Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 36,945 (bp)   Positions: 540
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
FHH/EurMcwi (2019) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
Mgat4d
-
A
C
A
T
C
T
A
A
T
A
A
A
A
T
T
C
C
C
A
T
C
-
G
T
T
-
-
A
T
-
A
A
G
G
T
G
T
C
A
G
A
T
-
-
-
C
C
T
T
-
T
T
T
T
G
C
C
A
T
G
T
C
T
G
C
A
G
A
A
T
C
T
C
-
-
A
A
G
-
A
G
T
C
C
T
A
T
-
T
A
-
-
A
T
T
-
A
-
A
A
A
T
C
C
T
T
C
G
G
A
G
-
-
G
T
C
A
C
G
C
G
A
C
A
-
-
T
G
T
C
A
C
T
C
C
-
C
G
-
C
G
A
T
T
60
T
T
C
17
T
G
A
C
C
-
C
A
C
T
C
-
G
G
G
A
C
A
C
G
C
G
G
A
A
T
T
T
T
T
T
C
9
T
-
C
-
C
A
G
-
2
-
C
A
C
G
2
C
T
-
C
A
C
G
A
A
G
-
C
T
C
T
-
2
A
T
G
T
T
-
A
C
A
2
C
C
2
G
G
G
A
C
T
C
-
-
-
C
C
T
T
C
G
A
A
A
-
-
C
C
A
A
A
T
-
-
-
A
-
A
A
C
G
A
2
A
T
G
-
C
C
-
G
C
3
A
C
A
A
T
A
2
C
T
-
-
G
A
T
C
T
G
A
G
T
T
T
G
T
A
T
A
G
2
C
C
T
C
G
C
A
T
T
T
12
G
T
C
G
T
-
G
T
T
C
T
T
-
6
2
-
T
C
A
C
T
C
T
T
A
A
G
A
T
C
C
T
G
G
A
C
C
-
C
T
C
T
T
C
T
A
C
-
C
G
A
-
-
G
C
C
C
A
C
C
C
C
C
T
A
-
A
G
C
T
-
G
T
C
T
2
-
2
C
A
C
T
G
G
4
T
A
-
T
A
G
C
G
A
G
T
A
C
C
G
C
C
T
C
A
C
A
G
-
T
A
C
T
C
G
G
C
6
C
A
-
C
T
-
A
G
2
-
-
-
-
C
A
-
C
G
2
2
-
A
A
-
G
-
G
G
C
-
A
-
G
T
C
C
-
-
A
C
C
A
T
-
G
-
-
C
A
A
A
T
T
G
-
2
A
3
-
T
T
A
-
C
G
T
G
C
C
T
A
C
T
G
-
A
4
G
T
A
A
T
A
T
T
A
A
T
-
2
4
C
-
2
A
T
3
C
-
C
A
-
A
-
G
G
  24,740,106
  24,740,218
  24,740,825
  24,740,832
  24,741,035
  24,741,042
  24,741,046
  24,741,056
  24,741,093
  24,741,095
  24,741,096
  24,741,105
  24,741,110
  24,741,112
  24,741,117
  24,741,136
  24,741,142
  24,741,148
  24,741,156
  24,741,159
  24,741,257
  24,741,365
  24,741,545
  24,742,022
  24,742,317
  24,742,353
  24,742,424
  24,742,735
  24,743,124
  24,743,579
  24,743,750
  24,743,958
  24,744,044
  24,744,127
  24,744,179
  24,744,527
  24,744,604
  24,744,821
  24,744,989
  24,745,219
  24,745,247
  24,745,468
  24,745,844
  24,745,980
  24,746,101
  24,746,141
  24,746,171
  24,746,236
  24,746,341
  24,746,342
  24,746,422
  24,746,469
  24,746,483
  24,746,489
  24,746,490
  24,746,492
  24,746,495
  24,746,499
  24,746,502
  24,746,504
  24,746,511
  24,746,520
  24,746,522
  24,746,573
  24,746,575
  24,746,625
  24,746,634
  24,746,686
  24,746,725
  24,746,732
  24,746,772
  24,746,837
  24,746,916
  24,746,923
  24,746,941
  24,747,092
  24,747,111
  24,747,116
  24,747,157
  24,747,195
  24,747,312
  24,747,330
  24,747,463
  24,747,501
  24,747,503
  24,747,559
  24,747,699
  24,747,722
  24,747,733
  24,747,813
  24,747,822
  24,747,914
  24,747,949
  24,748,003
  24,748,081
  24,748,464
  24,748,601
  24,748,656
  24,748,671
  24,748,687
  24,748,780
  24,748,916
  24,748,930
  24,749,037
  24,749,058
  24,749,148
  24,749,256
  24,749,344
  24,749,508
  24,749,526
  24,749,646
  24,749,661
  24,749,701
  24,749,773
  24,749,774
  24,749,790
  24,749,837
  24,749,839
  24,749,968
  24,750,023
  24,750,101
  24,750,293
  24,750,296
  24,750,331
  24,750,424
  24,750,560
  24,750,732
  24,750,748
  24,750,917
  24,751,725
  24,751,755
  24,751,759
  24,751,933
  24,751,971
  24,752,025
  24,752,074
  24,752,149
  24,752,162
  24,752,172
  24,752,215
  24,752,220
  24,752,296
  24,752,310
  24,752,352
