Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 205,487 (bp)   Positions: 502
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEW/Crl (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
Morc1
T
C
C
C
A
G
T
G
A
G
T
C
T
-
C
C
A
T
A
A
T
3
A
T
T
C
G
C
A
G
G
T
-
24
G
T
T
-
-
A
G
C
6
C
G
G
G
T
-
G
-
-
T
T
G
A
G
A
C
C
T
C
-
G
-
A
A
C
2
G
G
T
A
T
A
A
-
C
G
C
C
C
C
A
C
T
G
T
G
G
G
T
T
C
C
G
T
G
G
A
G
A
T
A
G
G
G
C
A
-
G
-
G
G
G
T
2
A
C
6
T
C
G
A
T
G
A
T
T
G
A
T
T
C
A
A
A
T
C
C
G
T
C
T
-
C
C
T
T
G
C
C
G
A
A
-
-
A
T
C
C
T
A
C
A
T
C
G
A
G
T
C
A
T
C
C
G
T
A
C
G
A
T
G
C
T
C
G
T
T
C
G
T
A
T
G
T
4
G
G
C
T
A
C
C
G
G
T
C
C
T
T
T
-
A
C
G
-
G
C
C
G
A
C
A
T
-
C
G
A
T
C
G
A
T
C
A
G
G
4
2
3
-
C
A
C
C
T
T
C
C
G
C
C
G
G
T
C
T
A
T
G
A
T
C
C
A
G
3
A
C
C
-
6
A
A
G
G
T
G
G
G
A
A
-
C
A
A
T
T
T
T
C
-
A
A
A
C
A
G
T
A
G
A
C
G
C
T
C
T
A
G
A
T
T
G
A
T
C
T
C
A
C
A
T
C
A
A
C
A
C
A
G
C
A
C
C
T
T
G
C
A
G
T
A
C
-
G
G
T
A
T
T
A
G
T
G
G
C
A
G
G
G
A
T
C
G
G
G
T
G
A
T
T
2
-
G
T
C
T
C
-
C
A
T
C
C
T
G
T
G
A
G
A
T
A
A
T
G
T
G
C
-
A
T
A
A
C
C
G
-
A
-
C
A
C
-
A
A
G
T
-
T
A
A
G
A
G
G
T
T
-
3
G
A
C
T
A
G
A
A
G
G
G
G
T
A
G
G
C
A
C
C
C
A
T
A
C
T
T
A
T
G
-
G
2
T
G
T
C
C
G
A
C
T
C
-
C
T
C
G
C
C
-
T
A
G
A
-
G
-
A
G
A
21
G
-
T
C
A
2
-
  52,179,328
  52,179,453
  52,179,747
  52,179,751
  52,179,882
  52,179,984
  52,180,098
  52,180,249
  52,180,422
  52,180,435
  52,180,447
  52,180,655
  52,180,697
  52,180,701
  52,180,737
  52,181,162
  52,182,700
  52,182,759
  52,183,093
  52,184,920
  52,186,268
  52,186,713
  52,186,769
  52,187,223
  52,187,382
  52,188,282
  52,188,322
  52,188,540
  52,189,068
  52,190,520
  52,191,002
  52,191,569
  52,191,803
  52,192,134
  52,192,946
  52,194,862
  52,195,157
  52,195,606
  52,198,231
  52,198,491
  52,199,611
  52,200,232
  52,201,275
  52,201,528
  52,202,863
  52,202,864
  52,202,873
  52,203,253
  52,203,451
  52,203,817
  52,203,860
  52,203,861
  52,203,997
  52,205,876
  52,206,265
  52,206,283
  52,207,252
  52,208,777
  52,208,786
  52,208,873
  52,209,217
  52,209,569
  52,210,088
  52,210,564
  52,210,772
  52,210,791
  52,210,792
  52,210,814
  52,210,848
  52,211,429
  52,213,283
  52,213,587
  52,213,780
  52,213,887
  52,214,416
  52,215,572
  52,216,071
  52,216,075
  52,216,274
  52,216,336
  52,217,012
  52,217,238
  52,217,310
  52,217,312
  52,217,475
  52,217,477
  52,217,544
  52,217,581
  52,217,672
  52,217,734
  52,217,777
  52,217,927
  52,218,814
  52,219,110
  52,219,669
  52,221,543
  52,221,633
  52,221,996
  52,222,058
  52,222,135
  52,223,108
  52,223,295
  52,223,471
  52,223,491
  52,224,117
  52,224,119
  52,224,128
  52,224,247
  52,224,401
  52,224,442
  52,224,972
  52,225,277
  52,227,011
  52,227,180
  52,227,241
  52,227,396
  52,227,401
  52,227,402
  52,227,403
  52,227,425
  52,227,578
  52,227,803
  52,227,870
  52,228,457
  52,230,526
  52,231,596
  52,231,818
  52,231,968
  52,232,642
  52,234,007
  52,234,645
  52,235,414
