Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 233,948 (bp)   Positions: 551
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
Pdgfd
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Ddi1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
G
G
A
A
A
C
T
G
G
T
T
T
G
A
T
A
A
G
G
G
A
T
T
A
A
A
G
T
G
T
-
C
G
A
A
G
C
C
G
C
T
A
A
G
T
A
C
G
-
T
T
A
A
C
A
T
T
T
A
G
A
C
T
C
A
A
A
A
G
C
A
G
C
C
4
G
C
G
-
C
T
A
A
A
A
A
A
A
G
A
T
A
G
C
G
-
C
T
T
G
T
G
G
G
T
A
T
T
T
T
C
G
T
A
A
T
A
A
A
G
C
T
C
T
A
C
-
A
C
A
G
G
C
T
T
G
T
C
A
G
C
T
T
T
4
T
A
G
A
C
T
C
T
T
-
G
A
A
4
A
T
T
T
-
C
A
G
G
A
G
C
-
3
7
A
-
G
T
-
C
T
T
G
A
G
C
C
A
T
A
C
G
T
T
A
T
T
-
A
C
G
G
G
G
G
G
A
G
G
A
-
G
A
G
-
G
-
T
T
C
A
A
T
C
C
A
C
C
C
A
G
A
C
C
A
T
A
G
C
A
T
C
A
-
A
G
C
T
-
G
C
-
G
-
C
A
A
A
T
C
T
T
T
C
G
C
A
8
C
A
G
G
C
C
C
G
A
G
A
-
G
C
G
C
T
-
A
T
-
-
A
G
G
T
T
A
G
-
A
G
G
A
C
A
G
A
A
T
G
T
A
T
G
C
G
G
A
A
A
C
A
A
G
T
G
C
-
A
C
G
G
T
-
C
T
-
C
10
A
A
A
G
G
A
T
T
G
T
A
A
G
C
A
C
C
A
T
G
G
T
T
C
T
C
-
G
C
T
T
C
G
A
T
A
T
A
G
G
T
A
A
A
A
C
C
G
G
T
G
C
A
C
A
T
-
C
C
-
A
C
G
C
G
G
G
G
T
G
C
A
G
G
A
T
4
A
2
T
G
T
2
C
T
C
T
G
-
G
G
G
14
C
A
A
A
C
4
A
T
-
T
G
C
C
-
T
T
C
T
T
T
G
-
C
T
C
G
G
G
A
C
T
T
A
C
T
T
G
A
G
G
A
T
G
C
T
A
A
A
T
A
A
T
G
T
T
C
G
A
2
T
T
T
C
A
A
C
C
3
T
2
G
T
T
A
A
C
C
G
T
G
26
T
A
A
-
C
C
G
T
G
A
A
T
G
C
A
G
T
T
C
C
A
T
2
A
A
C
G
A
A
G
T
T
A
G
A
-
A
  3,489,278
  3,489,279
  3,489,311
  3,489,318
  3,489,368
  3,489,693
  3,489,694
  3,489,877
  3,490,033
  3,490,039
  3,496,758
  3,497,863
  3,498,244
  3,498,877
  3,498,896
  3,499,142
  3,499,405
  3,499,805
  3,500,042
  3,501,009
  3,501,693
  3,501,824
  3,501,833
  3,501,912
  3,502,148
  3,502,218
  3,502,364
  3,502,429
  3,502,967
  3,503,002
  3,503,119
  3,503,695
  3,505,324
  3,505,462
  3,505,491
  3,506,573
  3,506,624
  3,507,234
  3,508,007
  3,508,028
  3,508,374
  3,508,462
  3,508,543
  3,508,544
  3,508,589
  3,508,622
  3,508,796
  3,509,028
  3,509,035
  3,509,061
  3,509,075
  3,509,106
  3,509,235
  3,509,573
  3,509,677
  3,509,971
  3,510,521
  3,510,778
  3,510,789
  3,511,179
  3,511,564
  3,511,847
  3,511,928
  3,511,975
  3,512,086
  3,512,330
  3,512,390
  3,512,411
  3,512,573
  3,513,044
  3,513,095
  3,513,324
  3,513,451
  3,513,493
  3,513,669
  3,513,674
  3,513,690
  3,513,761
  3,513,846
  3,513,946
  3,514,004
  3,514,066
  3,514,154
  3,514,337
  3,514,395
  3,514,399
  3,514,403
  3,515,103
  3,515,304
  3,515,398
  3,515,511
  3,515,612
  3,515,620
  3,515,659
  3,515,745
  3,515,876
  3,516,181
  3,516,273
  3,516,321
  3,516,327
  3,516,333
  3,516,802
  3,517,669
  3,517,978
  3,518,266
  3,518,721
  3,518,824
  3,519,315
  3,519,323
  3,519,487
  3,519,598
  3,519,687
  3,520,037
  3,520,583
  3,520,593
  3,520,718
  3,521,034
  3,521,080
  3,521,233
  3,521,850
  3,522,588
  3,522,589
  3,522,848
  3,522,904
  3,523,084
  3,523,733
  3,523,748
  3,524,939
  3,526,327
  3,527,831
  3,530,860
  3,535,061
  3,544,709
  3,544,828
  3,545,065
  3,545,976
  3,548,384
  3,552,280
  3,552,639
  3,553,560
