Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 279,503 (bp)   Positions: 651
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
F344/N (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
LOC120101718
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
Kif16b
A
A
G
A
G
C
A
C
A
A
-
C
3
C
A
G
T
A
T
T
-
A
T
C
C
-
-
T
111
C
T
T
C
C
C
A
C
A
A
T
A
C
T
C
G
C
T
A
C
G
T
A
C
G
A
G
T
G
T
T
2
A
A
C
G
C
T
A
-
T
T
A
G
A
C
A
G
A
A
A
A
T
T
G
-
G
A
T
T
C
G
T
3
-
G
T
T
A
G
A
G
A
A
G
G
G
2
C
3
A
A
T
C
A
G
2
A
T
G
A
A
C
G
C
G
C
G
T
C
-
A
C
A
C
C
C
T
T
C
T
C
T
C
C
A
C
T
T
G
T
T
A
C
A
C
G
-
T
A
C
G
A
A
G
C
A
-
C
T
G
C
T
-
A
A
A
T
A
G
T
C
G
C
T
C
A
T
T
T
C
A
A
T
C
A
-
-
T
A
T
A
T
G
A
A
A
G
T
A
T
-
T
A
G
-
G
12
A
A
C
C
A
14
A
C
G
A
G
C
G
C
9
T
C
G
A
A
G
A
G
T
T
G
C
C
G
C
G
C
C
G
A
G
C
T
A
C
A
G
G
C
G
C
A
T
G
T
C
A
T
C
C
T
T
T
T
-
A
4
T
T
A
T
C
T
A
T
T
G
G
T
C
C
T
C
T
C
C
T
A
A
G
C
A
T
G
G
G
A
G
A
G
T
G
A
A
3
G
T
A
A
T
C
A
G
-
G
G
C
-
A
T
-
A
-
G
T
G
A
60
A
C
G
A
T
T
G
2
C
C
C
T
T
C
G
A
G
A
A
A
A
A
C
T
G
A
A
-
T
T
C
T
T
-
G
-
2
T
T
T
T
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
T
14
A
G
C
T
T
T
C
-
G
A
G
T
T
-
A
C
A
G
T
A
G
T
G
C
G
C
T
T
C
G
-
T
A
A
T
C
T
G
A
T
T
A
T
G
G
-
T
A
C
C
A
A
A
C
T
T
T
T
G
C
A
T
T
G
C
G
C
-
G
A
T
T
A
C
C
G
A
A
G
G
T
T
C
A
A
A
A
A
A
T
-
A
-
T
A
G
T
C
G
G
A
T
A
G
G
A
-
G
C
G
A
G
C
A
G
C
C
T
A
C
A
A
A
A
C
C
T
G
T
A
C
T
C
T
T
A
A
G
G
A
C
T
8
G
A
C
G
A
T
C
T
T
C
C
C
T
T
T
T
T
A
T
A
C
A
-
A
C
C
-
A
T
G
T
-
A
C
C
C
G
G
-
G
C
A
G
G
C
A
T
G
T
C
C
-
T
T
T
G
G
G
A
A
A
T
T
A
G
A
T
C
G
T
3
-
T
C
11
A
G
T
G
G
G
G
G
3
G
T
T
G
A
A
T
G
C
A
G
8
4
G
T
G
G
G
-
6
C
A
C
A
-
T
C
C
C
T
  129,974,978
  129,975,092
  129,975,712
  129,975,894
  129,976,288
  129,978,309
  129,979,449
  129,979,992
  129,980,372
  129,980,760
  129,980,787
  129,980,838
  129,981,152
  129,981,342
  129,981,675
  129,981,735
  129,982,133
  129,982,596
  129,982,698
  129,982,863
  129,983,209
  129,983,480
  129,983,535
  129,983,578
  129,983,586
  129,983,913
  129,983,916
  129,983,974
  129,983,995
  129,984,237
  129,984,934
  129,984,998
  129,985,127
  129,985,612
  129,985,618
  129,986,108
  129,986,145
  129,986,596
  129,986,660
  129,986,726
  129,986,953
  129,987,231
  129,987,571
  129,987,690
  129,988,613
  129,988,659
  129,989,007
  129,989,077
  129,989,216
  129,990,146
  129,991,121
  129,991,178
  129,991,530
  129,991,798
  129,992,293
  129,992,301
  129,992,957
  129,992,965
  129,993,028
  129,993,030
  129,993,034
  129,993,923
  129,994,484
  129,994,509
  129,994,685
  129,994,766
  129,994,868
  129,994,910
  129,995,253
  129,995,514
  129,995,730
  129,995,861
  129,996,330
  129,996,335
  129,996,423
  129,996,837
  129,996,851
  129,997,278
  129,997,280
  129,997,290
  129,997,292
  129,997,390
  129,997,488
  129,997,504
  129,997,618
  129,997,631
  129,997,728
  129,997,814
  129,997,830
  129,998,119
  129,998,143
  129,998,469
  129,998,900
  129,999,773
  129,999,839
  130,000,279
  130,000,305
  130,000,452
  130,000,903
  130,000,969
  130,001,447