  24,752,358
  24,752,372
  24,752,407
  24,752,414
  24,752,429
  24,752,443
  24,752,476
  24,752,487
  24,752,509
  24,752,523
  24,752,574
  24,752,605
  24,752,662
  24,752,673
  24,752,715
  24,752,738
  24,752,830
  24,752,851
  24,752,950
  24,752,957
  24,752,977
  24,753,000
  24,753,020
  24,753,028
  24,753,031
  24,753,063
  24,753,067
  24,753,156
  24,753,164
  24,753,194
  24,753,271
  24,753,297
  24,753,301
  24,753,314
  24,753,328
  24,753,373
  24,753,401
  24,753,467
  24,753,482
  24,753,523
  24,753,527
  24,753,541
  24,753,561
  24,753,625
  24,753,629
  24,753,641
  24,753,648
  24,753,653
  24,753,659
  24,753,723
  24,753,737
  24,753,744
  24,753,764
  24,753,772
  24,753,777
  24,753,789
  24,753,801
  24,753,876
  24,753,914
  24,753,931
  24,753,975
  24,754,068
  24,754,114
  24,754,133
  24,754,189
  24,754,235
  24,754,289
  24,754,305
  24,754,343
  24,754,364
  24,754,371
  24,754,375
  24,754,396
  24,754,425
  24,754,428
  24,754,448
  24,754,505
  24,754,555
  24,754,583
  24,754,600
  24,754,639
  24,754,654
  24,754,678
  24,754,711
  24,754,782
  24,754,787
  24,754,840
  24,754,847
  24,754,866
  24,754,945
  24,754,951
  24,754,975
  24,755,006
  24,755,007
  24,755,025
  24,755,105
  24,755,256
  24,755,283
  24,755,401
  24,755,459
  24,755,463
  24,755,469
  24,755,522
  24,755,608
  24,755,642
  24,755,680
  24,755,699
  24,755,706
  24,755,760
  24,755,775
  24,755,830
  24,755,845
  24,755,875
  24,755,884
  24,755,890
  24,755,912
  24,755,922
  24,755,968
  24,755,998
  24,756,098
  24,756,113
  24,756,182
  24,756,256
  24,756,266
  24,756,280
  24,756,298
  24,756,312
  24,756,338
  24,756,377
  24,756,400
  24,756,419
  24,756,421
  24,756,438
  24,756,447
  24,756,450
  24,756,454
  24,756,484
  24,756,607
  24,756,630
  24,756,639
  24,756,851
  24,756,927
  24,756,939
  24,756,979
  24,757,077
  24,757,221
  24,757,262
  24,757,276
  24,757,337
  24,757,461
  24,757,472
  24,757,499
  24,757,781
  24,757,814
  24,757,860
  24,758,048
  24,758,414
  24,758,656
  24,758,676
  24,758,765
  24,758,771
  24,758,815
  24,758,866
  24,758,869
  24,758,888
  24,758,957
  24,758,976
  24,758,987
  24,759,152
  24,759,180
  24,759,230
  24,759,318
  24,759,361
  24,759,411
  24,760,093
  24,760,134
  24,760,671
  24,760,685
  24,760,799
  24,760,821
  24,760,853
  24,760,882
  24,760,946
  24,760,949
  24,760,953
  24,761,019
  24,761,062
  24,761,065
  24,761,066
  24,761,068
  24,761,118
  24,761,120
  24,761,134
  24,761,135
  24,761,198
  24,761,215
  24,761,238
  24,761,401
  24,761,475
  24,761,576
  24,761,625
  24,761,798
  24,761,837
  24,761,893
  24,762,172
  24,762,281
  24,762,429
  24,762,497
  24,762,570
  24,762,846
  24,762,853
  24,762,856
  24,762,886
  24,762,976
  24,763,020
  24,763,025
  24,763,076
  24,763,117
  24,763,141
  24,763,155
  24,763,304
  24,763,547
  24,763,667
  24,763,719
  24,763,739
  24,763,741
  24,763,767
  24,763,838
  24,763,867
  24,763,868
  24,763,910
  24,763,961
  24,764,054
  24,764,071
  24,764,178
  24,764,179
  24,764,249
  24,764,274
  24,764,296
  24,764,308
  24,764,329
  24,764,343
  24,764,363
