Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 252,397 (bp)   Positions: 615
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120096254
LOC120096254
LOC120096254
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102553722
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
Nav1
G
G
C
C
-
G
C
A
A
T
4
T
T
-
G
T
T
T
T
T
T
G
T
G
A
C
A
T
T
C
C
A
C
T
C
-
A
G
C
T
T
C
C
C
G
C
C
G
-
A
A
G
A
A
T
C
T
G
C
C
A
A
11
C
C
T
-
A
G
C
G
G
A
-
C
C
T
T
A
-
C
T
3
T
T
4
T
G
G
A
C
G
C
G
A
C
-
C
C
A
A
-
-
-
A
-
G
T
T
G
T
A
A
T
C
C
A
T
T
-
A
7
A
G
T
-
C
G
G
C
G
-
G
-
C
A
G
A
T
A
C
A
A
C
C
41
G
A
G
T
A
A
C
C
T
A
-
29
A
G
G
T
T
T
110
C
G
T
T
A
A
T
G
T
C
-
T
T
T
T
T
T
T
T
T
C
A
T
C
C
T
C
C
G
T
T
C
9
G
G
C
-
C
G
C
G
A
C
4
T
T
A
G
A
T
106
G
T
G
T
A
A
T
C
A
C
T
G
C
C
A
A
G
G
G
C
-
T
A
2
T
-
A
T
T
G
T
G
C
C
T
T
-
G
G
T
C
C
T
A
A
C
A
G
G
G
3
T
T
-
7
C
-
T
G
2
A
G
G
C
A
G
-
A
-
9
T
C
G
A
A
A
A
G
G
T
A
T
T
G
-
T
C
C
C
-
C
C
T
G
A
7
A
G
T
C
-
T
T
A
2
G
T
3
-
T
T
T
G
C
C
C
A
A
T
T
C
T
A
G
G
T
A
G
T
G
G
A
G
A
T
A
C
G
G
G
T
T
T
G
T
C
A
C
A
C
G
-
G
C
C
C
T
G
T
A
A
A
G
-
C
T
T
A
G
C
A
A
T
T
C
T
T
-
-
G
-
T
A
C
T
T
G
A
G
A
G
-
C
G
C
G
A
A
9
G
T
G
T
A
-
-
G
T
A
A
A
G
A
G
C
T
T
T
A
T
C
-
G
A
G
C
T
A
30
G
G
C
A
-
G
A
C
A
C
C
T
A
A
A
C
G
A
-
T
A
C
G
-
G
T
32
G
C
C
G
T
C
T
-
C
T
A
T
T
41
A
T
A
A
-
A
A
T
T
G
C
C
A
G
G
A
T
G
A
T
A
G
G
G
C
T
C
C
A
G
A
T
T
-
2
6
T
-
2
31
8
8
T
T
C
G
C
A
G
C
C
G
A
T
A
T
A
G
G
T
A
A
A
C
T
C
A
T
13
G
T
A
C
C
T
C
A
G
T
G
G
G
C
G
A
-
T
C
T
G
T
G
C
T
A
G
C
T
C
C
G
G
C
G
G
C
A
A
A
G
G
A
A
C
T
A
G
A
T
T
T
G
G
T
C
-
-
G
C
  46,868,518
  46,868,598
  46,868,845
  46,869,702
  46,870,224
  46,871,261
  46,871,584
  46,874,438
  46,874,881
  46,879,831
  46,881,220
  46,881,308
  46,881,322
  46,881,373
  46,881,376
  46,881,660
  46,883,129
  46,883,278
  46,884,369
  46,885,841
  46,886,784
  46,887,146
  46,891,498
  46,893,264
  46,894,600
  46,894,650
  46,894,934
  46,895,904
  46,896,027
  46,896,041
  46,897,642
  46,897,913
  46,898,442
  46,898,460
  46,898,795
  46,900,420
  46,900,802
  46,900,999
  46,901,946
  46,902,251
  46,902,296
  46,903,542
  46,903,558
  46,903,721
  46,905,330
  46,905,432
  46,909,401
  46,910,517
  46,913,327
  46,913,587
  46,914,429
  46,914,814
  46,915,218
  46,918,456
  46,918,900
  46,919,557
  46,921,408
  46,921,606
  46,921,757
  46,921,759
  46,921,760
  46,923,840
  46,924,298
  46,925,677
  46,928,980
  46,929,318
  46,931,823
  46,931,834
  46,932,198
  46,932,830
  46,933,363
  46,933,598
  46,934,404
  46,934,936
  46,934,954
  46,934,988
  46,935,087
  46,935,288
  46,935,311
  46,935,412
  46,936,178
  46,936,228
  46,936,358
  46,936,386
  46,936,804
  46,937,413
  46,937,535
  46,938,098
  46,938,702
  46,939,987
