Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 147,642 (bp)   Positions: 564
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
FXLE18/Stm (2020) 
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
Micu1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
-
-
G
G
6
C
C
-
A
G
A
A
C
8
T
T
T
C
G
T
T
T
T
G
G
C
G
G
-
T
G
T
C
T
T
A
C
A
C
A
G
A
G
G
G
6
C
T
C
A
A
T
G
8
T
T
G
-
C
-
C
-
T
C
C
C
C
C
C
T
-
G
C
T
C
T
14
A
A
32
A
A
C
A
C
A
-
A
C
C
A
T
G
C
G
T
88
C
A
A
-
G
C
G
C
T
36
A
G
T
T
T
G
C
A
4
G
A
T
C
C
G
C
A
G
C
T
A
T
C
C
G
G
G
G
G
T
C
A
G
C
A
C
C
T
C
C
G
G
G
G
G
G
G
T
A
G
C
-
-
A
A
A
G
A
G
T
T
A
G
T
-
G
6
G
G
A
G
T
T
C
T
A
C
C
-
G
C
C
C
A
G
-
G
G
G
G
G
G
G
C
T
T
C
A
T
A
C
G
C
C
T
C
C
C
G
G
C
-
A
C
G
C
-
C
4
C
A
T
2
A
G
A
A
G
T
-
T
A
C
G
-
-
T
T
A
A
-
T
G
A
T
C
G
G
C
C
G
C
A
A
T
4
G
A
G
G
G
C
G
-
C
C
2
G
T
G
G
C
G
G
G
C
T
C
C
A
C
3
T
G
C
A
C
C
A
A
A
G
T
C
A
A
T
G
T
A
C
A
G
C
G
A
C
T
A
-
G
T
G
-
G
T
T
C
-
G
T
C
T
C
A
G
C
A
T
A
C
A
G
T
T
G
G
10
G
T
C
G
-
T
-
C
A
A
G
T
T
C
G
T
A
T
T
G
T
G
A
T
T
-
G
C
G
G
G
A
-
C
2
2
C
-
C
T
C
A
G
T
G
4
T
A
2
G
A
G
T
T
T
T
C
C
-
-
-
C
-
A
-
G
A
C
A
G
A
G
C
A
G
G
A
T
G
T
C
A
T
G
C
G
C
A
T
G
C
T
T
G
G
G
G
A
T
T
C
A
A
A
G
C
C
C
G
T
G
C
C
A
C
T
A
C
A
T
C
T
-
A
-
C
A
G
-
A
A
T
C
C
T
T
T
A
A
A
6
G
C
T
C
2
G
C
3
T
A
A
T
A
C
G
G
A
C
C
A
C
T
G
T
A
A
G
T
T
-
A
C
G
G
A
C
C
G
G
G
C
-
C
T
2
A
T
-
T
-
T
A
G
T
A
G
26
A
C
T
C
A
T
T
A
C
A
A
A
G
G
G
T
T
G
G
  27,669,198
  27,670,270
  27,671,244
  27,671,267
  27,671,269
  27,671,271
  27,671,280
  27,672,962
  27,674,268
  27,674,497
  27,675,110
  27,676,408
  27,676,700
  27,677,214
  27,677,303
  27,677,305
  27,677,414
  27,677,438
  27,677,445
  27,677,446
  27,677,588
  27,677,657
  27,678,175
  27,678,286
  27,678,794
  27,678,795
  27,678,898
  27,679,066
  27,679,304
  27,679,760
  27,679,821
  27,680,055
  27,680,166
  27,680,263
  27,680,363
  27,680,537
  27,680,572
  27,680,660
  27,680,668
  27,680,678
  27,680,696
  27,680,708
  27,680,876
  27,681,298
  27,681,307
  27,681,328
  27,681,337
  27,681,386
  27,681,497
  27,681,506
  27,681,565
  27,681,594
  27,681,612
  27,681,733
  27,681,739
  27,681,746
  27,681,757
  27,681,761
  27,681,917
  27,682,009
  27,682,226
  27,682,231
  27,682,441
  27,682,520
  27,682,525
  27,682,529
  27,682,533
  27,683,092
  27,683,095
  27,683,098
  27,683,104
  27,683,209
  27,683,423
  27,683,441
  27,683,455
  27,683,492
  27,683,534
  27,683,536
  27,683,562
  27,683,601
  27,683,603
  27,683,636
  27,683,661
