Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 288,718 (bp)   Positions: 573
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
GK/FarMcwi (2019) 
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
Igf1r
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pgpep1l
T
A
-
T
-
C
G
G
A
T
T
A
T
G
A
T
A
G
C
G
A
A
T
A
G
C
T
T
T
G
T
T
T
T
G
G
C
A
A
A
G
A
C
4
G
-
A
A
A
-
A
C
C
A
A
A
G
T
G
-
C
A
-
G
2
C
C
2
A
-
T
G
C
A
G
C
G
A
A
G
A
G
C
T
-
-
A
A
4
A
T
T
A
T
T
T
-
C
A
G
G
G
T
A
C
-
-
G
22
A
A
A
T
-
-
C
A
A
C
C
T
T
C
C
C
G
A
A
C
T
G
C
T
C
T
A
T
C
T
G
T
C
G
C
T
G
-
C
T
T
A
G
A
C
C
-
C
A
C
C
C
C
C
C
C
C
C
A
-
A
C
A
A
G
T
A
A
2
A
-
G
C
G
G
2
G
G
G
T
A
C
C
G
C
T
G
G
C
T
A
-
A
G
G
T
T
A
C
43
T
T
T
T
A
A
T
T
C
A
T
-
G
C
A
A
-
G
T
T
A
-
C
C
G
G
12
C
A
-
G
-
G
T
T
4
C
-
T
-
G
T
G
T
2
G
G
T
T
T
G
G
G
C
G
T
T
A
A
T
T
G
C
C
G
A
-
C
G
G
G
T
G
T
T
A
A
T
T
A
G
A
A
T
A
C
C
T
T
-
A
A
G
C
G
G
G
C
G
-
C
C
3
G
G
G
C
G
T
-
G
27
A
C
A
-
A
6
T
A
2
C
C
C
C
A
C
C
T
C
A
G
G
T
G
T
T
G
-
G
G
3
-
C
T
-
T
G
A
-
A
A
-
A
A
G
C
G
G
G
T
T
-
A
A
T
G
A
A
A
A
A
4
T
A
-
A
G
C
-
G
G
-
C
C
A
T
4
4
A
A
A
A
G
6
A
G
C
C
C
A
-
C
G
G
C
G
T
30
T
C
T
G
A
A
A
-
G
T
G
A
A
G
G
C
A
A
T
C
G
G
G
A
C
-
A
C
G
C
A
A
G
A
G
A
C
T
A
C
C
G
G
A
T
T
T
2
G
G
C
A
-
T
T
C
-
A
A
A
2
G
-
A
G
G
G
T
C
G
C
G
T
T
C
T
C
C
A
G
A
-
T
G
A
T
A
A
A
2
-
T
G
C
A
-
2
A
A
T
C
A
G
G
C
C
T
122
T
A
A
A
A
G
15
G
T
G
A
T
A
A
A
121
A
A
A
T
T
G
G
T
A
A
25
G
C
G
C
T
T
A
T
A
T
A
-
2
C
T
T
T
C
G
A
  121,550,424
  121,550,434
  121,550,739
  121,550,769
  121,551,118
  121,551,261
  121,551,375
  121,551,700
  121,551,919
  121,552,910
  121,553,142
  121,553,287
  121,553,396
  121,553,587
  121,554,504
  121,555,039
  121,555,204
  121,556,245
  121,556,286
  121,556,535
  121,557,053
  121,558,568
  121,559,282
  121,559,318
  121,559,745
  121,559,966
  121,560,010
  121,560,198
  121,560,825
  121,561,005
  121,563,767
  121,565,041
  121,565,236
  121,566,369
  121,566,955
  121,567,070
  121,567,100
  121,567,159
  121,567,246
  121,568,055
  121,568,770
  121,569,246
  121,584,273
  121,588,269
  121,592,725
  121,593,346
  121,597,683
  121,597,703
  121,597,705
  121,605,971
  121,607,399
  121,611,470
  121,613,009
  121,616,017
  121,616,694
  121,616,695
  121,618,248
  121,621,926
  121,622,626
  121,627,242
  121,627,963
  121,628,868
  121,628,899
  121,628,916
  121,628,931
  121,628,932
  121,628,936
  121,628,959
  121,629,506
  121,629,587
  121,629,785
  121,630,171
  121,630,223
  121,631,029
  121,631,333
  121,632,827
  121,632,873
  121,633,661
  121,633,662
  121,633,917
  121,634,104
  121,634,825
  121,634,903
  121,635,345
  121,635,737
  121,635,747
  121,635,791
  121,635,880
  121,636,840
