Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 163,317 (bp)   Positions: 302
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
SHR/OlalpcvMcwi (2019) 
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
Pde3b
--
--
--
--
--
--
--
LOC102548890
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cyp2r1
Cyp2r1
Cyp2r1
Cyp2r1
Cyp2r1
Cyp2r1
Cyp2r1
G
G
C
C
T
T
G
C
T
A
T
13
G
G
A
A
C
G
A
G
A
A
A
T
A
G
T
-
A
A
T
C
3
T
A
C
A
G
T
T
G
C
A
G
C
T
A
T
G
G
-
A
A
T
A
3
A
-
T
-
T
-
G
T
T
T
-
C
C
7
G
A
T
A
A
C
T
C
A
A
C
-
T
G
G
C
13
G
C
-
A
A
4
G
3
T
G
T
C
C
T
T
C
C
T
G
-
T
A
G
A
C
A
C
A
A
G
T
13
A
G
G
G
A
G
G
C
G
G
T
G
G
A
C
T
A
G
A
C
G
A
G
T
T
A
C
T
17
T
9
G
T
-
-
T
T
G
T
A
G
3
T
-
-
T
T
T
G
G
G
T
A
T
C
T
G
G
A
A
-
G
50
C
A
A
A
G
T
C
C
G
C
T
A
-
T
T
5
G
C
G
T
G
C
-
T
C
-
G
C
G
T
G
G
G
G
8
A
A
3
T
G
G
G
-
30
-
-
C
G
A
2
G
C
C
19
C
-
4
-
-
A
A
A
A
12
2
A
G
G
G
G
G
G
G
G
G
4
C
C
C
A
G
T
T
T
C
2
C
G
C
A
T
A
-
A
-
G
C
A
A
A
C
T
A
C
C
A
A
-
-
G
G
G
T
A
T
A
T
T
A
C
  168,610,970
  168,611,908
  168,611,983
  168,616,088
  168,623,264
  168,624,322
  168,625,112
  168,627,771
  168,629,994
  168,630,880
  168,631,237
  168,631,374
  168,634,509
  168,635,539
  168,636,672
  168,636,745
  168,638,258
  168,640,681
  168,640,771
  168,641,441
  168,644,776
  168,645,349
  168,645,579
  168,647,063
  168,647,106
  168,649,137
  168,650,241
  168,650,555
  168,653,024
  168,653,416
  168,656,582
  168,658,094
  168,659,500
  168,659,505
  168,666,554
  168,667,991
  168,668,542
  168,669,146
  168,672,263
  168,675,625
  168,677,069
  168,677,100
  168,677,137
  168,677,603
  168,677,804
  168,677,875
  168,678,567
  168,678,623
  168,679,099
  168,679,317
  168,679,576
  168,679,936
  168,680,389
  168,680,933
  168,680,944
  168,680,947
  168,681,669
  168,681,870
  168,682,892
  168,683,400
  168,684,526
  168,684,546
  168,684,557
  168,685,342
  168,685,595
  168,685,638
  168,685,977
  168,685,982
  168,687,184
  168,693,878
  168,694,634
  168,695,125
  168,695,321
  168,695,494
  168,695,804
  168,695,964
  168,696,137
  168,697,907
  168,698,391
  168,698,476
  168,698,644
  168,698,667
  168,698,833
  168,699,303
  168,700,590
  168,700,666
  168,700,978
  168,701,015
  168,701,872
  168,702,234
  168,703,555
  168,703,731
  168,703,788
  168,704,514
  168,704,736
  168,704,805
  168,705,244
  168,705,322
  168,705,498
  168,706,195
  168,706,328
  168,707,659
  168,708,047
  168,708,048
  168,708,148
  168,709,053
  168,709,101
  168,709,228
  168,709,233
  168,709,421
  168,711,508
  168,712,393
  168,712,444
  168,712,570
  168,712,917
  168,713,024
  168,713,121
  168,713,346
  168,715,845
  168,716,377
  168,716,395
  168,716,425
  168,719,202
  168,719,219
  168,719,292
  168,719,653
  168,719,709
  168,719,797
  168,719,873
  168,719,880
  168,720,023
  168,720,305
  168,720,346
  168,720,483
  168,720,659
  168,720,797
  168,720,836
  168,720,857
  168,721,029
  168,721,358
