Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly mRatBN7.2

Genes ( + )

Genes ( - )

Genes ( - )

mRatBN7.2

SHR/OlalpcvMcwi (2019)


--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	LOC120101579										LOC120101579										LOC120101579										--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a										Pde11a
--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
A	A	C	G	G	T	G	T	2	12	A	G	C	-	-	G	T	T	A	T	C	C	C	-	C	A	C	A	-	-	T	-	G	T	-	-	C	A	G	T	T	C	-	G	-	-	C	T	T	C	A	T	T	C	G	T	T	A	G	C	C	C	C	C	C	A	T	C	C	C	G	T	C	C	G	C	C	C	T	A	G	A	G	T	C	A	-	C	A	T	T	3	2	G	C	G	C	T	C	A	C	A	C	G	G	C	A	T	T	C	C	T	G	T	T	22	C	G	C	C	-	G	-	A	A	T	G	-	A	G	T	C	A	G	A	T	C	C	T	G	T	A	T	T	A	T	A	2	A	A	A	T	C	G	C	T	A	T	G	C	A	A	G	G	A	G	A	T	T	G	-	A	-	A	G	T	C	G	A	T	T	A	A	-	G	-	2	T	A	-	C	G	-	C	C	C	G	A	3	-	G	G	G	G	G	G	T	T	A	-	2	A	A	C	A	C	2	T	A	A	C	A	G	T	C	A	-	C	-	C	T	10	2	2	T	A	G	G	32	C	2	2	T	G	T	A	T	T	T	A	G	T	G	11	T	G	G	-	G	T	C	A	T	T	T	G	30	C	G	G	A	A	C	C	T	G	T	-	T	G	C	C	G	A	T	A	C	-	-	G	-	A	C	A	T	A	C	T	C	G	A	C	T	G	A	G	G	C	T	T	G	C	T	C	C	T	C	G	T	A	G	C	A	A	A	A	G	A	T	C	C	T	A	A	G	-	T	G	T	G	G	C	A	22	A	G	8	A	28	A	G	A	C	C	G	C	-	G	T	A	C	T	-	C	A	T	G	G	A	A	T	G	A	T	C	-	T	C	-	T	C	A	T	3	C	-	-	A	9	G	T	T	C	C	-	-	-	G	A	G	T	T	C	G	G	T	T	T	G	C	T	C	A	G	T	G	5	-	C	T	-	A	C	A	G	A	T	T	A	T	A	C	A	T	C	T	G	C	G	19	C	A	G	C	G	-	C	G	C	A	T	C	A	A	A	G	T	G	A	C	C	G	T	T	A	C	C	A	C	9	C	G	T	C	A	C	C	T	4	G	2	C	T	T	G	T	T	A	T	A	G	A	G	A	A	A	C	G
60,913,621	60,913,691	60,914,631	60,914,785	60,914,928	60,915,473	60,916,111	60,916,495	60,916,639	60,916,646	60,919,906	60,920,554	60,924,204	60,925,000	60,927,069	60,927,204	60,927,332	60,927,492	60,927,706	60,927,708	60,929,169	60,929,688	60,930,190	60,930,407	60,930,658	60,930,747	60,931,112	60,935,707	60,936,334	60,936,694	60,939,992	60,940,714	60,941,736	60,941,858	60,942,295	60,943,194	60,944,004	60,944,243	60,946,522	60,947,683	60,947,909	60,948,066	60,948,086	60,948,395	60,948,602	60,948,604	60,948,633	60,948,650	60,948,731	60,948,995	60,949,103	60,949,142	60,949,585	60,950,158	60,950,417	60,950,602	60,950,967	60,951,006	60,951,154	60,951,913	60,952,417	60,952,873	60,953,312	60,953,425	60,953,574	60,955,599	60,956,620	60,957,055	60,958,160	60,958,320	60,962,235	60,962,930	60,962,966	60,963,631	60,963,739	60,964,076	60,964,897	60,965,234	60,965,241	60,965,493	60,965,760	60,966,322	60,966,513	60,966,719	60,967,019	60,967,946	60,968,619	60,969,451	60,970,130	60,971,831	60,971,991	60,972,158	60,973,267	60,974,037	60,975,749	60,975,850	60,975,851	60,976,447	60,977,755	60,977,820	60,978,352	60,978,589	60,979,187	60,979,465	60,979,755	60,981,198	60,982,996	60,983,874	60,984,213	60,984,405	60,984,675	60,984,680	60,984,780	