Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,504,758 (bp)   Positions: 632
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Envl-ps10
--
--
--
--
--
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
A
C
G
T
2
-
T
T
A
C
2
G
T
-
A
C
C
T
G
T
A
4
G
A
A
G
T
A
T
T
C
C
-
C
A
A
C
A
T
T
C
G
T
C
T
A
A
-
C
C
A
A
A
A
A
G
C
C
T
G
-
C
T
A
A
-
G
G
C
A
T
C
A
G
T
C
-
C
T
T
T
G
T
-
C
G
A
G
T
-
C
G
C
A
G
A
T
C
G
T
G
G
T
-
A
T
T
T
G
A
C
C
G
-
A
A
T
G
G
G
T
A
T
-
C
T
T
A
T
A
A
G
A
T
T
G
G
-
C
T
G
T
T
-
T
C
21
G
-
A
C
T
-
G
G
3
G
A
A
G
G
-
G
C
12
A
A
A
A
A
A
A
A
T
-
-
-
T
-
2
-
G
A
7
G
T
-
-
-
A
C
C
C
A
A
G
C
A
G
C
A
T
T
C
C
A
T
G
G
T
T
A
A
A
T
A
-
T
T
3
G
C
C
T
C
A
-
A
A
T
-
G
G
C
C
A
C
A
-
-
T
T
C
T
-
-
A
A
G
5
A
T
C
G
C
T
C
3
2
A
-
T
T
C
A
C
A
T
A
G
A
-
A
A
A
C
G
A
T
A
T
G
A
-
A
C
C
A
A
G
T
C
-
G
T
T
A
C
2
T
A
T
-
G
-
T
T
C
T
G
A
T
G
A
T
T
T
T
A
A
G
C
C
A
C
T
G
C
G
T
-
G
G
A
A
-
T
C
G
T
C
T
C
-
A
T
-
G
G
18
T
A
G
2
A
G
A
C
T
G
A
G
-
-
A
G
T
A
T
T
A
A
C
G
G
C
-
G
T
A
G
A
A
C
C
T
G
C
C
C
A
G
T
T
C
T
G
A
A
A
A
T
-
T
G
A
2
G
C
A
4
4
A
C
A
C
A
T
G
T
A
C
A
C
G
T
C
-
2
A
A
T
G
T
A
-
A
T
A
G
T
2
T
G
A
C
-
G
A
A
C
C
-
T
A
2
C
C
-
T
-
C
-
-
-
G
T
C
-
A
C
-
-
-
A
A
A
C
A
A
2
C
-
T
C
12
G
G
T
C
C
A
-
-
G
G
T
A
C
A
-
C
-
A
T
T
T
A
A
2
C
C
-
T
T
2
-
A
G
G
G
T
C
A
-
G
T
T
T
G
G
C
A
A
C
A
A
C
A
A
C
C
C
G
G
G
A
A
-
A
C
T
T
G
T
-
G
T
C
T
G
T
C
-
C
A
C
A
G
A
T
G
C
A
G
T
2
G
C
C
A
-
C
C
C
4
T
T
C
C
C
T
-
G
T
C
T
G
G
A
A
A
-
G
C
A
A
C
C
T
T
T
-
G
C
T
-
A
4
-
A
G
G
G
A
T
A
G
-
G
T
-
  51,409,141
  51,409,222
  51,478,742
  51,501,278
  51,536,882
  51,635,322
  51,821,327
  51,943,107
  51,943,472
  51,946,097
  52,014,193
  52,115,960
  52,118,419
  52,118,662
  52,118,665
  52,120,549
  52,123,987
  52,126,672
  52,126,674
  52,126,836
  52,127,126
  52,129,444
  52,130,873
  52,132,078
  52,133,640
  52,133,781
  52,134,368
  52,134,727
  52,135,935
  52,137,002
  52,137,503
  52,138,646
  52,139,428
  52,139,507
  52,139,962
  52,140,383
  52,143,174
  52,146,530
  52,148,289
  52,149,603
  52,149,630
  52,149,743
  52,150,373
  52,150,994
  52,151,492
  52,151,759
  52,152,221
  52,152,610
  52,152,858
  52,153,212
  52,154,093
  52,154,612
  52,155,328
  52,157,040
  52,157,197
  52,157,232
  52,158,135
  52,160,665
  52,161,784
  52,162,852
  52,163,850
  52,163,894
  52,165,122
  52,165,829
  52,166,973
  52,169,841
  52,172,037
  52,172,345
  52,173,607
  52,173,807
  52,175,834
  52,176,016
  52,176,545
  52,177,108
  52,177,950
  52,178,220
  52,178,249
  52,178,397
  52,180,654
  52,181,460
  52,181,581
  52,181,582
  52,183,099
  52,184,701
  52,186,157
  52,186,574
  52,186,576
  52,186,582
  52,186,658
  52,186,718
  52,187,107
  52,187,493
  52,187,662
  52,187,779
  52,187,961
  52,188,015
  52,188,059
  52,188,107
