Variant Visualizer (Variants)

Submit Data | Help | Video Tutorials | News | Publications | Download | REST API | Citing RGD | Contact

Sequence Annotation

Assembly mRatBN7.2

Genes ( + )

Genes ( - )

mRatBN7.2

F344/Stm (2019)


--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--	--
Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn										Nalcn
C	C	C	T	G	G	G	A	A	G	-	G	A	T	-	T	C	G	C	A	T	A	A	A	A	C	A	C	T	-	T	G	A	C	C	T	A	-	G	T	A	T	T	T	A	G	A	A	4	A	C	T	C	C	A	G	A	G	A	A	C	G	T	-	G	C	3	G	T	C	C	C	G	-	-	C	C	G	-	C	G	G	T	C	G	A	A	C	G	A	-	C	-	-	G	G	T	T	A	A	-	G	G	-	C	T	G	G	C	-	-	T	G	4	C	T	T	A	-	-	2	T	A	C	T	2	2	2	-	A	5	C	T	T	A	A	A	-	4	A	A	T	C	T	G	G	T	T	C	G	T	A	G	A	T	T	4	T	T	C	A	C	C	G	A	T	A	T	G	T	C	-	A	A	A	-	T	A	C	G	T	C	T	-	A	T	C	T	C	T	A	A	G	T	A	A	A	A	30	G	T	T	C	-	T	4	C	G	2	-	A	A	T	-	2	C	C	T	T	A	-	T	-	-	G	G	C	C	T	C	A	C	T	G	5	C	T	A	A	G	G	T	A	G	C	-	T	C	G	A	G	A	T	T	T	T	T	A	C	T	C	A	C	-	-	T	G	-	C	-	A	A	A	A	G	G	T	G	G	A	C	C	T	T	A	T	C	A	G	-	A	G	A	T	T	A	C	A	A	C	C	C	A	A	G	G	T	T	T	T	G	C	G	A	G	T	T	-	-	G	G	A	A	-	-	T	C	C	C	C	A	T	A	A	T	T	T	G	-	A	G	T	T	C	G	G	T	G	C	C	A	T	C	C	A	T	C	T	-	A	T	A	A	36	A	A	-	G	T	A	A	G	T	A	C	-	C	C	-	C	G	G	T	-	2	6	G	2	2	G	G	G	-	A	C	G	G	A	A	T	T	G	A	C	T	T	C	T	C	G	G	T	G	T	A	T	C	C	T	C	T	C	A	C	28	T	C	T	6	T	G	T	A	A	T	G	C	C	-	G	C	A	T	C	T	A	-	T	G	A	A	G	C	-	C	C	A	T	12	C	C	6	G	A	C	C	T	-	G	G	T	T	C	T	G	A	T	T	-	T	A	G	T	C	C	A	T	G	G	A	A	G	T	G	A	T	C	A	-	T	C	T	A	-	G	T	C	C	T	A	T	-	-	T	T	-	-	T	4	T	A	C	T	C	C	C	C	G	G	G	C	A	G	-	G	C	C	G	A	C	T	C	A	C	A	G	T	G	T	G	C	-	-	T	T	G	A	C	A	G	G	T	A	G	-	2	2	-	2	T	G	-	-	G	T	C	T	G	T	C	A	A	G	T	T	T	C	A	T	T	A	T	G	T	A	G	T	A	-	3	-	A	G	C	-	114	T	A	G	C	3	C	A	T	-	C	T	A	A	G	A	C	G	G	C	-	A	T	C	4	G	G	T	T	T	T	A	A	C	G	C	G	A	C	T	C	C	C	A	C	G	G	A	G	C	G	T	G	G	-	A	T	C	A	-	T	T	C	G	2	G	T	A	C	C	A	T	T	-	A	T	T	C	T	T	C	A	C	C	C	T	T	T	G	C	2	G	G	C	A	A	A	T	A	A	2	C	C	A	G	A	C
100,398,916	100,399,944	100,405,049	100,407,716	100,408,088	100,408,652	100,408,724	100,409,997	100,409,998	100,415,875	100,416,536	100,419,890	100,420,072	100,428,208	100,437,397	100,440,248	100,440,493	100,440,730	100,440,852	100,441,605	100,441,731	100,441,732	100,441,879	100,442,697	100,443,492	100,444,061	100,444,924	100,445,349	100,446,058	100,447,152	100,447,775	100,448,095	100,448,570	100,448,912	100,449,057	100,449,082	100,450,351	100,450,605	100,450,836	100,452,216	100,452,683	100,452,732	100,452,845	100,453,104	100,453,218	100,453,419	100,454,092	100,454,161	100,454,226	100,454,588	100,454,714	100,454,719	100,455,155	100,455,191	100,455,236	100,455,297	100,455,451	100,455,501	100,455,612	100,455,680	100,456,423	100,457,972	100,458,202	100,458,294	100,458,325	100,458,548	100,458,626	100,458,884	100,458,960	100,459,719	100,459,910	100,459,970	100,460,053	100,460,501	100,460,577	100,460,586	100,461,389	100,461,460	100,462,251	100,462,592	100,462,900	100,462,959	100,463,475	100,464,513	100,464,907	100,465,789	100,468,486	100,468,522	100,468,861	100,468,862	100,469,340	100,469,593	100,469,999	100,470,009	100,470,048	100,470,050	