Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 147,642 (bp)   Positions: 361
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF11/Stm (2020) 
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
A
-
G
6
C
C
G
G
C
C
-
C
A
3
G
C
C
T
T
T
7
T
T
T
A
T
-
A
A
G
T
C
G
C
A
G
T
9
A
G
G
C
T
A
G
-
C
T
C
T
A
C
C
C
A
G
T
A
T
T
G
G
T
4
G
C
G
2
G
G
G
G
T
C
C
G
C
T
A
G
C
-
A
C
A
A
G
G
A
G
T
T
A
G
T
-
6
G
G
A
G
T
T
C
T
A
G
C
C
-
G
G
C
C
C
A
G
-
G
G
G
G
G
G
C
T
T
C
A
T
A
C
G
C
C
C
C
G
G
C
-
A
C
G
C
-
C
G
4
C
A
C
2
G
2
A
G
A
C
2
-
C
T
A
C
-
T
T
A
A
T
A
G
C
C
-
C
G
C
9
G
C
T
A
T
G
A
T
C
A
A
G
-
C
T
T
T
C
G
A
A
T
G
G
A
G
G
A
T
T
C
C
T
-
A
A
-
G
A
C
A
A
G
A
G
4
G
A
T
G
T
C
A
T
C
G
C
G
C
C
A
T
G
T
T
G
G
T
G
G
G
A
A
C
T
T
C
A
A
A
C
G
C
G
G
T
G
C
C
A
G
A
A
T
C
-
T
A
A
A
A
A
7
A
C
C
C
C
C
A
G
A
C
C
G
C
G
G
G
T
-
T
C
T
A
T
A
A
-
A
C
G
C
T
G
G
A
C
G
A
-
T
T
G
C
G
A
C
-
A
C
C
A
G
A
A
G
A
C
A
G
4
-
T
C
A
T
C
G
A
A
A
G
G
G
G
T
T
T
  27,669,794
  27,670,432
  27,671,115
  27,671,267
  27,671,269
  27,671,280
  27,671,548
  27,671,687
  27,671,697
  27,671,825
  27,672,962
  27,673,551
  27,674,497
  27,675,047
  27,675,110
  27,675,999
  27,676,408
  27,677,079
  27,677,303
  27,678,286
  27,678,794
  27,679,672
  27,679,888
  27,680,262
  27,680,572
  27,681,256
  27,681,904
  27,682,042
  27,683,631
  27,683,698
  27,684,393
  27,684,898
  27,685,212
  27,685,284
  27,686,842
  27,687,811
  27,688,390
  27,688,709
  27,689,728
  27,689,889
  27,690,131
  27,690,921
  27,691,001
  27,691,565
  27,691,695
  27,692,057
  27,692,319
  27,692,741
  27,692,842
  27,693,432
  27,693,568
  27,693,845
  27,694,233
  27,694,263
  27,694,865
  27,695,158
  27,695,170
  27,695,172
  27,695,301
  27,695,329
  27,695,403
  27,695,665
  27,696,177
  27,696,201
  27,696,250
  27,696,298
  27,697,006
  27,697,264
  27,697,825
  27,697,882
  27,697,886
  27,697,888
  27,697,890
  27,697,934
  27,697,938
  27,698,355
  27,699,749
  27,699,900
  27,700,488
  27,701,085
  27,701,591
  27,701,825
  27,702,195
  27,702,621
  27,702,696
  27,702,942
  27,702,943
  27,703,077
  27,703,546
  27,703,761
  27,703,835
  27,703,918
  27,703,977
  27,704,003
  27,704,012
  27,704,138
  27,705,104
  27,705,134
  27,705,610
  27,705,643
  27,705,931
  27,706,045
  27,706,106
  27,706,266
  27,706,365
  27,706,422
  27,706,794
  27,706,860
  27,706,951
  27,707,138
  27,707,190
  27,707,413
  27,707,641
  27,707,943
  27,707,997
  27,708,021
  27,708,078
  27,708,255
  27,708,259
  27,708,506
  27,708,707
  27,708,838
  27,708,889
  27,708,952
  27,709,192
  27,709,245
  27,709,374
  27,709,749
  27,709,798
  27,709,995
  27,710,025
  27,710,095
  27,710,914
  27,710,967
  27,710,994
  27,711,265
  27,711,348
  27,711,624
  27,711,874
  27,712,792
  27,713,694
  27,714,023
  27,714,703
  27,714,726
  27,715,104
  27,715,411
  27,715,416
  27,715,602
  27,715,655
  27,715,889
  27,716,164
  27,716,168
  27,716,305
  27,716,945
  27,716,947
  27,716,952
  27,717,955
  27,717,981
  27,718,847
  27,719,769
  27,720,446
  27,721,602
  27,721,967
  27,722,019
  27,722,644
  27,723,020
  27,723,236
  27,723,642
  27,724,963
  27,725,100
  27,725,412
  27,725,611
  27,726,521
  27,729,172
