Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 214,709 (bp)   Positions: 489
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
Plch1
-
C
G
G
A
C
C
C
G
A
T
A
T
T
C
T
T
T
G
G
T
C
T
-
-
A
G
T
C
A
C
G
T
G
T
C
C
G
G
-
C
G
A
A
A
A
T
2
G
2
G
C
G
A
A
C
T
A
G
A
A
C
A
G
C
G
T
A
G
T
A
G
A
G
A
-
T
G
A
C
A
C
A
A
A
T
G
-
-
-
-
C
15
G
T
G
A
T
3
A
-
A
G
A
A
T
G
C
G
C
A
G
4
A
G
T
2
C
G
C
G
G
A
G
C
G
A
A
G
C
C
G
A
C
T
T
T
T
T
T
-
-
-
A
A
-
4
C
T
G
C
T
G
C
G
G
A
A
G
A
T
G
C
T
G
A
G
T
-
G
T
A
G
C
G
A
T
G
G
C
A
G
A
A
-
A
G
A
T
-
T
A
G
T
G
-
C
-
2
C
G
3
A
-
G
T
A
A
G
A
T
A
A
C
T
3
C
3
G
-
T
G
T
4
G
A
C
T
-
A
A
T
C
C
G
C
A
2
C
A
T
24
4
A
-
A
8
G
A
-
T
G
G
T
C
A
G
A
2
2
G
6
3
G
A
T
T
T
T
-
-
G
T
T
G
C
T
C
G
A
G
G
T
T
G
T
C
T
C
C
A
C
C
3
T
2
T
T
A
A
A
G
T
A
13
T
G
G
G
A
C
T
T
C
T
C
A
A
G
G
C
13
-
15
-
T
-
G
G
-
7
G
C
A
C
A
C
G
T
G
C
C
C
C
C
G
A
T
G
G
G
G
G
A
T
G
T
C
A
A
A
G
A
C
A
A
C
G
16
A
G
G
A
C
T
A
G
3
G
T
G
A
T
A
C
T
T
T
A
C
A
A
T
C
T
C
G
C
T
T
A
G
C
-
G
G
C
G
A
G
C
T
C
G
G
-
-
A
C
C
-
-
2
G
-
T
2
A
-
T
-
2
A
T
A
C
A
C
A
G
C
G
-
A
G
A
G
C
T
G
T
G
G
T
A
T
T
C
A
-
C
T
G
G
A
T
C
C
A
-
G
A
C
T
T
A
C
G
C
A
T
G
T
T
A
G
T
G
3
  148,150,039
  148,151,545
  148,152,631
  148,152,705
  148,152,885
  148,152,894
  148,153,326
  148,153,469
  148,153,500
  148,153,987
  148,154,442
  148,158,687
  148,160,245
  148,160,968
  148,161,260
  148,161,418
  148,161,846
  148,161,998
  148,162,187
  148,163,291
  148,163,555
  148,163,826
  148,163,919
  148,163,981
  148,164,032
  148,164,125
  148,164,584
  148,164,693
  148,165,069
  148,165,070
  148,165,150
  148,165,325
  148,165,378
  148,165,485
  148,165,624
  148,165,781
  148,166,005
  148,166,635
  148,166,727
  148,166,792
  148,167,248
  148,167,252
  148,167,891
  148,168,390
  148,168,537
  148,168,867
  148,168,989
  148,169,209
  148,169,210
  148,169,215
  148,169,216
  148,169,418
  148,169,921
  148,170,003
  148,170,073
  148,170,332
  148,170,827
  148,171,797
  148,171,859
  148,172,048
  148,172,254
  148,172,748
  148,173,260
  148,173,424
  148,173,540
  148,173,773
  148,174,196
  148,174,722
  148,174,804
  148,175,048
  148,175,099
  148,175,157
  148,175,310
  148,175,471
  148,175,579
  148,176,736
  148,177,418
  148,177,533
  148,177,946
  148,178,031
  148,178,713
  148,178,751
  148,179,072
  148,179,343
  148,180,379
  148,180,535
  148,180,688
  148,180,709
  148,180,726
  148,180,728
  148,180,729
  148,181,020
  148,181,075
  148,181,505
  148,181,646
  148,181,899
  148,182,083
  148,182,313
  148,182,408
  148,182,822
  148,182,956
  148,183,230
  148,183,440
  148,183,492
  148,184,060
  148,184,555
  148,184,890
  148,184,891
  148,184,970
  148,185,522
  148,185,704
  148,185,770
  148,185,809
  148,186,277
  148,186,512
  148,186,551
  148,186,786
  148,186,839
  148,187,151
  148,187,167
  148,187,726
  148,188,079
  148,188,231
  148,188,246
  148,188,298
  148,188,385
  148,189,114
  148,189,317
  148,189,334
  148,189,387
  148,189,532
  148,190,163
  148,192,180
