Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 93,198 (bp)   Positions: 358
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
Map1b
T
-
A
T
T
T
G
T
T
-
G
G
A
G
C
C
C
C
C
T
G
3
T
C
T
A
C
G
-
C
G
4
T
A
A
A
T
G
A
16
T
C
C
G
T
A
G
A
T
C
T
A
C
C
G
G
A
C
G
A
G
T
T
G
G
-
T
G
T
C
-
C
T
G
T
C
A
A
-
C
C
C
C
C
G
C
C
G
T
G
-
G
T
T
G
C
T
A
T
C
-
G
T
G
T
C
G
T
4
C
T
T
G
T
4
4
G
A
G
-
-
T
T
T
A
T
-
C
T
A
A
A
C
A
T
A
C
G
T
C
A
G
3
G
C
T
C
G
A
C
T
C
-
C
C
C
G
T
A
A
4
C
A
C
115
-
A
A
T
C
C
C
G
C
A
T
T
C
C
-
C
G
T
A
C
C
G
A
T
G
G
A
A
T
C
G
G
G
G
G
G
A
T
A
T
A
T
C
G
G
G
-
A
T
A
C
T
2
G
T
G
-
-
-
T
A
C
101
G
C
G
A
C
C
A
T
T
G
A
T
-
T
T
2
A
T
C
A
T
C
C
C
G
C
T
G
C
A
A
-
T
A
G
T
A
T
G
A
A
C
T
A
A
A
-
A
T
T
T
G
-
T
T
-
2
A
T
A
T
T
C
T
-
T
C
T
G
G
A
C
T
A
G
2
A
2
G
G
3
C
-
G
C
A
-
T
A
G
C
15
G
T
G
-
7
T
T
2
T
C
C
A
C
G
C
C
A
-
-
T
A
A
A
G
C
A
A
G
A
C
A
G
G
A
2
6
18
C
  30,817,328
  30,817,701
  30,818,242
  30,819,184
  30,820,391
  30,820,392
  30,820,513
  30,821,124
  30,821,883
  30,821,961
  30,822,168
  30,822,175
  30,822,340
  30,822,363
  30,822,398
  30,822,668
  30,823,368
  30,824,408
  30,824,924
  30,825,053
  30,825,482
  30,828,120
  30,828,128
  30,829,302
  30,830,075
  30,832,113
  30,832,128
  30,833,098
  30,833,280
  30,833,385
  30,833,518
  30,833,573
  30,833,593
  30,833,617
  30,833,630
  30,833,739
  30,833,820
  30,833,861
  30,834,061
  30,834,182
  30,834,255
  30,834,323
  30,834,543
  30,834,908
  30,835,123
  30,835,146
  30,835,151
  30,835,758
  30,836,082
  30,836,581
  30,836,898
  30,837,068
  30,837,296
  30,837,972
  30,838,033
  30,838,325
  30,838,529
  30,839,162
  30,840,495
  30,840,529
  30,840,582
  30,840,594
  30,841,589
  30,842,482
  30,842,724
  30,842,765
  30,842,857
  30,842,898
  30,842,959
  30,843,104
  30,843,154
  30,843,593
  30,843,651
  30,843,654
  30,843,680
  30,843,763
  30,843,773
  30,843,805
  30,843,856
  30,843,878
  30,843,881
  30,843,883
  30,844,036
  30,844,044
  30,844,155
  30,844,509
  30,844,935
  30,844,990
  30,845,327
  30,845,554
  30,845,623
  30,845,840
  30,845,865
  30,845,868
  30,846,058
  30,846,443
  30,846,458
  30,846,653
  30,846,684
  30,847,394
  30,847,437
  30,848,016
  30,848,312
  30,848,342
  30,848,486
  30,849,149
  30,849,163
  30,849,202
  30,849,460
  30,849,525
  30,849,544
  30,849,652
  30,849,658
  30,849,943
  30,850,194
  30,850,248
  30,850,521
  30,850,746
  30,850,785
  30,850,897
  30,851,220
  30,851,294
  30,851,658
  30,851,811
  30,851,973
  30,852,033
  30,852,167
  30,852,168
  30,852,346
  30,852,625
  30,852,628
  30,852,719
  30,852,812
  30,853,003
  30,853,197
  30,853,366
  30,853,678
  30,853,824
  30,854,029
  30,854,100
  30,854,134
  30,854,259
  30,854,349
  30,854,350
  30,854,351
  30,854,415
  30,854,461
  30,854,465
  30,854,610
  30,854,833
  30,855,033
  30,855,335
  30,855,404
  30,855,752
  30,855,770
  30,855,791
  30,856,031
  30,856,448
  30,856,586
  30,856,740
  30,856,752
  30,856,814
  30,856,913
  30,856,924
  30,856,954
  30,857,096
  30,857,099
  30,857,101
  30,857,224
  30,857,408
  30,857,426
  30,857,478
  30,857,489
  30,857,693
  30,857,758
