Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 45,026 (bp)   Positions: 424
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
LEXF10A/StmMcwi (2020) 
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
Kif9
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
G
C
C
A
G
T
A
A
A
T
C
G
A
A
T
T
T
C
A
G
A
T
T
C
A
G
G
C
T
G
A
T
G
G
G
C
C
G
C
-
10
G
-
4
T
G
A
T
G
T
G
4
T
-
-
T
108
G
G
-
-
T
T
T
G
C
C
A
G
A
A
T
T
6
G
A
C
C
T
C
C
A
A
G
T
C
C
C
T
G
C
4
A
-
A
A
C
2
A
G
T
A
C
100
C
T
T
A
A
2
-
C
A
A
T
A
A
-
A
C
T
G
T
G
T
T
G
G
A
A
T
G
T
-
-
2
T
A
-
A
C
C
A
T
T
T
T
C
A
A
C
T
A
C
T
G
G
A
A
A
C
A
G
2
T
G
T
G
T
T
C
T
T
C
A
T
C
C
T
T
G
G
G
T
2
G
T
A
C
G
A
C
C
G
A
C
A
G
G
C
-
T
C
G
C
C
A
G
G
C
-
T
A
C
A
-
A
A
G
4
G
A
A
G
A
A
T
3
3
A
-
T
G
T
-
T
C
G
A
T
A
C
C
G
-
G
A
G
C
G
C
C
A
4
A
G
T
T
T
T
3
-
T
C
T
C
C
T
-
G
G
T
G
T
G
A
T
3
3
T
T
C
G
T
C
A
C
C
C
C
-
A
G
A
C
T
-
T
A
A
C
A
T
G
C
A
A
-
T
C
A
C
G
T
G
T
G
G
A
-
C
C
A
T
C
T
G
C
C
-
-
G
C
-
-
G
C
C
G
C
2
G
C
G
C
A
C
C
C
-
-
A
C
G
C
C
C
-
A
T
A
T
T
C
-
A
A
A
T
T
T
T
C
C
A
C
G
-
G
C
4
C
T
C
C
T
T
5
C
C
G
G
A
T
T
11
C
T
T
G
A
T
G
C
3
-
C
C
-
C
C
C
C
C
A
A
A
C
A
T
T
A
  110,459,478
  110,459,621
  110,459,939
  110,460,002
  110,460,245
  110,460,347
  110,460,405
  110,460,963
  110,461,055
  110,461,463
  110,461,733
  110,462,046
  110,462,451
  110,462,476
  110,462,526
  110,462,679
  110,462,780
  110,462,807
  110,462,838
  110,463,001
  110,463,121
  110,463,155
  110,463,262
  110,463,282
  110,463,627
  110,463,772
  110,463,776
  110,463,978
  110,464,097
  110,464,520
  110,464,633
  110,464,960
  110,464,969
  110,465,179
  110,465,326
  110,465,338
  110,465,573
  110,465,635
  110,465,763
  110,465,795
  110,466,078
  110,466,150
  110,466,240
  110,466,411
  110,466,439
  110,466,487
  110,466,583
  110,466,702
  110,466,710
  110,466,805
  110,466,806
  110,466,921
  110,467,290
  110,467,315
  110,467,515
  110,467,601
  110,467,622
  110,467,648
  110,467,718
  110,467,752
  110,467,894
  110,467,924
  110,467,925
  110,467,928
  110,467,960
  110,468,036
  110,468,039
  110,468,043
  110,468,356
  110,468,420
  110,468,443
  110,468,553
  110,468,715
  110,468,738
  110,468,935
  110,469,108
  110,469,125
  110,469,197
  110,469,378
  110,469,523
  110,469,700
  110,469,754
  110,469,786
  110,469,792
  110,470,207
  110,470,660
  110,471,037
  110,471,498
  110,471,596
  110,471,672
  110,471,700
  110,471,755
  110,471,785
  110,471,842
  110,471,918
  110,472,524
  110,473,257
  110,473,490
  110,473,582
  110,473,591
  110,473,637
  110,473,649
  110,474,165
  110,474,470
  110,474,923
  110,474,958
  110,475,093
  110,475,174