100,471,259	100,471,267	100,471,757	100,472,453	100,472,982	100,473,013	100,473,021	100,473,073	100,473,622	100,473,691	100,473,960	100,474,023	100,474,273	100,474,799	100,474,801	100,475,160	100,475,457	100,475,649	100,475,882	100,476,220	100,477,249	100,477,491	100,477,728	100,477,783	100,478,134	100,479,131	100,479,196	100,479,281	100,479,669	100,479,785	100,479,799	100,479,807	100,479,885	100,480,015	100,480,736	100,480,842	100,481,092	100,481,135	100,481,182	100,481,234	100,481,629	100,482,136	100,482,231	100,482,424	100,483,359	100,483,579	100,483,841	100,484,651	100,484,846	100,484,892	100,485,711	100,486,587	100,486,913	100,487,643	100,488,221	100,490,096	100,491,106	100,491,263	100,491,441	100,491,786	100,491,983	100,492,106	100,492,997	100,493,278	100,493,330	100,493,453	100,493,530	100,494,058	100,494,734	100,494,829	100,496,319	100,496,750	100,497,994	100,499,060	100,499,966	100,500,716	100,501,260	100,501,409	100,501,818	100,501,976	100,502,256	100,502,320	100,502,405	100,502,418	100,502,480	100,502,930	100,503,134	100,503,229	100,503,395	100,503,457	100,503,551	100,504,078	100,504,182	100,504,205	100,504,220	100,504,255	100,504,326	100,504,420	100,504,508	100,504,620	100,504,661	100,504,662	100,504,703	100,504,774	100,505,076	100,505,158	100,505,256	100,505,647	100,505,929	100,506,090	100,506,168	100,506,250	100,506,422	100,506,639	100,506,642	100,506,710	100,506,971	100,507,216	100,507,415	100,507,451	100,507,453	100,507,861	100,508,059	100,508,214	100,508,291	100,508,420	100,508,663	100,508,824	100,509,101	100,510,094	100,510,160	100,510,242	100,510,300	100,510,355	100,510,702	100,510,780	100,510,805	100,511,041	100,511,079	100,511,450	100,511,470	100,511,577	100,511,763	100,511,921	100,512,201	100,512,236	100,512,249	100,512,305	100,512,338	100,512,409	100,512,457	100,512,556	100,512,608	100,512,764	100,512,995	100,513,124	100,513,160	100,513,199	100,514,024	100,514,451	100,514,558	100,514,676	100,514,772	100,514,966	100,515,204	100,515,373	100,515,376	100,515,415	100,515,852	100,515,911	100,516,141	100,516,342	100,516,433	100,516,540	100,516,582	100,516,584	100,516,651	100,516,931	100,516,990	100,516,992	100,517,077	100,517,097	100,517,261	100,517,736	100,517,786	100,517,945	100,518,129	100,518,332	100,518,386	100,518,651	100,518,872	100,519,251	100,519,837	100,520,100	100,520,161	100,520,830	100,521,024	100,521,100	100,521,180	100,521,207	100,521,337	100,521,374	100,521,536	100,521,542	100,521,611	100,521,618	100,521,619	100,521,656	100,521,683	100,521,690	100,521,775	100,521,825	100,521,849	100,521,951	100,522,043	100,522,258	100,522,424	100,522,448	100,522,612	100,522,944	100,523,033	100,523,329	100,523,332	100,523,333	100,523,472	100,523,669	100,523,853	100,525,940	100,526,693	100,526,765	100,527,482	100,527,485	100,527,541	100,528,014	100,528,140	100,529,710	100,529,722	100,529,852	100,530,036	100,530,060	100,530,339	100,530,492	100,530,757	100,531,696	100,531,707	100,531,711	