  148,193,445
  148,193,532
  148,193,534
  148,193,536
  148,193,538
  148,193,540
  148,193,542
  148,193,922
  148,193,956
  148,194,529
  148,194,546
  148,195,038
  148,195,057
  148,195,059
  148,195,066
  148,195,088
  148,195,093
  148,195,108
  148,195,339
  148,195,346
  148,195,353
  148,195,387
  148,195,718
  148,196,040
  148,196,265
  148,196,527
  148,196,567
  148,196,571
  148,196,614
  148,196,754
  148,196,775
  148,196,919
  148,197,085
  148,197,214
  148,197,682
  148,197,744
  148,198,457
  148,198,499
  148,198,804
  148,199,270
  148,199,364
  148,199,637
  148,199,808
  148,200,142
  148,200,442
  148,201,180
  148,201,204
  148,201,997
  148,203,197
  148,203,320
  148,203,925
  148,204,393
  148,204,465
  148,204,486
  148,204,610
  148,204,875
  148,205,251
  148,205,956
  148,205,966
  148,206,239
  148,206,253
  148,206,664
  148,206,692
  148,206,806
  148,206,813
  148,206,840
  148,207,008
  148,207,522
  148,208,090
  148,208,207
  148,208,532
  148,208,537
  148,208,736
  148,209,050
  148,209,090
  148,209,291
  148,209,372
  148,209,497
  148,210,017
  148,211,611
  148,212,222
  148,212,329
  148,212,489
  148,213,278
  148,213,285
  148,213,673
  148,214,018
  148,214,162
  148,214,407
  148,214,589
  148,215,289
  148,215,572
  148,216,313
  148,216,565
  148,216,582
  148,217,291
  148,217,553
  148,223,883
  148,223,930
  148,224,246
  148,224,280
  148,224,919
  148,224,984
  148,225,832
  148,225,889
  148,226,469
  148,227,223
  148,229,023
  148,229,937
  148,230,507
  148,230,538
  148,230,583
  148,230,796
  148,230,860
  148,231,128
  148,232,175
  148,232,933
  148,233,657
  148,234,835
  148,234,836
  148,234,864
  148,235,319
  148,237,548
  148,238,524
  148,239,100
  148,240,140
  148,240,357
  148,240,393
  148,243,868
  148,244,087
  148,246,483
  148,247,370
  148,247,608
  148,249,598
  148,249,952
  148,250,959
  148,251,369
  148,252,001
  148,252,136
  148,255,724
  148,258,485
  148,259,136
  148,260,122
  148,260,142
  148,261,393
  148,262,422
  148,262,738
  148,263,450
  148,263,626
  148,263,928
  148,264,175
  148,264,968
  148,265,413
  148,266,583
  148,266,674
  148,266,696
  148,266,853
  148,267,389
  148,267,856
  148,268,368
  148,268,677
  148,269,284
  148,269,299
  148,269,304
  148,269,604
  148,269,915
  148,270,577
  148,270,975
  148,271,983
  148,272,004
  148,272,029
  148,272,392
  148,272,501
  148,273,078
  148,273,153
  148,273,339
  148,273,791
  148,273,823
  148,273,933
  148,274,003
  148,274,040
  148,274,099
  148,274,191
  148,274,230
  148,274,295
  148,274,980
  148,275,214
  148,275,793
  148,276,055
  148,276,346
  148,276,405
  148,276,490
  148,277,127
  148,277,252
  148,277,595
  148,277,774
  148,277,800
  148,278,226
  148,278,353
  148,278,824
  148,279,348
  148,279,840
  148,280,118
  148,280,300
  148,280,393
  148,280,533
  148,280,584
  148,280,753
  148,280,823
  148,281,025
  148,281,118
  148,281,119
  148,281,383
  148,281,468