  110,475,290
  110,475,306
  110,475,347
  110,475,386
  110,475,403
  110,475,492
  110,475,504
  110,475,530
  110,475,543
  110,475,585
  110,475,613
  110,475,615
  110,475,726
  110,476,211
  110,476,393
  110,476,415
  110,476,430
  110,476,714
  110,476,764
  110,477,044
  110,477,072
  110,477,258
  110,477,651
  110,478,045
  110,478,094
  110,478,390
  110,478,435
  110,478,707
  110,478,713
  110,478,715
  110,478,990
  110,479,025
  110,479,045
  110,479,087
  110,479,355
  110,479,391
  110,479,666
  110,479,866
  110,479,887
  110,480,130
  110,480,496
  110,480,546
  110,480,609
  110,480,695
  110,480,890
  110,481,070
  110,481,191
  110,481,320
  110,481,523
  110,481,622
  110,481,641
  110,481,729
  110,481,799
  110,481,870
  110,481,952
  110,481,973
  110,482,101
  110,482,402
  110,482,538
  110,482,742
  110,482,862
  110,483,102
  110,483,114
  110,483,313
  110,483,329
  110,483,337
  110,483,393
  110,483,419
  110,483,437
  110,483,439
  110,483,765
  110,483,767
  110,483,919
  110,483,943
  110,484,031
  110,484,035
  110,484,081
  110,484,084
  110,484,089
  110,484,111
  110,484,146
  110,484,165
  110,484,349
  110,484,467
  110,484,493
  110,484,615
  110,484,617
  110,484,632
  110,484,713
  110,484,930
  110,484,944
  110,484,960
  110,485,199
  110,485,323
  110,485,345
  110,485,354
  110,485,492
  110,485,737
  110,485,926
  110,485,964
  110,485,978
  110,486,073
  110,486,286
  110,486,333
  110,486,519
  110,486,523
  110,486,677
  110,486,689
  110,486,741
  110,486,749
  110,487,060
  110,487,076
  110,487,092
  110,487,095
  110,487,098
  110,487,217
  110,487,238
  110,487,403
  110,487,739
  110,487,760
  110,487,811
  110,487,825
  110,487,830
  110,487,834
  110,487,837
  110,487,861
  110,487,875
  110,487,995
  110,488,047
  110,488,077
  110,488,087
  110,488,191
  110,488,278
  110,488,334
  110,488,494
  110,488,499
  110,488,823
  110,488,963
  110,489,083
  110,489,149
  110,489,469
  110,490,152
  110,490,260
  110,490,411
  110,490,727
  110,490,757
  110,491,011
  110,491,106
  110,491,151
  110,491,173
  110,491,181
  110,491,299
  110,491,303
  110,491,321
  110,491,359
  110,491,364
  110,491,373
  110,491,401
  110,491,403
  110,491,663
  110,491,825
  110,492,085
  110,492,197
  110,492,210
  110,492,362
  110,492,482
  110,492,838
  110,492,847
  110,492,859
  110,492,939
  110,492,942
  110,493,034
  110,493,054
  110,493,210
  110,493,296
  110,493,427
  110,493,468
  110,493,520
  110,493,544
  110,493,559
  110,493,570
  110,493,572
  110,493,574
  110,493,591
  110,493,735
  110,494,116
  110,494,142
  110,494,158
  110,494,207
