,421
  10,074,855
  10,074,883
  10,074,951
  10,074,963
  10,074,999
  10,075,034
  10,075,344
  10,075,485
  10,075,498
  10,076,006
  10,076,014
  10,076,176
  10,076,252
  10,076,258
  10,076,286
  10,076,422
  10,076,478
  10,076,483
  10,076,502
  10,076,519
  10,076,634
  10,076,635
  10,076,710
  10,076,720
  10,076,755
  10,076,811
  10,076,870
  10,076,937
  10,076,938
  10,076,964
  10,076,976
  10,076,991
  10,077,017
  10,077,067
  10,077,094
  10,077,132
  10,077,167
  10,077,168
  10,082,942
  10,082,943
  10,083,145
  10,083,162
  10,083,253
  10,083,376
  10,083,544
  10,083,595
  10,083,740
  10,083,790
  10,083,804
  10,083,866
  10,083,920
  10,083,929
  10,083,967
  10,084,019
  10,084,040
  10,084,083
  10,084,084
  10,084,190
  10,084,211
  10,084,282
  10,084,424
  10,084,698
  10,084,867
  10,084,910
  10,084,977
  10,084,988
  10,085,019
  10,085,041
  10,085,043
  10,085,092
  10,085,183
  10,085,275
  10,085,299
  10,085,300
  10,085,307
  10,085,308
  10,085,331
  10,085,346
  10,085,350
  10,085,359
  10,085,364
  10,085,383
  10,085,400
  10,085,404
  10,085,406
  10,085,431
  10,085,449
  10,085,465
  10,085,484
  10,085,496
  10,085,512
  10,085,594
  10,085,603
  10,085,616
  10,085,621
  10,085,635
  10,085,672
  10,085,740
  10,085,892
  10,085,895
  10,085,992
  10,086,365
  10,086,370
  10,086,517
  10,086,522
  10,086,551
  10,086,715
  10,086,856
  10,087,038
  10,087,313
  10,087,316
  10,087,319
  10,087,322
  10,087,429
  10,087,478
  10,087,866
  10,087,868
  10,087,910
  10,088,047
  10,088,586
  10,088,932
  10,088,974
  10,089,231
  10,089,336
  10,089,420
  10,089,869
  10,089,898
  10,091,246
  10,091,312
  10,092,398
  10,092,696
  10,092,709
  10,092,960
  10,093,113
  10,093,278
  10,093,590
  10,093,657
  10,093,857
  10,094,581
  10,096,020
  10,096,228
  10,099,958
  10,101,438
  10,103,857
  10,106,060
  10,106,428
  10,106,925
  10,108,667
  10,108,998
  10,109,557
  10,109,582
  10,109,668
  10,109,701
  10,109,873
  10,110,699
  10,110,738
  10,111,255
  10,111,782
  10,111,793
  10,112,004
  10,112,037
  10,112,062
  10,112,198
  10,112,315
  10,112,318
  10,112,327
  10,112,461
  10,112,462
  10,112,701
  10,112,996
  10,113,753
  10,115,306
  10,116,188
  10,116,503
  10,116,668
  10,116,847
  10,118,057
  10,118,344
  10,118,521
  10,118,659
  10,118,660
  10,118,836
  10,118,853
  10,118,871
  10,118,990
  10,119,242
  10,119,387
  10,119,525
  10,119,619
  10,119,697
  10,119,948
  10,120,038
  10,120,083
  10,120,107
  10,120,168
  10,120,572
  10,121,135
  10,121,137
  10,121,482
  10,121,537
  10,121,542
  10,121,572
  10,121,573
  10,121,610
  10,121,671
  10,121,741
  10,122,139
  10,122,321
  10,122,370
  10,122,429
  10,122,606
  10,122,607
  10,122,707
  10,122,718
  10,122,732
  10,122,955
  10,122,969
  10,123,082
  10,123,193
  10,123,258
  10,123,286
  10,123,312
  10,123,540
  10,123,782
  10,123,831
  10,123,866
  10,123,925
  10,123,986
  10,124,029
  10,124,071
  10,124,098
  10,124,246
  10,124,248
  10,124,292
  10,124,331
  10,124,351
