Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 383,593 (bp)   Positions: 284
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF1C/Stm (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120101580
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Anp32a-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
Pde11a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
C
A
G
A
A
A
C
T
T
T
-
G
115
-
T
C
A
C
T
T
C
C
T
C
G
T
A
G
C
A
A
A
A
G
T
C
T
C
T
A
A
G
-
T
G
T
G
G
C
A
22
A
C
G
8
A
28
A
G
A
C
C
C
-
G
A
G
T
T
A
C
T
-
2
C
C
A
C
T
A
G
A
T
G
G
A
T
C
G
-
T
C
-
G
G
C
T
G
-
T
T
G
A
A
T
G
-
G
A
A
G
G
T
C
T
C
C
2
A
A
G
T
C
G
G
C
T
T
T
G
C
T
C
A
G
G
T
A
C
C
-
2
C
A
A
C
A
T
C
A
-
G
G
G
C
T
T
C
T
-
19
T
C
A
G
G
G
G
T
-
G
T
A
G
G
T
T
A
A
C
A
C
G
T
-
C
C
G
T
C
C
C
T
A
T
G
A
T
C
G
T
G
G
G
T
A
C
C
G
3
T
G
G
G
G
G
C
C
C
T
A
G
A
A
C
T
G
2
C
T
A
A
G
C
G
T
C
G
T
A
G
-
-
G
T
A
C
C
C
G
C
A
13
T
T
T
T
C
A
-
T
C
G
C
T
A
2
A
G
T
A
G
T
C
C
A
A
-
A
C
A
C
  60,955,599
  61,067,774
  61,081,870
  61,119,244
  61,145,154
  61,145,410
  61,147,441
  61,151,119
  61,152,409
  61,154,290
  61,155,140
  61,155,764
  61,157,064
  61,157,525
  61,157,688
  61,157,889
  61,158,589
  61,159,001
  61,169,205
  61,169,607
  61,170,732
  61,171,338
  61,171,539
  61,171,651
  61,172,392
  61,172,500
  61,172,870
  61,173,205
  61,173,217
  61,173,384
  61,174,106
  61,174,162
  61,177,563
  61,178,575
  61,180,912
  61,181,841
  61,182,415
  61,182,980
  61,183,259
  61,183,590
  61,183,707
  61,183,811
  61,184,626
  61,185,168
  61,185,221
  61,185,354
  61,185,355
  61,185,782
  61,185,793
  61,186,111
  61,186,226
  61,186,279
  61,186,722
  61,187,343
  61,187,540
  61,188,480
  61,188,483
  61,188,500
  61,188,532
  61,188,559
  61,189,153
  61,189,471
  61,189,905
  61,190,003
  61,190,659
  61,191,603
  61,191,868
  61,192,760
  61,192,807
  61,193,791
  61,193,832
  61,193,914
  61,194,690
  61,195,610
  61,195,654
  61,196,184
  61,197,071
  61,205,684
  61,205,709
  61,206,488
  61,206,891
  61,207,057
  61,207,167
  61,207,194
  61,207,226
  61,207,659
  61,207,965
  61,208,096
  61,208,176
  61,208,429
  61,208,495
  61,208,510
  61,208,713
  61,208,879
  61,208,906
  61,210,051
  61,210,085
  61,211,618
  61,211,878
  61,212,320
  61,212,820
  61,213,014
  61,213,289
  61,213,596
  61,213,836
  61,214,096
  61,214,398
  61,214,665
  61,215,401
  61,215,458
  61,216,701
  61,216,828
  61,217,138
  61,217,876
  61,218,198
  61,218,407
  61,219,258
  61,219,742
  61,220,388
  61,220,831
  61,220,859
  61,221,162
  61,222,296
  61,223,087
  61,223,431
  61,224,853
  61,225,352
  61,226,130
