Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 329,816 (bp)   Positions: 621
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
Oca2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pole3-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
T
A
A
A
C
G
G
C
G
C
G
G
G
2
T
T
C
T
G
G
A
T
2
T
-
C
T
G
G
T
C
T
G
C
-
T
A
2
T
G
T
T
-
A
C
A
C
A
T
T
G
C
G
G
C
C
G
C
G
-
G
C
T
A
A
T
C
T
C
T
-
-
-
-
C
G
T
T
-
G
T
G
G
C
T
G
G
G
C
G
A
-
G
A
C
G
A
C
T
-
C
A
T
A
C
G
C
T
T
T
C
G
G
A
A
G
G
C
A
C
G
G
G
-
G
C
G
C
A
C
8
G
G
T
A
G
G
26
-
C
C
T
T
A
A
A
T
A
T
T
A
C
A
A
-
A
T
C
T
G
C
A
G
G
C
A
G
A
G
A
T
T
G
G
A
T
C
C
T
C
A
A
A
C
T
T
T
T
C
-
C
G
C
T
T
A
A
C
T
C
-
-
T
T
A
3
-
3
15
9
T
C
G
A
T
C
A
T
G
A
T
C
C
C
C
C
G
C
C
C
C
G
T
C
C
C
T
T
T
-
A
T
T
C
C
C
A
C
C
C
T
T
A
G
A
G
T
C
G
A
C
T
A
-
7
A
A
A
A
G
A
T
T
G
T
G
-
C
C
T
T
T
C
T
C
T
T
2
C
A
G
A
-
-
T
A
T
G
A
T
G
G
C
G
A
G
T
4
-
A
A
C
C
T
T
A
G
C
C
7
G
C
G
G
A
C
-
-
C
T
-
A
G
C
C
C
C
G
C
2
G
A
A
A
T
T
G
T
A
C
C
T
G
A
C
A
A
A
A
A
A
15
-
A
T
A
C
C
C
C
A
A
G
A
A
G
T
G
T
T
T
A
T
T
G
A
C
-
G
C
C
T
A
2
C
C
T
G
T
G
A
G
A
T
2
A
G
A
A
T
C
6
A
A
C
G
G
T
G
-
C
C
A
C
A
C
A
-
T
T
A
2
C
T
C
3
A
G
C
T
T
C
G
-
T
C
14
C
T
G
A
T
T
C
G
C
A
A
T
A
G
G
C
G
A
C
A
T
A
T
C
-
T
C
T
A
C
5
T
T
G
C
C
A
G
T
A
T
T
G
14
A
T
T
T
A
T
-
T
T
-
-
A
G
T
A
C
G
T
C
A
T
C
G
T
C
-
T
C
T
T
T
C
G
-
C
T
C
T
T
C
-
T
A
A
-
T
A
G
C
A
A
T
G
A
G
A
C
A
A
G
G
2
A
C
T
-
T
-
-
A
C
2
T
T
T
T
T
A
T
G
G
G
T
G
G
-
A
-
T
A
A
A
C
T
G
C
T
T
A
T
-
T
C
C
A
T
A
A
C
C
G
T
A
C
2
G
G
C
A
T
T
G
C
G
A
C
T
A
A
  107,116,818
  107,116,915
  107,117,729
  107,117,802
  107,117,808
  107,118,368
  107,118,854
  107,119,902
  107,120,054
  107,120,476
  107,121,305
  107,121,344
  107,121,990
  107,122,479
  107,129,380
  107,129,383
  107,129,414
  107,130,126
  107,130,287
  107,130,933
  107,137,701
  107,145,359
  107,146,124
  107,146,881
  107,147,035
  107,147,051
  107,147,078
  107,147,227
  107,150,679
  107,151,836
  107,153,091
  107,156,847
  107,157,376
  107,158,264
  107,158,357
  107,158,413
  107,158,496
  107,158,522
  107,158,926
  107,159,004
  107,159,015
  107,161,298
  107,161,489
  107,162,053
  107,162,546
  107,162,604
  107,163,419
  107,163,421
  107,163,442
  107,166,339
  107,167,882
  107,171,096
  107,172,211
  107,172,634
  107,175,843
  107,175,869
  107,177,398
  107,177,899
  107,178,699
  107,178,719
  107,178,914
  107,179,022
  107,179,275
  107,180,236
  107,180,352
  107,180,599
  107,180,749
  107,180,851
  107,181,513
  107,182,016
  107,182,497
  107,182,747
  107,182,749
  107,182,751
  107,183,698
  107,183,985
  107,184,010
  107,184,305
  107,184,419
  107,185,053
  107,186,426
  107,186,429
  107,186,895
  107,188,005
  107,188,393
  107,188,641
  107,188,819
  107,188,976
  107,189,694
  107,190,293
  107,191,073
  107,191,369
  107,192,186
  107,192,752
  107,193,458
  107,193,634
  107,193,654
  107,193,657
  107,193,696