  27,683,663
  27,683,687
  27,683,698
  27,683,780
  27,684,236
  27,684,352
  27,684,393
  27,684,649
  27,684,690
  27,684,843
  27,685,212
  27,685,241
  27,685,284
  27,685,524
  27,685,744
  27,687,184
  27,687,811
  27,687,864
  27,687,939
  27,688,247
  27,688,285
  27,688,651
  27,688,709
  27,688,891
  27,689,728
  27,690,096
  27,690,131
  27,690,412
  27,690,572
  27,691,087
  27,691,695
  27,691,907
  27,692,003
  27,692,057
  27,692,469
  27,693,081
  27,693,621
  27,693,845
  27,694,263
  27,694,536
  27,694,846
  27,695,158
  27,695,170
  27,695,172
  27,695,230
  27,695,301
  27,695,329
  27,695,403
  27,695,893
  27,695,990
  27,696,177
  27,696,243
  27,696,467
  27,696,787
  27,696,795
  27,696,862
  27,696,905
  27,696,906
  27,697,825
  27,698,104
  27,698,584
  27,698,604
  27,698,921
  27,699,458
  27,700,449
  27,700,488
  27,700,686
  27,700,688
  27,700,690
  27,700,692
  27,700,694
  27,700,696
  27,700,698
  27,701,085
  27,701,591
  27,701,825
  27,702,195
  27,702,356
  27,702,621
  27,702,696
  27,702,943
  27,703,077
  27,703,546
  27,703,835
  27,703,918
  27,703,977
  27,704,003
  27,704,012
  27,704,138
  27,705,104
  27,705,134
  27,705,531
  27,705,610
  27,705,643
  27,705,931
  27,706,045
  27,706,106
  27,706,266
  27,706,365
  27,706,422
  27,706,794
  27,706,860
  27,707,138
  27,707,190
  27,707,413
  27,707,943
  27,707,997
  27,708,021
  27,708,078
  27,708,255
  27,708,259
  27,708,506
  27,708,707
  27,708,838
  27,708,889
  27,708,952
  27,709,006
  27,709,192
  27,709,245
  27,709,374
  27,709,749
  27,709,798
  27,709,995
  27,710,025
  27,710,095
  27,710,914
  27,710,967
  27,710,994
  27,711,265
  27,711,348
  27,711,620
  27,711,624
  27,711,874
  27,712,588
  27,712,792
  27,713,694
  27,714,023
  27,714,703
  27,714,726
  27,715,104
  27,715,411
  27,715,416
  27,715,602
  27,715,655
  27,716,164
  27,716,168
  27,716,305
  27,717,288
  27,717,955
  27,718,476
  27,718,847
  27,719,715
  27,719,769
  27,720,193
  27,721,458
  27,721,967
  27,722,644
  27,723,020
  27,723,236
  27,723,407
  27,723,642
  27,723,658
  27,724,963
  27,725,100
  27,725,412
  27,725,611
  27,726,176
  27,726,521
  27,728,553
  27,729,172
  27,731,177
  27,731,226
  27,731,387
  27,731,465
  27,731,589
  27,731,695
  27,731,749
  27,731,841
  27,731,986
  27,732,087
  27,732,098
  27,732,104
  27,732,141
  27,732,278
  27,732,301
  27,732,549
  27,732,605
  27,732,890
  27,733,005
  27,733,026
  27,733,095