  30,857,768
  30,857,940
  30,857,951
  30,858,168
  30,858,194
  30,858,202
  30,858,227
  30,858,302
  30,858,311
  30,858,351
  30,858,377
  30,858,386
  30,858,402
  30,858,408
  30,858,585
  30,858,642
  30,858,846
  30,858,882
  30,859,168
  30,859,216
  30,859,383
  30,859,385
  30,859,387
  30,859,389
  30,859,391
  30,859,406
  30,859,439
  30,859,446
  30,859,462
  30,859,585
  30,859,595
  30,859,719
  30,859,871
  30,859,947
  30,859,957
  30,860,005
  30,860,040
  30,860,123
  30,860,131
  30,860,212
  30,860,542
  30,860,586
  30,860,816
  30,860,927
  30,861,426
  30,861,443
  30,862,974
  30,863,237
  30,863,238
  30,863,782
  30,863,857
  30,863,950
  30,864,344
  30,864,400
  30,864,444
  30,864,487
  30,864,509
  30,864,924
  30,865,310
  30,865,569
  30,865,654
  30,865,728
  30,866,081
  30,866,515
  30,866,819
  30,866,971
  30,866,984
  30,867,041
  30,867,060
  30,867,297
  30,867,680
  30,867,822
  30,867,891
  30,867,963
  30,868,062
  30,868,239
  30,868,299
  30,868,713
  30,868,886
  30,868,891
  30,868,892
  30,869,018
  30,869,028
  30,869,030
  30,869,103
  30,869,148
  30,869,376
  30,869,388
  30,869,420
  30,870,053
  30,870,343
  30,871,292
  30,872,009
  30,873,163
  30,873,208
  30,873,642
  30,873,901
  30,873,920
  30,873,945
  30,874,017
  30,874,060
  30,874,196
  30,874,241
  30,874,429
  30,874,668
  30,875,748
  30,875,984
  30,876,150
  30,876,340
  30,876,981
  30,877,027
  30,877,509
  30,878,076
  30,878,236
  30,878,357
  30,878,364
  30,878,394
  30,878,457
  30,879,080
  30,879,210
  30,880,894
  30,881,631
  30,881,726
  30,882,991
  30,883,016
  30,883,351
  30,883,357
  30,883,365
  30,884,694
  30,884,776
  30,884,854
  30,884,858
  30,885,068
  30,885,323
  30,885,325
  30,885,758
  30,886,591
  30,887,021
  30,887,836
  30,887,875
  30,888,319
  30,888,377
  30,890,385
  30,892,429
  30,892,431
  30,894,120
  30,894,321
  30,894,347
  30,895,104
  30,895,182
  30,895,904
  30,898,377
  30,898,725
  30,898,819
  30,899,845
  30,899,917
  30,900,298
  30,900,340
  30,900,676
  30,900,707
  30,900,843
  30,901,125
  30,901,228
  30,901,230
  30,901,653
  30,901,964
  30,902,170
  30,902,351
  30,903,174
  30,903,491
  30,903,719
  30,904,107
  30,905,040
  30,905,407
  30,908,710
  30,908,711
  30,908,996
  30,909,027
  30,909,132
  30,909,386
  30,909,402
  30,909,421
  30,910,332
-
T
T
A
G
A
A
C
C
G
T
A
G
C
T
T
T
T
T
C
A
-
C
A
C
G
T
C
A
T
A
-
C
C
G
T
A
T
G
-
A
T
A
A
A
C
A
C
C
T
C
G
T
A
A
A
G
T
T
G
A
C
-
A
A
18
C
T
G
T
A
G
-
A/T
C
T
G
G
G
A
-/T
T
T
T
A
T
T
A
C
A
A
A
A
-
C
T
C
G
C
T
T
T
C
A
-
T
C
-
-
T
C
-
A
C
-
-
A
G
A
T
2
A
-
C
G
C
T
T
C
G
C
G
A
G
C
C
T
A
C
-
G
A
-
-/A
T/-
C
T
A
G
T
C
T
4
T
G
T
A
G
G
G
-
T
G
A
-
G
G
G
C
A
A
T
A
T
G
C
C
G
T
T
T
T
C
C
A
T
A
G
A
A
A
G
G
C
T
-/A
-/A
-/A
A/-
-/A
-/A
C
A
G
C
G
C
A
A
A
A
T
G
A
C
T
C
-
A
G
A
T
3
13
C
G
G
-
-/A
-/G
T
C
G
T
G
G
A
A
G
A/C
G
C
C
-
G
C
G
G
G
T
T
T
T
T
C
T
T
T
G
A
C
G
A
C
C
C
C
G
G
T
G
-
G
G
G
C
G
C
C
C
C
G
C
11
-
G
A/G
G
C
C
T
C
T
C
G
G
A
A
T
T
C
G
A
-
G/-
-
A
A
-
-/A
3
A
T
G
6
C
G
A
-
-
A
-
T/-
T
-
C
C
-
C
G
T
G
A/-
T
G
T
G
4
4
G
G
G/6
G
A
A
G
G
A
G
G
G
C
A
C
-
-
-
G