Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 190,630 (bp)   Positions: 512
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Osbpl1al
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102546723
LOC102546723
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
Osbpl1a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
A
T
A
2
C
T
T
G
T
T
T
A
C
C
A
A
T
11
5
C
T
G
C
A
G
-
T
T
C
T
15
G
G
39
C
G
G
-
G
G
G
-
T
T
C
G
T
A
C
G
A
C
G
C
C
T
G
G
C
C
-
T
A
C
2
A
G
C
A
C
T
A
G
A
A
C
C
A
A
A
T
C
A
-
T
-
A
T
G
C
A
T
T
G
G
T
C
A
-
-
C
C
T
G
C
G
C
C
A
T
-
A
G
G
C
A
G
C
G
-
G
-
A
109
G
T
G
A
T
-
T
T
G
G
T
T
C
C
A
A
A
T
A
A
A
C
C
T
A
G
G
C
G
A
G
G
G
A
A
T
G
A
A
G
A
A
C
A
A
15
T
-
-
A
T
-
A
A
A
G
T
T
G
T
T
A
T
A
G
T
A
A
A
A
A
T
T
T
C
A
C
G
A
5
T
A
T
T
-
A
G
A
G
G
G
T
A
G
-
C
A
-
-
-
G
G
A
A
A
T
G
-
T
T
G
C
-
C
C
C
G
-
G
G
-
G
T
G
T
G
G
A
G
C
-
-
C
A
G
11
16
T
G
A
T
T
C
A
T
G
A
C
A
G
-
11
A
6
G
G
C
C
C
A
C
T
T
A
A
C
A
C
A
C
A
C
A
G
T
4
C
A
A
C
-
T
A
T
C
G
A
G
-
-
T
T
T
A
C
A
G
G
G
C
G
A
C
G
T
T
-
C
4
A
C
G
G
C
-
A
A
G
T
T
T
T
2
A
T
A
A
G
T
T
G
G
T
C
C
A
A
T
A
A
T
A
-
T
A
C
A
C
G
G
A
T
G
3
A
C
T
T
C
G
T
A
C
11
8
G
G
A
G
A
T
C
G
G
A
G
-
C
T
T
T
A
G
A
T
C
G
C
A
G
C
C
-
C
17
C
A
G
A
T
C
C
-
T
-
-
T
A
-
C
T
C
A
G
A
2
G
C
T
C
G
G
A
A
A
T
-
C
-
-
G
T
-
C
C
G
A
G
G
G
A
G
A
G
C
A
T
A
G
-
G
T
G
G
T
T
A
C
G
A
C
T
A
C
A
G
A
A
C
G
3
-
C
T
T
G
A
T
96
T
T
A
C
C
A
A
  3,906,596
  3,909,092
  3,909,185
  3,909,316
  3,909,864
  3,910,055
  3,910,177
  3,910,222
  3,911,532
  3,911,977
  3,912,696
  3,914,190
  3,914,859
  3,915,188
  3,916,210
  3,916,328
  3,916,915
  3,917,190
  3,917,512
  3,918,375
  3,918,451
  3,918,527
  3,918,541
  3,919,115
  3,919,257
  3,919,880
  3,919,926
  3,920,185
  3,921,065
  3,921,215
  3,921,286
  3,921,299
  3,921,571
  3,921,887
  3,922,082
  3,922,109
  3,922,439
  3,923,207
  3,923,450
  3,923,724
  3,923,835
  3,923,868
  3,923,870
  3,923,929
  3,924,599
  3,924,748
  3,925,006
  3,925,296
  3,925,674
  3,926,050
  3,926,175
  3,926,245
  3,926,278
  3,927,912
  3,927,987
  3,928,019
  3,928,092
  3,928,618
  3,928,819
  3,928,999
  3,929,043
  3,929,094
  3,929,187
  3,929,479
  3,929,545
  3,929,685
  3,930,079
  3,930,199
  3,930,363
  3,930,543
  3,931,338
  3,931,426
  3,931,564
  3,931,623
  3,931,632
  3,931,709
  3,931,743
  3,933,053
  3,933,088
  3,933,101
  3,933,804
  3,934,104
  3,934,344
  3,936,519
  3,936,554
  3,937,901
  3,938,095
  3,938,099
  3,938,464
  3,941,013
  3,941,330
  3,941,799
  3,942,317
  3,942,449
  3,942,587
  3,942,903
  3,943,119
  3,943,329
  3,943,384
  3,944,633
  3,944,638
  3,944,642
  3,944,669
  3,944,671
  3,945,480
  3,946,289
  3,946,651
  3,947,066
  3,947,530
  3,948,724
  3,949,732
  3,950,037
  3,950,043
  3,952,164
  3,952,370
  3,952,379
  3,953,181
  3,953,487
  3,954,282
  3,956,265
  3,956,535
  3,956,572
  3,957,033
  3,958,702
