Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 325,364 (bp)   Positions: 509
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LN/MavRrrcAek (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
Macf1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
A
A
C
T
A
C
A
T
-
T
A
-
9
C
A
T
T
T
A
A
-
A
C
C
T
-
T
T
T
C
G
G
C
T
C
G
G
-
G
3
G
T
A
2
T
C
G
A
C
-
-
A
G
-
A
C
T
T
3
C
A
4
-
A
-
A
C
T
C
G
A
C
-
C
A
3
C
A
T
G
T
C
-
-
T
G
C
A
-
G
C
C
G
T
C
G
G
A
G
-
-
G
A
T
-
T
G
-
C
6
T
A
-
C
C
C
4
A
A
C
A
C
C
G
G
G
G
T
C
T
G
A
C
T
G
G
G
G
A
C
A
G
A
T
A
C
T
C
T
A
T
G
T
T
C
T
A
5
C
T
A
G
3
G
2
G
T
A
C
G
A
A
A
C
G
-
T
T
A
2
-
-
A
G
T
C
T
18
G
G
-
A
C
G
A
G
G
C
G
G
G
A
C
C
G
T
G
-
A
C
C
G
T
C
A
C
C
G
C
G
C
A
T
C
4
A
T
-
C
G
T
-
A
T
A
A
C
C
-
A
A
T
C
A
C
C
-
T
C
A
G
T
G
A
T
C
C
A
-
A
C
A
G
C
A
T
C
T
T
C
G
-
-
G
A
G
A
T
A
G
C
G
C
T
A
T
A
T
C
T
A
A
G
C
T
G
A
C
A
G
G
C
T
A
T
C
A
A
T
C
T
G
G
3
G
-
-
G
C
C
G
C
A
A
G
4
-
C
A
108
G
A
C
-
G
-
-
A
T
G
T
T
A
G
A
T
G
A
C
-
G
G
T
A
G
C
G
8
T
T
A
G
2
T
A
C
A
G
T
T
C
A
C
A
T
-
A
C
T
G
T
4
T
G
C
T
A
C
A
T
A
G
T
G
A
T
T
-
T
A
T
G
G
C
C
T
G
T
T
T
A
G
T
3
C
G
A
G
C
-
C
G
G
A
G
A
T
T
3
T
G
T
4
A
G
A
A
G
12
G
A
A
A
G
A
A
A
T
A
-
A
C
8
T
C
2
C
G
G
C
G
2
C
G
35
A
A
T
T
T
T
T
T
2
-
G
T
A
T
G
T
T
A
-
C
T
T
C
-
C
C
C
T
T
T
C
T
A
A
A
G
-
T
A
T
A
-
  135,624,000
  135,625,006
  135,626,562
  135,627,342
  135,628,643
  135,631,288
  135,632,043
  135,636,765
  135,638,513
  135,638,853
  135,638,866
  135,638,918
  135,639,606
  135,644,076
  135,645,000
  135,645,274
  135,646,996
  135,647,357
  135,647,832
  135,648,810
  135,652,410
  135,655,934
  135,659,373
  135,661,349
  135,661,640
  135,662,338
  135,665,521
  135,665,603
  135,665,644
  135,665,695
  135,666,083
  135,666,392
  135,666,447
  135,667,402
  135,667,462
  135,667,508
  135,668,264
  135,668,633
  135,668,840
  135,668,918
  135,669,796
  135,669,911
  135,670,517
  135,670,820
  135,671,057
  135,671,099
  135,671,339
  135,671,793
  135,672,123
  135,672,498
  135,673,216
  135,673,995
  135,674,045
  135,674,089
  135,674,296
  135,674,473
  135,674,499
  135,674,515
  135,674,541
  135,674,813
  135,675,263
  135,675,980
  135,676,012
  135,676,371
  135,679,324
  135,680,755
  135,681,004
  135,682,971
  135,684,007
  135,686,524
  135,687,220
  135,688,347
  135,688,562
  135,688,847
  135,691,945
  135,691,975
  135,692,462
  135,692,761
  135,696,053
  135,696,130
  135,696,336
  135,696,523
  135,696,559
  135,697,989
  135,699,186
  135,701,483
  135,701,538
  135,701,641
  135,701,890
  135,702,437
  135,702,743
  135,704,289
  135,704,614
  135,706,317
  135,707,611
  135,708,026
  135,708,456
  135,708,564
  135,708,602
  135,709,801
  135,712,762
  135,712,984
  135,712,985
  135,713,518
  135,715,206
  135,715,729
  135,716,501
  135,716,593
  135,717,920
  135,718,746
  135,720,306
  135,720,431
  135,720,440
  135,720,526
  135,720,684
  135,721,454
  135,722,016
  135,722,387
  135,722,524
  135,722,723
  135,722,791
  135,722,806
  135,722,884
  135,722,889
  135,722,893
  135,722,909
  135,723,009
  135,723,178
  135,723,196
  135,723,407
  135,723,594
  135,724,185
  135,724,267
  135,724,933