  10,124,528
  10,124,538
  10,124,569
  10,124,658
  10,124,747
  10,124,754
  10,124,793
  10,124,801
  10,124,840
  10,124,843
  10,124,935
  10,124,974
  10,124,984
  10,124,989
  10,124,993
  10,125,030
  10,125,035
  10,125,044
  10,125,068
  10,125,085
  10,125,112
  10,125,134
  10,125,210
  10,125,226
  10,125,258
  10,125,264
  10,125,320
  10,125,345
  10,125,403
  10,125,470
  10,125,573
  10,125,586
  10,125,612
  10,125,619
  10,125,642
  10,125,648
  10,125,658
  10,125,713
  10,125,808
  10,125,810
  10,125,840
  10,125,858
  10,125,888
  10,125,919
  10,125,946
  10,125,948
  10,125,990
  10,125,992
  10,126,034
  10,126,130
  10,126,346
  10,126,473
  10,126,478
  10,126,504
  10,126,516
  10,126,528
  10,126,531
  10,126,597
  10,126,669
  10,126,675
  10,126,692
  10,126,695
  10,126,715
  10,126,769
  10,126,795
  10,126,922
  10,126,924
  10,127,018
  10,127,082
  10,127,230
  10,127,265
  10,127,314
  10,127,336
  10,127,375
  10,127,430
  10,127,466
  10,127,519
  10,127,543
  10,127,583
  10,127,623
  10,127,654
  10,127,791
  10,127,876
  10,127,890
  10,128,008
  10,128,060
  10,128,077
  10,128,106
  10,128,218
  10,128,259
  10,128,287
  10,128,334
  10,128,356
  10,128,399
  10,128,411
  10,128,441
  10,128,450
  10,128,468
  10,128,487
  10,128,495
  10,128,520
  10,128,551
  10,128,639
  10,128,703
  10,128,735
  10,128,802
  10,128,816
  10,128,858
  10,128,928
  10,128,983
  10,129,036
  10,129,098
  10,129,238
  10,129,329
  10,129,460
  10,129,495
  10,129,562
  10,129,572
  10,129,594
  10,129,647
  10,129,690
  10,129,691
  10,129,901
  10,129,915
  10,129,951
  10,130,032
  10,130,036
  10,130,094
  10,130,113
  10,130,119
  10,130,209
  10,130,309
  10,130,332
  10,130,548
  10,130,587
  10,130,646
  10,130,701
  10,130,871
  10,130,895
  10,130,897
  10,130,950
  10,130,979
  10,131,006
  10,131,062
  10,131,269
  10,131,271
  10,131,274
  10,131,285
  10,131,338
  10,131,502
  10,131,518
  10,131,583
  10,131,591
  10,131,623
  10,131,721
  10,131,730
  10,131,811
  10,131,827
  10,131,852
  10,131,865
  10,131,882
  10,131,919
A
G
-
-
C
-
T
-
-
A
-
-
C
A
A
-
-
A
-
-
C/-
C/-
-
-
T
-
T
T
-
C
-
-
C
G
-
-
T
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
T
-
A
T
-
C
-
-
-
T
-
-
A
A
-
A
-
A
T
-
-
-
-
C
C
A
G
-
-
-
-
-
-
-
-/A
C
T
-
-
-
-
-
C
T
G
C
-
T
C
G
C
-
C
-
-
T
-
T
A/A
-
T
-
-
-
-
-
G
-
-
-/T
T
-
T
-
-
-
T
-
-
G
-
-/G
C
-
-
-
-
-
C
C
A
-
-
T
G
C
-
A
C
C
-
A/-
-
T
T
T
T
T
T
T
C
A
G
-
A
-
C
C
T
G
A
-
C/G
-/A
C
T
T
2/-
C/G
-
-
A
G
-
C
G
G
C
-
T
G
T
G/-
T
G
A
C
A
C
T
C
C
4
G
C/-
G
T
-
T
C
2
T
T
T
C
2
A
G
C
T
T
A
G
-/A
C
T
-/T
T
A
T
C
C
C
G
G
T
T
C
T
A
T
-
G
-/A
A/-
C
G
T
A
T
-
T
-
T/-
T
G
-
T
A
-
T
-
-
-
G
A
-
-
A
C
A
-
-
-
-
-
-
C
T
G
-
T
C
A
-
G
T
T
G
-
G
T
-
-
T
T
2
-/T
-
-
T
A
-
-
A
T
T
C
-
-
-
-
-/T
-
C
A
A
A
T
G
A
G
T
-
C
T
G
G
A
2
-
-
-
-
G
T
-
-
T
G
-
-
G
-
-
-
T
T
C
A
-
T
-
G
C
-
-
A
C
G
-
-
G
-
-
-
C
T
T
-/A
T
A
-
-
-
-
T
C
A
G
A
G
C
G
A
T
T
A
G
-
A
A
T
G
A
-
A
-
-
-
A
A
G
T
C
C
-
G
G
G
G
4
G
C
T
G
G
G
-
C
-
-
C
G
G
A
-
T/-
-/T
A
2
-
G
-
-
-
-
-
-
G
A
G
A
G
T