  121,638,361
  121,638,517
  121,638,552
  121,640,456
  121,640,462
  121,640,508
  121,641,440
  121,641,704
  121,642,502
  121,642,759
  121,643,609
  121,643,944
  121,645,303
  121,647,222
  121,647,688
  121,648,033
  121,648,332
  121,649,469
  121,651,197
  121,654,471
  121,654,486
  121,654,588
  121,655,832
  121,656,409
  121,656,444
  121,657,806
  121,657,814
  121,657,815
  121,658,291
  121,658,701
  121,658,781
  121,659,145
  121,659,155
  121,659,689
  121,660,156
  121,660,175
  121,660,273
  121,660,307
  121,660,308
  121,660,651
  121,660,689
  121,661,842
  121,661,861
  121,661,894
  121,662,687
  121,662,715
  121,662,829
  121,663,402
  121,663,590
  121,664,087
  121,664,118
  121,664,212
  121,664,342
  121,664,398
  121,664,414
  121,664,552
  121,664,687
  121,664,915
  121,664,920
  121,664,921
  121,665,497
  121,665,546
  121,665,598
  121,665,606
  121,665,634
  121,666,222
  121,666,753
  121,666,827
  121,667,059
  121,667,651
  121,667,653
  121,667,657
  121,667,659
  121,667,661
  121,667,663
  121,667,665
  121,667,667
  121,667,675
  121,667,785
  121,667,802
  121,667,865
  121,667,866
  121,668,072
  121,668,298
  121,668,306
  121,668,478
  121,668,549
  121,669,514
  121,669,719
  121,669,888
  121,669,991
  121,670,901
  121,670,993
  121,671,555
  121,671,808
  121,671,854
  121,671,889
  121,671,894
  121,671,926
  121,672,263
  121,672,321
  121,672,326
  121,672,351
  121,672,403
  121,672,535
  121,672,608
  121,672,631
  121,673,261
  121,673,767
  121,674,122
  121,674,221
  121,674,227
  121,674,249
  121,674,293
  121,674,453
  121,674,537
  121,674,998
  121,675,058
  121,675,253
  121,675,330
  121,675,356
  121,675,357
  121,675,358
  121,675,479
  121,675,590
  121,675,592
  121,675,714
  121,675,750
  121,675,848
  121,677,322
  121,677,660
  121,678,426
  121,679,101
  121,679,533
  121,679,846
  121,680,417
  121,680,460
  121,680,906
  121,680,974
  121,681,019
  121,681,754
  121,681,919
  121,681,968
  121,682,835
  121,682,953
  121,683,723
  121,683,799
  121,683,892
  121,685,527
  121,685,541
  121,685,857
  121,686,111
  121,686,271
  121,686,903
  121,686,923
  121,686,963
  121,686,966
  121,687,054
  121,687,847
  121,688,000
  121,688,255
  121,688,900
  121,689,157
  121,689,620
  121,689,960
  121,689,975
  121,689,978
  121,690,917
  121,691,265
  121,691,664
  121,692,150
  121,692,304
  121,692,365
  121,692,380
  121,692,982
  121,693,033
  121,693,249
  121,693,981
  121,694,657
  121,694,919
  121,694,978
  121,695,059
  121,695,288
  121,695,786
  121,696,251
  121,696,971
  121,698,282
  121,698,984
  121,700,505
  121,700,754
  121,700,923
  121,701,590