  46,939,999
  46,940,498
  46,940,723
  46,941,460
  46,941,470
  46,942,280
  46,942,903
  46,943,092
  46,944,328
  46,944,696
  46,944,729
  46,945,241
  46,945,246
  46,945,249
  46,945,441
  46,945,658
  46,945,875
  46,946,047
  46,946,121
  46,946,135
  46,946,563
  46,946,869
  46,947,110
  46,947,849
  46,947,897
  46,947,906
  46,948,105
  46,948,412
  46,948,413
  46,948,794
  46,948,955
  46,949,574
  46,950,329
  46,950,540
  46,950,741
  46,950,798
  46,951,164
  46,951,964
  46,952,076
  46,952,079
  46,952,135
  46,952,612
  46,952,898
  46,953,010
  46,953,011
  46,953,016
  46,953,022
  46,953,054
  46,953,055
  46,953,824
  46,954,266
  46,954,695
  46,954,891
  46,955,382
  46,955,480
  46,955,483
  46,955,669
  46,955,710
  46,955,723
  46,955,763
  46,956,003
  46,956,068
  46,956,118
  46,956,271
  46,956,615
  46,956,827
  46,956,927
  46,957,047
  46,957,292
  46,957,394
  46,957,468
  46,957,944
  46,958,161
  46,958,538
  46,959,044
  46,959,233
  46,959,248
  46,959,434
  46,959,451
  46,959,486
  46,959,518
  46,959,602
  46,960,033
  46,960,330
  46,960,384
  46,961,180
  46,961,244
  46,961,247
  46,961,250
  46,961,253
  46,961,256
  46,961,259
  46,961,262
  46,961,265
  46,961,268
  46,961,307
  46,961,464
  46,962,725
  46,964,517
  46,965,171
  46,966,348
  46,966,395
  46,968,259
  46,971,101
  46,971,357
  46,971,394
  46,971,685
  46,973,253
  46,973,728
  46,973,730
  46,974,218
  46,974,427
  46,974,897
  46,976,666
  46,977,354
  46,978,074
  46,978,182
  46,978,593
  46,978,876
  46,979,372
  46,980,581
  46,982,530
  46,983,013
  46,983,183
  46,983,186
  46,983,744
  46,983,985
  46,984,114
  46,984,140
  46,984,366
  46,984,379
  46,984,381
  46,984,503
  46,984,504
  46,984,676
  46,984,788
  46,984,825
  46,984,975
  46,985,133
  46,985,185
  46,985,192
  46,985,536
  46,985,889
  46,986,281
  46,986,282
  46,986,454
  46,987,165
  46,987,746
  46,988,021
  46,988,115
  46,988,555
  46,988,661
  46,988,862
  46,988,879
  46,988,886
  46,988,917
  46,988,926
  46,989,156
  46,989,334
  46,989,505
  46,990,468
  46,991,501
  46,991,607
  46,991,636
  46,991,687
  46,992,194
  46,992,230
  46,992,740
  46,992,914
  46,992,945
  46,993,053
  46,993,784
  46,993,790
  46,994,861
  46,995,258
  46,995,691
  46,996,025
  46,996,231
  46,997,439
  46,997,792
  46,998,101
  46,998,243
  46,999,116
  46,999,266
  46,999,644
  46,999,969
  47,000,097
  47,000,259
  47,001,198
  47,001,364
  47,003,412
  47,003,938
  47,006,899
  47,006,901
  47,006,904
  47,007,128
  47,007,133
  47,007,351
  47,009,699
  47,010,510
  47,010,959
  47,013,110
  47,014,956
  47,015,193
  47,015,566
  47,016,393
  47,016,658
  47,019,900
  47,019,901