  168,721,956
  168,722,079
  168,722,185
  168,722,373
  168,722,429
  168,722,722
  168,723,002
  168,723,415
  168,723,544
  168,724,279
  168,725,327
  168,725,439
  168,725,476
  168,725,742
  168,725,822
  168,725,847
  168,725,848
  168,725,915
  168,725,960
  168,726,247
  168,726,626
  168,726,690
  168,726,859
  168,726,990
  168,727,034
  168,727,170
  168,727,230
  168,727,231
  168,728,106
  168,728,311
  168,728,465
  168,728,784
  168,728,946
  168,729,058
  168,729,230
  168,729,307
  168,729,318
  168,730,419
  168,730,543
  168,733,260
  168,733,522
  168,733,790
  168,733,839
  168,734,389
  168,734,459
  168,734,745
  168,734,795
  168,735,161
  168,735,217
  168,735,916
  168,735,920
  168,736,605
  168,736,681
  168,736,684
  168,736,722
  168,738,607
  168,738,663
  168,739,075
  168,739,324
  168,739,334
  168,739,410
  168,739,481
  168,739,928
  168,740,144
  168,741,148
  168,741,439
  168,742,006
  168,742,683
  168,742,745
  168,743,400
  168,744,223
  168,744,614
  168,744,660
  168,744,662
  168,744,664
  168,744,668
  168,745,036
  168,745,055
  168,745,552
  168,745,566
  168,746,039
  168,746,217
  168,746,257
  168,746,676
  168,746,762
  168,747,327
  168,747,622
  168,748,122
  168,748,178
  168,748,376
  168,748,681
  168,748,707
  168,748,798
  168,748,812
  168,748,816
  168,748,968
  168,748,997
  168,749,693
  168,749,744
  168,750,309
  168,750,801
  168,750,803
  168,750,805
  168,750,807
  168,751,941
  168,751,948
  168,752,536
  168,752,537
  168,752,555
  168,752,557
  168,752,559
  168,752,561
  168,752,563
  168,752,565
  168,752,567
  168,752,569
  168,752,571
  168,752,611
  168,752,673
  168,752,949
  168,753,170
  168,753,277
  168,753,370
  168,753,443
  168,753,641
  168,753,662
  168,753,786
  168,754,079
  168,761,128
  168,761,541
  168,761,660
  168,761,695
  168,761,702
  168,761,768
  168,761,922
  168,762,262
  168,762,431
  168,762,949
  168,763,266
  168,763,291
  168,763,295
  168,763,297
  168,763,505
  168,763,517
  168,763,571
  168,764,155
  168,764,526
  168,764,594
  168,764,748
  168,764,854
  168,765,052
  168,765,165
  168,765,362
  168,765,644
  168,765,800
  168,767,048
  168,767,564
  168,767,784
  168,767,886
  168,767,916
  168,768,818
  168,769,658
A
A
A
T
C
C
A
T
G
T
T/A
13/-
G/A
C
C
T
A
A
T
A
G
C
C
C
T
C
G
T
G
G
C/A
T
-
-/G
C
T
G
T
C
C
A
T
G
A
A
G
T
G
A
A
3
G
-/T
A/-
-
-
G
G
C
A
C
A
A
-
A
C
2
T
T
-
A
G
C
G
C
T
A
T
G
G
T
2
C
C
T
T
-
A
T
3
G
G
-
A
-
G
T
C
A
T
C
A
-
A
C
A
T
C
G
A
G
A
C
A
C
C
A
G
-
G
C
A
A
C
T
C
T
T
T
C
T
T
G
T
A
G
A
-
A
A
G
C
-
C
G
T
-
-
C
-
A
C
7
G
C
C
A
C
G
A
-
C
9
13
C
C
C
A
A
T
G
G
C
T
G
T
A
G
T
3
A
-
-/G
G
T
G
A
C
T
T
A
T
-
-
28
C
C
-
C
T
C
A
A
T
3
C
T
37
A
T
C
C
-/A
-/A
A
A
-
G
G
-
C
A
A
C/-
2
-
A
13
G
A
T
-
C
T
T
-
G
11
-
13
-/G
G
G
A/G
G
-
-
G/-
C/-
C/-
C/-
C/-
-/C
C
C
C
G/C
-
A
A
T
-
C
C
-
C
G
-
C/T
T
T
G
A
T
5
G
A
T
T
G
-
G
T
G
T
T
T
C
G
T
A
A
-
A
G
G
C
T
C
C
C
T