60,984,840	60,984,870	60,985,280	60,985,351	60,985,369	60,986,270	60,986,805	60,986,978	60,987,256	60,987,496	60,988,358	60,988,706	60,988,968	60,989,066	60,989,776	60,990,292	60,990,666	60,990,747	60,990,956	60,991,020	60,992,068	60,992,131	60,992,263	60,992,693	60,993,159	60,993,546	60,994,169	60,995,486	60,995,495	60,996,991	60,997,100	60,997,219	60,998,086	60,998,651	60,998,791	61,000,129	61,000,550	61,002,085	61,004,022	61,005,011	61,008,015	61,009,083	61,010,456	61,011,456	61,011,506	61,011,650	61,011,917	61,012,035	61,012,044	61,012,190	61,012,604	61,012,692	61,014,377	61,014,591	61,015,211	61,015,879	61,016,690	61,017,210	61,019,303	61,019,379	61,019,506	61,020,686	61,021,669	61,022,431	61,022,578	61,022,910	61,023,152	61,023,454	61,023,540	61,023,777	61,024,081	61,024,284	61,024,383	61,024,385	61,024,534	61,024,830	61,024,894	61,026,170	61,027,555	61,027,903	61,027,979	61,028,056	61,030,428	61,031,887	61,032,515	61,032,588	61,032,592	61,033,647	61,033,657	61,033,659	61,033,661	61,033,663	61,034,372	61,035,325	61,035,772	61,036,369	61,036,645	61,036,695	61,036,801	61,037,501	61,037,837	61,040,869	61,042,218	61,042,849	61,046,602	61,046,834	61,047,221	61,048,351	61,052,987	61,053,361	61,053,663	61,054,522	61,055,814	61,055,923	61,056,480	61,057,815	61,058,658	61,067,121	61,067,403	61,067,634	61,067,741	61,067,742	61,070,187	61,070,645	61,071,739	61,071,787	61,072,027	61,075,139	61,075,308	61,075,416	61,078,696	61,082,471	61,082,690	61,090,341	61,091,078	61,097,045	61,097,649	61,099,015	61,099,061	61,099,275	61,099,583	61,102,036	61,103,123	61,103,350	61,106,082	61,112,032	61,112,080	61,114,653	61,114,868	61,116,161	61,116,227	61,116,249	61,118,088	61,118,415	61,120,021	61,121,315	61,124,772	61,126,385	61,131,135	61,131,261	61,132,080	61,132,163	61,132,431	61,132,444	61,133,882	61,133,899	61,134,829	61,135,640	61,135,845	61,135,950	61,136,827	61,137,086	61,137,087	61,138,091	61,138,291	61,138,527	61,140,248	61,140,407	61,140,477	61,140,787	61,141,746	61,142,586	61,142,603	61,143,193	61,143,415	61,143,504	61,143,510	61,143,525	61,144,185	61,144,884	61,145,205	61,145,886	61,145,907	61,146,036	61,146,053	61,149,291	61,152,832	61,160,578	61,169,607	61,171,338	61,171,539	61,171,651	61,172,392	61,172,500	61,172,870	61,173,205	61,173,217	61,173,384	61,174,106	61,174,162	61,177,563	61,178,575	61,180,912	61,181,841	61,181,967	61,182,415	61,182,980	61,183,590	61,183,707	61,183,811	61,184,626	61,185,168	61,185,221	61,185,354	61,185,355	61,185,782	61,185,793	61,186,111	61,186,226	61,186,279	61,186,722	61,187,343	61,188,480	61,188,483	61,188,500	61,188,532	61,188,559	61,189,153	61,189,471	61,189,905	61,190,003	