Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 167,073 (bp)   Positions: 343
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
ACI/EurMcwi (2019) 
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
Myrip
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
G
A
A
G
A
G
C
G
G
-
C
C
T
G
G
T
A
C
C
C
A
-
C
G
T
A
G
A
C
C
G
A
G
T
A
C
C
G
T
G
-
C
10
G
G
-
C
A
T
C
-
T
T
A
A
G
G
C
C
T
T
A
-
-
A
A
G
C
G
T
A
-
C
A
C
T
T
G
G
G
G
A
T
T
C
-
T
A
-
2
G
C
A
G
C
11
C
T
C
A
C
G
G
C
T
C
C
A
A
G
T
G
C
T
A
A
T
T
T
A
G
A
A
-
G
A
G
C
C
C
G
2
C
2
C
T
G
C
4
T
G
-
2
A
T
13
G
21
A
A
T
T
G
A
G
A
T
C
G
-
A
A
A
T
C
G
T
-
A
T
17
-
A
T
A
C
T
T
-
C
T
T
2
A
G
T
A
G
C
T
G
G
T
C
A
A
A
A
6
A
C
A
G
A
C
A
G
G
C
T
T
T
T
C
G
-
G
A
G
C
G
G
A
A
G
G
13
12
G
G
G
A
T
A
C
T
T
T
G
C
A
C
G
A
A
T
G
C
A
-
A
A
-
C
C
T
A
G
A
C
C
T
G
G
G
C
G
A
-
C
C
G
A
T
4
T
C
A
14
C
C
C
C
T
C
4
60
T
C
C
A
T
G
T
T
4
-
-
C
C
C
A
G
T
8
C
C
T
G
G
G
C
A
A
3
A
G
G
C
C
C
10
A
G
T
G
G
4
G
G
T
G
-
C
T
T
T
T
G
A
C
  120,018,365
  120,019,068
  120,019,075
  120,019,120
  120,019,259
  120,020,123
  120,020,468
  120,021,152
  120,021,558
  120,021,589
  120,022,534
  120,022,760
  120,028,510
  120,030,672
  120,031,692
  120,032,037
  120,032,883
  120,033,126
  120,033,212
  120,033,283
  120,033,315
  120,033,316
  120,033,411
  120,033,528
  120,033,559
  120,033,693
  120,033,731
  120,033,918
  120,034,148
  120,034,205
  120,034,548
  120,034,585
  120,034,682
  120,034,772
  120,034,851
  120,035,146
  120,035,165
  120,035,190
  120,035,480
  120,035,660
  120,035,688
  120,035,892
  120,035,988
  120,035,999
  120,036,130
  120,036,149
  120,036,181
  120,036,217
  120,036,322
  120,036,864
  120,036,900
  120,037,009
  120,037,174
  120,037,191
  120,037,202
  120,037,209
  120,037,302
  120,037,335
  120,037,409
  120,037,724
  120,037,836
  120,037,902
  120,038,308
  120,038,768
  120,038,959
  120,038,962
  120,039,516
  120,040,472
  120,040,745
  120,040,967
  120,041,391
  120,041,598
  120,041,770
  120,042,051
  120,042,140
  120,042,641
  120,042,664
  120,042,739
  120,043,769
  120,044,240
  120,044,471
  120,044,475
  120,044,481
  120,044,489
  120,044,835
  120,044,942
  120,045,119
  120,045,647
  120,046,011
  120,046,346
  120,046,389
  120,046,443
  120,046,460
  120,046,529
  120,046,560
  120,047,605
  120,047,804
  120,047,808
  120,048,416
  120,049,193
  120,051,762
  120,052,563
  120,055,401
  120,055,408
  120,055,412
  120,055,416
  120,055,417
  120,055,427
  120,055,429
  120,055,884
  120,058,854
  120,059,201
  120,062,233
  120,063,799
  120,064,199
  120,065,004
  120,065,350
  120,065,739
  120,065,762
  120,065,993
  120,065,995
  120,066,490
  120,066,549
  120,066,584
  120,066,759
  120,068,840
  120,070,860
  120,070,978
  120,072,241
  120,072,583
  120,072,585
  120,073,609
  120,074,072
  120,074,085
  120,074,086
  120,074,106
  120,075,033
  120,076,831
  120,078,189
  120,078,482
  120,079,324
  120,080,436
  120,082,532
  120,084,214
  120,085,224
  120,085,480
  120,085,576
  120,085,665
  120,085,673
  120,086,133
  120,087,020
  120,087,644
  120,088,008
  120,090,199
  120,090,383
  120,090,406
  120,090,841
  120,090,843
  120,091,373
  120,091,474
  120,092,023
  120,092,994
  120,093,352
  120,094,417