100,531,718	100,531,734	100,531,742	100,531,744	100,531,745	100,531,937	100,533,035	100,533,386	100,533,736	100,533,873	100,533,902	100,534,462	100,536,632	100,537,307	100,537,488	100,537,550	100,537,940	100,537,971	100,539,137	100,540,261	100,540,583	100,541,097	100,542,124	100,542,138	100,542,710	100,542,911	100,543,659	100,545,441	100,545,888	100,546,538	100,547,158	100,549,308	100,549,651	100,550,589	100,550,605	100,550,966	100,551,749	100,551,932	100,556,262	100,556,438	100,556,505	100,556,969	100,557,023	100,557,042	100,557,108	100,557,721	100,558,214	100,558,840	100,559,005	100,559,768	100,562,431	100,562,609	100,563,588	100,565,006	100,565,259	100,565,869	100,567,033	100,569,499	100,569,587	100,569,754	100,570,007	100,570,427	100,570,763	100,571,025	100,571,035	100,571,176	100,571,584	100,571,649	100,572,118	100,572,132	100,572,254	100,572,453	100,572,657	100,572,757	100,572,883	100,572,989	100,573,296	100,573,554	100,574,200	100,574,240	100,574,399	100,574,872	100,574,894	100,575,006	100,575,230	100,575,304	100,575,416	100,575,551	100,575,826	100,576,031	100,576,338	100,577,444	100,577,643	100,578,490	100,578,527	100,578,542	100,578,641	100,580,742	100,581,189	100,582,246	100,582,604	100,582,656	100,583,079	100,583,668	100,583,698	100,584,190	100,584,391	100,584,711	100,584,746	100,584,765	100,584,856	100,585,063	100,585,313	100,585,516	100,585,584	100,585,716	100,585,781	100,585,806	100,587,957	100,587,993	100,588,463	100,594,870	100,595,740	100,595,754	100,595,759	100,595,793	100,595,796	100,597,214	100,597,412	100,597,436	100,599,320	100,600,870	100,600,888	100,601,108	100,602,689	100,603,205	100,603,867	100,603,869	100,604,325	100,604,634	100,604,763	100,605,261	100,605,790	100,607,356	100,607,472	100,610,481	100,611,317	100,611,951	100,612,033	100,613,021	100,613,386	100,613,995	100,614,460	100,614,523	100,614,700	100,614,935	100,617,211	100,617,475	100,619,377	100,619,813	100,619,847	100,620,261	100,621,167	100,621,483	100,622,286	100,622,569	100,625,907	100,635,230	100,641,401	100,647,756	100,656,445	100,656,931	100,665,382	100,665,428	100,666,124	100,666,125	100,666,127	100,680,880	100,688,603	100,690,280	100,690,864	100,691,803	100,694,946	100,694,948	100,695,267	100,695,276	100,695,568	100,695,736	100,695,896	100,695,985	100,695,993	100,696,073	100,696,080	100,696,090	100,696,111	100,696,189	100,696,213	100,696,215	100,696,218	100,696,251	100,696,268	100,696,303	100,696,304	100,696,316	100,696,335	100,696,363	100,696,370	100,696,381	100,696,383	100,696,395	100,696,412	100,696,446	100,696,457	100,696,474	100,696,480	100,696,555	100,696,565	100,696,584	100,696,585	100,696,589	100,696,599	100,696,623	100,696,631	100,696,695	100,696,699	100,696,705	100,696,707	100,696,732	100,696,777	100,696,801	100,696,802	100,696,809	100,696,888	100,696,904	100,696,912	100,696,914	100,696,936	100,696,948	100,697,038	100,697,059	100,697,096	100,697,163	100,697,193	100,697,198	100,697,235	100,697,244	