  135,724,935
  135,725,164
  135,725,206
  135,725,249
  135,725,290
  135,725,665
  135,725,778
  135,726,490
  135,726,785
  135,726,884
  135,727,063
  135,727,352
  135,727,434
  135,727,743
  135,727,929
  135,728,636
  135,728,818
  135,728,870
  135,729,971
  135,731,079
  135,731,483
  135,734,703
  135,735,068
  135,735,327
  135,736,353
  135,736,452
  135,736,462
  135,736,713
  135,739,243
  135,740,904
  135,740,906
  135,740,908
  135,741,144
  135,741,153
  135,741,542
  135,742,687
  135,744,768
  135,747,673
  135,747,681
  135,750,234
  135,750,520
  135,751,087
  135,751,921
  135,754,459
  135,755,351
  135,755,752
  135,756,723
  135,758,034
  135,762,454
  135,762,718
  135,763,157
  135,764,088
  135,765,119
  135,765,124
  135,765,371
  135,765,432
  135,765,776
  135,767,362
  135,767,852
  135,771,661
  135,771,787
  135,773,368
  135,773,978
  135,774,238
  135,774,760
  135,776,680
  135,777,979
  135,781,091
  135,782,211
  135,782,332
  135,782,334
  135,782,895
  135,782,983
  135,783,033
  135,783,311
  135,783,351
  135,784,299
  135,784,703
  135,784,902
  135,785,032
  135,785,407
  135,785,506
  135,786,268
  135,786,623
  135,787,768
  135,788,727
  135,788,769
  135,789,548
  135,790,265
  135,790,733
  135,792,165
  135,792,172
  135,793,072
  135,794,282
  135,794,470
  135,794,486
  135,794,926
  135,795,000
  135,795,384
  135,796,004
  135,797,385
  135,798,334
  135,798,770
  135,799,142
  135,799,310
  135,799,322
  135,799,779
  135,799,825
  135,800,318
  135,800,776
  135,800,854
  135,801,078
  135,801,491
  135,803,002
  135,803,200
  135,803,287
  135,803,315
  135,803,549
  135,803,573
  135,804,237
  135,804,238
  135,804,604
  135,804,727
  135,805,412
  135,806,726
  135,807,169
  135,807,499
  135,807,510
  135,807,513
  135,807,514
  135,807,517
  135,807,529
  135,808,320
  135,808,337
  135,808,373
  135,808,499
  135,808,505
  135,808,514
  135,809,638
  135,809,641
  135,810,258
  135,811,410
  135,812,014
  135,812,053
  135,812,247
  135,812,455
  135,812,896
  135,812,972
  135,813,352
  135,813,354
  135,813,383
  135,813,997
  135,814,206
  135,814,227
  135,814,404
  135,814,495
  135,815,082
  135,815,085
  135,815,242
  135,815,255
  135,815,258
  135,815,266
  135,815,270
  135,815,274
  135,815,290
  135,815,635
  135,815,762
  135,815,778
  135,815,782
  135,816,470
  135,816,742
  135,817,070
  135,817,217
  135,817,346
  135,817,504
  135,817,505
  135,817,652
  135,817,834
  135,818,874
  135,819,437
  135,819,813
  135,819,915
  135,820,238
  135,820,277
  135,820,325
  135,820,447
  135,821,125
  135,821,228
  135,821,278
  135,821,462
  135,821,766
  135,821,844
  135,822,946
  135,823,390
  135,823,513
  135,823,698
  135,823,765
  135,823,925
  135,824,119
  135,824,129
  135,824,131
  135,824,260
  135,824,615
  135,825,004
  135,825,007
  135,825,936
  135,825,966
  135,826,124
  135,826,295
  135,826,321
  135,826,607
  135,827,431
  135,827,868
  135,827,901
  135,828,301
  135,828,844
  135,828,896
  135,829,165
  135,829,522
  135,829,551
  135,830,044
  135,830,046
  135,830,055
  135,833,282
  135,834,726
  135,835,036
