Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 127,142 (bp)   Positions: 293
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF10A/StmMcwi (2020) 
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
Map7
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120098801
G
G
T
T
T
2
-
C
-
A
G
A
A
T
T
-
-
G
C
-
T
A
-
C
G
G
T
4
2
T
G
A
C
C
A
G
C
T
T
G
G
T
5
C
C
T
A
-
G
A
C
G
G
T
T
G
C
G
A
C
A
A
T
-
-
A
G
A
G
C
G
T
C
A
C
C
G
C
C
C
A
T
T
G
C
C
G
A
T
C
T
-
4
-
A
G
4
8
A
G
-
C
A
C
C
G
A
G
T
C
T
C
G
G
A
A
C
G
G
G
A
C
G
A
C
C
C
G
T
4
-
T
T
C
T
-
9
A
A
T
T
A
G
A
C
C
-
C
A
-
A
A
G
A
T
C
A
A
C
-
G
-
C
A
T
-
G
A
A
C
G
T
T
T
G
C
7
G
T
T
T
C
-
T
T
G
G
C
2
A
3
-
G
A
T
A
G
A
G
C
T
C
G
T
T
A
C
-
G
A
A
G
C
C
G
A
T
A
G
T
T
T
A
A
A
T
A
T
A
G
A
G
A
G
C
C
A
A
C
A
G
C
A
T
G
A
G
-
A
A
A
T
G
T
C
G
A
C
T
2
T
G
G
G
-
C
T
-
T
-
C
T
G
C
G
G
A
5
G
A
A
T
C
G
A
A
T
G
T
T
G
-
C
  14,910,804
  14,910,888
  14,911,172
  14,911,896
  14,911,906
  14,912,350
  14,912,383
  14,913,069
  14,913,171
  14,913,328
  14,913,490
  14,914,080
  14,916,071
  14,916,102
  14,916,104
  14,917,111
  14,917,122
  14,917,757
  14,918,143
  14,918,175
  14,919,498
  14,919,793
  14,920,264
  14,920,317
  14,920,915
  14,921,007
  14,921,631
  14,921,803
  14,921,808
  14,922,174
  14,922,181
  14,922,872
  14,923,881
  14,923,900
  14,925,591
  14,928,091
  14,928,310
  14,928,650
  14,929,750
  14,930,087
  14,930,907
  14,931,245
  14,931,314
  14,932,179
  14,932,465
  14,932,922
  14,933,724
  14,933,783
  14,934,271
  14,935,619
  14,935,864
  14,936,015
  14,936,105
  14,936,183
  14,936,398
  14,936,621
  14,937,005
  14,937,384
  14,937,466
  14,938,738
  14,940,029
  14,940,132
  14,940,421
  14,940,958
  14,941,823
  14,941,828
  14,942,463
  14,942,831
  14,942,851
  14,943,163
  14,944,644
  14,944,794
  14,944,856
  14,945,073
  14,945,471
  14,945,526
  14,946,277
  14,947,145
  14,947,147
  14,947,151
  14,947,192
  14,948,098
  14,948,342
  14,950,390
  14,950,825
  14,953,663
  14,954,728
  14,955,460
  14,955,469
  14,959,538
  14,960,196
  14,960,677
  14,960,687
  14,960,693
  14,960,798
  14,960,932
  14,961,150
  14,961,817
  14,961,981
  14,962,053
  14,962,055
  14,962,599
  14,962,689
  14,963,128
  14,963,397
  14,963,482
  14,963,515
  14,963,530
  14,963,542
  14,963,554
  14,963,630
  14,963,741
  14,963,754
  14,963,828
  14,963,850
  14,963,886
  14,963,944
  14,964,040
  14,964,050
  14,964,251
  14,964,483
  14,964,484
  14,964,495
  14,964,616
  14,965,170
  14,965,188
  14,965,221
  14,965,322
  14,965,323
  14,965,387
  14,965,816
  14,966,060
  14,966,847
  14,966,954
  14,966,976
  14,966,981