  47,020,108
  47,020,863
  47,023,623
  47,023,992
  47,024,644
  47,024,989
  47,025,573
  47,025,629
  47,026,992
  47,027,162
  47,027,541
  47,027,861
  47,027,971
  47,027,973
  47,027,981
  47,028,522
  47,028,540
  47,028,749
  47,028,782
  47,029,001
  47,029,042
  47,029,227
  47,029,228
  47,029,251
  47,029,256
  47,029,266
  47,029,281
  47,029,430
  47,029,518
  47,029,528
  47,029,545
  47,029,607
  47,029,630
  47,029,661
  47,030,126
  47,030,169
  47,030,174
  47,030,178
  47,030,301
  47,030,329
  47,030,808
  47,030,833
  47,030,836
  47,030,851
  47,030,866
  47,030,871
  47,030,872
  47,031,952
  47,033,461
  47,033,809
  47,033,887
  47,034,151
  47,034,941
  47,035,779
  47,036,871
  47,036,953
  47,037,042
  47,038,579
  47,038,583
  47,038,876
  47,038,901
  47,040,043
  47,040,377
  47,040,826
  47,041,798
  47,043,458
  47,044,062
  47,044,517
  47,045,728
  47,046,058
  47,046,209
  47,046,429
  47,047,362
  47,048,550
  47,048,847
  47,048,892
  47,051,018
  47,051,297
  47,051,440
  47,051,511
  47,051,758
  47,051,764
  47,051,773
  47,051,777
  47,051,835
  47,051,971
  47,052,584
  47,052,870
  47,053,144
  47,054,230
  47,054,435
  47,054,495
  47,054,605
  47,054,632
  47,055,023
  47,055,386
  47,055,402
  47,055,453
  47,055,564
  47,055,666
  47,055,735
  47,056,144
  47,056,152
  47,056,285
  47,056,333
  47,056,493
  47,056,531
  47,056,539
  47,056,543
  47,056,676
  47,056,725
  47,056,877
  47,056,888
  47,056,940
  47,057,127
  47,057,285
  47,057,352
  47,058,412
  47,058,483
  47,058,897
  47,059,076
  47,059,087
  47,059,088
  47,059,102
  47,059,378
  47,059,443
  47,059,454
  47,059,468
  47,059,500
  47,059,501
  47,059,813
  47,059,948
  47,059,959
  47,059,980
  47,060,448
  47,060,624
  47,060,708
  47,060,734
  47,060,922
  47,061,287
  47,061,528
  47,061,530
  47,061,641
  47,063,590
  47,063,694
  47,063,787
  47,065,827
  47,066,029
  47,067,715
  47,068,177
  47,069,615
  47,070,409
  47,070,569
  47,070,768
  47,073,193
  47,073,977
  47,073,991
  47,074,353
  47,074,879
  47,076,986
  47,077,646
  47,078,923
  47,080,252
  47,080,261
  47,080,572
  47,081,143
  47,082,168
  47,082,276
  47,082,689
  47,084,020
  47,084,493
  47,085,242
  47,085,321
  47,085,335
  47,085,339
  47,085,409
  47,085,413
  47,085,742
  47,085,877
  47,086,617
  47,087,230
  47,087,366
  47,087,417
  47,087,544
  47,087,750
  47,088,582
  47,088,754
  47,089,350
  47,090,118
  47,090,330
  47,090,369
  47,090,874
  47,090,898
  47,091,288
  47,091,393
  47,091,642
  47,091,826
  47,092,174
  47,093,097
  47,093,259
  47,093,532
  47,093,634
  47,093,785
  47,093,798
  47,093,847
  47,094,282
  47,094,425
  47,095,013