  3,958,753
  3,960,213
  3,960,408
  3,960,417
  3,960,450
  3,960,454
  3,961,094
  3,961,685
  3,961,689
  3,963,053
  3,963,186
  3,963,495
  3,963,996
  3,965,071
  3,965,923
  3,965,983
  3,966,103
  3,966,862
  3,966,901
  3,966,985
  3,967,033
  3,967,211
  3,967,238
  3,967,456
  3,967,660
  3,967,673
  3,969,961
  3,970,292
  3,970,856
  3,971,101
  3,971,371
  3,971,452
  3,971,483
  3,971,683
  3,971,694
  3,973,052
  3,973,724
  3,974,566
  3,975,598
  3,975,712
  3,976,332
  3,976,477
  3,976,601
  3,976,924
  3,977,089
  3,977,211
  3,977,853
  3,978,158
  3,978,415
  3,978,471
  3,978,676
  3,979,658
  3,979,665
  3,979,696
  3,979,928
  3,980,023
  3,980,387
  3,980,396
  3,980,452
  3,980,532
  3,980,598
  3,981,318
  3,981,465
  3,982,762
  3,983,145
  3,983,426
  3,983,695
  3,983,743
  3,983,974
  3,983,983
  3,984,037
  3,984,059
  3,984,172
  3,984,179
  3,984,187
  3,984,190
  3,984,194
  3,984,217
  3,984,323
  3,984,716
  3,984,768
  3,984,942
  3,984,954
  3,985,184
  3,985,339
  3,985,340
  3,985,382
  3,985,387
  3,985,859
  3,985,901
  3,985,907
  3,986,012
  3,986,126
  3,986,137
  3,986,391
  3,986,432
  3,986,445
  3,987,033
  3,987,252
  3,987,292
  3,987,320
  3,987,334
  3,987,389
  3,987,851
  3,988,286
  3,988,881
  3,989,532
  3,989,641
  3,989,976
  3,990,363
  3,990,426
  3,990,480
  3,990,510
  3,990,673
  3,990,915
  3,991,125
  3,991,414
  3,991,888
  3,992,527
  3,993,856
  3,993,951
  3,994,036
  3,994,654
  3,994,720
  3,995,391
  3,995,485
  3,995,820
  3,995,889
  3,996,242
  3,996,243
  3,996,682
  3,997,046
  3,997,177
  3,997,345
  3,997,401
  3,997,481
  3,997,707
  3,998,055
  3,998,068
  3,998,105
  3,998,636
  3,998,676
  3,998,721
  3,998,826
  3,998,917
  3,999,068
  3,999,342
  3,999,416
  3,999,439
  3,999,611
  3,999,989
  4,000,082
  4,000,284
  4,000,523
  4,000,686
  4,000,735
  4,000,744
  4,000,748
  4,000,753
  4,000,757
  4,000,787
  4,000,788
  4,000,791
  4,001,073
  4,001,358
  4,001,633
  4,002,084
  4,002,891
  4,003,934
  4,003,992
  4,004,347
  4,004,495
  4,004,516
  4,004,545
  4,004,549
  4,004,800
  4,004,909
  4,005,395
  4,006,313
  4,009,767
  4,010,006
  4,010,467
  4,011,243
  4,011,485
  4,014,201
  4,014,258
  4,014,424
  4,014,439
  4,015,027
  4,015,051
  4,015,572
  4,016,272
  4,019,812
  4,019,865
  4,020,156
  4,020,159
  4,020,162
  4,020,458
  4,020,481
  4,020,519
  4,020,529
  4,020,540
  4,020,576
  4,020,583
  4,020,614
  4,020,623
  4,020,656
  4,020,674
  4,020,696
  4,020,707
  4,020,876
  4,020,913
  4,020,979
  4,020,993
  4,020,995
  4,021,216
  4,021,485
  4,021,565
  4,021,742
  4,022,028
  4,022,158
  4,022,175
  4,022,285
  4,022,526
  4,022,545
  4,022,672
  4,022,908
  4,022,934
  4,022,954
  4,023,120
  4,023,186
  4,023,244
  4,023,302
  4,023,312
  4,023,343
  4,023,538
  4,023,547
  4,024,088