  52,188,534
  52,188,537
  52,188,550
  52,188,799
  52,188,814
  52,188,849
  52,188,880
  52,188,898
  52,189,921
  52,190,147
  52,190,690
  52,191,922
  52,192,233
  52,192,691
  52,192,774
  52,193,261
  52,193,340
  52,193,734
  52,194,723
  52,194,915
  52,194,926
  52,195,055
  52,195,163
  52,195,708
  52,195,847
  52,195,858
  52,201,541
  52,201,977
  52,202,262
  52,202,327
  52,202,516
  52,202,804
  52,202,881
  52,203,315
  52,203,436
  52,203,759
  52,203,819
  52,203,828
  52,203,861
  52,203,931
  52,204,098
  52,204,235
  52,204,302
  52,204,364
  52,205,192
  52,206,259
  52,206,298
  52,206,324
  52,206,326
  52,207,207
  52,207,261
  52,207,350
  52,207,422
  52,207,915
  52,208,217
  52,210,693
  52,211,495
  52,211,922
  52,212,246
  52,212,518
  52,212,566
  52,212,594
  52,212,916
  52,213,033
  52,214,722
  52,215,248
  52,215,412
  52,215,857
  52,215,859
  52,215,861
  52,215,863
  52,215,865
  52,215,867
  52,215,871
  52,216,301
  52,216,639
  52,216,980
  52,216,990
  52,216,991
  52,216,992
  52,216,997
  52,217,148
  52,217,369
  52,217,373
  52,218,358
  52,218,360
  52,218,366
  52,218,613
  52,218,915
  52,219,027
  52,219,053
  52,219,430
  52,219,787
  52,219,829
  52,219,885
  52,220,185
  52,220,220
  52,221,069
  52,221,730
  52,221,845
  52,221,849
  52,222,371
  52,223,056
  52,223,675
  52,224,450
  52,225,107
  52,225,736
  52,225,932
  52,226,009
  52,227,073
  52,227,082
  52,227,168
  52,227,258
  52,227,312
  52,227,678
  52,228,585
  52,228,967
  52,228,968
  52,230,182
  52,230,604
  52,230,861
  52,231,173
  52,231,758
  52,231,796
  52,232,533
  52,232,722
  52,234,279
  52,235,151
  52,235,722
  52,236,713
  52,237,232
  52,237,999
  52,238,299
  52,238,348
  52,238,543
  52,238,633
  52,238,947
  52,238,969
  52,238,970
  52,239,026
  52,239,161
  52,239,162
  52,239,181
  52,239,184
  52,239,203
  52,239,392
  52,241,495
  52,241,940
  52,245,188
  52,248,633
  52,249,666
  52,255,921
  52,257,808
  52,258,582
  52,261,195
  52,261,268
  52,262,957
  52,263,659
  52,264,362
  52,266,589
  52,268,607
  52,270,313
  52,271,884
  52,272,907
  52,273,497
  52,275,075
  52,282,895
  52,282,900
  52,288,455
  52,289,039
  52,291,828
  52,292,751
  52,293,525
  52,298,251
  52,301,829
  52,303,528
  52,305,444
  52,309,537
  52,311,962
  52,315,403
  52,315,851
  52,318,119
  52,318,501
  52,319,486
  52,321,851
  52,322,090
  52,322,443
  52,324,665
  52,328,893
  52,329,354
  52,332,676
  52,333,071
  52,333,405
  52,335,696
  52,335,943
  52,342,791
  52,342,799
  52,342,943
  52,343,156
  52,343,241
  52,343,827
  52,343,958
  52,344,646
  52,345,680
  52,345,857
  52,347,668
  52,348,805
  52,349,213
  52,349,822
  52,350,222
  52,351,475
  52,352,003
