Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 96,993 (bp)   Positions: 202
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
BXH3/CubMcwi (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
Nup98
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
C
C
A
A
G
12
C
C
G
-
G
-
-
C
9
G
T
C
C
C
T
A
G
G
T
A
7
T
T
C
-
G
G
G
G
T
T
A
G
T
-
C
A
A
A
T
C
G
T
A
C
A
C
C
C
T
T
C
G
A
G
A
A
20
3
T
G
A
A
G
A
A
-
C
-
G
A
18
T
T
T
G
G
A
C
A
C
T
A
C
T
-
123
G
C
T
T
9
C
A
G
-
C
C
A
G
T
A
G
T
T
-
T
C
A
4
-
G
T
-
C
C
C
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
-
T
A
G
C
A
T
A
A
C
A
A
G
G
G
C
-
G
G
T
A
-
-
2
C
G
-
A
C
A
A
G
G
C
A
C
C
C
-
C
A
A
T
A
T
T
T
A
A
G
G
A
T
T
T
G
C
T
A
C
A
A
C
3
-
C
C
C
  156,495,652
  156,496,073
  156,496,239
  156,497,385
  156,501,266
  156,501,275
  156,501,507
  156,501,862
  156,501,924
  156,503,447
  156,503,718
  156,504,661
  156,505,469
  156,505,486
  156,505,593
  156,506,547
  156,506,873
  156,507,971
  156,508,027
  156,508,031
  156,508,035
  156,508,066
  156,508,262
  156,508,341
  156,508,347
  156,508,493
  156,509,101
  156,509,279
  156,511,018
  156,514,764
  156,515,482
  156,515,921
  156,515,992
  156,515,994
  156,515,996
  156,515,998
  156,516,785
  156,517,403
  156,517,707
  156,518,273
  156,519,135
  156,519,916
  156,519,980
  156,520,403
  156,521,064
  156,522,295
  156,523,537
  156,524,003
  156,524,262
  156,524,358
  156,524,645
  156,524,661
  156,524,750
  156,526,405
  156,526,645
  156,527,499
  156,527,902
  156,529,455
  156,529,466
  156,529,559
  156,529,972
  156,532,635
  156,532,889
  156,533,077
  156,534,616
  156,534,640
  156,534,975
  156,536,196
  156,536,197
  156,537,110
  156,537,316
  156,537,589
  156,537,843
  156,538,434
  156,538,463
  156,538,525
  156,538,729
  156,539,265
  156,539,649
  156,540,142
  156,540,163
  156,540,229
  156,540,245
  156,540,261
  156,540,263
  156,540,267
  156,540,573
  156,540,598
  156,540,602
  156,540,614
  156,540,748
  156,540,835
  156,541,189
  156,541,253
  156,541,372
  156,541,763
  156,541,926
  156,541,985
  156,542,231
  156,542,269
  156,542,271
  156,542,744
  156,543,771
  156,543,903
  156,544,447
  156,544,774
  156,545,055
  156,545,182
  156,546,416
  156,546,626
  156,547,255
  156,548,020
  156,548,917
  156,549,100
  156,549,113
  156,549,359
  156,550,622
  156,551,586
  156,551,984
  156,552,856
  156,553,448
  156,554,026
  156,554,958
  156,555,141
  156,555,323
  156,555,380
  156,555,382
  156,556,469
  156,556,473
  156,556,479
  156,556,481
  156,556,485
  156,556,487
  156,556,491
  156,556,679
  156,556,817
  156,557,063
  156,557,089
  156,557,675
  156,558,888
  156,559,644
  156,560,354
  156,561,393
  156,561,823
  156,561,934
  156,563,105
  156,564,016
  156,564,903
  156,565,696
  156,565,708
  156,566,299
  156,566,705
  156,566,859
  156,567,632
  156,569,908
  156,570,016
  156,570,280
  156,570,450
  156,570,456
  156,570,673
  156,571,882
  156,572,010
  156,573,216
  156,573,408
  156,573,418
  156,573,949
  156,574,252
  156,576,232
  156,577,365
  156,577,525
  156,579,027
  156,579,071
  156,580,194
  156,580,934
  156,581,131
  156,581,265
  156,582,185
  156,582,216
  156,582,376
  156,582,432
  156,582,733
  156,582,827
  156,583,812
  156,584,750
  156,584,759
  156,584,896
  156,585,457
  156,586,960
  156,586,994
  156,587,023
  156,587,041
  156,587,231
  156,588,267
  156,588,422
  156,588,688
  156,588,728
  156,589,892
  156,590,438
  156,590,474
  156,590,633
  156,590,954
  156,591,160
A
A
G
G
G
-/A
-
T
T
T
T
T
8
T
T
9/-
C
G
A/-
-/A
A/-
A
G
C
A
G
G
-
G
C
T
4
A/-
-/A
-/A
-/A
C
C
-
A
C
A
T
-/C
T
G
G
T
A
C
-/T
A/-
G
T
G
T
C
G
T
A
C/-
A
T
G
-
-
-
T
C
-
T
G
C
T
T
4
A
G
-
C
C
C
C
A
G
T
T
G
C
G
T
G
2
-
A/-
T
G
C
-
A
-
A
C
T
T
G
T
A
-/T
A
A/-
C
A
C
-/T
G
-
2
T
C
3
T
T
T
C
T/A
A
-/C
-/C
T/C
T/C
T/C
T/C
T/C
4
G
T
A
G
G
-
G
G
A
G
C
T
A
A
T
T
A
A
C
G
T
2
-
-/A
A
T
G
T
G/-
G
T
A
A
T
-
T
T
3
T
-
G
C
G
C
A
C
C
G
A
T
G
C
T/C
T/C
G/A
C/-
C
G
T
G
G/-
T
-
5
T
T
T