  107,193,872
  107,194,101
  107,194,141
  107,194,235
  107,194,588
  107,194,641
  107,194,823
  107,195,215
  107,195,284
  107,195,340
  107,195,479
  107,195,480
  107,195,520
  107,195,572
  107,195,653
  107,196,062
  107,196,275
  107,196,537
  107,197,335
  107,197,599
  107,197,708
  107,198,554
  107,198,750
  107,198,982
  107,199,156
  107,199,345
  107,199,745
  107,199,849
  107,200,109
  107,200,720
  107,201,617
  107,205,373
  107,205,378
  107,205,431
  107,205,439
  107,205,937
  107,205,985
  107,206,281
  107,206,321
  107,207,852
  107,208,160
  107,208,271
  107,209,417
  107,210,860
  107,212,537
  107,213,308
  107,213,477
  107,213,996
  107,214,108
  107,215,151
  107,215,522
  107,217,009
  107,217,910
  107,218,346
  107,221,643
  107,222,201
  107,223,495
  107,224,786
  107,224,808
  107,225,290
  107,225,566
  107,225,569
  107,225,964
  107,225,972
  107,226,712
  107,227,238
  107,228,477
  107,229,278
  107,229,497
  107,229,545
  107,229,853
  107,229,955
  107,230,087
  107,230,647
  107,230,794
  107,231,698
  107,232,465
  107,233,240
  107,233,573
  107,233,737
  107,233,884
  107,234,425
  107,235,225
  107,236,194
  107,236,202
  107,236,393
  107,237,368
  107,237,810
  107,237,821
  107,238,440
  107,238,560
  107,238,738
  107,238,871
  107,239,040
  107,239,660
  107,243,040
  107,243,132
  107,243,134
  107,243,327
  107,244,601
  107,244,797
  107,244,805
  107,244,853
  107,244,906
  107,244,920
  107,245,025
  107,245,126
  107,247,009
  107,247,016
  107,247,020
  107,247,025
  107,247,043
  107,247,052
  107,247,287
  107,247,398
  107,248,371
  107,249,077
  107,249,843
  107,249,923
  107,252,310
  107,252,478
  107,252,568
  107,256,366
  107,258,485
  107,258,798
  107,258,929
  107,259,056
  107,259,069
  107,259,075
  107,259,111
  107,259,199
  107,259,264
  107,259,411
  107,259,782
  107,259,828
  107,263,004
  107,263,934
  107,263,936
  107,273,356
  107,273,358
  107,274,973
  107,277,426
  107,281,024
  107,281,336
  107,281,879
  107,283,550
  107,283,851
  107,285,992
  107,287,603
  107,289,910
  107,296,288
  107,298,856
  107,298,858
  107,300,196
  107,301,942
  107,302,243
  107,302,250
  107,302,368
  107,302,375
  107,309,079
  107,313,912
  107,317,039
  107,318,398
  107,320,544
  107,329,903
  107,332,088
  107,332,190
  107,337,140
  107,337,554
  107,342,053
  107,344,041
  107,344,966
  107,345,848
  107,346,354
  107,352,852
  107,353,218
  107,355,191
  107,356,111
  107,359,067
  107,359,408
  107,359,650
  107,359,675
  107,360,146
  107,360,381
  107,360,711
  107,360,772
  107,361,086
  107,361,171
  107,361,181
  107,361,237
  107,361,238
  107,361,788
  107,361,846
  107,361,919
  107,362,372
  107,362,432
  107,362,542
  107,362,653
  107,362,685
  107,362,739
  107,362,828
  107,362,846
  107,362,890
  107,362,902
  107,362,947