  52,235,630
  52,235,668
  52,235,906
  52,236,087
  52,236,745
  52,237,146
  52,237,307
  52,237,526
  52,237,597
  52,237,685
  52,238,643
  52,238,708
  52,239,167
  52,239,217
  52,239,218
  52,239,387
  52,239,396
  52,239,411
  52,239,439
  52,239,819
  52,239,871
  52,240,426
  52,241,094
  52,242,874
  52,244,029
  52,244,141
  52,244,239
  52,244,617
  52,246,659
  52,247,684
  52,247,884
  52,247,985
  52,250,467
  52,250,785
  52,250,798
  52,251,652
  52,252,878
  52,254,261
  52,255,217
  52,255,665
  52,255,867
  52,257,494
  52,257,925
  52,258,959
  52,263,143
  52,263,593
  52,265,935
  52,265,953
  52,266,105
  52,266,125
  52,266,156
  52,266,220
  52,266,265
  52,266,396
  52,266,399
  52,266,479
  52,266,641
  52,266,763
  52,266,787
  52,266,814
  52,266,981
  52,266,997
  52,267,015
  52,267,019
  52,267,049
  52,267,068
  52,267,086
  52,267,102
  52,267,103
  52,267,144
  52,267,153
  52,267,211
  52,267,227
  52,267,247
  52,267,249
  52,267,269
  52,267,280
  52,267,301
  52,267,333
  52,267,354
  52,267,399
  52,267,444
  52,267,542
  52,267,617
  52,267,682
  52,267,694
  52,267,832
  52,267,878
  52,267,913
  52,267,952
  52,267,975
  52,268,016
  52,268,038
  52,268,043
  52,268,125
  52,268,128
  52,268,130
  52,268,268
  52,268,450
  52,268,512
  52,268,525
  52,268,537
  52,268,604
  52,268,737
  52,268,765
  52,268,849
  52,268,894
  52,268,904
  52,268,911
  52,268,917
  52,268,922
  52,269,113
  52,269,138
  52,269,156
  52,269,267
  52,269,273
  52,269,365
  52,269,679
  52,269,711
  52,269,740
  52,269,773
  52,269,785
  52,269,879
  52,270,066
  52,270,191
  52,270,228
  52,270,235
  52,270,251
  52,270,520
  52,270,521
  52,270,542
  52,270,641
  52,270,683
  52,270,817
  52,270,977
  52,271,309
  52,271,665
  52,271,799
  52,272,298
  52,272,438
  52,272,448
  52,272,620
  52,272,665
  52,272,760
  52,273,067
  52,273,189
  52,273,218
  52,273,374
  52,273,376
  52,273,643
  52,273,851
  52,274,433
  52,276,144
  52,276,846
  52,277,338
  52,277,560
  52,277,742
  52,277,951
  52,279,333
  52,279,409
  52,279,535
  52,279,566
  52,279,814
  52,279,860
  52,279,933
  52,280,061
  52,280,158
  52,280,484
  52,280,503
  52,280,559
  52,280,620
  52,280,625
  52,280,687
  52,280,765
  52,280,833
  52,280,882
  52,280,918
  52,280,926
  52,281,046
  52,281,066
  52,281,124
  52,281,134
  52,281,210
  52,281,339
  52,281,534
  52,281,591
  52,281,602
  52,281,653
  52,281,671
  52,281,681
  52,281,764
  52,281,964
  52,282,071
  52,282,115
  52,282,143
  52,282,145
  52,282,150
  52,282,217
  52,282,219
  52,282,221
  52,282,235
  52,282,309
  52,282,403
  52,282,561
  52,282,562
  52,282,589
  52,282,638
  52,282,934
  52,282,978
  52,283,040
  52,283,223
  52,283,247
  52,283,253
  52,283,409
  52,283,475
  52,283,510
  52,283,626
  52,283,670
  52,283,687
  52,283,787
  52,283,800
  52,283,802
  52,287,491
  52,287,506
  52,287,523