  110,494,333
  110,494,390
  110,494,398
  110,494,472
  110,494,554
  110,494,558
  110,494,653
  110,494,663
  110,494,694
  110,494,740
  110,494,842
  110,495,009
  110,495,085
  110,495,093
  110,495,190
  110,495,240
  110,495,527
  110,495,617
  110,495,650
  110,495,719
  110,495,788
  110,495,999
  110,496,058
  110,496,345
  110,496,624
  110,496,813
  110,496,834
  110,496,895
  110,497,032
  110,497,336
  110,497,350
  110,497,392
  110,497,421
  110,497,423
  110,497,454
  110,497,455
  110,497,457
  110,497,459
  110,497,548
  110,497,560
  110,497,601
  110,497,649
  110,497,658
  110,497,690
  110,497,705
  110,497,714
  110,497,718
  110,497,721
  110,497,727
  110,497,728
  110,497,731
  110,497,733
  110,497,737
  110,497,740
  110,497,758
  110,497,862
  110,497,960
  110,497,983
  110,497,993
  110,498,003
  110,498,153
  110,498,279
  110,498,411
  110,498,486
  110,498,580
  110,498,712
  110,498,903
  110,499,023
  110,499,190
  110,499,198
  110,499,298
  110,499,301
  110,499,334
  110,499,365
  110,499,555
  110,499,650
  110,499,789
  110,499,923
  110,499,930
  110,499,974
  110,500,024
  110,500,067
  110,500,204
  110,500,243
  110,500,245
  110,500,397
  110,500,565
  110,500,882
  110,500,950
  110,501,126
  110,501,138
  110,501,153
  110,501,263
  110,501,344
  110,501,420
  110,501,458
  110,501,591
  110,501,774
  110,501,780
  110,502,000
  110,502,065
  110,502,617
  110,502,703
  110,502,917
  110,503,090
  110,503,262
  110,503,294
  110,503,329
  110,503,343
  110,503,407
  110,503,416
  110,503,417
  110,503,419
  110,503,421
  110,503,459
  110,503,497
  110,503,625
  110,503,635
  110,503,698
  110,503,788
  110,503,863
  110,503,936
  110,503,995
  110,503,996
  110,504,011
  110,504,317
  110,504,391
T
G
T
A
T
T
A
C
G
T
C
C
T
A
G
G
-
C
C
T
G
C
C
G
A
G
G
C
A
T
-
A
G
C
-/A
-/A
C
T
G
-
A
2
-
A
T
-
C
C
C
C
A
C
A
-
C
2
T
C
-
A/-
A
2
6
C
C
A
A
T
T
G
A
?
T
G
C
-
A
G
T
A
C
T
G
T
G
A
A
T
T
T
-
T
T
-
G
2
C
G
G
-
G
A/-
G
G
T
-
T
C
C
G
C
-
4
T
C
G
C
G
G
G
G
T
C
A
C
A
C
C
A
C
G
C
C
T
C
G
A
-
C
C
T
C
T
A
G
C
C
C
C
-
G
T
A
C
C
T
C
A
A
C
G
C
T
G
A
-
C
A
G
A
C
C
A
C
C
A
C
-
T
T
G
C
-/A
-/A
A
C
-
A
C
C
G
A
G
T
T
A
G
G
G
T
C
T
C
G
A
C
T
T
T
A
A
T
5
C
G
T
G
23
G
-
-
-
-/A
G
G
C
G
G
G
-
-
G
2
C
-
-
G
G
-
A
G
C
G
T
T
T
T
T
C
T
A
A
T
T
G
-
G
A
C
C
G
C
-
C
C
T
C
T
T
A
-/6
A
A
C
A
G
A
T
C
-
-
A
G
A
A
C
T
G
T
T
T
G
7
G
A
G
T
A
G
G
C
G
T
G
G
A
T
G
-/G
A
C
T
T
T
T
C
A
G
A
A
T
A
-
A
G
C
A
G
C
-
-
6
2
-
T
T
6
A
T
T
A
A
-
T
-
A
T
T
A
T
T
29
17
G
T
A
T
G
T
5
G
C
T
C
G
A
G
G
G
G
C
A
G
C
A
T
-
T
A
C
A
A
-
G
G
T
T
C
G
-
T
T
A
T
G
A
G
-
T
C
C
A
C
C
C
T
-
19
G
-
6
T
T
G
G
T
G
G
G
T
G
C
C
G