Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 120,194 (bp)   Positions: 388
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
Mta3
A
C
9
C
G
G
T
C
-
C
A
C
T
T
G
C
A
C
T
A
C
T
T
T
A
A
C
A
A
T
T
-
C
C
-
T
G
T
A
C
A
T
C
C
C
C
T
A
A
A
T
T
G
A
T
C
T
C
C
-
G
C
G
3
A
A
T
G
T
T
A
G
-
G
T
G
A
G
G
G
A
6
C
T
G
G
C
G
T
T
A
G
T
G
-
A
-
G
-
T
A
G
G
T
A
C
G
T
T
G
A
T
A
T
C
C
G
A
T
C
T
14
C
A
C
G
-
A
A
2
-
C
-
T
C
T
A
T
G
T
-
C
2
-
A
C
C
T
A
G
C
C
2
T
T
G
C
T
A
T
C
A
C
A
T
C
G
T
G
C
C
-
C
C
T
G
A
T
T
T
G
A
T
T
T
G
A
T
T
6
G
-
G
A
T
C
12
2
C
-
C
T
50
G
G
C
C
T
G
C
T
A
A
C
-
A
C
G
G
G
C
C
T
C
G
G
G
T
G
A
T
A
T
A
A
T
-
C
G
9
C
G
G
C
A
C
A
A
T
G
T
T
A
A
A
G
C
A
C
C
C
T
C
G
C
C
T
3
T
G
A
T
G
16
T
G
C
T
C
C
C
C
C
C
G
C
A
125
C
G
A
T
G
G
T
G
A
G
C
A
T
G
G
A
A
-
-
-
A
T
A
A
G
T
A
C
C
A
T
C
A
G
4
-
A
A
A
A
A
A
A
A
A
A
A
G
C
T
A
G
T
C
C
C
C
C
G
C
G
G
G
A
A
C
A
C
A
G
G
A
T
G
T
C
-
3
A
G
C
3
A
T
-
G
T
A
A
T
A
A
G
A
G
C
C
T
A
-
  10,867,141
  10,867,497
  10,867,621
  10,867,800
  10,867,803
  10,867,970
  10,868,142
  10,868,149
  10,868,358
  10,868,570
  10,868,664
  10,868,748
  10,868,752
  10,869,017
  10,869,021
  10,869,082
  10,869,090
  10,869,470
  10,869,559
  10,869,585
  10,869,619
  10,869,628
  10,869,746
  10,869,748
  10,870,611
  10,870,613
  10,870,616
  10,870,703
  10,870,941
  10,871,220
  10,871,403
  10,871,434
  10,871,477
  10,871,576
  10,871,987
  10,872,396
  10,872,775
  10,872,907
  10,872,949
  10,873,180
  10,873,185
  10,873,617
  10,873,859
  10,873,920
  10,873,957
  10,874,268
  10,875,894
  10,875,896
  10,875,897
  10,875,957
  10,876,159
  10,877,275
  10,877,491
  10,877,950
  10,878,362
  10,878,488
  10,878,634
  10,878,689
  10,878,690
  10,878,763
  10,879,005
  10,879,048
  10,879,208
  10,879,684
  10,880,387
  10,880,627
  10,881,271
  10,881,532
  10,881,892
  10,881,922
  10,881,948
  10,882,056
  10,882,682
  10,882,757
  10,883,010
  10,884,749
  10,885,944
  10,885,948
  10,885,955
  10,885,956
  10,885,960
  10,885,967
  10,885,992
  10,886,911
  10,887,720
  10,887,835
  10,889,811
  10,889,852
  10,893,299
  10,893,423
  10,893,713
  10,893,925
  10,894,890
  10,895,497
  10,895,929
  10,896,891
  10,897,506
  10,898,202
  10,898,382
  10,898,509
  10,900,105
  10,900,889
  10,901,697
  10,903,190
  10,903,229
  10,903,935
  10,904,749
  10,906,172
  10,906,713
  10,906,786
  10,908,036
  10,908,659
  10,908,661
  10,908,664
  10,908,716
  10,908,747
  10,908,750
  10,908,890
  10,910,874
  10,910,880
  10,911,045
  10,911,449
  10,911,543
  10,911,606
  10,911,786
  10,911,993
  10,912,764
  10,913,071
  10,913,570
  10,913,613
  10,914,056
  10,914,076
  10,914,112
  10,914,528
  10,914,540
  10,914,819
  10,915,101
  10,915,652
  10,915,804
  10,916,053
  10,916,177
  10,916,191
  10,916,202
  10,916,218
  10,916,220
  10,916,247
  10,916,263
  10,916,294
  10,916,365
  10,916,496
  10,916,639
  10,916,744
  10,917,353
  10,917,390
  10,917,559
  10,917,606
  10,917,759
  10,917,778
  10,917,789
  10,918,008
  10,918,583
  10,918,584
  10,918,738
  10,919,100
  10,919,353
  10,919,631
  10,919,891
  10,920,017
  10,920,035
  10,920,105
  10,920,321
  10,920,579
  10,920,954
  10,921,073
  10,921,487
  10,921,553
  10,921,636
  10,921,834
  10,923,244
  10,924,726
  10,924,964
  10,925,769
  10,926,009
  10,926,245
  10,926,392
  10,926,573
  10,926,814
  10,926,888
  10,927,464
  10,927,923
  10,928,862
  10,928,900