  52,287,526
  52,287,593
  52,287,599
  52,287,615
  52,287,667
  52,287,674
  52,287,730
  52,287,733
  52,287,875
  52,287,897
  52,287,903
  52,287,927
  52,288,054
  52,288,120
  52,288,252
  52,288,298
  52,288,300
  52,288,340
  52,288,343
  52,288,347
  52,288,434
  52,288,472
  52,288,483
  52,288,526
  52,288,528
  52,288,529
  52,288,622
  52,288,639
  52,288,659
  52,288,725
  52,288,746
  52,288,802
  52,288,983
  52,288,988
  52,289,389
  52,289,465
  52,289,559
  52,289,736
  52,289,801
  52,289,903
  52,289,981
  52,290,137
  52,290,269
  52,290,297
  52,290,530
  52,290,657
  52,290,683
  52,290,686
  52,290,709
  52,290,725
  52,290,750
  52,290,757
  52,290,763
  52,290,792
  52,290,809
  52,290,858
  52,290,923
  52,291,039
  52,291,146
  52,291,154
  52,291,302
  52,291,305
  52,291,373
  52,291,631
  52,291,746
  52,291,878
  52,292,571
  52,292,740
  52,292,910
  52,293,087
  52,293,096
  52,293,240
  52,293,353
  52,293,405
  52,293,407
  52,293,408
  52,293,560
  52,293,581
  52,293,616
  52,293,634
  52,293,644
  52,293,914
  52,293,959
  52,294,084
  52,294,176
  52,294,213
  52,294,281
  52,294,346
  52,296,212
  52,296,530
  52,296,591
  52,296,757
  52,296,760
  52,297,115
  52,297,615
  52,297,671
  52,297,884
  52,297,905
  52,298,009
  52,298,037
  52,298,100
  52,298,279
  52,298,291
  52,298,628
  52,298,878
  52,298,879
  52,314,057
  52,315,750
  52,328,135
  52,330,285
  52,331,666
  52,332,978
  52,334,141
  52,334,318
  52,335,051
  52,335,327
  52,335,467
  52,340,660
  52,340,661
  52,340,714
  52,340,715
  52,341,537
  52,348,912
  52,349,346
  52,349,389
  52,351,603
  52,353,785
  52,356,108
  52,356,332
  52,356,568
  52,359,673
  52,361,300
  52,361,524
  52,361,874
  52,363,251
  52,364,947
  52,365,043
  52,370,856
  52,372,249
  52,374,711
  52,375,162
  52,376,372
  52,378,097
  52,380,275
  52,382,429
G
T
A
T
G
A
C
A
C
A
C
A
A
A
A
A
G
-/C
G
G
C
-
G
C
G
T
A
G
G
A
A
C
T
24/-
A
C
A
2
2
G
T
T
-
T
G/-
G/T
T
A
T
A
T
T
-
C
A
G
C
G
T
T
A
A
2
C
4
T
C
T
-
T
T
C
T
C
-
T
T
T
A
T
-
G
A
-
T
A
A
C
A
C
A
A
C
A
T
A
C
A
C
G
A
C
C
C
A
A
C
A
G
T
T
T
A
A
A
A
2/-
?
C/T
6/-
C
A
A
C
C
T
C
C
C
A
-
C
G
T
G
T
G
C
T
T
T
C
T
A
T
T
T
G
A
A
G
G
A
G
C
A
G
C
C
T
T
A
T
G
G
C
T
C
G
A
G
T
C
C
T
T
A
C
G
G
A
G
C
T
-
C
G
A
G
G
A
-
C
C
C
A
C
-
A
A
T
G
G
T
T
A
T
C
T
T
C
C
G
2
G
A
C
4
A
T
T
A
G
A
G
A
C
T
T
G
C
T
A
G
C
T
G
T
A
4/-
2/-
3/-
-/9
T
T
T
-
A
C
G
T
A
T
T
A
A
G
T
G
C
C
A
T
G
T
-
C
T
-
G
G
G
2
-
G
T
A
C
C
C
A
T
G
G
C
T
G
G
G
A
C
C
T
A
G
G
G
A
G
A
G
G
A
G
G
A
T
A
T
C
G
A
C
G
A
T
G
C
T
C
G
G
T
G
G
A
C
G
T
T
T
G
A
G
C
T
T
C
C
A
G
G
A
C
G
T
17
A
C
C
G
C
G
C
A
C
A
A
T
G
C
C
A
T
C
T
A
A
T
C
T
G
C
G
-
2
T
C
T
C
T
T
T
T
C
T
G
C
A
G
A
C
T
G
C
T
G
C
A
C
C
T
A
G
C
G
G
T
T
A
5
G
8
G
G
T
T
G
G
T
C
T
A
G
T
A
G
T
A
A
A
2
-
T
T
T
G
G
A
C
G
C
T
A
A
G
G
C
A
T
G
G
T
T
-
C
G
A
T/C
T/G
-
C
A
2
A
-
G
A
C
G
A
T
C
-
A
A/T
C
A
A
T
C
T
T
4
C
G
-/A
G
C
A
A
C
C
C
-
A
A
C
T
G
-
T