  3,554,308
  3,556,269
  3,556,317
  3,558,317
  3,558,455
  3,558,776
  3,559,821
  3,560,146
  3,560,659
  3,562,462
  3,564,647
  3,565,019
  3,565,164
  3,566,144
  3,566,532
  3,566,977
  3,567,521
  3,569,225
  3,571,213
  3,571,596
  3,571,611
  3,571,661
  3,572,293
  3,573,240
  3,573,249
  3,573,284
  3,573,400
  3,573,682
  3,574,911
  3,576,191
  3,576,907
  3,579,058
  3,581,895
  3,583,480
  3,583,563
  3,583,567
  3,583,810
  3,583,929
  3,586,715
  3,587,104
  3,588,197
  3,589,781
  3,589,899
  3,590,107
  3,590,162
  3,593,686
  3,596,289
  3,596,292
  3,596,411
  3,596,537
  3,597,696
  3,597,916
  3,598,132
  3,598,221
  3,599,334
  3,600,117
  3,600,576
  3,600,676
  3,601,109
  3,601,150
  3,601,512
  3,602,297
  3,602,417
  3,602,419
  3,602,421
  3,602,423
  3,602,425
  3,602,427
  3,602,773
  3,604,362
  3,604,505
  3,604,739
  3,604,909
  3,605,128
  3,605,284
  3,605,539
  3,605,548
  3,605,559
  3,605,674
  3,605,684
  3,605,753
  3,605,910
  3,606,201
  3,607,043
  3,607,614
  3,607,739
  3,607,865
  3,608,139
  3,608,194
  3,608,585
  3,608,680
  3,608,903
  3,609,093
  3,609,204
  3,609,299
  3,609,588
  3,609,605
  3,609,606
  3,609,740
  3,609,762
  3,610,803
  3,611,096
  3,611,180
  3,611,219
  3,611,677
  3,611,746
  3,611,749
  3,611,803
  3,611,920
  3,612,709
  3,612,736
  3,613,472
  3,613,745
  3,614,077
  3,614,290
  3,614,439
  3,614,675
  3,615,024
  3,615,410
  3,615,605
  3,615,968
  3,617,916
  3,618,178
  3,618,366
  3,619,997
  3,620,443
  3,620,717
  3,621,146
  3,621,429
  3,623,744
  3,624,151
  3,624,657
  3,625,158
  3,625,920
  3,625,967
  3,626,917
  3,630,699
  3,631,054
  3,631,133
  3,633,389
  3,633,543
  3,633,551
  3,633,760
  3,633,812
  3,633,890
  3,634,627
  3,635,010
  3,635,080
  3,635,105
  3,635,336
  3,635,850
  3,635,865
  3,636,198
  3,636,224
  3,636,336
  3,636,760
  3,636,789
  3,637,089
  3,637,129
  3,637,690
  3,637,750
  3,638,110
  3,638,272
  3,638,303
  3,638,414
  3,638,616
  3,638,970
  3,638,971
  3,639,300
  3,639,689
  3,639,720
  3,640,139
  3,640,453
  3,641,221
  3,641,265
  3,642,029
  3,642,558
  3,642,589
  3,642,654
  3,642,660
  3,642,866
  3,643,417
  3,644,549
  3,644,567
  3,644,698
  3,644,710
  3,644,744
  3,645,125
  3,645,492
  3,645,981
  3,646,177
  3,646,947
  3,647,377
  3,647,452
  3,647,677
  3,648,651
  3,648,735
  3,648,847
  3,649,788
  3,650,147
  3,650,186
  3,651,353
  3,651,446
  3,651,771
  3,651,810
  3,652,069
  3,652,271
  3,652,343
  3,652,617
  3,652,663
  3,652,962
  3,652,981
  3,653,137
  3,653,210
  3,653,558
  3,653,686
  3,654,199
  3,654,229
  3,654,443
  3,654,625
  3,655,044
  3,655,538
  3,655,827
  3,656,677
  3,656,727
  3,656,735
  3,659,098
  3,659,253
  3,659,305
  3,659,449
  3,659,828
  3,661,547
  3,661,984
  3,661,999
  3,662,149
  3,663,102
  3,664,254
  3,664,389
  3,664,888
  3,665,443
  3,666,182
  3,666,984
  3,667,976
  3,668,377
  3,668,466
  3,668,467
  3,668,468
  3,672,278
  3,672,925
  3,672,989
  3,673,025
  3,673,035