  107,363,026
  107,363,071
  107,363,251
  107,363,265
  107,363,495
  107,363,542
  107,363,755
  107,363,881
  107,364,004
  107,364,167
  107,364,274
  107,364,505
  107,364,837
  107,365,192
  107,365,377
  107,365,418
  107,365,536
  107,365,869
  107,365,968
  107,366,034
  107,366,098
  107,366,653
  107,367,161
  107,367,958
  107,367,995
  107,368,249
  107,368,256
  107,369,377
  107,369,566
  107,369,904
  107,370,110
  107,370,154
  107,370,190
  107,370,381
  107,370,388
  107,370,647
  107,370,715
  107,372,354
  107,372,704
  107,373,638
  107,373,661
  107,374,404
  107,375,187
  107,375,601
  107,376,747
  107,376,826
  107,377,179
  107,377,427
  107,378,130
  107,378,250
  107,378,292
  107,378,756
  107,378,898
  107,378,900
  107,378,902
  107,378,904
  107,378,906
  107,378,908
  107,379,033
  107,379,843
  107,381,818
  107,382,153
  107,382,472
  107,382,838
  107,384,043
  107,385,212
  107,385,219
  107,385,265
  107,385,539
  107,385,884
  107,386,196
  107,386,300
  107,386,610
  107,387,315
  107,387,316
  107,387,462
  107,387,511
  107,387,559
  107,387,714
  107,387,848
  107,388,189
  107,388,675
  107,388,926
  107,388,946
  107,389,204
  107,389,322
  107,389,748
  107,389,927
  107,389,979
  107,390,007
  107,395,990
  107,396,573
  107,396,809
  107,397,326
  107,397,413
  107,398,060
  107,398,761
  107,398,812
  107,398,931
  107,398,933
  107,399,019
  107,399,049
  107,399,053
  107,399,395
  107,399,428
  107,399,686
  107,400,066
  107,400,164
  107,400,409
  107,400,449
  107,400,477
  107,400,692
  107,400,802
  107,400,931
  107,401,093
  107,401,113
  107,401,234
  107,401,989
  107,402,137
  107,402,176
  107,402,248
  107,402,443
  107,402,617
  107,402,876
  107,402,898
  107,403,253
  107,403,399
  107,403,592
  107,403,676
  107,403,711
  107,403,722
  107,403,783
  107,404,311
  107,404,643
  107,404,797
  107,404,860
  107,405,339
  107,405,434
  107,405,513
  107,405,866
  107,406,130
  107,406,175
  107,406,618
  107,406,863
  107,407,096
  107,407,155
  107,407,253
  107,407,445
  107,407,897
  107,407,977
  107,408,090
  107,408,231
  107,408,482
  107,408,487
  107,408,492
  107,408,637
  107,408,686
  107,408,847
  107,408,907
  107,409,031
  107,409,142
  107,409,171
  107,409,306
  107,409,350
  107,409,386
  107,409,421
  107,409,559
  107,409,588
  107,409,656
  107,409,690
  107,409,698
  107,409,714
  107,409,738
  107,409,797
  107,409,828
  107,410,021
  107,410,293
  107,410,376
  107,410,800
  107,410,881
  107,411,010
  107,411,341
  107,411,506
  107,411,507
  107,411,534
  107,411,627
  107,411,746
  107,411,783
  107,411,849
  107,411,894
  107,411,954
  107,412,160
  107,412,641
  107,412,812
  107,413,146
  107,413,686
  107,413,719
  107,413,815
  107,413,816
  107,413,833
  107,413,962
  107,414,267
  107,414,300
  107,415,139
  107,415,567
  107,416,009
