Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 111,359 (bp)   Positions: 200
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LL/MavRrrcAek (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Asf1a
Asf1a
Asf1a
Asf1a
Asf1a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
Mcm9
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
A
C
C
C
17
C
T
G
T
C
-
T
A
C
A
T
T
T
G
C
C
T
C
T
A
-
C
A
G
G
T
C
G
C
T
C
3
T
C
C
T
G
C
C
T
T
A
A
C
C
C
C
C
G
C
C
G
C
A
-
A
A
A
G
G
A
A
G
G
G
C
G
7
C
A
T
G
T
G
A
T
C
T
-
C
G
T
A
C
4
G
G
A
G
C
C
G
-
A
C
2
C
T
C
C
C
G
A
G
A
C
C
A
T
A
A
A
A
A
C
T
C
C
C
G
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
G
-
T
-
C
T
T
C
T
T
A
A
T
A
T
G
G
4
T
7
A
C
A
A
T
C
A
T
A
G
G
A
A
T
C
T
T
G
T
A
G
G
G
G
C
G
A
G
C
T
T
T
-
-
T
C
A
  32,819,010
  32,819,058
  32,819,654
  32,820,192
  32,820,223
  32,820,376
  32,820,537
  32,820,629
  32,820,778
  32,820,975
  32,821,564
  32,823,243
  32,823,601
  32,823,881
  32,823,920
  32,824,033
  32,824,231
  32,829,291
  32,829,458
  32,831,086
  32,831,688
  32,831,842
  32,833,151
  32,834,071
  32,840,030
  32,840,031
  32,841,366
  32,841,533
  32,843,478
  32,844,341
  32,847,654
  32,849,915
  32,850,714
  32,851,650
  32,851,922
  32,852,388
  32,852,947
  32,853,254
  32,854,399
  32,854,403
  32,854,899
  32,855,107
  32,855,148
  32,855,196
  32,855,951
  32,855,978
  32,856,215
  32,856,426
  32,857,478
  32,857,927
  32,858,188
  32,858,802
  32,860,450
  32,860,454
  32,860,458
  32,860,462
  32,863,674
  32,864,493
  32,864,617
  32,864,858
  32,865,592
  32,866,159
  32,867,227
  32,867,233
  32,868,199
  32,871,043
  32,872,752
  32,873,169
  32,873,509
  32,873,852
  32,873,867
  32,873,927
  32,873,958
  32,875,203
  32,875,273
  32,876,275
  32,876,276
  32,876,277
  32,876,280
  32,876,285
  32,876,756
  32,877,399
  32,878,777
  32,879,975
  32,880,749
  32,882,472
  32,883,333
  32,884,966
  32,885,276
  32,886,020
  32,886,439
  32,887,159
  32,887,169
  32,887,195
  32,887,199
  32,887,241
  32,887,244
  32,887,887
  32,888,265
  32,889,169
  32,889,906
  32,889,942
  32,890,007
  32,891,810
  32,894,127
  32,894,237
  32,894,274
  32,894,277
  32,894,673
  32,895,109
  32,895,578
  32,897,073
  32,897,120
  32,897,548
  32,897,550
  32,898,120
  32,899,609
  32,900,318
  32,900,319
  32,900,320
  32,900,321
  32,900,322
  32,900,355
  32,900,616
  32,900,644
  32,900,751
  32,903,629
  32,904,490
  32,904,648
  32,904,650
  32,904,652
  32,904,657
  32,904,662
  32,904,665
  32,904,666
  32,904,667
  32,904,669
  32,904,670
  32,904,671
  32,904,673
  32,904,674
  32,904,678
  32,905,474
  32,905,695
  32,906,177
  32,907,580
  32,908,145
  32,910,725
  32,911,349
  32,911,353
  32,911,432
  32,911,476
  32,912,343
  32,912,657
  32,913,357
  32,913,537
  32,913,552
  32,913,673
  32,914,005
  32,914,231
  32,914,239
  32,915,355
  32,915,756
  32,915,922
  32,916,137
  32,916,730
  32,917,602
  32,917,904
  32,917,928
  32,918,294
  32,918,803
  32,918,811
  32,919,178
  32,919,183
  32,919,353
  32,919,439
  32,919,496
  32,919,640
  32,919,660
  32,919,991
  32,921,112
  32,922,995
  32,923,115
  32,923,385
  32,923,394
  32,923,730
  32,923,739
  32,925,194
  32,925,216
  32,925,924
  32,926,169
  32,927,050
  32,927,281
  32,927,446
  32,927,590
  32,927,747
  32,927,780
  32,928,009
  32,928,323
  32,929,301
C
C
C
G
T
G
A
-
A
C
T
C
A
C
C
C
T
G
C
C
G
T
T
G
?
A
C
G
3
T
G
T
A
C
T
T
T
A
-
-
A
T
T
G
C
T
T
C
C
T
G
T
G/-
G
G
G
A
T
T
A
T
G
T
C
G
G
T
A
-/G
-/G
-/A
-/A
A/-
G
A
7/-
T/-
G/-
C/-
G/T
C/-
A
-
C
T
C
G
T
A
C
G
T
-
A/-
-/A
-/G
C/-
T
T
A
A
-
T
-
T
G
T
T
G
T
G
A
T
T
A
G
C
G/-
-/G
-/G
G/-
-/G
A
C
T
T
T
A
G
G
C
C
-/A
-/C
C/-
A/-
-/A
A/-
C/-
?
?
C/A
C
A
T
A
A
T
C/-
G/-
T
-/C
C
G
G
C
G
C
A
-
-
C
7/-
G
A
G
G
C
T
G
C
G
T
A
G
G
C
G
G
C
A
A/G
G
-/T
T
A
A
T
A
C
A
T
C
A
C
2
2
C
G
G