  24,764,437
  24,764,439
  24,764,524
  24,764,532
  24,764,535
  24,764,568
  24,764,649
  24,764,659
  24,764,725
  24,764,861
  24,765,033
  24,765,097
  24,765,158
  24,765,428
  24,765,516
  24,765,899
  24,766,028
  24,766,347
  24,766,473
  24,766,579
  24,766,698
  24,766,791
  24,767,003
  24,767,294
  24,767,449
  24,767,499
  24,767,711
  24,767,716
  24,767,729
  24,767,829
  24,767,902
  24,767,954
  24,768,008
  24,768,168
  24,768,353
  24,768,385
  24,768,435
  24,768,523
  24,768,556
  24,768,579
  24,768,718
  24,768,874
  24,768,915
  24,769,139
  24,769,240
  24,769,294
  24,769,855
  24,770,010
  24,770,018
  24,770,037
  24,770,096
  24,770,098
  24,770,177
  24,770,207
  24,770,240
  24,770,268
  24,770,291
  24,770,293
  24,770,401
  24,770,414
  24,770,438
  24,770,447
  24,770,459
  24,770,467
  24,770,484
  24,770,500
  24,770,503
  24,770,514
  24,770,524
  24,770,587
  24,770,615
  24,770,623
  24,770,651
  24,770,664
  24,770,670
  24,770,711
  24,770,762
  24,770,769
  24,770,781
  24,770,783
  24,770,826
  24,770,876
  24,771,023
  24,771,064
  24,771,067
  24,771,115
  24,771,158
  24,771,258
  24,771,324
  24,771,417
  24,771,488
  24,771,516
  24,771,561
  24,771,695
  24,771,726
  24,771,750
  24,771,760
  24,771,822
  24,771,908
  24,771,937
  24,771,940
  24,771,976
  24,771,990
  24,772,000
  24,772,036
  24,772,040
  24,772,046
  24,772,049
  24,772,177
  24,772,276
  24,772,280
  24,772,299
  24,772,530
  24,772,579
  24,772,595
  24,772,624
  24,772,693
  24,772,713
  24,772,719
  24,773,190
  24,773,264
  24,773,388
  24,773,426
  24,773,438
  24,773,491
  24,773,732
  24,773,750
  24,773,904
  24,773,966
  24,774,121
  24,774,134
  24,774,340
  24,774,372
  24,774,377
  24,774,466
  24,774,995
  24,775,018
  24,775,026
  24,775,043
  24,775,088
  24,775,100
  24,775,340
  24,775,450
  24,775,520
  24,775,569
  24,776,219
  24,776,250
  24,776,266
  24,776,273
  24,776,311
  24,776,390
  24,776,582
  24,776,756
A
G
A
G
T/C
C/T
T/C
A/C
A/T
T/C
A/G
A/G
A/C
A/C
T/A
T/-
C/T
C/T
C/A
A/G
C
T
T
-
G
A
G
G
C
C
G
C
-
A
A
A
-
G
T
-
A
-
G
C
T
C
-
A
A
A
3
C
C
C
C
A
T
T
G
C
A
C
T
C
C
T
-
T
-
T/3
C
-
C
T
A
T
T
-
-
A
-
-
A
T
A
-
G
-
T
A
-
C
T
-
C
-
T
-
T
C
-
-/C
-
-
-
-
-
T
-
-
G
-
T
A
A
A
T
T
T
-
T
A
-
-
T
G
T
-
-
A
A
-
-
A
T
-
A
-
-
C
-
A
G
A
-
60/-
C/-
C/-
-/T
17/-
-
T/-
-
-
-
T
A
-
T
-
-
A
-
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
T
-/G
G
A
-
A
C
-
-
-
G
-
T
-
C
-
T
-
T
-
-
-
-
-
-
G
G
A
-
-
-
-
T
-
G
-
-
-
A
G
-
G
A
-
A
-
G
T
-
-
-
-
-
-
-
A
-
-
-
-
-
C
G
G
-
A
-
-
-
-
T
-
T
G
A
-
-
-
-
-
-
A
2
C
T/-
C
C/-
-
-
A
-
-
-
C
-
2
-
A
G
-
A
-
-
A
-
-
C
-
-
-
C
C
A
A
G
C
A
C
A
T
C
C
C
C
T
C
T
C
G
A
-
T
G
A
T
A
T
G
C
C
C
-
A
C
T
A
C
4
-
C
C
T
C
C
C
-
-
3
G
T
T
T
C
T
C
C
G
G
A
G
C
T
T
C
A
A
T
T
T
7
T
C
T
C
C
G
C
G
T
G
G
A
G
2
A
A
T
T
A
G
G
T
T
T
A
G
G
T
G
A
T
C
2
A
C
T
C
-
12
-
T
G
T
C
C
A
-
C
G
7
C
G
A
G
A
G
T
-/G
G
T
T
A
T
T
-
T
G
T
G
A
21
C
-
T
C
T
A
A
T
-
A
C
C
-
A
T
A/-
-
-
G
T
A
A
A
T
G
A
-
-
-
G
-
-
T
C
C
T
-
-
G
-
C
A
-
-
-
2
A
-
T
G
T
C
T
-
A
T
T
-
-
-
-
A
A
G
-
-
-
11
C
-
-
C
T
A
C
A
T
T
G
G
T
-/C
A
A
G
-
C
C
T
G
C
G
C
G
G
G
C
2
-
-
T/-
2
-
G
C
-
T
A
-
G
A
T
A
A
A