  27,733,106
  27,733,115
  27,733,146
  27,733,481
  27,733,527
  27,734,076
  27,734,082
  27,734,129
  27,734,155
  27,734,186
  27,734,441
  27,734,733
  27,734,747
  27,734,891
  27,734,892
  27,734,966
  27,734,998
  27,735,022
  27,735,077
  27,735,142
  27,735,151
  27,735,156
  27,735,553
  27,735,567
  27,735,591
  27,735,679
  27,735,715
  27,735,718
  27,735,728
  27,735,730
  27,735,847
  27,735,870
  27,735,913
  27,735,953
  27,736,115
  27,736,286
  27,736,288
  27,736,419
  27,736,483
  27,736,502
  27,736,511
  27,736,678
  27,736,981
  27,737,005
  27,737,171
  27,737,214
  27,737,285
  27,737,661
  27,737,742
  27,737,778
  27,737,782
  27,737,860
  27,737,910
  27,738,462
  27,738,470
  27,738,495
  27,738,551
  27,738,792
  27,738,831
  27,738,931
  27,738,953
  27,739,197
  27,739,221
  27,739,280
  27,739,353
  27,739,456
  27,739,917
  27,740,004
  27,740,029
  27,740,173
  27,740,373
  27,740,733
  27,740,843
  27,740,958
  27,741,023
  27,741,042
  27,741,057
  27,741,129
  27,741,173
  27,741,212
  27,741,373
  27,741,461
  27,741,533
  27,742,029
  27,742,299
  27,742,442
  27,742,709
  27,742,738
  27,742,883
  27,742,984
  27,743,292
  27,743,548
  27,743,580
  27,743,717
  27,744,424
  27,745,003
  27,745,008
  27,745,151
  27,745,300
  27,745,363
  27,745,421
  27,745,483
  27,745,564
  27,745,579
  27,746,335
  27,746,471
  27,746,500
  27,747,026
  27,747,034
  27,747,043
  27,747,096
  27,747,267
  27,747,589
  27,747,624
  27,747,638
  27,747,724
  27,748,121
  27,748,138
  27,748,159
  27,748,170
  27,748,192
  27,748,221
  27,748,839
  27,748,943
  27,748,944
  27,748,995
  27,749,224
  27,749,352
  27,749,443
  27,749,707
  27,749,953
  27,750,051
  27,750,085
  27,750,779
  27,750,901
  27,752,014
  27,752,389
  27,753,893
  27,753,905
  27,754,103
  27,755,485
  27,755,636
  27,756,086
  27,756,228
  27,756,231
  27,757,427
  27,757,769
  27,757,893
  27,760,213
  27,760,587
  27,761,549
  27,761,685
  27,762,104
  27,762,695
  27,763,984
  27,764,568
  27,765,269
  27,767,252
  27,767,725
  27,769,598
  27,769,831
  27,770,008
  27,770,448
  27,770,582
  27,771,162
  27,772,141
  27,772,478
  27,772,564
  27,773,126
  27,773,527
  27,776,552
  27,777,404
  27,778,182
  27,778,292
  27,778,340
  27,778,831
  27,779,198
  27,779,457
  27,779,667
  27,780,216
  27,782,229
  27,782,956
  27,783,062
  27,783,457
  27,783,989
  27,784,059
  27,784,165
  27,784,670
  27,785,020
  27,785,327
  27,785,347
