Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 96,993 (bp)   Positions: 211
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
WKY/N (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
T
C
G
A
A
A
A
C
C
G
G
T
T
T
G
T
-
C
G
-
C
G
C
T
C
C
C
T
A
G
T
G
T
C
C
G
G
G
G
G
C
T
2
4
G
2
T
T
A
A
C
-
G
A
A
G
A
G
G
A
G
C
G
T
C
T
C
C
T
G
C
C
T
A
T
3
A
C
G
A
T
G
A
T
G
A
C
T
A
G
A
C
C
C
C
-
G
T
T
C
G
-
T
G
G
T
C
A
G
-
T
A
T
C
T
A
C
-
T
T
C
A
C
C
T
-
G
T
C
-
C
C
T
A
2
-
T
31
C
T
C
A
T
C
A
A
A
10
A
C
A
T
A
5
G
G
C
G
12
A
-
-
A
C
G
C
-
G
A
G
A
10
C
A
C
G
T
13
A
C
A
C
T
C
A
-
C
C
A
3
T
A
T
T
A
A
A
T
C
T
A
-
A
G
-
T
G
C
C
  156,495,345
  156,495,361
  156,495,665
  156,496,239
  156,496,557
  156,497,111
  156,497,385
  156,497,720
  156,498,829
  156,500,106
  156,500,590
  156,501,019
  156,501,275
  156,501,538
  156,501,540
  156,501,544
  156,503,447
  156,503,478
  156,503,718
  156,504,047
  156,504,661
  156,505,469
  156,506,294
  156,506,798
  156,507,856
  156,507,971
  156,508,027
  156,508,031
  156,508,035
  156,508,066
  156,508,262
  156,508,341
  156,508,493
  156,508,666
  156,514,764
  156,515,262
  156,515,482
  156,515,844
  156,515,992
  156,515,994
  156,515,996
  156,515,998
  156,516,104
  156,517,403
  156,517,710
  156,517,965
  156,518,273
  156,518,779
  156,519,135
  156,519,416
  156,520,403
  156,520,406
  156,520,478
  156,520,645
  156,520,701
  156,520,970
  156,522,295
  156,522,316
  156,522,785
  156,522,969
  156,523,269
  156,523,513
  156,523,712
  156,524,013
  156,524,262
  156,524,358
  156,524,661
  156,524,828
  156,526,405
  156,526,645
  156,526,830
  156,527,057
  156,527,499
  156,527,842
  156,527,902
  156,529,413
  156,529,455
  156,529,591
  156,530,837
  156,530,838
  156,531,293
  156,533,077
  156,533,254
  156,533,797
  156,534,431
  156,534,975
  156,536,196
  156,536,197
  156,536,986
  156,537,088
  156,537,110
  156,537,316
  156,537,589
  156,538,025
  156,538,091
  156,538,104
  156,538,105
  156,538,525
  156,538,729
  156,540,142
  156,540,163
  156,540,550
  156,540,812
  156,541,189
  156,541,208
  156,541,401
  156,541,890
  156,541,926
  156,542,269
  156,542,271
  156,543,025
  156,543,771
  156,544,498
  156,544,774
  156,545,182
  156,545,308
  156,547,255
  156,548,047
  156,548,520
  156,548,917
  156,548,931
  156,549,099
  156,549,113
  156,549,359
  156,549,917
  156,551,002
  156,551,182
  156,551,586
  156,551,984
  156,552,856
  156,553,205
  156,553,448
  156,554,026
  156,555,141
  156,555,323
  156,556,228
  156,556,464
  156,556,679
  156,556,817
  156,557,374
  156,557,675
  156,558,109
  156,558,883
  156,558,888
  156,559,188
  156,559,700
  156,560,229
  156,560,354
  156,561,393
  156,561,489
  156,561,494
  156,561,823
  156,561,934
  156,562,742
  156,563,105
  156,563,119
  156,564,016
  156,565,056
  156,565,063
  156,566,859
  156,567,394
  156,569,908
  156,570,016
  156,570,280
  156,570,442
  156,570,456
  156,570,673
  156,571,842
  156,571,882
  156,571,946
  156,572,010
  156,572,521
  156,573,418
  156,573,480
  156,573,720
  156,574,323
  156,574,693
  156,574,700
  156,575,246
  156,576,186
  156,577,365
  156,577,525
  156,577,860
  156,578,902
  156,579,460
  156,580,008
  156,580,023
  156,580,194
  156,580,444
  156,580,934
  156,581,265
  156,581,528
  156,582,185
  156,582,216
  156,582,376
  156,582,432
  156,582,827
  156,583,812
  156,584,896
  156,585,457
  156,586,275
  156,587,553
  156,588,267
  156,588,721
  156,588,728
  156,590,319
  156,590,474
  156,590,558
  156,590,562
  156,590,633
  156,590,954
C
T
C
G
G/-
G
G
T
G
T
T
A
A/-
C/-
-/C
-/C
T
C
T
A
T
8
A
A
T
G
-/A
-/A
-/A
A
G
C
G
A
C
T
T
A
A/-
A/-
A/-
-/A
T
C
-
-
A
-
C
A
C/-
C
T
T
C
C
G
A
G
A
A
G
A
T
A
C
-/A
C
T
G
A
A
T
T/-
C
T
G
-
C/-
-/T
A
G
C
A
G
-
T
C
T
C
-
T
G
T/-
-
T
T
4
A
C
C
T
T
2
G
T
A
G
A
-
A
C
G
G
A
T
-/A
G
T
A
A
-/C
T/-
G
A
T
C
2
T
C
T
3
T
T
C
-
-
4
G
-
G
A
T
G
C
T
G
G
G
-
-/C
A
G
-
C
-
T
A
T
A
-
G
T
2
C
A/-
A
T
T
A
G
A
G
-
T
C
T
C
G
-
T
-
T
A
C
T
G
3
T
T
G
-
C
G
C
A
C
G
G
C
T
A
G
6
-/G
-/A
5
G
C
T
T