  14,967,033
  14,967,065
  14,967,085
  14,967,203
  14,967,233
  14,967,334
  14,967,394
  14,967,454
  14,967,910
  14,967,952
  14,968,346
  14,968,352
  14,968,420
  14,968,763
  14,968,800
  14,969,497
  14,969,598
  14,970,561
  14,970,948
  14,971,058
  14,971,233
  14,971,947
  14,972,371
  14,972,689
  14,973,027
  14,974,282
  14,975,004
  14,975,507
  14,975,953
  14,976,631
  14,977,155
  14,977,169
  14,977,188
  14,977,227
  14,977,238
  14,977,257
  14,977,628
  14,977,630
  14,977,645
  14,977,855
  14,979,978
  14,985,946
  14,986,496
  14,986,763
  14,989,189
  14,991,495
  14,991,529
  14,992,113
  14,993,283
  14,996,974
  14,998,598
  14,998,600
  14,999,051
  14,999,721
  15,000,963
  15,001,252
  15,001,434
  15,004,122
  15,004,420
  15,004,458
  15,004,546
  15,005,202
  15,005,370
  15,005,536
  15,005,653
  15,005,805
  15,005,855
  15,006,220
  15,006,296
  15,006,315
  15,006,367
  15,006,632
  15,007,064
  15,007,209
  15,007,781
  15,007,833
  15,007,955
  15,007,980
  15,008,240
  15,008,292
  15,008,755
  15,008,978
  15,009,121
  15,010,047
  15,010,056
  15,010,411
  15,010,492
  15,010,697
  15,010,743
  15,010,888
  15,011,181
  15,011,213
  15,011,566
  15,011,919
  15,012,438
  15,012,455
  15,013,561
  15,013,567
  15,013,769
  15,013,898
  15,014,189
  15,014,344
  15,015,348
  15,015,777
  15,015,942
  15,015,950
  15,015,972
  15,016,203
  15,016,335
  15,016,575
  15,017,122
  15,017,176
  15,017,451
  15,017,608
  15,017,794
  15,017,885
  15,018,436
  15,018,454
  15,018,635
  15,019,252
  15,019,331
  15,019,546
  15,020,961
  15,022,900
  15,022,981
  15,024,855
  15,026,966
  15,029,233
  15,029,397
  15,030,577
  15,030,672
  15,030,736
  15,030,740
  15,030,751
  15,030,756
  15,030,881
  15,030,882
  15,031,122
  15,031,292
  15,031,510
  15,031,544
  15,031,548
  15,031,799
  15,032,073
  15,032,623
  15,032,790
  15,032,833
  15,033,153
  15,033,205
  15,033,259
  15,033,538
  15,034,072
  15,035,342
  15,035,697
  15,036,416
  15,036,658
  15,037,154
T
T
C
A
C
-
A
A
4
G
A
G
T
C
C
T
C
A
T
C
C
G
A
A
A
A
C
-
-
G
C
C
T
A
T
C
T
C
C
A
A
A
-
T
T
C
C
2
A
G
T
-
A
C
C
A
T
T
G
T
G
C
C
C
C
G
A
G
A
T
T
G
C/T
G
T
T
A
-/T
-/T
-/T
G/T
C
C
T
T
T
A
T
C
T
-
A
-
4
G
T
-
-
G
A
4
A
G
T
T
A
C
A
G
T
-
A
A
T
T
G
T
A
A
A
G
T
A
G
T
A
T
A
C
-
3
A
C
A
C
C
-
T
T
C
C
G
A
G
G
T
A
T
G
T
C
T
A
C
C
G
G
G
T
A
A
2
T
G
C
G
A
-
-
A
C
G
C
C
A
T
-
A
C
C
C
T
2
C
C
A
T
T
-
G
-
T
A
-/G
C
G
A
C
A
T
C
A
A
C
A
G
T
7
A
G
G
T
T
T
A
G
C
G
A
C
G
C
G
G
G
C
T
A
G
A
G
A
C
A
T
T
G
-
T
G
A
T
G
C
A
T
A
2
G
G
C
C
C
C
T
A
G
T
G
2/-
A
-
A
A
4
T
C
T
C
2
G
C
C
T
A
A
T
-
A
G
G
A
-
C
G
G
C
A
C
C
A
T
T