  10,931,939
  10,933,326
  10,933,909
  10,934,865
  10,934,887
  10,935,167
  10,935,187
  10,935,203
  10,935,439
  10,935,850
  10,935,891
  10,936,476
  10,937,204
  10,937,514
  10,938,162
  10,938,202
  10,939,299
  10,940,171
  10,940,495
  10,941,067
  10,941,070
  10,941,480
  10,941,483
  10,941,499
  10,941,748
  10,942,223
  10,942,248
  10,942,482
  10,942,650
  10,943,128
  10,943,164
  10,943,182
  10,943,235
  10,943,507
  10,943,744
  10,943,878
  10,944,005
  10,944,167
  10,944,298
  10,944,370
  10,944,377
  10,944,479
  10,944,704
  10,944,801
  10,945,406
  10,945,956
  10,945,977
  10,945,994
  10,946,089
  10,946,123
  10,946,422
  10,946,621
  10,946,622
  10,946,844
  10,946,893
  10,947,049
  10,947,265
  10,947,349
  10,947,809
  10,948,409
  10,948,970
  10,949,118
  10,949,191
  10,949,647
  10,949,940
  10,949,971
  10,949,974
  10,949,989
  10,949,999
  10,950,568
  10,951,430
  10,952,138
  10,954,429
  10,954,557
  10,954,783
  10,954,806
  10,955,025
  10,955,986
  10,956,036
  10,956,406
  10,956,749
  10,957,011
  10,957,136
  10,959,276
  10,959,512
  10,959,526
  10,960,069
  10,960,071
  10,960,073
  10,960,075
  10,960,105
  10,960,678
  10,960,696
  10,960,988
  10,961,780
  10,961,839
  10,962,264
  10,962,509
  10,964,297
  10,964,871
  10,964,878
  10,965,253
  10,965,453
  10,965,511
  10,965,529
  10,965,585
  10,965,613
  10,966,309
  10,966,403
  10,966,477
  10,966,483
  10,966,494
  10,966,726
  10,966,770
  10,966,879
  10,966,896
  10,967,010
  10,967,091
  10,967,194
  10,967,379
  10,967,439
  10,967,556
  10,967,559
  10,967,779
  10,967,801
  10,967,806
  10,967,839
  10,967,894
  10,968,113
  10,968,118
  10,968,272
  10,968,613
  10,968,619
  10,968,623
  10,968,625
  10,968,627
  10,968,629
  10,968,631
  10,968,635
  10,968,637
  10,968,639
  10,968,641
  10,968,643
  10,968,884
  10,968,925
  10,968,961
  10,968,968
  10,969,116
  10,969,139
  10,969,167
  10,969,171
  10,969,175
  10,969,179
  10,969,329
  10,969,845
  10,970,118
  10,970,815
  10,971,250
  10,971,346
  10,971,675
  10,971,680
  10,972,009
  10,972,030
  10,972,066
  10,972,171
  10,972,231
  10,972,910
  10,973,134
  10,973,437
  10,974,098
  10,974,200
  10,974,741
  10,975,407
  10,975,446
  10,975,502
  10,975,868
  10,976,166
  10,976,187
  10,976,924
  10,977,042
  10,977,445
  10,977,716
  10,977,728
  10,978,187
  10,979,190
  10,979,435
  10,979,502
  10,979,574
  10,979,577
  10,980,557
  10,982,433
  10,982,440
  10,983,650
  10,984,166
  10,985,412
  10,985,638
G
A
-
A
A
A
G
T
T
G
G
A
C
C
A
T
T
T
G
G
T
C
A
C
-
C
T
G
C
C
G
2
T
T
4
C
A
C
G
T
G
G
T
T
T
T
C
T
T
G
C
C
A
G
C/A
G
C
A
T
48
T
T
T
-
G
G
C
A
G
C
G
A
3
A
C
A
A/G
G/A
G/A
G/C
A/G
6/-
C/A
A
A
C
T
T
C
-/A
G
A
A
A
5
C
A
C
A
A
T
A
A
C
G
A
A
C
C
A
G
G
G
C
T
T
A
C
C
T
C
-
T
G
G
A
T
-
G
-
2
T/-
12
C
T
C
G
C
A
C
10
T
-
10
-/G
T
A
C
G
A
T
T
-
C
C
A
T
G
G
C
T
G
A
G
C
T
A
C
A
T
-/A
2
T
T
C
A
C
C
C
A
-
G
C
C
C
A
G
C
A
-
C
39
A
T
-
T
-
-
T
24
T
A/-
-
A
T
T
A
A
T
T
C
G
G
T
5
G
T
T
A
A
T
A
A
T
C
A
A
C
A
G
A
G
C
G
C
C
23
A
A
-
T
A
A
T
G
T
T
G
G
A
T/-
C
G
G
G
C
A
-
A/-
-/A
T
C
T
T
T
-
-
3/-
C
A
C
G
A
16/-
C
A
T
-
-/G
G/-
-/G
G/-
-/G
T
A
A
G
125/-
T
-
-
C
C
A
C
T
G
A
T
G
C
A/-
A/-
-/G
C
2
2
T
C
C
G
T
A
C
G
-
T
G
C
T
G
A
-
6
G/-
G/-
-/G
G/-
G/-
-/G
-/G
G/-
G
G
G
A/-
T
C
T
C
A
G/-
-/G
-/G
-/G
A
A
T
A
C
C
C
C
G
G
T
-/T
A
-
G
C
T
C
T
2
-
G
A
T
-
G
C
2
A
C
T
G
C
G
-
T
C
A
G
T
G
-
5