  121,701,599
  121,701,600
  121,702,196
  121,703,004
  121,703,246
  121,703,496
  121,704,071
  121,704,349
  121,704,367
  121,704,424
  121,706,211
  121,707,043
  121,708,156
  121,708,328
  121,708,892
  121,709,178
  121,709,497
  121,709,552
  121,709,996
  121,710,012
  121,710,742
  121,710,912
  121,711,204
  121,711,519
  121,711,524
  121,711,540
  121,711,542
  121,711,722
  121,711,906
  121,711,938
  121,712,123
  121,712,138
  121,712,350
  121,713,077
  121,713,451
  121,713,454
  121,713,894
  121,714,650
  121,714,665
  121,714,701
  121,715,249
  121,715,577
  121,715,578
  121,715,673
  121,716,160
  121,716,566
  121,716,724
  121,716,839
  121,717,209
  121,717,338
  121,718,324
  121,718,335
  121,719,038
  121,719,050
  121,719,136
  121,719,582
  121,719,618
  121,720,109
  121,720,312
  121,720,459
  121,720,467
  121,720,474
  121,720,475
  121,720,584
  121,720,857
  121,720,989
  121,721,022
  121,721,545
  121,721,909
  121,721,994
  121,722,480
  121,722,961
  121,723,947
  121,724,779
  121,726,565
  121,727,069
  121,727,387
  121,727,484
  121,728,501
  121,728,652
  121,730,462
  121,731,109
  121,733,360
  121,733,878
  121,734,244
  121,734,971
  121,736,396
  121,736,654
  121,736,983
  121,737,300
  121,737,434
  121,739,520
  121,739,625
  121,739,890
  121,740,143
  121,741,189
  121,741,191
  121,741,193
  121,741,195
  121,741,197
  121,741,523
  121,742,149
  121,742,361
  121,743,023
  121,744,694
  121,744,771
  121,747,684
  121,750,555
  121,750,570
  121,750,573
  121,750,945
  121,751,952
  121,752,243
  121,754,197
  121,755,034
  121,755,178
  121,755,207
  121,755,624
  121,755,971
  121,756,333
  121,756,769
  121,756,903
  121,757,444
  121,760,263
  121,760,512
  121,760,553
  121,760,747
  121,761,285
  121,761,290
  121,761,348
  121,761,561
  121,761,931
  121,761,951
  121,762,150
  121,762,162
  121,762,185
  121,762,199
  121,762,206
  121,762,397
  121,762,606
  121,762,607
  121,762,789
  121,762,866
  121,762,937
  121,762,977
  121,763,193
  121,763,261
  121,763,327
  121,763,340
  121,763,342
  121,763,344
  121,763,363
  121,763,419
  121,764,085
  121,764,086
  121,764,141
  121,764,389
  121,764,623
  121,764,661
  121,764,742
  121,764,968
  121,765,013
  121,765,016
  121,765,022
  121,765,133
  121,765,248
  121,765,482
  121,765,509
  121,765,535
  121,765,595
  121,765,603
  121,765,688
  121,765,771
  121,765,824
  121,765,922
  121,765,926
  121,766,008
  121,766,029
  121,766,175
  121,766,417
  121,767,139
  121,767,326
  121,768,062
  121,769,456
  121,769,712
  121,770,634
  121,770,659
  121,770,677
  121,771,074
  121,771,084
  121,771,126
