Send us a Message
Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
Search RGD Grant Resources Citing RGD About Us Contact Us
Genes Variants Community Projects QTLs Strains Markers Genome Information Ontologies Cell Lines References Download Submit Data
OntoMate (Literature Search) JBrowse (Genome Browser) Synteny Browser (VCMap) Variant Visualizer Multi-Ontology Enrichment (MOET) Gene-Ortholog Location Finder (GOLF) InterViewer (Protein-Protein Interactions) PhenoMiner (Quatitative Phenotypes) Gene Annotator OLGA (Gene List Generator) AllianceMine GViewer (Genome Viewer)
Aging & Age-Related Disease Cancer & Neoplastic Disease Cardiovascular Disease Coronavirus Disease Developmental Disease Diabetes Hematologic Disease Immune & Inflammatory Disease Infectious Disease Liver Disease Neurological Disease Obesity & Metabolic Syndrome Renal Disease Respiratory Disease Sensory Organ Disease
Find Models   new Genetic Models Autism Models Rat PhenoMiner (Quantitative Phenotypes) Chinchilla PhenoMiner Expected Ranges (Quantitative Phenotype) PhenoMiner Term Comparison Hybrid Rat Diversity Panel Phenotypes Phenotypes in Other Animal Models Animal Husbandry Strain Medical Records Phylogenetics Strain Availability Calendar Rats 101 Submissions Photo Archive
Pathways
Rat Community Forum Directory of Rat Laboratories Video Tutorials News RGD Publications RGD Presentations Archive Nomenclature Guidelines Resource Links Laboratory Resources Employment Resources
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly mRatBN7.2
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 87,498 (bp)   Positions: 312
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
mRatBN7.2  
FXLE16/Stm (2020) 
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
Hsf2bp
A
C
G
A
C
G
T
C
4
G
4
G
G
G
C
G
T
C
T
T
A
6
A
A
A
A
T
C
C
T
C
G
G
T
G
-
-
A
G
C
C
C
C
G
T
T
G
A
G
T
-
-
T
A
C
G
C
A
T
G
G
G
-
C
C
A
C
A
T
A
G
T
T
C
A
T
C
-
C
A
A
A
A
G
A
G
G
T
G
A
T
C
T
C
T
T
T
T
G
A
T
C
A
G
G
T
C
G
A
G
A
G
A
C
-
-
G
T
A
A
C
A
G
-
C
G
C
C
T
T
G
C
T
G
A
G
5
A
A
G
T
A
G
G
G
C
112
A
A
C
T
A
A
C
G
T
A
C
G
A
G
C
A
A
C
G
C
A
G
A
C
A
G
T
-
2
-
A
G
A
G
A
G
C
G
-
T
A
T
A
G
G
C
G
A
T
C
C
G
T
T
2
A
G
C
A
-
G
G
C
C
C
C
C
C
T
G
G
G
G
T
G
-
G
G
G
C
-
A
C
T
4
C
T
C
-
T
T
A
T
A
A
G
C
C
A
2
A
A
A
T
T
A
A
A
C
C
C
C
A
4
G
T
G
A
2
2
C
T
C
A
G
T
10
G
A
G
G
-
-
A
A
C
G
G
C
A
G
T
G
A
C
G
C
-
C
G
G
9
C
G
A
C
G
G
C
A
C
C
A
A
A
  10,035,799
  10,036,172
  10,036,218
  10,036,268
  10,036,278
  10,036,955
  10,037,130
  10,037,770
  10,038,015
  10,038,207
  10,038,437
  10,038,530
  10,039,005
  10,039,117
  10,039,733
  10,039,762
  10,039,815
  10,040,005
  10,040,252
  10,040,805
  10,041,597
  10,042,070
  10,042,555
  10,042,557
  10,042,559
  10,042,561
  10,043,132
  10,043,294
  10,043,936
  10,044,261
  10,044,646
  10,044,750
  10,045,136
  10,045,520
  10,045,524
  10,045,667
  10,045,680
  10,046,405
  10,048,159
  10,048,967
  10,049,017
  10,049,158
  10,049,169
  10,049,500
  10,049,761
  10,049,848
  10,051,070
  10,051,580
  10,051,830
  10,051,888
  10,051,929
  10,051,943
  10,051,985
  10,053,233
  10,053,266
  10,053,384
  10,053,444
  10,053,477
  10,053,518
  10,053,519
  10,053,688
  10,053,693
  10,054,422
  10,054,482
  10,054,518
  10,054,648
  10,054,837
  10,054,893
  10,055,064
  10,055,248
  10,055,299
  10,055,458
  10,055,576
  10,056,111
  10,056,159
  10,056,317
  10,056,380
  10,056,952
  10,056,959
  10,057,155
  10,057,246
  10,057,261
  10,057,543
  10,057,702
  10,057,850
  10,058,040
  10,058,287
  10,058,393
  10,058,544