100,697,261	100,697,547	100,697,552	100,697,585	100,697,600	100,697,633	100,697,668	100,697,885	100,698,230	100,698,485	100,698,984	100,698,986	100,699,084	100,699,318	100,700,635	100,700,637	100,700,640	100,700,649	100,700,815	100,700,820	100,700,989	100,701,109	100,701,118	100,701,368	100,701,933	100,701,945	100,701,994	100,702,071	100,702,642	100,702,891	100,703,150	100,703,617	100,704,183	100,704,300	100,704,428	100,705,069	100,705,811	100,706,026	100,706,474	100,707,260	100,710,795	100,711,005	100,711,076	100,711,084	100,712,332	100,713,573	100,713,812	100,715,798	100,716,067	100,716,187	100,717,655	100,718,464	100,718,774	100,719,136	100,719,490	100,719,742	100,719,986	100,720,095	100,720,269	100,723,457	100,727,018	100,729,479	100,730,176	100,730,393	100,730,597	100,730,864	100,730,894	100,731,621	100,731,811	100,732,460	100,732,464	100,732,580	100,732,662	100,732,664	100,732,780	100,732,808	100,732,812	100,732,900	100,732,988	100,732,997	100,733,045	100,733,062	100,733,075	100,733,082	100,733,143	100,733,184	100,733,185	100,733,266	100,733,275	100,733,477	100,733,496	100,733,557	100,733,560	100,734,244	100,734,478	100,734,504	100,734,586	100,735,408	100,735,445	100,735,676	100,735,808	100,736,191	100,736,209	100,737,294	100,737,471	100,737,592	100,737,769	100,737,845	100,738,033	100,738,399	100,738,402	100,738,506	100,738,510	100,738,775	100,738,893	100,738,982	100,739,007	100,739,367	100,739,894	100,740,124	100,740,492	100,740,555	100,740,628	100,740,901
T	T	T	C	A	A	A	G	G	C	5	T	G	C	T	G	T	A	T	G	G	G	G	G	G	G	G	T	C	T	C	A	C	T	T	G	C	A	A	C	G	C	A	A	G	T	G	G	-	G	T	A	G	G	G	A	-	A	C	G	T	A	G	2	A	T	-	A	C	T	T	T	T	T	T	A	T	T	A	A	A	A	-	T	-	G	G	T	C	T	2	T	2	-/2	G/C	G/C	G	G	G	G	A	A	A	A	T	G	A	A	T	G	3	A	C	-	T	C	G	G	9	C	-	-	T	T	G	-	-	2/-	16	T	-	T	G	C	C	-	G	G	-	-	T	C	G	C	C	C	C	G	T	C	C	G	C	G	-	C	-	C	C	T	G	T	T	A	G	G	T	C	A	C	T	T	C	G	G	3	A	T	A	C	C	A	C	G	T	C	T	C	A	A	G	C	A	C	G	C	G	G	-	A	G	A	T	T	C	-	T	-	-	2	G	G	A	4	-	T	T	-	A	-	T	C	A	A	A	A	T	T	G	T	G	T	C	C	-	T	C	T	G	A	A	C	G	A	T	A	G	T	A	G	A	C	C	C	C	C	C	C	G	C	-	T	T	T	C	G	A	C	T	T	T	T	G	G	C	A	C	C	A	C	T	T	A	A	G	C	A	-	T	A	G	T	C	A	G	T	T	-	G	A	T	T	G	G	C	A	C	G	C	C	A	T	T	G	A	-	A	G	G	A	T	T	T	2	T	C	T	G	T	G	C	-	G	G	G	A	G	C	C	C	T	G	G	A	A	C	A	C	T	T	G	G	T	T	G	C	A	C	A	T	C	G	G	-	G	T	3	T	C	G	G	A	G	T	A	A	A	T	A	T	C	A	C	T	-	-	C	-	-	A	A	A	A	G	T	C	A	-	C	T/-	G	A	C	T	C	A	T	C	G	A	A	C	A	C	G	C	T	T	-	G	C	T	C	G	-	A	T	G	-	C	A	G	T	G	G	A	G	A	T	A	T	T	C	T	C	G	A	C	C	C	T	T	A	2	A	T	G	-	-	T	C/T	6/-	G/-	-	C/T	C/-	G	-/T	G/T	A	C	C	T	A	T	-	C	C	-/3	T/G	G	A	C	T	G	C	G	A	A	C	-	A	A	A	G	A	T	G	A	A	T	G	T	G/G	A	C	A	T	C	G	G	T	A	C	G	-/2	2	G	-	C	-	T	A	A	T	T	A	A	A	T	A	G	A	G/C	A	T	T	A	T	T	-	T	G	T	G	C	A	A	G	A	T	C	A	C	A	C	T	A	G	A	A	A	T	A	2	-	-	6	-	A	T	2	3	T	-	T	G	T	A	T	T	G	A	G	-	C	T	G	C	-	T	A	A	C	G	A	C	G	2	-	A	T	-	T	3	-	C	G	T	T	-	T	G	C	2	T	C	C	G	A	-	T	A	T	A	T	G	C	T	4/-	A	A	C	C	C	-	G	G	T	C	T	A	C	A	-	T	T	T	T	T	A	A	T	A	T	C	G	C	T	9	C	G	G	G	6	C	C	G	C	-	T	C	G	G	T	C	C	G	A	T	C	C	T	C	C	T	G	T	T	T	G	A	A	A	T	-	A	A	A	T	-	G	C	G	G	-	A	A	G	A	G	G