  130,001,889
  130,002,506
  130,002,624
  130,002,628
  130,002,634
  130,002,656
  130,002,728
  130,002,851
  130,003,154
  130,003,660
  130,003,822
  130,003,823
  130,004,614
  130,004,922
  130,005,191
  130,005,209
  130,005,960
  130,006,507
  130,006,737
  130,006,936
  130,009,130
  130,010,117
  130,010,946
  130,010,982
  130,011,389
  130,011,401
  130,011,461
  130,011,946
  130,012,688
  130,013,286
  130,013,996
  130,014,086
  130,014,345
  130,015,289
  130,016,428
  130,017,001
  130,018,573
  130,018,574
  130,018,577
  130,018,578
  130,018,581
  130,018,582
  130,019,529
  130,019,782
  130,020,263
  130,020,328
  130,020,486
  130,020,752
  130,020,948
  130,021,224
  130,021,338
  130,021,422
  130,022,470
  130,022,850
  130,023,083
  130,023,267
  130,023,317
  130,023,395
  130,023,757
  130,023,886
  130,024,270
  130,024,311
  130,024,699
  130,024,750
  130,024,855
  130,024,879
  130,025,012
  130,025,013
  130,025,104
  130,025,218
  130,025,259
  130,025,511
  130,026,268
  130,027,456
  130,028,250
  130,028,847
  130,029,377
  130,029,461
  130,030,248
  130,030,685
  130,031,601
  130,031,730
  130,032,360
  130,032,449
  130,032,498
  130,033,022
  130,034,085
  130,034,327
  130,034,455
  130,034,822
  130,035,059
  130,035,121
  130,035,714
  130,035,968
  130,036,051
  130,038,669
  130,038,985
  130,039,074
  130,039,521
  130,039,752
  130,039,759
  130,039,767
  130,039,769
  130,039,776
  130,039,781
  130,039,784
  130,039,796
  130,039,925
  130,040,755
  130,041,791
  130,042,311
  130,042,884
  130,043,028
  130,043,817
  130,044,337
  130,045,368
  130,046,545
  130,046,679
  130,047,538
  130,048,236
  130,049,071
  130,049,082
  130,049,094
  130,049,290
  130,049,538
  130,050,502
  130,050,872
  130,051,321
  130,051,685
  130,051,770
  130,052,256
  130,052,561
  130,053,862
  130,054,645
  130,054,651
  130,055,292
  130,056,408
  130,057,144
  130,057,497
  130,058,334
  130,058,908
  130,059,431
  130,061,253
  130,062,015
  130,062,043
  130,062,142
  130,064,153
  130,064,370
  130,064,418
  130,064,827
  130,066,377
  130,066,926
  130,066,980
  130,067,080
  130,067,348
  130,067,479
  130,068,519
  130,069,797
  130,070,060
  130,070,921
  130,070,968
  130,071,048
  130,071,321
  130,071,582
  130,072,362
  130,073,050
  130,073,076
  130,074,248
  130,074,453
  130,076,276
  130,076,296
  130,076,315
  130,076,368
  130,077,092
  130,077,766
  130,078,005
  130,078,287
  130,078,329
  130,078,333
  130,079,157
  130,079,209
  130,079,787
  130,080,353
  130,080,567
  130,081,348
  130,081,381
  130,082,508
  130,082,703
  130,082,892
  130,085,158
  130,085,672
  130,087,006
  130,087,728
  130,089,013
  130,089,095
  130,089,959
  130,090,979
  130,093,518
  130,093,522
  130,094,560
  130,095,380
  130,095,590
  130,095,613
  130,095,625
  130,096,472
  130,096,507
  130,096,515
  130,096,735
  130,097,289
  130,097,819
  130,099,266
  130,099,451
  130,099,705
  130,100,276
  130,100,681
  130,101,341
