Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 49,996 (bp)   Positions: 236
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
FHH/EurMcwi (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
A
-
C
G
C
T
A
A
-
G
T
A
A
8
T
T
A
A
2
A
G
G
G
T
-
4
A
2
T
T
T
C
T
G
35
G
G
T
T
-
T
A
-
-
C
T
A
T
C
T
-
C
C
2
C
12
4
10
26
C
T
T
C
A
-
-
T
A
C
G
T
A
2
2
T
G
C
G
A
2
C
2
-
G
G
T
72
G
G
A
G
G
-
A
C
G
A
C
A
G
G
A
A
A
-
T
T
A
C
T
G
A
T
A
T
A
A
A
C
G
T
A
A
-
A
C
C
G
G
A
A
A
C
A
T
G
-
G
A
G
4
C
A
G
G
7
C
G
C
G
-
C
C
-
G
T
T
A
G
G
T
C
A
A
A
T
C
-
A
-
A
A
2
C
A
20
A
A
A
G
2
T
T
C
G
-
T
C
A
C
4
C
G
A
C
G
2
A
G
G
C
G
C
T
C
T
T
T
A
G
A
15
A
G
T
G
A
-
C
T
2
-
C
C
A
A
-
C
G
T
T
T
G
G
G
G
  101,591,599
  101,591,720
  101,591,807
  101,592,418
  101,592,424
  101,592,655
  101,592,661
  101,592,812
  101,593,188
  101,593,224
  101,593,573
  101,593,590
  101,593,716
  101,593,741
  101,593,947
  101,593,967
  101,594,051
  101,594,148
  101,594,282
  101,594,285
  101,594,356
  101,595,034
  101,595,237
  101,595,512
  101,595,520
  101,595,530
  101,595,793
  101,595,809
  101,595,814
  101,595,830
  101,596,039
  101,596,124
  101,596,217
  101,596,732
  101,596,783
  101,596,852
  101,596,980
  101,597,400
  101,597,668
  101,598,473
  101,598,578
  101,598,906
  101,598,969
  101,598,980
  101,599,049
  101,599,359
  101,599,722
  101,599,778
  101,599,888
  101,599,913
  101,600,291
  101,601,176
  101,602,066
  101,602,238
  101,602,331
  101,602,453
  101,602,593
  101,602,732
  101,603,488
  101,603,511
  101,603,773
  101,603,852
  101,604,156
  101,605,912
  101,605,992
  101,606,011
  101,606,149
  101,606,643
  101,606,770
  101,606,918
  101,607,428
  101,607,690
  101,608,419
  101,608,423
  101,608,481
  101,608,482
  101,608,546
  101,608,719
  101,608,726
  101,608,841
  101,608,852
  101,609,488
  101,609,638
  101,609,640
  101,609,744
  101,609,775
  101,611,039
  101,611,556
  101,611,683
  101,612,116
  101,612,137
  101,612,695
  101,613,235
  101,614,111
  101,615,330
  101,615,536
  101,615,787
  101,615,894
  101,617,588
  101,618,435
  101,618,437
  101,618,438
  101,618,440
  101,619,556
  101,619,736
  101,619,935
  101,619,975
  101,620,173
  101,621,206
  101,621,297
  101,622,064
  101,623,684
  101,623,815
  101,623,967
  101,623,982
  101,624,295
  101,624,434
  101,624,604
  101,625,562
  101,625,975
  101,626,710
  101,627,065
  101,627,219
  101,627,405
  101,628,017
  101,628,920
  101,629,134
  101,629,366
  101,629,692
  101,630,584
  101,630,586
  101,630,588
  101,630,714
  101,631,281
  101,631,424
  101,631,676
  101,631,953
  101,632,100
  101,633,328
  101,633,432
  101,633,673
  101,634,020
  101,634,286
  101,634,362
  101,634,491
  101,634,494
  101,634,655
  101,634,890
  101,634,963
  101,635,189
  101,635,213
  101,635,219
  101,635,252
  101,635,258
  101,635,283
  101,635,400
  101,635,606
  101,635,848
  101,635,892
  101,636,046
  101,636,390
  101,636,524
  101,636,658
  101,636,667
  101,636,688
  101,636,695
  101,636,706
  101,636,710
  101,636,711
  101,636,720
  101,636,730
  101,636,736
  101,636,739
  101,636,747
  101,636,748
  101,636,756
  101,636,899
  101,636,900
  101,636,934
  101,636,978
  101,637,004
  101,637,102
  101,637,170
  101,637,208
  101,637,247
  101,637,304
  101,637,455
  101,637,662
  101,637,853
  101,637,897
  101,637,958
  101,638,135
  101,638,205
  101,638,389
  101,638,397
  101,638,573
  101,638,616
  101,638,622
  101,638,696
  101,638,715
  101,638,723
  101,638,731
  101,638,754
  101,638,766
  101,638,777
  101,638,846
  101,638,927
  101,639,032
  101,639,160
  101,639,594
  101,639,623
  101,639,644
  101,639,652
  101,639,831
  101,639,950
  101,640,045
  101,640,104
  101,640,147
  101,640,227
  101,640,248
  101,640,254
  101,640,257
  101,640,346
  101,640,370
  101,640,481
  101,640,580
  101,640,590
  101,640,614
  101,640,697
  101,640,712
  101,640,787
  101,640,817
  101,641,095
  101,641,139
  101,641,154
  101,641,198
G
5
G
A
T
C
G
C
2
A/-
C
G
G
-
C
C
G
G
-
G
A
A
A
C
19
-
G
-
C
C
C
T
C
T
-
A
A
C
C
A
A
G
8
4
T
C
G
C
A
C
3
T
T
-
T
-
-
-
-
G/-
C
C
T
C
4
4
G
-
T
C
G
G
-
-
C
C
T
A
G
-
G
-
G
A
A/-
C
-
A
A
G
A
C
A
C
T
A
G
T
G
G/-
G/A
A/G
A/-
T
7
G
C
C
T
C
A
G
C
T
C
G
G
T
A
A
C
T
C
T
G
T
A
A
A
C/-
-/C
-/C
T
G
C
-/A
C
A
T
A
-
T
G
A
-
-
T
C/-
T
T
2
T
T
C
A
C
C
G
A
A
C
T
G
G
G
G
T
T
C
4
T
G
-
T
G
-
G
G
G
A
-
C
C
T
A
2
C
T
T
T
-
T
A
G
G
T
-
T
A
A
A
T
T
G
T
C
G
C
T
A
T
-
G/-
C
A
A/-
G
3
T
-
-
3
T
A
G
-/C
3
T
A
C
C
C
A
C
A
A