  10,058,771
  10,059,670
  10,059,956
  10,060,163
  10,060,187
  10,060,290
  10,060,385
  10,060,472
  10,060,508
  10,060,762
  10,060,814
  10,060,982
  10,061,394
  10,061,412
  10,061,509
  10,061,623
  10,062,124
  10,062,189
  10,062,209
  10,062,833
  10,062,953
  10,063,034
  10,063,261
  10,063,440
  10,063,815
  10,065,395
  10,065,397
  10,066,683
  10,067,722
  10,067,851
  10,068,296
  10,068,384
  10,068,705
  10,069,150
  10,070,426
  10,071,621
  10,072,159
  10,072,246
  10,072,400
  10,072,442
  10,072,715
  10,072,953
  10,073,312
  10,073,416
  10,073,574
  10,073,724
  10,073,965
  10,074,166
  10,074,656
  10,074,667
  10,074,978
  10,075,155
  10,075,344
  10,075,453
  10,075,531
  10,075,627
  10,075,895
  10,075,922
  10,076,538
  10,076,804
  10,076,890
  10,076,953
  10,077,138
  10,077,255
  10,077,476
  10,077,604
  10,077,672
  10,077,785
  10,078,089
  10,078,150
  10,079,087
  10,079,276
  10,079,300
  10,079,523
  10,079,556
  10,079,690
  10,080,069
  10,080,097
  10,080,395
  10,080,953
  10,081,145
  10,081,822
  10,081,878
  10,081,890
  10,081,976
  10,082,088
  10,082,099
  10,082,128
  10,082,426
  10,082,459
  10,082,515
  10,082,734
  10,082,825
  10,083,659
  10,083,813
  10,083,926
  10,084,193
  10,084,382
  10,084,477
  10,084,647
  10,084,656
  10,084,808
  10,084,868
  10,084,952
  10,085,180
  10,085,236
  10,085,291
  10,085,313
  10,085,380
  10,085,412
  10,085,464
  10,085,496
  10,085,542
  10,085,921
  10,085,951
  10,086,356
  10,086,424
  10,086,523
  10,086,893
  10,087,009
  10,087,278
  10,087,594
  10,087,598
  10,087,627
  10,087,691
  10,087,742
  10,087,847
  10,087,865
  10,087,893
  10,087,921
  10,087,949
  10,089,805
  10,090,400
  10,090,403
  10,090,649
  10,090,806
  10,090,855
  10,091,027
  10,091,186
  10,091,656
  10,091,738
  10,091,758
  10,092,316
  10,092,744
  10,092,820
  10,093,373
  10,093,453
  10,093,528
  10,093,786
  10,093,895
  10,093,961
  10,094,028
  10,094,088
  10,094,339
  10,095,177
  10,095,644
  10,095,684
  10,096,118
  10,096,564
  10,096,566
  10,097,126
  10,097,274
  10,097,420
  10,097,573
  10,097,984
  10,098,623
  10,098,981
  10,099,437
  10,099,471
  10,099,726
  10,100,398
  10,100,638
  10,100,950
  10,101,212
  10,101,294
  10,101,575
  10,101,756
  10,101,759
  10,101,961
  10,102,149
  10,102,295
  10,102,331
  10,102,345
  10,102,529
  10,103,120
  10,103,129
  10,103,368
  10,103,563
  10,103,685
  10,104,053
  10,104,880
  10,105,214
  10,105,720
  10,105,724
  10,105,772
  10,106,058
  10,106,710
  10,106,711
  10,107,436
  10,107,699
  10,108,195
  10,108,869
  10,110,314
  10,112,599
  10,113,694
  10,114,262
  10,114,561
  10,114,871
  10,115,042
  10,115,617
  10,115,903
  10,116,400
  10,117,563
  10,117,655
  10,118,109
  10,118,341
  10,119,024
  10,119,277
  10,119,810
  10,119,819
  10,121,961
  10,121,962
  10,123,047
G
T
A
G/-
T/-
C
C
T
-
A
-
A
A
A
T
A
C
T
C
A
G
-
T/-
T/-
-/T
T/-
C
T
A
C
A
-/A
A
A
A
3
9
G
A
T
T
-
T
A
C
C
A
G
T
-
5
G
C
G
T
A
G
G
C
A
A
A
T
T
T
-/T
T
G
C
G
A
C
G
A
G
C
T
G
T
G
C
G
C
A
G
T
A
A
A
G
C
T
C
T
C
C
C
C
A
C
G
T
G
A
-
C
T
A
G
A
G
A
-
A
-/2
-/2
A
C
T
G
T
G
A
2
G
T
T
T
G
-
A
T
C
A
C
A
-
G
G
A
C
C
C
A
A
A
-
G
G
A
C
C
G
T
T
C
C
T
A
G
A
G
G
G
T
C
T
G
A
G
T
C
A
C
4
-
2
C
T
G
A
G
A
A
C
TT/T
C
G
C
G
A
-
T
C
G
A
T
T
A
C
G
-
G
C
T
C/-
3
A
A
T
-
T
A
G
G
G
A
A
A
A
A
A
G
A
A
A
A
2
G
T
C
-
T
C
G
2
C
C
G
C
-/T
T/-
A
G
T
G
-
G
G
G
C
C
C
G
G
G
T
G
A
G
-
A
C
A
T
-
-
T
C
T
T
A
C
10/-
A/-
T
A
A
4
G
G
C
A
A
A
T
G
C
C
A
G
T
T
G
C
-
A
A
-
T
A
G
A
A
A
T
G
-
A
T/-
-/T
G