  107,416,016
  107,416,238
  107,416,770
  107,416,791
  107,417,025
  107,417,091
  107,417,305
  107,417,309
  107,417,478
  107,417,523
  107,417,571
  107,417,655
  107,418,169
  107,418,251
  107,418,290
  107,418,527
  107,418,959
  107,419,273
  107,419,275
  107,419,368
  107,419,591
  107,419,628
  107,419,632
  107,419,636
  107,419,855
  107,420,085
  107,420,141
  107,420,185
  107,420,419
  107,420,592
  107,420,817
  107,421,018
  107,421,122
  107,421,545
  107,421,964
  107,421,979
  107,422,340
  107,422,562
  107,423,022
  107,423,471
  107,423,495
  107,423,500
  107,423,502
  107,423,529
  107,423,532
  107,423,634
  107,423,648
  107,423,900
  107,423,904
  107,424,072
  107,424,198
  107,424,660
  107,424,915
  107,424,918
  107,425,003
  107,425,091
  107,425,255
  107,425,409
  107,425,449
  107,425,874
  107,425,931
  107,425,933
  107,425,934
  107,425,973
  107,426,042
  107,426,345
  107,427,082
  107,428,120
  107,428,958
  107,429,312
  107,429,733
  107,430,496
  107,430,832
  107,430,858
  107,430,869
  107,431,047
  107,431,067
  107,431,327
  107,431,348
  107,431,623
  107,431,646
  107,431,814
  107,431,838
  107,431,839
  107,431,842
  107,432,683
  107,433,367
  107,433,436
  107,434,019
  107,434,158
  107,434,418
  107,434,740
  107,435,192
  107,435,894
  107,436,120
  107,436,466
  107,436,625
  107,436,864
  107,436,938
  107,436,960
  107,437,772
  107,437,993
  107,441,244
  107,441,523
  107,441,633
  107,442,013
  107,443,003
  107,443,962
  107,444,155
  107,444,528
  107,445,374
A
C
C
-/T
T/-
T
A
A
T
A
T
T
A
T
-
G/-
A/-
A
-
A
C
G
G
-
C
C
T
C
C
A
C
C/T
T/-
G/A
C/T
-/4
T/G
A/G
2/-
T/C
T/C
A/G
G
2
G
T
T
T
T/-
A
-
C
T
A
A
T
T
C
T
A
T
A
T
G
T
G
C
T
C
T
C
4
C
9
2
T
A
C
C
A
A
C
A
A
T
-
A
T
A
T
A
C
2
A
-
T
C
T
A
G
24
T
C
C
G
A
A
T
C
C
A
G
A
A
G
T
T
T
T
G
T
C
T
A
C
A
G
C
T
G
-/G
-
C
C
C
C
T
-
-
3
T
T
-
A
C
G
-
C
C
A
G/-
G
G
G
T
T
T
C
T
A
T
T
T
-
G/-
-
C
T
G
A
C
G
C
T
A
G
C
G
A
C
G
G
T
G
T
C
A
C
C
T
2
A
A
T
-
-
C
G
T
A
T
G
A
C
C
T
-
2
-
-
-
C
-
A
T
C
T
G
A
A
T
C
T
T
G
T
G
T
G
A
T
T
T
C
T
G/-
-/G
-/C
-/C
C
2
T
C
C
T
T
T
G
T
T
T/-
-/C
-
A/-
G/A
A/T
G/A
T/C
T
A
-
T
A
G
T
-
G
G
C
-/T
T
C
C
C
G/A
C
T
T
T
A
C
C
C
-/A
-
T
C
C
-
-/T
C
A
T
16
4
C
G
C
T
C
C
A
A
T
A
G
A
G
-
2
G
T
T
T
C
A
G
A
T
-
-
A
T
A
A
T
T
T
C
A
C
12
T
A
A
T
G
A
A
T
-
A
T
G
G
C
C
A
C
T
G
T
C
A
G
T
C/-
C/-
C
C
C
C
-
G
G
C
C
T
T
T
T
C
G
A
G
G
A
A
T
A
C
C
G
C
G
C
C
A
A
T
A
A
C
G
2/-
T
T
C
A
-
A
G
A
T
A
-
-
A
G
G
C
T
-
T
G
T
A
A
C
T
A
A
T
G
G
G
-
G
T
G
G
C
-
T
C
T
-
T/T
C
T
C
C
T
A
2
G
T
-
T
C
T
G
C
G
G
A
T
C
C
C
T
A
A
T
A
G
A
G
C
T
C
T
T
C
A
C
C
T
-
G
C
C
T
T
C
A
G
G
C
C
A
-
G
A
C
C
T
G
T
C
G
A
19
G
A
C
C
T
A
C
T
G
A
G
A
A
T
4
C
G
C
-
G
T
T
A
T
G
T
-
C
T
A
G
C
G
T
C
G
A
T
G
G
C
A
G
A
G
A
G
G/-
-/A
-/A
2/-
A/G
T
A
T
G
7
6
G
T
-
?
C
G
G
G
G
G
A
A
T
C
A
A
A
G
2
C
C
G
-
T
C
A
G
C
C
G
G
C
C
T
T
G
C
C
C
T
T
A
C
G
T
-
A
C
T
T
A
A
C
G
A
G
T
C
C
G