  61,227,026
  61,227,087
  61,227,173
  61,227,481
  61,228,094
  61,228,154
  61,228,311
  61,228,408
  61,228,556
  61,228,576
  61,228,905
  61,230,058
  61,230,441
  61,230,969
  61,231,046
  61,231,105
  61,231,829
  61,232,485
  61,233,284
  61,233,737
  61,235,173
  61,235,230
  61,235,818
  61,235,867
  61,235,951
  61,236,208
  61,236,210
  61,236,216
  61,236,838
  61,237,078
  61,237,511
  61,238,582
  61,238,705
  61,239,108
  61,239,124
  61,239,404
  61,239,498
  61,239,514
  61,239,843
  61,240,282
  61,241,237
  61,241,309
  61,241,371
  61,241,385
  61,241,399
  61,241,424
  61,241,572
  61,241,662
  61,242,033
  61,242,089
  61,242,198
  61,242,690
  61,242,691
  61,242,821
  61,243,054
  61,243,459
  61,244,427
  61,245,098
  61,245,912
  61,246,016
  61,246,208
  61,247,160
  61,247,392
  61,247,667
  61,247,753
  61,248,181
  61,248,285
  61,248,503
  61,248,573
  61,248,602
  61,248,618
  61,248,646
  61,248,659
  61,248,672
  61,248,749
  61,249,229
  61,249,607
  61,249,675
  61,250,214
  61,250,262
  61,250,379
  61,250,461
  61,250,656
  61,250,875
  61,250,945
  61,251,047
  61,251,049
  61,251,051
  61,251,053
  61,251,055
  61,251,087
  61,251,126
  61,251,295
  61,251,420
  61,251,471
  61,251,872
  61,252,357
  61,252,881
  61,252,942
  61,253,408
  61,254,108
  61,254,833
  61,254,961
  61,255,355
  61,255,455
  61,256,121
  61,256,520
  61,263,577
  61,264,014
  61,265,242
  61,267,689
  61,268,321
  61,268,786
  61,270,023
  61,270,636
  61,273,671
  61,275,027
  61,276,542
  61,276,554
  61,278,011
  61,278,044
  61,282,390
  61,283,655
  61,284,603
  61,284,617
  61,285,583
  61,286,177
  61,286,225
  61,286,592
  61,286,593
  61,288,010
  61,288,355
  61,288,745
  61,289,260
  61,289,717
  61,290,047
  61,290,540
  61,291,311
  61,291,543
  61,291,631
  61,291,695
  61,291,830
  61,292,488
  61,293,400
  61,293,449
  61,293,483
  61,293,655
  61,293,854
  61,293,859
  61,294,274
  61,294,408
  61,295,775
  61,296,186
  61,296,395
  61,296,502
  61,296,531
G
T/-
T
-/C
A
G
T
G
T
C
A
-
8
C
-
6
C
T
T
T
A
A
T
T
A
T
A
G
G
T
T
G
C
G
G
A
C
T
T/-
T
C
T
C
A
A
C
A
A
A
A
G
G
-
T
T
-
-
-/T
-
T/-
-
G
G
T
T
11
C
T
A
G
A
C
T
C
2
-
C/A
C/A
A/C
T
C
G
C
T
G
A
A
G
C
T
-
4
G
T
T
A
A
T
C
A
T
C
C
A
G
G
C
A
18
A
G
G
A
A
G
T
C
T
A
-
G/-
G
A
C
T
A
A
T
C
C
C
A
T
C
G
C
A
T
G
C
A
G
6
-
T
C
C
T
G
C
T
-
2
-/A
A/-
A/-
T
C
C
G
A
2
-
G
T
-
A
A
A
A
C
A
T
C
G
A
A
C
A
G
G
T
T
T
A
C
2
-/T
-
C
G
T
T
T
G
C
G
A
G
C
G
A
C
A
A
A
A
G
T
T
A
-
A
C/-
C
C
C
C
-/G
T
T
C
G
A
G
G
T
C
A
-
T
C
G
G
A
A
A
A
T
A
C
G
T
G
C
T
C
G
T
A
T
C
A
G
-
G
G
A
C
T
G
G
C
T
A
A
C
C
-
G
A
C
T
-
C
T
-
G
C
7
T
T
C
A