  130,101,749
  130,102,099
  130,104,020
  130,104,319
  130,105,434
  130,106,588
  130,107,729
  130,107,844
  130,107,919
  130,110,140
  130,110,161
  130,110,220
  130,111,143
  130,111,950
  130,112,754
  130,113,958
  130,114,718
  130,115,068
  130,115,305
  130,115,643
  130,116,064
  130,116,497
  130,116,642
  130,116,965
  130,117,233
  130,117,464
  130,120,742
  130,120,997
  130,120,998
  130,121,500
  130,121,863
  130,121,876
  130,121,878
  130,121,880
  130,123,437
  130,124,109
  130,124,498
  130,125,809
  130,126,088
  130,126,154
  130,126,244
  130,126,315
  130,128,096
  130,128,098
  130,128,100
  130,128,310
  130,128,356
  130,128,726
  130,128,966
  130,129,297
  130,129,322
  130,129,551
  130,130,723
  130,131,557
  130,131,560
  130,131,693
  130,131,828
  130,131,882
  130,133,800
  130,133,808
  130,133,809
  130,133,813
  130,133,821
  130,134,560
  130,134,998
  130,135,630
  130,135,632
  130,135,634
  130,135,636
  130,135,638
  130,135,640
  130,135,642
  130,135,644
  130,135,646
  130,135,648
  130,136,716
  130,137,477
  130,137,921
  130,138,387
  130,139,359
  130,139,393
  130,139,826
  130,140,229
  130,140,384
  130,140,535
  130,140,541
  130,141,052
  130,141,094
  130,141,297
  130,141,854
  130,142,423
  130,142,747
  130,150,402
  130,150,753
  130,150,812
  130,151,154
  130,151,409
  130,151,619
  130,151,906
  130,152,250
  130,153,849
  130,154,334
  130,154,429
  130,154,511
  130,154,955
  130,155,387
  130,155,559
  130,156,517
  130,156,962
  130,157,104
  130,158,816
  130,158,873
  130,159,095
  130,159,140
  130,159,410
  130,160,303
  130,160,347
  130,160,749
  130,161,833
  130,162,880
  130,162,931
  130,163,093
  130,163,122
  130,163,357
  130,164,344
  130,164,415
  130,164,730
  130,165,110
  130,165,437
  130,165,734
  130,166,111
  130,166,376
  130,167,501
  130,167,527
  130,167,968
  130,168,326
  130,168,752
  130,169,279
  130,169,358
  130,169,395
  130,169,934
  130,170,782
  130,170,820
  130,171,201
  130,172,702
  130,173,724
  130,173,978
  130,174,220
  130,174,446
  130,174,799
  130,175,057
  130,175,958
  130,176,049
  130,177,339
  130,177,398
  130,177,543
  130,177,852
  130,177,995
  130,178,008
  130,178,012
  130,178,142
  130,178,227
  130,178,331
  130,179,025
  130,179,315
  130,179,523
  130,180,658
  130,181,070
  130,181,284
  130,181,722
  130,181,792
  130,182,332
  130,183,084
  130,183,419
  130,183,652
  130,183,977
  130,184,819
  130,184,847
  130,185,129
  130,185,338
  130,185,891
  130,186,087
  130,186,108
  130,187,790
  130,187,802
  130,188,030
  130,188,530
  130,188,547
  130,188,723
  130,189,414
  130,189,519
  130,191,324
  130,192,154
  130,192,347
  130,192,451
  130,192,518
  130,192,619
  130,192,684
  130,193,623
  130,194,075
  130,194,421
  130,194,973
  130,195,112
  130,195,379
  130,195,686
  130,195,964
  130,197,787
  130,198,674
  130,199,128
  130,201,218
  130,202,236
  130,203,322
  130,203,616
  130,204,548
  130,204,774
  130,205,427