  52,354,026
  52,354,995
  52,357,692
  52,358,158
  52,358,368
  52,358,968
  52,361,723
  52,361,732
  52,365,355
  52,366,543
  52,367,679
  52,371,146
  52,374,586
  52,377,414
  52,378,949
  52,381,548
  52,381,680
  52,382,498
  52,389,512
  52,390,994
  52,391,246
  52,391,670
  52,394,006
  52,394,007
  52,394,576
  52,395,459
  52,397,080
  52,399,939
  52,399,952
  52,400,378
  52,401,359
  52,401,585
  52,403,136
  52,404,084
  52,406,110
  52,406,588
  52,406,825
  52,408,988
  52,411,178
  52,416,839
  52,416,999
  52,417,940
  52,421,016
  52,421,677
  52,421,814
  52,423,978
  52,424,378
  52,426,667
  52,427,143
  52,428,472
  52,428,821
  52,430,004
  52,432,800
  52,433,622
  52,434,075
  52,435,263
  52,435,713
  52,436,265
  52,438,703
  52,439,159
  52,442,926
  52,443,888
  52,446,196
  52,446,614
  52,446,895
  52,447,147
  52,449,135
  52,451,175
  52,452,725
  52,453,173
  52,455,176
  52,456,341
  52,457,970
  52,458,726
  52,458,874
  52,458,875
  52,459,140
  52,459,323
  52,459,960
  52,460,176
  52,460,191
  52,460,431
  52,463,303
  52,463,309
  52,463,692
  52,463,846
  52,464,320
  52,465,921
  52,466,162
  52,467,035
  52,472,537
  52,473,767
  52,473,798
  52,473,901
  52,474,478
  52,474,510
  52,475,688
  52,477,458
  52,477,668
  52,478,583
  52,478,927
  52,478,967
  52,479,820
  52,481,219
  52,481,827
  52,482,552
  52,484,028
  52,485,748
  52,488,712
  52,489,108
  52,490,377
  52,491,800
  52,491,849
  52,492,163
  52,492,239
  52,492,498
  52,497,217
  52,500,040
  52,501,794
  52,511,809
  52,512,568
  52,513,004
  52,513,603
  52,513,842
  52,513,968
  52,514,153
  52,515,483
  52,515,981
  52,516,031
  52,516,326
  52,516,460
  52,517,393
  52,518,097
  52,519,259
  52,520,603
  52,521,153
  52,521,592
  52,522,041
  52,522,351
  52,522,460
  52,523,397
  52,524,007
  52,524,965
  52,525,633
  52,526,012
  52,527,307
  52,527,318
  52,528,669
  52,529,071
  52,529,105
  52,529,662
  52,531,206
  52,531,661
  52,531,749
  52,532,961
  52,533,130
  52,533,383
  52,534,356
  52,535,229
  52,536,392
  52,537,419
  52,537,991
  52,538,434
  52,538,448
  52,540,647
  52,542,349
  52,542,422
  52,542,796
  52,542,845
  52,542,955
  52,542,969
  52,544,631
  52,545,703
  52,546,697
  52,546,880
  52,548,665
  52,549,314
  52,553,178
  52,553,456
  52,553,458
  52,555,560
  52,556,151
  52,556,234
  52,558,376
  52,560,321
  52,563,299
  52,565,592
  52,565,747
  52,566,288
  52,566,385
  52,566,463
  52,566,587
  52,567,781
  52,568,305
  52,568,312
  52,569,090
  52,570,116
  52,570,229
  52,570,788
  52,570,885
  52,571,011
  52,571,034
  52,571,040
  52,571,091
  52,571,105
  52,571,134
  52,571,140
  52,571,365
  52,571,386
  52,571,407
  52,572,099
  52,572,127
  52,572,355