  148,281,619
  148,281,678
  148,281,688
  148,281,770
  148,281,929
  148,282,030
  148,282,041
  148,282,197
  148,282,290
  148,282,338
  148,282,427
  148,283,067
  148,283,201
  148,283,655
  148,283,808
  148,283,986
  148,285,118
  148,288,440
  148,288,683
  148,288,776
  148,289,015
  148,289,157
  148,289,172
  148,289,281
  148,289,344
  148,289,614
  148,289,914
  148,289,945
  148,290,039
  148,290,128
  148,290,229
  148,290,279
  148,290,285
  148,290,308
  148,290,376
  148,290,958
  148,291,007
  148,291,363
  148,291,537
  148,291,900
  148,292,014
  148,292,251
  148,292,919
  148,293,290
  148,293,432
  148,293,651
  148,293,902
  148,293,953
  148,294,444
  148,294,468
  148,294,480
  148,294,518
  148,295,056
  148,297,809
  148,298,867
  148,300,741
  148,301,130
  148,302,089
  148,302,212
  148,303,120
  148,303,610
  148,303,938
  148,303,939
  148,304,860
  148,306,310
  148,306,319
  148,306,427
  148,306,723
  148,306,919
  148,306,921
  148,307,203
  148,308,611
  148,308,670
  148,308,913
  148,308,915
  148,309,176
  148,309,228
  148,310,071
  148,311,517
  148,311,711
  148,312,015
  148,312,638
  148,313,702
  148,314,981
  148,315,076
  148,318,867
  148,322,396
  148,323,224
  148,323,248
  148,323,362
  148,323,928
  148,324,705
  148,324,742
  148,324,847
  148,325,430
  148,326,364
  148,326,968
  148,328,416
  148,328,442
  148,328,559
  148,328,712
  148,329,022
  148,329,312
  148,329,518
  148,330,316
  148,330,801
  148,330,816
  148,330,907
  148,330,964
  148,330,982
  148,331,460
  148,331,587
  148,331,872
  148,332,108
  148,332,541
  148,333,004
  148,333,430
  148,333,714
  148,333,829
  148,334,087
  148,334,092
  148,334,227
  148,334,831
  148,335,291
  148,336,090
  148,336,305
  148,336,737
  148,337,564
  148,338,476
  148,338,487
  148,338,626
  148,340,729
  148,342,031
  148,344,482
  148,345,776
  148,349,221
  148,350,410
  148,350,618
  148,353,913
  148,358,281
  148,359,413
  148,362,743
A
A
A
A
T
A
T
T
A
G
C
-
-
C
T
C
C
G
A
T
C
T
C
A
3
G
A
C
T
G
T
A
C
A
C
T
T
C
A
2
T
A
G
G
G
G
G
-
-/C
-
C/-
A
A
G
C
T
C
-
A
G
G
T
-
A
G
A
G
G
A
C
G
A
G
T
G
T
C
A
G
T
G
T
G
T
C
G
-/A
C
-/A
-/2
-/2
T
-
T
C
A
-
C
-
G
2
G
A
C
T
C
A
T
A
T
G
A
-
C
A
G
-
T
A
T
A
A
T
A
T
A
G
G
A
A
T
A
-
T
A/-
-/A
-/A
A/-
-/A
T/A
C
A
C
G
G
4
-
T
C
A
T
G
A
T
A
A
G
G
T
C
G
C
T
G
A
T
A
G
T
A
A
G
A
A
A
G
C
T
A
T
G
C
T
G
2
T
A
G
C
T
C
C
A
C
A
2
T
2
-
T
T
-
G
A
T
-
G
C
A
G
C
G
G
T
C
-
T
-
T
A
C
T
-
-
C
C
T
G
C
T
-
C
T
G
A
T
G
-
A
G
G
-
-
C
8
-
-
A
G
3
G
A
A
C
T
G
A
T
-
-
A
-
-
A
G
G
C
C
C
T
2
A
G
C
-/A
T
C
T
A
T
T/-
A
G
C
A
C
T
C
T
A
T
G
T
-
C
-
G
C
G
T
G
C
C
G
-
C
T
A
A
C
A
C
G
A
C
T
G
-
T
A
-
-
5
-
T
C
C
A
A
3
-
A
T
G
T
T
G
A
C
A
G
A
G
A
A
A
T
C
C
A
A
A
A
C
C
A
A
T
-
G
T
A
G
T
G
G
T
T
-
G/-
A
C
C
T
G
G
A
-
T
G
A
G
C
T
T
G
C
A
G
G
G
C
-
T
G
A
A
A
C
G
C
A
T
5
A
T
A
C
C
T
T
C
T
A
A
2
2
G
T
A
-/4
-/4
2/-
G/A
T
C
-
G
T
-
2
-
G
A
G
T
G
G
T
A
T
A
2
G
A
G
A
G
C
C
G
T
A
G
C
G
C
T
T
C
T
C
T
A
G
C
-
G
G
4
A
G
T
G
A
G
A
C
T
G
C
A
C
A
G
A
-
A
-