  130,206,184
  130,206,613
  130,207,506
  130,207,631
  130,207,687
  130,208,419
  130,209,320
  130,209,437
  130,209,760
  130,209,927
  130,210,696
  130,210,846
  130,210,861
  130,211,133
  130,211,654
  130,212,788
  130,212,953
  130,212,955
  130,212,957
  130,212,959
  130,213,707
  130,214,068
  130,214,597
  130,214,659
  130,215,233
  130,216,428
  130,216,469
  130,216,655
  130,216,934
  130,217,657
  130,218,260
  130,219,291
  130,219,624
  130,219,652
  130,219,831
  130,219,855
  130,219,909
  130,220,256
  130,220,432
  130,220,513
  130,221,248
  130,221,432
  130,222,553
  130,222,796
  130,223,491
  130,224,513
  130,225,003
  130,225,129
  130,225,488
  130,227,321
  130,227,823
  130,228,048
  130,228,775
  130,229,529
  130,229,815
  130,230,029
  130,230,221
  130,230,227
  130,230,246
  130,230,350
  130,230,950
  130,231,095
  130,231,999
  130,232,005
  130,232,022
  130,232,332
  130,232,493
  130,232,980
  130,233,934
  130,234,900
  130,235,354
  130,235,934
  130,236,424
  130,236,425
  130,236,427
  130,236,434
  130,236,459
  130,237,266
  130,237,960
  130,238,174
  130,238,253
  130,238,518
  130,239,191
  130,239,283
  130,239,884
  130,240,187
  130,240,217
  130,240,324
  130,240,851
  130,241,194
  130,242,161
  130,242,405
  130,242,407
  130,242,652
  130,242,783
  130,243,156
  130,243,220
  130,243,863
  130,244,506
  130,244,677
  130,244,724
  130,244,913
  130,245,377
  130,245,609
  130,245,710
  130,245,843
  130,247,094
  130,248,345
  130,249,772
  130,249,852
  130,250,095
  130,250,158
  130,251,043
  130,252,433
  130,252,643
  130,253,029
  130,253,477
  130,253,728
G
G
A
C
A
T
G
T
G
G
3
T
-
T
C
A
C
G
C
G
8
G
-
G
G
C
3
G
-
T
C
C
T
A
T
G
A
G
G
C
G
A
C
T
A
T
G
G
T
A
C
G
T
A
G
A
G
A
A
C/4
-
G
-/C
T
A
T
G
G
3
A
G
G
C
G
T
G
A
T
T
T/-
T/-
C
C
C
4
T
G
C
G
T
T
C
-
2
A
C
C
G
T
G
C
G
C
-/C
C/-
C
-
T
-
T
T
C
A
G
A
-
T
A
A
G
T
T
A
T
A
T
T
-
T
A
G
T
T
T
T
T
C
G
A
G
A
G
A
T
-/T
T
C
A
C
C
C
G
T
G
G
T
C
C
G
T
A
T
G
A
T
G
8
T
C
C
T
C
A
G
G
-/G
C
G
A
C
T
A
T
C
T
G
C
C
A
T
G
G
A
T
G
T
19
G
G
C
A/G
T/A
G/T
A/T
A/T
A/G
G/A
T/G
G
C
A
C
G
A
T
A
-
G
G
A
T
-
-
-/G
T
-/C
G
A
T
A
G
-
A
T
A
C
G
A
C
A
C
G
A
-
T
T
T
A
T
T
A
G
T
T
A
G
T
G
A
A
T
C
T
G
A
T
C
T
C
C
G
T
C
C
C
C
24
T
-
G
C
C
C
G
C
-
A
G
T
A
C
T
G
G
T
C
A
T
G
G
G
C
T
C
C
-
A
A
C
A
G
C
C
T
G
G
-
A
A
G
G
C
T
G
C
A
A
A
T
39
T
C
A
G
2
A
C
C
C
-
G
A
T
G
A
A
C
-
-/T
-/T
T/-
-
C
A
T
G
C
C
C
T
T
T
T
C
T
C
G
T
G
A
T
A
-
2
A
2
-
-/G
G
G
-
A
C/-
-/C
-/C
-/C
-/C
-/C
-/C
-/C
C/-
C
C
-
G
A
T
A
C
A
T
A
A
G
A
C
C
A
T
A
G
A
-/A
-
C
A
A
G
A
A
C
C
T
A
A
G
G
G
C
T
C
A
C
G
C
G
C
A
A
2
C
G
A
A
G
G
G
T
C
C
C
A
A
-
G
C
C
A
T
A
G
A
T
T
C
G
G
A
T
A
G
-
A
A
C
C
A
G
G
G
G
G
G
C
A
G
7
C
G
A
A
T
C
A
G
-
G
A
A
G
8
A
T
T
C
A
G
G
A
A
T
C
G
G
G
T
G
-
T
T
C
A
C
T
-
C
T
A
-
T
G
A
A
G
T
C
-
C
C
T
A
G
C
T
C
C
T
T
A
A/-
A/-
A/-
A/-
C
G
C
G
T
G
T
G
T
A
27
G
C
A
C
2
C
G
T
T
C
A
3
A
T
G
A
T
T
G
C
A
C
T
T
4
C
C
G
C
A
A
-
G
-
C
C
G
A
G
A
-
C
C
-
2
C
T
-
T
C
C
A
A
T
A
A/-
-
A
C
G
A
-
G
C
A
T
G
T
-
-
A
C
A
A
A
5
-
T
G
G
G
16
C
T
T
T
C