  52,572,909
  52,572,913
  52,573,132
  52,573,189
  52,573,332
  52,573,791
  52,573,870
  52,573,975
  52,574,092
  52,574,402
  52,574,621
  52,574,828
  52,574,973
  52,575,021
  52,575,120
  52,575,153
  52,575,195
  52,575,289
  52,575,403
  52,575,426
  52,575,498
  52,575,694
  52,575,839
  52,576,671
  52,576,848
  52,577,222
  52,577,310
  52,577,404
  52,577,442
  52,577,464
  52,577,643
  52,577,662
  52,577,692
  52,577,699
  52,577,779
  52,577,883
  52,577,885
  52,578,003
  52,578,631
  52,578,752
  52,578,809
  52,578,822
  52,578,827
  52,578,846
  52,578,966
  52,579,164
  52,579,182
  52,579,192
  52,579,332
  52,580,267
  52,580,276
  52,580,423
  52,580,586
  52,580,603
  52,581,021
  52,581,307
  52,581,365
  52,581,441
  52,581,859
  52,581,959
  52,582,238
  52,582,285
  52,582,452
  52,583,558
  52,583,649
  52,583,725
  52,584,097
  52,588,843
  52,589,853
  52,589,901
  52,590,024
  52,590,396
  52,590,806
  52,592,005
  52,592,816
  52,593,481
  52,598,937
  52,603,190
  52,603,796
  52,603,881
  52,603,998
  52,607,514
  52,607,668
  52,608,150
  52,609,874
  52,611,485
  52,611,798
  52,614,955
  52,621,679
  52,625,923
  52,626,150
  52,629,989
  52,631,414
  52,631,885
  52,632,114
  52,641,420
  52,666,689
  52,673,052
  52,679,754
  52,705,629
  52,717,264
  52,733,012
  52,740,727
  52,751,227
  52,757,009
  52,791,585
  52,846,305
  52,854,543
  52,861,007
A/T
C/A
T
-
2/-
-/2
T/C
T/A
A/G
-
2/-
T
A
2
G
T
G
C
C
-
T
-
A
G
G
A
C
C
A
G
G
C/G
A
T
C
-
T
C
G
C
G
A
C
T
-
T
G
T
T
A
G
T
G
C
G
C
T
T
C
A
6
T
A
G
T
T
A
T
T
G
C
T
G
T
C
A
A
T
G
C
C
A
-
G
A
A
C
-
C
A
T
T
A
T
-/A
-
A
A
-/T
G
T/-
A
G
3
G
A
G
A
T
-
T
G
A
A
T
G
C
A
A
T
G
G
C
T
G
C
C
C
C
T
G
G/T
T
C
A
C
C
A
T
G
C
G
A
4
C
-
-
A
A
G
T
C
2
A
A
-
A
G
G
T
A
A
T
G
-
T/-
T/-
T/-
T/-
A/T
A/T
A/T
G
C
2
C
C
C
3
-
T
A
-
-
-/T
C
A
C
C
G
A
A
T
C
T
C
A
G
T
A
T
C
A
A
T
G
C
T
T
A
C
G
C
G
A
T
-/A
-
-
-
C
A
T
-
T
G
A
G
G
A
T
T
C
T
T
C
T
C
A
5
A
C
T
A
C
T
G
G
C
-
-
A
G
A
A
C
T
-
-
-
T
C
-
-
-
T
G
C/-
-
C
G
97
C
-
T
T
A
G
G
G
G
T
-
2
-
T
T
-
G
A
C
T
4
C
A
C
G
G
-
C
G
A
T
C/C
T
C
C
G
C
T
C
-
T
G
A
C
G
A
G
G
A
A
T
G
T
C
A
T
A
C
2
A
A
G
C
-/129
-/G
C/T
A
C
T
G
A
A
T
G
A
A
-
-
C
T
T
-
-
A
-
C/A
C
A
G
C
9
A
-
A
C
-
C
G
C
C
T
A
A
T
A
A
C
G
A
G
T
G
T
G
A
T
T
A
C
A
C
A
G
C
T
T
G
G
-
-
T
-
T
-
2/-
A
A
G
-
-
C
T
G
T
T
C
A
-
C
T
G
T
A
-
T
T
-
G
C
-
C
G
G
T
C
C
G
A
C
-
-/C
A
-
T
T
A
-
G
A
T
2
C
-
-
T
T
A
C
2
A
2
4
T
C
C
G
4
C
A
T
2
22
C
T
G
A
C
T
-
A
T
C
G
12/-
A
-
G
T
T
G
T
2
A
T
G
T
T
G
T
A
G
G
C
C
C
-
G
-
G
T
4
C
A
-
3
T
C
T
A
C
A
T
A
T
G
C
A
C
A
T
C
G
T
T
G
A
T
G
A
T
T
A
A
A
T
G
4
T
T
A
A
A
C
G
T
A
A
A
A
C
A
C
T
T
G
G
C
C
A
T
T
-
A
G
-
A
T
T
G
A
T
T
T
-
G
C
T
A
A
-
10
A
C
T
G
A
T
T
G
T
A
A
T
C
C
T
T
A
G
-
10
A
T
T/-
3
C
-
T
T
A
A
-/C
C
C
G
T
A
A
C
T