61,190,460	61,190,659	61,191,603	61,191,868	61,193,832	61,193,914	61,194,690	61,195,610	61,195,654	61,197,071	61,197,306	61,206,891	61,206,909	61,207,033	61,207,057	61,207,194	61,207,226	61,207,965	61,208,096	61,208,176	61,208,429	61,208,510	61,208,713	61,208,879	61,208,906	61,209,614	61,213,431	61,214,096	61,214,398	61,214,581	61,214,940	61,215,383	61,215,401	61,216,828	61,216,960	61,217,876	61,218,562	61,219,258	61,220,200	61,220,388	61,220,861	61,220,863	61,220,865	61,220,869	61,221,162	61,222,543	61,222,582	61,223,087	61,223,352	61,224,853	61,225,352	61,227,026	61,227,087	61,227,173	61,227,481	61,228,094	61,228,154	61,228,311	61,228,408	61,228,556	61,228,905	61,229,158	61,229,829	61,230,168	61,230,369	61,230,996	61,231,046	61,231,297	61,231,881	61,232,485	61,232,926	61,233,284	61,234,469	61,234,633	61,235,173	61,235,230	61,235,672	61,235,818	61,235,867	61,236,822	61,236,838	61,237,078	61,237,299	61,238,582	61,239,108	61,239,124	61,239,498	61,239,514	61,240,282	61,240,878	61,241,237	61,243,814	61,244,219	61,248,741	61,249,901	61,249,961	61,250,945	61,251,087	61,255,455	61,256,095	61,256,121	61,256,222	61,256,512	61,263,247	61,263,561	61,263,577	61,263,631	61,264,631	61,268,786	61,269,395	61,269,806	61,272,969	61,277,353	61,278,011	61,278,044	61,280,106	61,280,117	61,282,023	61,282,352	61,282,354	61,282,355	61,282,390	61,283,249	61,283,437	61,284,292	61,284,603	61,285,561	61,285,871	61,286,225	61,287,384	61,287,484	61,287,774	61,287,830	61,290,668	61,293,655	61,294,075	61,294,163	61,294,274	61,294,430	61,294,969	61,296,186	61,296,502	61,296,531	61,296,961
T	G	G	A	A	C	A	C	-	-	G	A	-	2	2	A	C	C	G	C	-	T	T	G	T	G	T	C	T	3	C	2	A	C	6	2	A	G	C	C	C	G	C	A	C	-/3	T	C	A	T	-	A	C	T	A	C	G	G	A	T	T	T	T	T	T	G	C	T	T	T	A	C	T	T	A	T	T	T	C	G	T	G	A	G	G/-	G	A	T	G	C	C	-	-	T/-	T	T	T	C	T	G	T	G	T	A	A	A	-	C	C	T	T	C	A	-	C	22/-	-/G	C/-	T	T	T	C	C	G	G	C	A	T	G	A	C	T	G	A	G	C	T	A	C	A	C	G	C	C	G	C	G	-	G	G	G	-	T	C	A	C	G	C	A	T	G	G	A	A	G	A	G	C	A	A	2	G	2	G	T	A	T	T	G	C	C	G	G	T	-	6	-	C	G	T	T	A	24	T	T	A	A	C	-	2	A/-	-/A	-/A	A/-	-/A	A/-	C	A	G	6	-	C	-	T	C	T	-	C	T	G	T	G	A	A	T	G	6	T	T	T	C/-	-	?	-	-/A	-	T	C/-	-	G	-	-	C	-	G	T	A	C	-	T	A	C	A	-	-	A	A	G	T/-	-/C	T	G	C	C	G	A	-	A	T	T	T	-	T	T	C	C	C	7	C	T	T	T	A	-/T	C	C	T	T	T	A	3	G	T	C	C	-	T	C	T	A	G	-	A	T	G	T	C/T	T	A	C/-	A	T	A	T	T	A	T	A	G	G	T	T	G	C	G	G	A	T/-	C	T	T	C	T	C	A	A	C	A	A	A	A	G	G	-	T	-	-	-/T	-	T/-	-	G	G	T	A	T	11	C	A	C	T	C	2	A	C	C	A	A	G	T	G	A	G	C	T	4	G	T	T	C	A	G	C	-	T	15	18	G	-	A	C	C	T	A	-/8	-/6	-/4	A	G	T	C	C	T	A	A	C	C	C	A	T	C	G	C	A	G	A	-	42	T	C	6	G	T	C	T	C	G	C	G	C	G	T	-	C	T	C	A	G	A	-	T	-	A	A	A	2	T	T	T	C	A	G/-	G	G	G	A	C	C	G	A	A	A	C	A	T	T	A	G	T	-	A	A	G	-	G	A	A	C	-	C	-	T	G	C	A	C	C	C/-	C	C	A	G	T	T	T	C	A	A