  27,729,858
  27,731,099
  27,731,695
  27,733,026
  27,733,112
  27,733,790
  27,734,066
  27,734,069
  27,734,076
  27,734,544
  27,734,733
  27,735,021
  27,735,085
  27,735,554
  27,735,567
  27,735,583
  27,735,584
  27,735,679
  27,735,847
  27,736,283
  27,736,386
  27,736,678
  27,736,689
  27,736,981
  27,737,285
  27,738,189
  27,738,865
  27,741,533
  27,744,085
  27,744,491
  27,744,749
  27,744,768
  27,745,195
  27,746,039
  27,747,297
  27,748,943
  27,749,443
  27,749,456
  27,749,707
  27,749,953
  27,750,652
  27,752,014
  27,752,389
  27,752,586
  27,753,893
  27,753,905
  27,754,103
  27,755,485
  27,755,636
  27,756,228
  27,756,231
  27,757,769
  27,757,893
  27,758,041
  27,758,115
  27,760,587
  27,761,549
  27,761,685
  27,762,104
  27,762,695
  27,763,984
  27,764,568
  27,765,010
  27,765,269
  27,767,252
  27,767,725
  27,768,320
  27,769,598
  27,769,831
  27,770,008
  27,770,448
  27,771,162
  27,772,141
  27,772,478
  27,772,564
  27,773,201
  27,773,527
  27,773,621
  27,775,791
  27,776,431
  27,776,552
  27,777,402
  27,777,404
  27,778,182
  27,778,292
  27,778,340
  27,778,831
  27,779,198
  27,779,667
  27,779,853
  27,780,216
  27,782,003
  27,782,956
  27,783,062
  27,783,457
  27,783,989
  27,784,059
  27,784,165
  27,784,455
  27,784,532
  27,784,770
  27,785,020
  27,786,534
  27,788,225
  27,788,707
  27,790,368
  27,790,372
  27,790,376
  27,790,380
  27,790,432
  27,791,011
  27,792,452
  27,793,354
  27,793,504
  27,793,724
  27,794,069
  27,796,386
  27,796,644
  27,797,371
  27,798,265
  27,800,699
  27,801,135
  27,801,170
  27,801,235
  27,801,239
  27,802,347
  27,802,709
  27,803,810
  27,803,812
  27,804,132
  27,804,149
  27,804,154
  27,804,356
  27,804,400
  27,804,420
  27,804,799
  27,804,806
  27,804,848
  27,804,941
  27,804,996
  27,805,057
  27,805,106
  27,805,419
  27,805,502
  27,805,804
  27,805,883
  27,805,909
  27,806,990
  27,807,134
  27,807,160
  27,807,525
  27,808,076
  27,808,331
  27,808,648
  27,808,666
  27,808,865
  27,808,963
  27,808,993
  27,809,289
  27,809,784
  27,810,167
  27,810,173
  27,810,295
  27,810,304
  27,810,328
  27,810,645
  27,810,681
  27,811,383
  27,811,455
  27,811,552
  27,811,719
  27,811,865
  27,811,867
  27,812,476
  27,812,760
  27,813,801
  27,813,894
  27,813,949
  27,814,092
  27,814,417
  27,814,665
  27,814,666
  27,814,903
  27,815,216
  27,815,230
  27,815,364
  27,815,529
A
-/G
C
G
A
-
T
T
A
A
A
T
4
T
G
-
A
T
-/T
C
C
C
-
A
C
A
T
C
2
G/-
G
A
C
T
A
T
G
-/T
C
-
-/G
A
A
T
-
-
A
2
T
G
T
C
G
T
T
G
G
T
C
G
C
-
C
A
C
4/-
C
T
A
-
A
A
A
G/C
T/C
T
T
A
T
-
G
A
G
3
C
G
G
G
A
A
G
A
C
C
G
A
A
A
-
C
A
G
A
C
C
T
C
G
A
T
T
4
A
-
G
T
T
G
A
27
A
A
A
T
A
C
-
C
C
T
G
C
G
T
A
T
G
A
T
T
A
T
3
G
G
A
A
C
T
T
-
T
G
A
2/-
G/A
-
-/G
A
G
-
-
G
T
C
G
T
A
C
G
C
G
C
G
A
G
T
A
T
A
-
-
A/-
T
C
G
C
A
G
A
A
G
G/-
T
2
T
C
C
A
T
C
G
-
A
A
T
G
A
A
C
C
C
G
G
C
4
G
C
C
A
G
T
T
G
A
G
A
-
A
G
C
T
C
A
T
C
T
C
T
A
T
A
G
A
A
C
G
A
A
G
A
A
A
G
G
T
G
G
T
G
G
G
T
T
T
A
A
G
A
T
G
C
A
G
G
C
T
6
C
-/G
-/G
-/G
G
G
-
T/-
G
A
A
T
T
-/G
A
G
T
T
A
G
A
A
A
C
10
C
T
C
G
G
G
G
4
C
T
A
G
-
A
A
G
T
C
G
3
C
A
A
T
A
G
T
T
T
T
T
G
T
G
G
A
C
T
-
C
-
2
G
T
G
C
T
A
G
C
G
T
T
A
C
A
C
C