  135,835,053
  135,835,798
  135,838,271
  135,838,350
  135,838,781
  135,839,336
  135,840,342
  135,840,474
  135,842,088
  135,842,093
  135,842,216
  135,842,910
  135,843,084
  135,843,138
  135,844,304
  135,844,462
  135,844,574
  135,844,871
  135,844,984
  135,845,050
  135,845,178
  135,845,221
  135,845,633
  135,846,038
  135,846,051
  135,846,411
  135,846,587
  135,846,883
  135,847,166
  135,847,178
  135,847,807
  135,847,900
  135,848,729
  135,848,943
  135,849,056
  135,849,871
  135,850,192
  135,851,076
  135,852,032
  135,855,136
  135,855,545
  135,856,114
  135,856,355
  135,856,380
  135,857,204
  135,857,209
  135,857,215
  135,857,275
  135,857,549
  135,860,613
  135,863,375
  135,866,909
  135,867,333
  135,867,771
  135,873,253
  135,873,359
  135,873,655
  135,874,169
  135,874,407
  135,875,217
  135,876,746
  135,879,727
  135,880,715
  135,880,945
  135,881,306
  135,881,413
  135,884,761
  135,886,195
  135,888,734
  135,888,746
  135,889,925
  135,890,509
  135,896,691
  135,897,708
  135,899,469
  135,899,495
  135,901,938
  135,902,022
  135,902,026
  135,904,564
  135,905,575
  135,906,440
  135,906,452
  135,907,056
  135,907,074
  135,907,884
  135,908,818
  135,916,712
  135,916,943
  135,917,006
  135,917,193
  135,917,998
  135,918,305
  135,920,240
  135,920,617
  135,921,162
  135,921,784
  135,922,385
  135,922,479
  135,922,593
  135,926,886
  135,927,088
  135,930,086
  135,930,307
  135,932,211
  135,933,854
  135,934,079
  135,934,164
  135,934,677
  135,934,909
  135,934,911
  135,934,913
  135,934,915
  135,935,559
  135,935,982
  135,936,143
  135,936,900
  135,937,526
  135,938,713
  135,939,568
  135,939,637
  135,939,963
  135,940,641
  135,940,924
  135,941,241
  135,941,540
  135,942,001
  135,942,187
  135,942,537
  135,942,758
  135,943,430
  135,943,432
  135,943,585
  135,943,710
  135,944,025
  135,944,028
  135,944,561
  135,944,903
  135,944,996
  135,945,013
  135,945,025
  135,945,055
  135,945,079
  135,945,279
  135,945,985
  135,946,960
  135,948,657
  135,948,674
  135,948,717
-
C
C
G
T
C
G
T
-
C
6
C
G
T
-
G
G
G
C
-/A
G
-
T
G
T
T
C
16
A
C
C
A
C
A
T
C
T
A
A
3
A
-
T
C
T
-
C
T
C
-
T
2
A
T
-
2
G
T
G
-
-
T
T
-
G
G
A
T
G
C
T
T
C
T
11
G
C
-
T
T
A
T
G
G
13
A
A
A
G
G
2
A
T
T
C
C
G
T
C
G
A
C
15
A
T
C
T
G
-
T
A
-
G
C
2
T
G
T
-
C
G
T
-
T
T
-
A
A
T
G
T
C
A
G
-
G
A
C
A
A
C
T
G
A
G
C
T
T
C
T
A
G
C
T
C
-
A
G
G
-
A
C
T
-
-
T/-
-
C
A
C
A
-
-
G
T
T
A
T
-
C
G
-
4
G
G
A
-
A
A
-
A
T
T
C
T
-/A
G
A
A
-
A
A
T
C
T
T
A
C
A
6
G
T
T
C
C
T
G
T
A
A
T
A
T
G
A
T
-
G
-/G
12
T
A
C
9
G
C
G
G
T
T
12
T
T
C
T
G
T
G
A
C
G
G
-
C
A
G
-
T
T
G
4
G
A
G
A
T
G
C
T
C
C
T
A
G
50
A
T
A
G
C
C
A
G
A
-
C
C
G
G
C
T
C
-/G
-/G
A
A
G/A
A
-/G
T
T
A/-
-/A
T
C
G
A
T
G
G
-
T
C
A
A
-
A
4
4
A
T
T
A
G
G
C/-
A
-
C
T
G
108/-
A
G
T
3
C
2
C
T
C
A
C
C
C
A
G
A
A
G
A
13
A
G/-
-/G
G
A
T
A
-
C
C
G
A
-
C
-
T
C
A
-
-
T
G
-/G
G
C
17
C
T
C
A
C
-
C
A
T
A
T
T
G
C
G
A
A
A
G
C
C
3
C
G
C
C
C
T
T/A
C
T
C
C
A
T
A
G
-
T
A
-
A
A
7
G
C
A
G
A
-
C
C/-
-
C
A
C
-
G
C
-/G
G/-
A
-
A
C
T/-
-/T
A
G
G/-
T
-/A
G
2
T
T
-
C
A
-
-/T
A
A
A
T
-
T
A
-
G
G
-/A
-/A
A
A
C
C
-
4
A
C
T
A
C
C
C
C
G
-
C
C
T
T
T
T
T
C
C
G
T
C
G
T
G
T
2
C
C
C
G
T