  121,771,710
  121,771,863
  121,772,850
  121,772,865
  121,772,869
  121,772,873
  121,773,169
  121,773,356
  121,774,808
  121,774,829
  121,774,837
  121,774,841
  121,776,328
  121,777,191
  121,777,563
  121,778,400
  121,778,496
  121,778,635
  121,780,130
  121,780,483
  121,780,788
  121,781,844
  121,781,943
  121,782,183
  121,782,214
  121,782,671
  121,782,687
  121,782,736
  121,783,015
  121,783,068
  121,783,120
  121,783,456
  121,783,533
  121,783,593
  121,783,841
  121,790,887
  121,790,896
  121,796,284
  121,797,360
  121,801,963
  121,803,605
  121,803,892
  121,803,907
  121,805,066
  121,806,232
  121,807,044
  121,807,138
  121,807,975
  121,808,762
  121,808,867
  121,809,222
  121,809,898
  121,809,911
  121,810,384
  121,810,557
  121,811,043
  121,811,049
  121,811,051
  121,811,055
  121,811,457
  121,811,522
  121,812,102
  121,814,597
  121,816,002
  121,816,966
  121,817,469
  121,818,021
  121,818,154
  121,818,751
  121,818,874
  121,819,114
  121,819,649
  121,820,488
  121,820,872
  121,821,048
  121,821,289
  121,821,346
  121,821,923
  121,822,412
  121,822,728
  121,822,985
  121,823,223
  121,823,534
  121,823,548
  121,823,778
  121,824,267
  121,825,156
  121,826,619
  121,826,747
  121,827,456
  121,830,839
  121,831,242
  121,831,691
  121,833,123
  121,834,724
  121,836,447
  121,837,441
  121,837,530
  121,837,812
  121,837,823
  121,838,324
C
G
3
C
14
-
T
-/T
G
A
C
G
A
A
G
C
G
A
T
A
-
G
C
G
A
T
C
C
C
A
G
C
C
C
A
C
T
T/G
G
G
A
G
T
-
A
C
G
G/-
G/-
T
G
A
A
C
-/C
-/C
C
C
A
34
T
T
30
A
-
T/-
T
-
G
7
C
C
-/A
G
A
T
A
C
T
A
G
A
T
C
A
A
G
G
-
-/T
C
C
T
C
C
-
T
A
-
T
-/T
-/C
G
C
A
C/C
5
A
-
-/C
G
G
-
109
3
G
G
G
T
T
C
A
T
G/A
T
C
T
T
T
C
A
T
C
T
C
G
A
T
C
T
C
T
C
T
C
C
3
T
G
C
T
A
G
T
T
5
-
G
T/-
-/T
T/-
-/T
-/T
-/T
T/-
-/T
T
G
A
C
T
A/T
C
T
C
G
C
2/-
G
T
A
T
A
T
-
A
A
A
A
G
T
T
C
T
G
C
A
T
C
G
4
G
T
A
A
C
G
T
-
-/G
-/G
G/-
C
T
G
A
C
T
G
C
3
A
T
G
G/-
2
A
C
C
G
G
-
T
A
A
-
T
G
A
T
C
T
C/-
C/-
-
-/G
C
C/-
2
A
G
A
-
-
A
A
C
A
C
A
T
A
T
A
A
G
G
G
C
C
A
T
T
A
-
A
T
A
A
A
G
T
G
C
T
G
C
C
G
A
G
C
C
T
T
T
C
C
G
G
-
C
T
A
A
A
T
A
T
G
T
-
C
T
A
A
A
A
T
A
-
G
T
G
2
G
-
C
C
-
T
G/-
-/A
A
G
T
A
C
T
G
T/-
T/-
C/-
-/T
C
C
A
A
C
A
-
2
T
C
9
-
C
G
A
G
G
31
T
G
C
T
A
A
A
C
A
9
G
-
C
A
-/T
T/-
-/T
-/T
T/-
-
-
G
2
-
A
T
2
T
T
T
T
T
G
C
-
-
G
C
G
T
A
-
G
A
T
T
A
G
A
T
C
A
T
A
C
-
-/G
T
C
A
G
G
G
16
A
C
A
T
G
A
A
T
T
C
G
T
A
C
A
G
G
2
C
T
C/-
T
G
G
C
G
T
T
G
C
C
-/T
T
A
A
G
C
C
-
-
A
T
T
G
C
G
C
T
4
G/-
G
G
-
A
2
-/G
A
C/A
A
G
T
A
T
A
C
C
T
C
T
G
G
A
G
13
C
A
G
C
G
C
G
-
6
A
-/C
G
G
2
-
G
G
A
G
G
A
A
T
T
C
122/-
G
-/G
-/G
-/G
G
-
-
A
C
A
G
C
G
G
G
121/-
G
G
G/-
C
C
T
A
C
G
G
-
A
T
A
T
G
C
G
-
G
C
G
T
-
T
C
A
C
-
T
-