  27,785,573
  27,785,794
  27,785,964
  27,787,069
  27,787,176
  27,787,254
  27,787,385
  27,787,505
  27,787,804
  27,787,942
  27,787,997
  27,788,108
  27,788,242
  27,788,388
  27,788,432
  27,788,523
  27,788,707
  27,789,521
  27,790,141
  27,791,887
  27,792,452
  27,792,454
  27,792,494
  27,792,963
  27,793,354
  27,793,415
  27,793,504
  27,793,860
  27,794,272
  27,794,357
  27,794,552
  27,794,556
  27,794,562
  27,794,574
  27,794,917
  27,795,273
  27,795,424
  27,795,620
  27,795,988
  27,796,179
  27,796,314
  27,796,386
  27,796,644
  27,796,759
  27,796,906
  27,796,980
  27,797,040
  27,797,503
  27,797,592
  27,797,772
  27,797,956
  27,798,090
  27,798,244
  27,798,265
  27,799,775
  27,799,819
  27,800,066
  27,800,303
  27,800,639
  27,800,699
  27,801,542
  27,801,798
  27,801,871
  27,802,058
  27,802,375
  27,802,668
  27,803,237
  27,803,269
  27,803,273
  27,803,810
  27,803,812
  27,804,132
  27,804,134
  27,804,154
  27,804,799
  27,804,875
  27,805,106
  27,806,990
  27,808,076
  27,808,393
  27,810,645
  27,810,852
  27,811,865
  27,811,867
  27,812,476
  27,812,760
  27,813,069
  27,813,114
  27,813,801
  27,813,949
  27,814,092
  27,814,417
  27,814,665
  27,814,666
  27,814,903
  27,815,230
  27,815,529
  27,815,634
  27,815,993
C
A
A
G
A
A
-
A
T
4
G
A
G
T
-/T
-
C
A
C
G
A
C
A
C
C
A
A
T
A
A
C
C/-
A
A
T
C
C
G
T
G
T
G
A
G
A
A
A
-
T
C
T
G
G
G
C
-
A
A
A
T
T
30
T/-
6
C
T
T
T
T
T
T
C
C/T
A
T
C
-
-
-
T/-
T/-
-
T/-
T/-
T/-
G/-
T
G
T
G
G
T
G
C
A
T
A
C
-
T
G
-
2
A
T
?
T
C
-
-/G
A
G
C
-
A
T
-
-
A
G
C
T
T
A
G
G
T
T
C
G
C
A
T
C
-/C
A
C
C
A
T
G
A
G
G
T
T
A
T
T
C/-
-/C
C/-
-/C
C/-
-/C
G/C
-
G
A
G
2
3
C
G
G
A
G
A
C
C
G
A
A
A
A
-
C
A
G
A
C
C
T
C
G
T
T
4
-
G
T
T
G
A
27
A
A
A
T
A
A
C
-
C
C
T
G
C
G
T
A
T
G
C
A
T
T
T
A
T
3
G
G
A
A
C
T
-
T
G
-
-
T
A
G
G
A
C
G
C
G
T
A
A
G
C
G
C
G
-/G
C
A
G
C
T
C
A
A
T
A
C/A
G
T
C
-
A
G
A
A
T
T
A
A
T
T
-
T
G
A
-/A
-
A
A
A
G
C
T
A
G
T
-
C
A
T
G
T
T
G
G
G
A
C
G
G
-/G
C/-
A
C
C
T
G
A
T
A
G
T
C
G
G
T
A
A
A
A
-
C
T
C
A
G
G
C
G
-
A
A
G
C
G
T
G
A
C
C
A
A
-
A
C
T
T
C
C
5
T
C
G
-
C
-
T
A
-
G
C
C
A
C
A
G
C
C
C
C
T
A
A
A
G
4
A
-
-
-
2
T
C
T
G
A
C
A
-
C
G
-
T
C
A
A
A
C
C
G
G
C
16
T
T
4
G
C
A
G
T
T
A
G
A
A
G
A
A
G
C
T
C
A
T
C
C
T
A
A
G
A
A
T
C
G
A
A
A
A
G
G
G
T
G
G
G
A
T
T
A
A
G
A
T
G
C
T
C
G
T
G
C
G
G
12
G
G
T
G
T
33
G
-
C
T
T
C
G/-
C
G
T/-
-/T
-
A
G
G
A
-
C
T
3/-
A
-
-/T
C
G
T
A
A
-
T
T
G/-
T
G
A
C
G
G
-
C
G
2
G
T
A
A
G
T
T
A
A
A
T
13
T
C
-
-
C
10
C
2
C
G
A
-
G
A
-
C
T
G
T
G
C
C
T/G
T
G
C
G
T
T
A
A
C
A
A