  4,024,275
  4,024,306
  4,024,385
  4,024,416
  4,024,545
  4,024,820
  4,024,964
  4,025,172
  4,025,204
  4,025,211
  4,025,212
  4,025,277
  4,025,367
  4,025,722
  4,025,805
  4,025,834
  4,025,863
  4,025,919
  4,025,941
  4,028,652
  4,028,918
  4,028,998
  4,029,292
  4,029,383
  4,029,713
  4,029,824
  4,029,877
  4,030,080
  4,030,219
  4,030,369
  4,030,508
  4,031,121
  4,031,338
  4,031,348
  4,031,555
  4,031,734
  4,031,805
  4,031,951
  4,031,983
  4,032,282
  4,032,340
  4,032,576
  4,033,157
  4,033,158
  4,034,152
  4,034,169
  4,034,958
  4,034,990
  4,034,998
  4,035,066
  4,035,460
  4,035,573
  4,035,585
  4,035,646
  4,035,671
  4,035,700
  4,035,816
  4,035,954
  4,035,974
  4,037,031
  4,037,429
  4,037,588
  4,037,844
  4,038,075
  4,038,959
  4,039,031
  4,039,614
  4,039,728
  4,039,814
  4,039,838
  4,040,213
  4,040,777
  4,040,955
  4,040,990
  4,041,010
  4,041,069
  4,041,094
  4,041,441
  4,042,703
  4,042,799
  4,043,056
  4,043,363
  4,043,553
  4,043,633
  4,044,188
  4,045,442
  4,045,864
  4,046,112
  4,046,162
  4,046,178
  4,046,235
  4,047,109
  4,047,349
  4,047,506
  4,047,587
  4,048,472
  4,049,227
  4,049,265
  4,049,781
  4,050,525
  4,051,607
  4,051,954
  4,054,720
  4,055,119
  4,056,368
  4,056,382
  4,056,536
  4,056,873
  4,057,142
  4,061,734
  4,061,849
  4,062,384
  4,062,387
  4,062,415
  4,062,429
  4,062,808
  4,063,345
  4,064,325
  4,065,754
  4,066,395
  4,066,478
  4,068,237
  4,069,250
  4,069,892
  4,070,006
  4,070,295
  4,070,999
  4,071,001
  4,071,126
  4,071,493
  4,071,926
  4,072,898
  4,074,387
  4,075,569
  4,075,968
  4,076,015
  4,077,390
  4,077,808
  4,077,809
  4,078,121
  4,079,443
  4,080,471
  4,082,238
  4,083,420
  4,084,038
  4,084,778
  4,087,099
  4,087,796
  4,088,901
  4,093,203
A
G
G
G
G
-
T
C
C
A
C
-
G
C
G
T
G
G
C
-
-
G
C
A
T
T
A
T
C
C
T
C
-
T
A
-
G
T
A
A
A
T
T
2
A
C
A
A
G
C
T
A
T
T
A
T
T
A
T
A
A
T
11
G
G
T
-
T
A
A
T
-
C
G
C
G
T
T
T
G
G
G
C
T
G
41
T/A
-/65
G
T/C
G/A
T
G
C
C
A
A
C
T
G
2
16
G
G
C
T
T
A
T
A
G
C
112
T
-
C
T
T
A
T
A
C
A
A
G
-
G/A
T/C
G/C
A/G
G
T
C
A
A
A
G
C
T
T
G
G
G
C
-
G
G
C/-
A
G
G
A
A
A
A
G
A
A
A
G
T
G
C
G
G
A
-
C
T
G
C
-
C
4
4
-
G
6
T
C
G
A
C
G
A
C
C
G
C
G
T
C
-
C
C
G
G
C
C
A
T
T
T
A
-
-
A
G
C
C
2
C
C
C
A
C
T
C
-
A
2
T
T
2
2
2
C
T
G
G
C
C
A
C
C
G
A
A
2
A
T
T
A
42
A
A
T
T
C
C
C
A
A
T
T
T
G
A
G
G
A
-
-
C
T
G
C
C
T
T
-
A
G
T
C
A
G
-
C
-
A
A
G
T
G
G
G
C
C
T
-
T
G
T
C
G
-
G
G
A
C
-
T
-
C
A
2
C
-
C
A
A
T
A
T
A
C
G
G
G
A
G
T
A
A
A
A
T
T
A
C
A
A
A
-
C
T
A
A
T
A
G
G
C
C
C
A
C
-
G
C
G
G
A
C
A
A
A
C
A
T
T
C
C
G
G
C
C
70
C
G
T
G
T
A
A
G
C
A
-
G
A
C
C
T
T
C
G
T
-
-
A
T
C
-
G
-
G
A
A
G
A
A
A
C
C
G
G
A
G
-
-
A
A
G
A
G
T
4
T
-
G
G
A
G
C
-
-
A
C
A
C
C
G
A
-
A
-
-
A
G
-
A
A
-
T
A
A
-
-
-
C
A
-
4
A
-
C
T
T
T
A
G
A
-
A
G
A
C
T
T
G
G
G
A
12
A
C
A
A
C
C
-
A
A
G
T
C
-
T
G
A
T
G
T
A
-
A
A
A
C
A
T
C
-
C
A
G
A
T
G
G