  3,673,049
  3,673,052
  3,673,236
  3,673,398
  3,673,535
  3,673,677
  3,674,728
  3,675,602
  3,680,075
  3,680,245
  3,680,378
  3,682,478
  3,682,509
  3,683,327
  3,683,725
  3,683,889
  3,684,578
  3,684,927
  3,685,842
  3,686,843
  3,687,235
  3,688,972
  3,689,250
  3,689,960
  3,690,338
  3,690,557
  3,690,878
  3,690,887
  3,690,894
  3,690,921
  3,690,923
  3,691,632
  3,691,635
  3,691,636
  3,694,022
  3,694,105
  3,694,116
  3,694,564
  3,694,736
  3,694,741
  3,695,275
  3,695,332
  3,695,530
  3,695,984
  3,696,156
  3,696,726
  3,696,943
  3,697,068
  3,697,262
  3,697,550
  3,698,754
  3,699,035
  3,699,177
  3,699,489
  3,699,874
  3,699,953
  3,700,330
  3,700,550
  3,700,756
  3,700,796
  3,700,797
  3,700,863
  3,700,990
  3,701,069
  3,701,129
  3,701,158
  3,702,441
  3,703,325
  3,703,343
  3,704,014
  3,704,032
  3,704,158
  3,704,312
  3,704,511
  3,704,590
  3,704,609
  3,704,647
  3,704,758
  3,704,823
  3,704,996
  3,705,265
  3,705,305
  3,705,321
  3,705,356
  3,705,479
  3,705,728
  3,705,777
  3,705,865
  3,705,930
  3,706,304
  3,707,088
  3,707,254
  3,707,278
  3,708,004
  3,708,787
  3,708,798
  3,708,835
  3,709,016
  3,709,403
  3,710,419
  3,710,794
  3,711,031
  3,711,145
  3,711,154
  3,711,741
  3,711,938
  3,712,025
  3,712,078
  3,712,122
  3,712,159
  3,712,168
  3,712,554
  3,712,815
  3,713,006
  3,713,076
  3,713,557
  3,713,675
  3,713,693
  3,713,854
  3,714,011
  3,714,317
  3,714,335
  3,714,408
  3,714,548
  3,715,023
  3,715,328
  3,715,718
  3,715,742
  3,715,927
  3,716,321
  3,716,714
  3,716,771
  3,716,889
  3,717,140
  3,717,684
  3,717,996
  3,718,052
  3,718,203
  3,718,907
  3,718,946
  3,719,130
  3,719,188
  3,719,357
  3,719,364
  3,719,677
  3,720,038
  3,720,183
  3,720,268
  3,720,373
  3,720,484
  3,720,522
  3,720,597
  3,721,142
  3,721,214
  3,721,230
  3,721,361
  3,721,371
  3,721,881
  3,722,146
T
G
T
C
G
G
C
T
G
A
A
C
C
G
T
G
C
G
C
A
-
-
-
C
C
G
T
T
T
C
A
C
2
T
A
G
C
A
T
T
A
T
A
T
G
T
C
T
T
A
T
G
C
G
G
T
G
G
C
C
G
T
C
T
G
T
C
-
G
C
A
T
G
A
T
T
-
T
T
T
A
A
C
C
A/G
A/G
A/G
T
G
C
T
G
C
T
A
T
C
4
T
C
C
A
C
A
C
C
C
G
C
A
C
C
G
T
-
G
T
C
T
G
C
C
T
C
T
C
G
G
-/2
T
T
G
A
A
T
C
C
A
G
T
C
A
G
G
C
C
-
A
G
A
G
T
G
T
C
C
13
A
C
G
-
G
C
G
-
2
T
G
T
A
G
A
A
2
-
-
G
T
A
A
T
A
C
A
A
G
A
G
-
G
C
G
T
C
C
G
G
A
C
T
-
G
C
C
C
C
C
G/C
G
T
A
T
T/A
A
T
A
2
T
A
A
C
T
T
G
G
A
T
C
A
A
A
G
T
G
T
T
G
C
G
A
T
C
C
T
G
2
T
T
T
C
4
A
G
9
A
A
T
C
G
G
C
A
G
C
C
T
T
T
G
8/-
T
C
A
T
T
T
T
A
G
T
G
A
T
G
A
T
C
2
T
C
2
T
G
A
T
C
C
C
A
4
C
T
A
G
T
G
C
C
G
G
-
G
G
G
A
T
A
C
G
G
G
G
C
T
T
C
A
G
T
T
A
A
A
G
T
T
C
3
G
-
-
G
G
A
A
G
C
G
A
C
G
G
C
G
G
T
A
T
C
C
-
C
A
T
G
A
G
A
T
C
A
T
C
G
G
T
C
G
A
C
G
G
G
G
G
T
G
A
A
C
A
T
G
T
T
C
4
T
A
12
G
T
A
T
A
C
A
A
G
A
T
C
A
A
G
-
-
G
-
C
C
C
-
G
C
G
C
C
G
C
A
A
14/-
T
G
G
G
T
-
G
A
2
C
A
T
T
15
A
C
A
C
C
C
A
G
T
C
T
A
A
T
T
T
C
A
C
G
-
C
A
G
T
A
T
C
A
T
A
G
G
G
C
G
G
G
T
A
C
A
A
C
-
G
G
C
T
G
G
T
T
-
T/C
2/-
A
A
C
C
T
-
T
C
G
A
-
C
G
G
2
T
A
A
A
A
G
G
-
A
T
G
T
C
C
G
-
G
A
-
G
G
T
A
T
G
A
C
C
G
A
T
T
G