  47,095,435
  47,095,452
  47,095,985
  47,096,334
  47,096,393
  47,096,534
  47,096,847
  47,096,864
  47,097,152
  47,097,439
  47,097,499
  47,097,537
  47,098,079
  47,098,106
  47,098,156
  47,098,454
  47,098,463
  47,098,530
  47,098,633
  47,098,684
  47,098,701
  47,098,708
  47,098,737
  47,098,782
  47,098,951
  47,098,955
  47,099,165
  47,099,492
  47,099,698
  47,100,247
  47,100,251
  47,100,324
  47,100,518
  47,100,611
  47,100,876
  47,101,342
  47,101,882
  47,102,078
  47,102,282
  47,102,424
  47,102,551
  47,102,906
  47,103,457
  47,103,658
  47,104,014
  47,104,031
  47,104,948
  47,105,090
  47,105,253
  47,105,567
  47,105,571
  47,108,682
  47,109,037
  47,109,287
  47,110,345
  47,110,496
  47,110,939
  47,111,004
  47,111,160
  47,111,168
  47,111,177
  47,111,231
  47,111,353
  47,111,484
  47,111,749
  47,111,877
  47,111,921
  47,111,946
  47,112,086
  47,112,090
  47,112,145
  47,112,177
  47,112,385
  47,112,386
  47,112,458
  47,112,494
  47,112,584
  47,113,117
  47,113,119
  47,113,483
  47,113,617
  47,113,776
  47,113,833
  47,113,841
  47,114,013
  47,114,135
  47,114,263
  47,114,445
  47,114,600
  47,114,692
  47,114,943
  47,114,962
  47,115,115
  47,115,225
  47,115,344
  47,115,577
  47,115,650
  47,115,992
  47,116,583
  47,116,625
  47,116,665
  47,116,684
  47,116,932
  47,117,289
  47,118,671
  47,118,681
  47,118,692
  47,118,909
A
A
T
T
2
A
G
G
T
T/C
-
C
C
4
A
G
C
C
C
G
C
T
C
A
G
A
G
C
G
T
G
G
A
C
G
C
C
-
G
C
A
T
-
T
A
T
T
A
A
G
G
A
-
G
C
T
C
A
T
T
G
T
-
T
T
C
A
G
T
T
A
C
G
T
T
T
C
C
G
A
A
A
-
A
C
-
C
A
A
G
T
C
T
A
T
T
4
A
T
G
T
-/10
-/2
-/28
G
13
-/A
A
C
A
C
G
G
C
T
T
T
G
C
G
G
-
G
A
A
40
G
A
C
T
A
18
A
3
G
G
C
T
C
G
T
G
C
T
?
-
A
G
A
C
C
G
T
T
C
G
C
-
C
A
A
C
C
C
-
T
A
C
C/-
T
T
-/A
T
C
T
C
G/-
-/G
G/-
G/-
G/-
G/-
G/-
G
G
-/T
G
G
T
T
-
T
T
A
G
C
T
-
-/A
A/-
T
11
T
A
T
T
G
T
-
C
G
C
A
G
C
-
T
C
C
C
G
C
C
T
C
T
C
A
T
A
G
G
A
A
A
T
C
C
G
-
G
G
T
C
C
A
C
A
-
G
C
G
4
A
A
C
T
T
A
G
G
T
G
A
T
T
-
A
C
G
-
T
T
C
T
-
G
A/-
A
T
G
A
5
G
34
-
C/-
T
T
C
T
C
G
A
A
C
T
A/A
G
A
4
G
T
T
T
T
T
T
C
A
G
-
G/-
A
A
T
G
C
C
G
-
-/T
G/-
-
2
C
A
C
A
T
G
T
G
G
G
G
G
G
T
A
C
G
G
A
C
A
A
G
C
G
C
G
T
A
A
A
-
C
C
A
C
T
C
T
G
T
A
C
A
T
T
T
C
A
C
-
T
G
A
6
-/T
-/C
C
C
T/-
-
G
G
C
C
A
C
C
2
T
T
C
G
C
T
A
A
A
G
A
G
-
T
T
T
T
A
C
C
-
A
C
C
C
G
2
A
A
C
G
-
G
A
C
A
T
C
C
C
G
C
T
3
C
G
A
T
A
T
-
A/-
A
A
C
14
A
G
T
T
A/-
-/A
C
G
G
G
T
A
T
4
G
G
T
T
3
A
C
-
C/-
T/-
T/-
C/-
G
T
C
6
-/A
C
G
C
C
-
G
A
G
G
2
T
G
C
G
A
T
G
G
A
A
G
G
T
G
G
G
A
C
T
T
A
T
A
C
A
G
C
G
2
-
-
C
18
-
-
-
-
-/C
-/C
A
T
T
G
A
T
A
C
G
-
G
-
T
A
A
C
G
G
G
-
C
T
G
C
-
A
C
G
G
G
C
T/A
G
A
G
C
T
A
T
T
G
T
G
T
-/A
A
C
A
G
C
G
C
G
G
T
G
T
A
T
A
C
T
G
G
G
A
C
G
G
G
C
G
A
G
-
C
G
A
A
G
T
4
4
C
T