  120,095,609
  120,095,957
  120,096,261
  120,096,782
  120,098,112
  120,098,496
  120,100,154
  120,100,543
  120,100,806
  120,102,977
  120,103,128
  120,103,802
  120,104,297
  120,105,302
  120,107,277
  120,111,672
  120,112,125
  120,112,447
  120,114,824
  120,116,660
  120,119,093
  120,119,579
  120,119,630
  120,119,956
  120,120,048
  120,120,383
  120,124,017
  120,124,662
  120,124,966
  120,125,607
  120,126,616
  120,126,847
  120,127,340
  120,127,595
  120,127,699
  120,128,316
  120,129,835
  120,130,721
  120,131,916
  120,132,426
  120,132,672
  120,134,478
  120,134,764
  120,134,890
  120,137,587
  120,137,594
  120,137,606
  120,137,782
  120,138,234
  120,139,259
  120,140,795
  120,141,055
  120,141,429
  120,141,546
  120,142,475
  120,142,497
  120,143,215
  120,143,420
  120,143,511
  120,143,543
  120,143,682
  120,143,777
  120,143,975
  120,144,051
  120,145,216
  120,145,250
  120,145,253
  120,145,257
  120,145,488
  120,145,596
  120,145,941
  120,146,584
  120,147,094
  120,147,113
  120,148,872
  120,149,008
  120,149,077
  120,149,499
  120,149,500
  120,149,845
  120,149,854
  120,149,918
  120,150,453
  120,151,006
  120,151,213
  120,151,346
  120,151,354
  120,151,900
  120,152,697
  120,153,040
  120,153,113
  120,153,713
  120,154,346
  120,154,781
  120,154,896
  120,155,027
  120,155,650
  120,156,093
  120,156,309
  120,156,359
  120,157,670
  120,157,762
  120,158,402
  120,158,916
  120,159,461
  120,159,677
  120,159,703
  120,159,774
  120,159,801
  120,160,734
  120,160,793
  120,160,866
  120,162,606
  120,162,784
  120,163,093
  120,163,108
  120,163,993
  120,164,067
  120,164,074
  120,164,877
  120,165,906
  120,165,921
  120,165,942
  120,166,180
  120,166,238
  120,166,371
  120,166,465
  120,166,549
  120,166,957
  120,167,025
  120,167,085
  120,167,661
  120,168,440
  120,168,825
  120,169,018
  120,169,111
  120,169,720
  120,169,759
  120,170,259
  120,170,278
  120,170,287
  120,170,556
  120,171,094
  120,171,250
  120,171,844
  120,171,845
  120,171,966
  120,172,163
  120,172,749
  120,172,901
  120,173,256
  120,173,508
  120,173,705
  120,174,457
  120,174,479
  120,174,886
  120,175,181
  120,175,205
  120,175,298
  120,175,598
  120,175,718
  120,176,010
  120,176,401
  120,176,455
  120,176,609
  120,176,645
  120,176,980
  120,176,992
  120,177,396
  120,178,789
  120,180,615
  120,181,636
  120,181,928
  120,182,011
  120,182,040
  120,182,051
  120,182,345
  120,182,427
  120,183,199
T
C
T
G
C
A
G
A
T
A
A
4
T
T
C/-
A
A
C
G
T
T
T
G
-/2
T
A
G
T
A
G
G
T
A
G
A
C
G
T
T
A
A
T
G
T
-
A
A
3
A
-
C
T
3
C
-/G
-/G
G
A
C
T
A
-
C
G
C
T
G
C
T
T
A
C
G
T
-
G
G
C
C
A
C
C
A/C
C/G
C
C
T
20
C
G
2
-
A
T
G
A
-
-
A
C
T
G
C/T
G/C
C/T
C/T
T/C
C/T
C/T
G
T
A
C
A
T
G
G
C
C
C/-
-/C
G
T
G
T
T
-
G
A
-/T
T/-
A
A
-
G/-
-
A
C
T
G
-
C
A
2
-
G
C
-
-/A
-
T
G
A
G
A
G
C
T
C
G
A
2
G
G
G
C
-/T
A
C
18
G
A
-
4
G
A
T
T
C
G
G
T
C
G
2/-
G/-
T
A
A/T
A
T
C
A
A
C
T
G
T
G
T
-
G
T
G
-
G
T
T
-/A
T
T
C
C
A
C
T
A
4
A
G
A
T
A
A
G
G
A
A
-
-
T/-
T/-
A
G
A
C
G
C
A
C
A
G
T/G
T
A
T
G
G
A
G
G
A
G
G
T
T
T
A
G
A
G
T
G
C
A
A
C
-
-
G
A
T
T
A/-
T
-
-
C
T
G
-
T
T
G
-/T
C/-
-/T
-
-
C
T
T
C
C
A
G
-
-
2
2
A
T
A
G
A
C
-
T
G
C
A
A
A
G
-
G
-
T
T
A
T
T
G
-
T
A
A
A
-
-
A
C
-
A
C
T
C
C
C
C
A
G
T